Standard

Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России. / Limonova, A. S.; Ershova, A. I.; Kiseleva, A. V. и др.

в: Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation), Том 22, № 12-1, 6, 2023, стр. 55-61.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

Harvard

Limonova, AS, Ershova, AI, Kiseleva, AV, Kutsenko, VA, Ramensky, VE, Vyatkin, YV, Sotnikova, EA, Zharikova, AA, Zaichenoka, M, Pokrovskaya, MS, Shalnova, SA, Meshkov, AN & Drapkina, OM 2023, 'Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России', Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation), Том. 22, № 12-1, 6, стр. 55-61. https://doi.org/10.15829/1728-8800-2023-3801

APA

Limonova, A. S., Ershova, A. I., Kiseleva, A. V., Kutsenko, V. A., Ramensky, V. E., Vyatkin, Y. V., Sotnikova, E. A., Zharikova, A. A., Zaichenoka, M., Pokrovskaya, M. S., Shalnova, S. A., Meshkov, A. N., & Drapkina, O. M. (2023). Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России. Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation), 22(12-1), 55-61. [6]. https://doi.org/10.15829/1728-8800-2023-3801

Vancouver

Limonova AS, Ershova AI, Kiseleva AV, Kutsenko VA, Ramensky VE, Vyatkin YV и др. Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России. Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation). 2023;22(12-1):55-61. 6. doi: 10.15829/1728-8800-2023-3801

Author

Limonova, A. S. ; Ershova, A. I. ; Kiseleva, A. V. и др. / Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России. в: Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation). 2023 ; Том 22, № 12-1. стр. 55-61.

BibTeX

@article{32b47e5b639a47fda6fd43c2be8f68de,
title = "Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России",
abstract = "Цель. Провести валидацию и оценить точность 4 шкал генетического риска (ШГР) артериальной гипертензии (АГ), созданных ранее на европейских выборках, на популяционной выборке населения Ивановской области.Материал и методы. Для генетического анализа было использовано секвенирование следующего поколения с использованием таргетной панели на выборке региона Центральной России (n=1682) на основе коллекции биобанка. Для валидации отобрано четыре ШГР, ассоциированных с АГ, ранее разработанных для европейской популяции. В качестве метрик качества для моделей регрессии использованы коэффициент детерминации и площадь под ROC-кривой. Проведена дополнительная валидация с включением всех вариантов нуклеотидной последовательности, независимо от уровня их неравновесного сцепления. Составлена объединенная ШГР на основе коэффициентов из отдельных ШГР методом C+T (clumping + thresholding).Результаты. В рамках исследования было продемонстрировано, что предсказательная способность ранее разработанных ШГР при использовании для популяции региона Центральной России ниже, чем в оригинальных исследованиях, доля объясненной дисперсии составила 0,5-0,8%. Наилучшую предсказательную способность (доля объясненной дисперсии - 2,5%) продемонстрировало применение ранее разработанной ШГР (Evangelou E, et al., 2018), включающей наибольшее количество вариантов нуклеотидной последовательности (n=852).Заключение. ШГР АГ, разработанные на европейских выборках, не рекомендуется использовать у представителей российской популяции без предварительной валидации. Для создания собственных ШГР не рекомендуется объединять статистические параметры (β-коэффициенты и p-value) из различных ШГР с целю создания собственных ШГР.",
keywords = "genetic risk score, hypertension, population study, validation",
author = "Limonova, {A. S.} and Ershova, {A. I.} and Kiseleva, {A. V.} and Kutsenko, {V. A.} and Ramensky, {V. E.} and Vyatkin, {Yu V.} and Sotnikova, {E. A.} and Zharikova, {A. A.} and M. Zaichenoka and Pokrovskaya, {M. S.} and Shalnova, {S. A.} and Meshkov, {A. N.} and Drapkina, {O. M.}",
note = "Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России / А. С. Лимонова, А. И. Ершова, А. В. Киселева [и др.] // Кардиоваскулярная терапия и профилактика. – 2023. – Т. 22. - № 12. – С. 55-61. Научно-исследовательская работа {"}Разработка интегрированных систем прогнозирования в персонализированной медицине{"}. Рег. № 121021700364-1. Публикация для корректировки.",
year = "2023",
doi = "10.15829/1728-8800-2023-3801",
language = "русский",
volume = "22",
pages = "55--61",
journal = "Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation)",
issn = "1728-8800",
publisher = "Vserossiiskoe Obshchestvo Kardiologov",
number = "12-1",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России

AU - Limonova, A. S.

AU - Ershova, A. I.

AU - Kiseleva, A. V.

AU - Kutsenko, V. A.

AU - Ramensky, V. E.

