Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4

Standard

Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4. / Alekseeva, I. V.; Bakman, A. S.; Iakovlev, D. A. et al.

In: Molekuliarnaia biologiia, Vol. 55, No. 2, 9, 01.03.2021, p. 277-288.

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

BibTeX

@article{a0764fdffe974c5c96ee9dc15760c326,

title = "Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4",

abstract = "N-гликозилазы человека SMUG1 и MBD4 катализируют удаление из ДНК остатков урацила, образующихся в результате дезаминирования цитозина или ошибок репликации. Для однонуклеотидных полиморфных вариантов (SNP) SMUG1 (G90C, P240H, N244S, N248Y) и каталитического домена MBD4cat (S470L, G507S, R512W, H557D) методом молекулярной динамики получены структуры фермент-субстратных комплексов. Экспериментально установлено, что SNP-варианты SMUG1 N244S и N248Y обладают повышенной каталитической активностью по сравнению с ферментом дикого типа, по-видимому, за счет ускорения диссоциации комплекса фермента с продуктом и увеличения числа оборотов фермента. У остальных вариантов SMUG1 (G90C, P240H) и всех вариантов MBD4cat, в которых замены аминокислот нарушали область связывания с субстратом и/или активный центр, каталитическая активность была значительно ниже, чем у ферментов дикого типа.",

keywords = "active site, catalysis, DNA repair, human uracil-DNA glycosylase, MBD4, polymorphic variant, SMUG1, DNA, DNA Damage, DNA Repair, Endodeoxyribonucleases, Humans, Uracil, Uracil-DNA Glycosidase/genetics",

author = "Alekseeva, {I. V.} and Bakman, {A. S.} and Iakovlev, {D. A.} and Kuznetsov, {N. A.} and Fedorova, {O. S.}",

note = "Алексеева И.В., Бакман А.С., Яковлев Д.А., Кузнецов Н.А., Федорова О.С. Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4 // Молекулярная биология. - 2021. - Т. 55. - № 2. - С. 277-288",

year = "2021",

month = mar,

day = "1",

doi = "10.31857/S0026898421020026",

language = "русский",

volume = "55",

pages = "277--288",

journal = "Molekulyarnaya Biologiya",

issn = "0026-8984",

publisher = "Russian Academy of Sciences",

number = "2",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4

AU - Alekseeva, I. V.

AU - Bakman, A. S.

AU - Iakovlev, D. A.

AU - Kuznetsov, N. A.

AU - Fedorova, O. S.

N1 - Алексеева И.В., Бакман А.С., Яковлев Д.А., Кузнецов Н.А., Федорова О.С. Сравнительный анализ активности полиморфных вариантов урацил-ДНК-гликолиаз человека человека SMUG1 и MBD4 // Молекулярная биология. - 2021. - Т. 55. - № 2. - С. 277-288

PY - 2021/3/1

Y1 - 2021/3/1

N2 - N-гликозилазы человека SMUG1 и MBD4 катализируют удаление из ДНК остатков урацила, образующихся в результате дезаминирования цитозина или ошибок репликации. Для однонуклеотидных полиморфных вариантов (SNP) SMUG1 (G90C, P240H, N244S, N248Y) и каталитического домена MBD4cat (S470L, G507S, R512W, H557D) методом молекулярной динамики получены структуры фермент-субстратных комплексов. Экспериментально установлено, что SNP-варианты SMUG1 N244S и N248Y обладают повышенной каталитической активностью по сравнению с ферментом дикого типа, по-видимому, за счет ускорения диссоциации комплекса фермента с продуктом и увеличения числа оборотов фермента. У остальных вариантов SMUG1 (G90C, P240H) и всех вариантов MBD4cat, в которых замены аминокислот нарушали область связывания с субстратом и/или активный центр, каталитическая активность была значительно ниже, чем у ферментов дикого типа.

AB - N-гликозилазы человека SMUG1 и MBD4 катализируют удаление из ДНК остатков урацила, образующихся в результате дезаминирования цитозина или ошибок репликации. Для однонуклеотидных полиморфных вариантов (SNP) SMUG1 (G90C, P240H, N244S, N248Y) и каталитического домена MBD4cat (S470L, G507S, R512W, H557D) методом молекулярной динамики получены структуры фермент-субстратных комплексов. Экспериментально установлено, что SNP-варианты SMUG1 N244S и N248Y обладают повышенной каталитической активностью по сравнению с ферментом дикого типа, по-видимому, за счет ускорения диссоциации комплекса фермента с продуктом и увеличения числа оборотов фермента. У остальных вариантов SMUG1 (G90C, P240H) и всех вариантов MBD4cat, в которых замены аминокислот нарушали область связывания с субстратом и/или активный центр, каталитическая активность была значительно ниже, чем у ферментов дикого типа.

KW - active site

KW - catalysis

KW - DNA repair

KW - human uracil-DNA glycosylase

KW - MBD4

KW - polymorphic variant

KW - SMUG1

KW - DNA

KW - DNA Damage

KW - DNA Repair

KW - Endodeoxyribonucleases

KW - Humans

KW - Uracil

KW - Uracil-DNA Glycosidase/genetics

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85104619958&partnerID=8YFLogxK

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?doi=10.31857/S0026898421020026

U2 - 10.31857/S0026898421020026

DO - 10.31857/S0026898421020026

M3 - статья

C2 - 33871441

AN - SCOPUS:85104619958

VL - 55

SP - 277

EP - 288

JO - Molekulyarnaya Biologiya

JF - Molekulyarnaya Biologiya

SN - 0026-8984

IS - 2

M1 - 9

ER -

ID: 28454083