Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
АНАЛИЗ СПЕКТРА ГАПЛОГРУПП мгДНК У ПАЦИЕНТОВ С НАРУШЕНИЯМИ СЛУХА, НЕСУЩИХ ВЕРОЯТНО-ПАТОГЕННЫЙ УЛЬТРАРЕДКИЙ ВАРИАНТ m.1494C>T В ГЕНЕ MT-RNR1. / Борисова, Туяра Валерьевна; Чердонова, А. М.; Пшенникова, В. Г. и др.
в: Генетика, Том 61, № 8, 2025, стр. 70-86.Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование
}
TY - JOUR
T1 - АНАЛИЗ СПЕКТРА ГАПЛОГРУПП мгДНК У ПАЦИЕНТОВ С НАРУШЕНИЯМИ СЛУХА, НЕСУЩИХ ВЕРОЯТНО-ПАТОГЕННЫЙ УЛЬТРАРЕДКИЙ ВАРИАНТ m.1494C>T В ГЕНЕ MT-RNR1
AU - Борисова, Туяра Валерьевна
AU - Чердонова, А. М.
AU - Пшенникова, В. Г.
AU - Терютин, Ф. М.
AU - Морозов, Игорь Владимирович
AU - Бондарь, А. А.
AU - Батурина, О. А.
AU - Кабилов, Марсель Расимович
AU - Романов, Г. П.
AU - Соловьев, А. В.
AU - Федорова, С. А.
AU - Барашков, Н. А.
N1 - АНАЛИЗ СПЕКТРА ГАПЛОГРУПП мгДНК У ПАЦИЕНТОВ С НАРУШЕНИЯМИ СЛУХА, НЕСУЩИХ ВЕРОЯТНО-ПАТОГЕННЫЙ УЛЬТРАРЕДКИЙ ВАРИАНТ m.1494C>T В ГЕНЕ MT-RNR1 / Т. В. Борисова, А. М. Чердонова, В. Г. Пшенинкова [и др.] // Генетика. – 2025. – Т. 61, № 8. – С. 70-86. – DOI 10.31857/S0016675825080071. – EDN XTVIBD. Работа выполнена в рамках НИР ЯНЦ КМП «Изучение генетической структуры и груза наследственной патологии в популяциях Республики Саха (Якутия)» и государственного задания Министерства науки и высшего образования РФ (FSRG-2023-0003 и 125012300656-5)
PY - 2025
Y1 - 2025
N2 - Вклад в этиологию потери слуха ультраредкого варианта m.1494C>T гена MT-RNR1 мгДНК, ассоциированного с аминогликозид-индуцированной глухотой (MT-RNR1, OMIM 561000), остается нензученным в большинстве выборок индивидов с нарушениями слуха. В связи с этим цель настоящей работы - скрининг m.1494C>T гена MT-RNR1 мгДНК среди пациентов с нарушениями слуха в Республике Бурятия, с последующим анализом выявленных в мире митохондриальных линий, несущих данный ультраредкий вариант. Из открытых баз данных, литературных источников, а также по результатам полнотеномного анализа мгДНК одного пациента с m.1494C>T, обнаруженного в настоящей работе, нами был проведен анализ митохондриальных линий для 27 пациентов из разных регионов мира, у которых был обнаружен данный ультраредкий вариант. У пациентов с m.1494C>T идентифицировано 19 различных галлогрупп мгДНК, что, вероятно, свидетельствует о независимом возникновении варианта m.1494C>T. Однако в спектре выявленных галлогрупп мы обнаружили преобладание галлогруппы A*, частота которой в 13 раз превышала (χ2 = 45.274, p < 0.001) среднее значение частоты данной галлогруппы в изученных ранее популяциях мира (1.45%, 519/35748). Избыточность галлогруппы A* у индивидов с m.1494C>T может являться следствием их общего происхождения. Вероятность влияния эффекта основателя на распространенность MT-RNR1 повышает релевантность целенаправленного поиска m.1494C>T в ранее неисследованных когортах пациентов с нарушениями слуха, в первую очередь в регионах, где встречается галлогруппа A* и ее дочерняя линия А2, - в Азии и в Америке.
AB - Вклад в этиологию потери слуха ультраредкого варианта m.1494C>T гена MT-RNR1 мгДНК, ассоциированного с аминогликозид-индуцированной глухотой (MT-RNR1, OMIM 561000), остается нензученным в большинстве выборок индивидов с нарушениями слуха. В связи с этим цель настоящей работы - скрининг m.1494C>T гена MT-RNR1 мгДНК среди пациентов с нарушениями слуха в Республике Бурятия, с последующим анализом выявленных в мире митохондриальных линий, несущих данный ультраредкий вариант. Из открытых баз данных, литературных источников, а также по результатам полнотеномного анализа мгДНК одного пациента с m.1494C>T, обнаруженного в настоящей работе, нами был проведен анализ митохондриальных линий для 27 пациентов из разных регионов мира, у которых был обнаружен данный ультраредкий вариант. У пациентов с m.1494C>T идентифицировано 19 различных галлогрупп мгДНК, что, вероятно, свидетельствует о независимом возникновении варианта m.1494C>T. Однако в спектре выявленных галлогрупп мы обнаружили преобладание галлогруппы A*, частота которой в 13 раз превышала (χ2 = 45.274, p < 0.001) среднее значение частоты данной галлогруппы в изученных ранее популяциях мира (1.45%, 519/35748). Избыточность галлогруппы A* у индивидов с m.1494C>T может являться следствием их общего происхождения. Вероятность влияния эффекта основателя на распространенность MT-RNR1 повышает релевантность целенаправленного поиска m.1494C>T в ранее неисследованных когортах пациентов с нарушениями слуха, в первую очередь в регионах, где встречается галлогруппа A* и ее дочерняя линия А2, - в Азии и в Америке.
KW - M.1494C>T
KW - ГЕН MT-RNR1
KW - АМИНОГЛИКОЗИД-ИНДУЦИРОВАННАЯ ПОТЕРЯ СЛУХА
KW - МГДНК
KW - ГАПЛОГРУППА A
KW - РЕГИОН ОЗ. БАЙКАЛ
UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=82972662
U2 - 10.31857/S0016675825080071
DO - 10.31857/S0016675825080071
M3 - статья
VL - 61
SP - 70
EP - 86
JO - Генетика
JF - Генетика
SN - 0016-6758
IS - 8
ER -
ID: 74607156