AU - Vyatkin, Yu V.

AU - Sotnikova, E. A.

AU - Zharikova, A. A.

AU - Zaichenoka, M.

AU - Pokrovskaya, M. S.

AU - Shalnova, S. A.

AU - Meshkov, A. N.

AU - Drapkina, O. M.

N1 - Валидация шкал генетического риска развития артериальной гипертензии на популяции региона Центральной России / А. С. Лимонова, А. И. Ершова, А. В. Киселева [и др.] // Кардиоваскулярная терапия и профилактика. – 2023. – Т. 22. - № 12. – С. 55-61. Научно-исследовательская работа "Разработка интегрированных систем прогнозирования в персонализированной медицине". Рег. № 121021700364-1. Публикация для корректировки.

PY - 2023

Y1 - 2023

N2 - Цель. Провести валидацию и оценить точность 4 шкал генетического риска (ШГР) артериальной гипертензии (АГ), созданных ранее на европейских выборках, на популяционной выборке населения Ивановской области.Материал и методы. Для генетического анализа было использовано секвенирование следующего поколения с использованием таргетной панели на выборке региона Центральной России (n=1682) на основе коллекции биобанка. Для валидации отобрано четыре ШГР, ассоциированных с АГ, ранее разработанных для европейской популяции. В качестве метрик качества для моделей регрессии использованы коэффициент детерминации и площадь под ROC-кривой. Проведена дополнительная валидация с включением всех вариантов нуклеотидной последовательности, независимо от уровня их неравновесного сцепления. Составлена объединенная ШГР на основе коэффициентов из отдельных ШГР методом C+T (clumping + thresholding).Результаты. В рамках исследования было продемонстрировано, что предсказательная способность ранее разработанных ШГР при использовании для популяции региона Центральной России ниже, чем в оригинальных исследованиях, доля объясненной дисперсии составила 0,5-0,8%. Наилучшую предсказательную способность (доля объясненной дисперсии - 2,5%) продемонстрировало применение ранее разработанной ШГР (Evangelou E, et al., 2018), включающей наибольшее количество вариантов нуклеотидной последовательности (n=852).Заключение. ШГР АГ, разработанные на европейских выборках, не рекомендуется использовать у представителей российской популяции без предварительной валидации. Для создания собственных ШГР не рекомендуется объединять статистические параметры (β-коэффициенты и p-value) из различных ШГР с целю создания собственных ШГР.

AB - Цель. Провести валидацию и оценить точность 4 шкал генетического риска (ШГР) артериальной гипертензии (АГ), созданных ранее на европейских выборках, на популяционной выборке населения Ивановской области.Материал и методы. Для генетического анализа было использовано секвенирование следующего поколения с использованием таргетной панели на выборке региона Центральной России (n=1682) на основе коллекции биобанка. Для валидации отобрано четыре ШГР, ассоциированных с АГ, ранее разработанных для европейской популяции. В качестве метрик качества для моделей регрессии использованы коэффициент детерминации и площадь под ROC-кривой. Проведена дополнительная валидация с включением всех вариантов нуклеотидной последовательности, независимо от уровня их неравновесного сцепления. Составлена объединенная ШГР на основе коэффициентов из отдельных ШГР методом C+T (clumping + thresholding).Результаты. В рамках исследования было продемонстрировано, что предсказательная способность ранее разработанных ШГР при использовании для популяции региона Центральной России ниже, чем в оригинальных исследованиях, доля объясненной дисперсии составила 0,5-0,8%. Наилучшую предсказательную способность (доля объясненной дисперсии - 2,5%) продемонстрировало применение ранее разработанной ШГР (Evangelou E, et al., 2018), включающей наибольшее количество вариантов нуклеотидной последовательности (n=852).Заключение. ШГР АГ, разработанные на европейских выборках, не рекомендуется использовать у представителей российской популяции без предварительной валидации. Для создания собственных ШГР не рекомендуется объединять статистические параметры (β-коэффициенты и p-value) из различных ШГР с целю создания собственных ШГР.

KW - genetic risk score

KW - hypertension

KW - population study

KW - validation

UR - https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85181114363&origin=inward&txGid=d8de82bab0a9bf73000692f174f40eda

UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=60001845

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/ff29351f-2a21-3961-aabd-6098ecd79629/

U2 - 10.15829/1728-8800-2023-3801

DO - 10.15829/1728-8800-2023-3801

M3 - статья

VL - 22

SP - 55

EP - 61

JO - Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation)

JF - Cardiovascular Therapy and Prevention (Russian Federation)

SN - 1728-8800

IS - 12-1

M1 - 6

ER -

ID: 59731671