Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4. / Alekseeva, I. V.; Bakman, A. S.; Iakovlev, D. A. и др.
в: Molekuliarnaia biologiia, Том 55, № 2, 9, 01.03.2021, стр. 277-288.Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
}
TY - JOUR
T1 - Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4
AU - Alekseeva, I. V.
AU - Bakman, A. S.
AU - Iakovlev, D. A.
AU - Kuznetsov, N. A.
AU - Fedorova, O. S.
N1 - Алексеева И.В., Бакман А.С., Яковлев Д.А., Кузнецов Н.А., Федорова О.С. Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4 // Молекулярная биология. - 2021. - Т. 55. - № 2. - С. 277-288
PY - 2021/3/1
Y1 - 2021/3/1
N2 - N-гликозилазы человека SMUG1 и MBD4 катализируют удаление из ДНК остатков урацила, образующихся в результате дезаминирования цитозина или ошибок репликации. Для однонуклеотидных полиморфных вариантов (SNP) SMUG1 (G90C, P240H, N244S, N248Y) и каталитического домена MBD4cat (S470L, G507S, R512W, H557D) методом молекулярной динамики получены структуры фермент-субстратных комплексов. Экспериментально установлено, что SNP-варианты SMUG1 N244S и N248Y обладают повышенной каталитической активностью по сравнению с ферментом дикого типа, по-видимому, за счет ускорения диссоциации комплекса фермента с продуктом и увеличения числа оборотов фермента. У остальных вариантов SMUG1 (G90C, P240H) и всех вариантов MBD4cat, в которых замены аминокислот нарушали область связывания с субстратом и/или активный центр, каталитическая активность была значительно ниже, чем у ферментов дикого типа.
AB - N-гликозилазы человека SMUG1 и MBD4 катализируют удаление из ДНК остатков урацила, образующихся в результате дезаминирования цитозина или ошибок репликации. Для однонуклеотидных полиморфных вариантов (SNP) SMUG1 (G90C, P240H, N244S, N248Y) и каталитического домена MBD4cat (S470L, G507S, R512W, H557D) методом молекулярной динамики получены структуры фермент-субстратных комплексов. Экспериментально установлено, что SNP-варианты SMUG1 N244S и N248Y обладают повышенной каталитической активностью по сравнению с ферментом дикого типа, по-видимому, за счет ускорения диссоциации комплекса фермента с продуктом и увеличения числа оборотов фермента. У остальных вариантов SMUG1 (G90C, P240H) и всех вариантов MBD4cat, в которых замены аминокислот нарушали область связывания с субстратом и/или активный центр, каталитическая активность была значительно ниже, чем у ферментов дикого типа.
KW - active site
KW - catalysis
KW - DNA repair
KW - human uracil-DNA glycosylase
KW - MBD4
KW - polymorphic variant
KW - SMUG1
KW - DNA
KW - DNA Damage
KW - DNA Repair
KW - Endodeoxyribonucleases
KW - Humans
KW - Uracil
KW - Uracil-DNA Glycosidase/genetics
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85104619958&partnerID=8YFLogxK
UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?doi=10.31857/S0026898421020026
U2 - 10.31857/S0026898421020026
DO - 10.31857/S0026898421020026
M3 - статья
C2 - 33871441
AN - SCOPUS:85104619958
VL - 55
SP - 277
EP - 288
JO - Molekulyarnaya Biologiya
JF - Molekulyarnaya Biologiya
SN - 0026-8984
IS - 2
M1 - 9
ER -
ID: 28454083