Standard

Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами. / Булыгин, Анатолий Алексеевич; Кузнецова, А.А.; Федорова, Ольга Семеновна и др.

в: Molekulyarnaya Biologiya, Том 57, № 2, 5, 2023, стр. 185-196.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

Harvard

APA

Vancouver

Булыгин АА, Кузнецова АА, Федорова ОС, Кузнецов НА. Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами. Molekulyarnaya Biologiya. 2023;57(2):185-196. 5. doi: 10.31857/S0026898423020040

Author

Булыгин, Анатолий Алексеевич ; Кузнецова, А.А. ; Федорова, Ольга Семеновна и др. / Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами. в: Molekulyarnaya Biologiya. 2023 ; Том 57, № 2. стр. 185-196.

BibTeX

@article{02c8e49ac9b640afaa765e2b75fbe63c,
title = "Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами",
abstract = "ДНК-полимеразы катализируют синтез ДНК при репликации, репарации и рекомбинации ДНК. Ряд ДНК-полимераз, например полимераза Taq из Thermus aquaticus, нашли применение в различных приложениях молекулярной биологии и биотехнологии, в частности, в качестве инструментов амплификации ДНК. Однако эффективность этих ферментов зависит от таких факторов, как происхождение ДНК, состав праймера, длина и GC-содержание матрицы, способность формировать стабильные вторичные структуры. Подобные ограничения делают актуальным поиск новых ферментов с улучшенными свойствами. В нашем обзоре рассмотрены основные структурные и молекулярно-кинетические особенности функционирования ДНК-полимераз, принадлежащих к структурному семейству А, включая Taq-полимеразу. Филогенетический анализ этих ферментов позволил установить высококонсервативный консенсусный “слепок”, содержащий 62 аминокислотных остатка, распределенных по структуре фермента. Сравнительный анализ этих аминокислотных остатков у малоизученных ДНК-полимераз позволил выявить семь ферментов, потенциально обладающих свойствами, необходимыми для их использования в амплификации ДНК.",
keywords = "БЕЛКОВО-НУКЛЕИНОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ, ДНК-ПОЛИМЕРАЗА, СТРУКТУРНОЕ СЕМЕЙСТВО, КАТАЛИТИЧЕСКИЙ МЕХАНИЗМ, АКТИВНЫЙ ЦЕНТР, КИНЕТИКА",
author = "Булыгин, {Анатолий Алексеевич} and А.А. Кузнецова and Федорова, {Ольга Семеновна} and Кузнецов, {Никита Александрович}",
note = "Булыгин А.А., Кузнецова А.А., Федорова О.С., Кузнецов Н.А. Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами // Молекулярная биология. – 2023. – Т. 57. - № 2. – С. 185-196.",
year = "2023",
doi = "10.31857/S0026898423020040",
language = "русский",
volume = "57",
pages = "185--196",
journal = "Molekulyarnaya Biologiya",
issn = "0026-8984",
publisher = "Russian Academy of Sciences",
number = "2",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами

AU - Булыгин, Анатолий Алексеевич

AU - Кузнецова, А.А.

AU - Федорова, Ольга Семеновна

AU - Кузнецов, Никита Александрович

N1 - Булыгин А.А., Кузнецова А.А., Федорова О.С., Кузнецов Н.А. Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами // Молекулярная биология. – 2023. – Т. 57. - № 2. – С. 185-196.

PY - 2023

Y1 - 2023

N2 - ДНК-полимеразы катализируют синтез ДНК при репликации, репарации и рекомбинации ДНК. Ряд ДНК-полимераз, например полимераза Taq из Thermus aquaticus, нашли применение в различных приложениях молекулярной биологии и биотехнологии, в частности, в качестве инструментов амплификации ДНК. Однако эффективность этих ферментов зависит от таких факторов, как происхождение ДНК, состав праймера, длина и GC-содержание матрицы, способность формировать стабильные вторичные структуры. Подобные ограничения делают актуальным поиск новых ферментов с улучшенными свойствами. В нашем обзоре рассмотрены основные структурные и молекулярно-кинетические особенности функционирования ДНК-полимераз, принадлежащих к структурному семейству А, включая Taq-полимеразу. Филогенетический анализ этих ферментов позволил установить высококонсервативный консенсусный “слепок”, содержащий 62 аминокислотных остатка, распределенных по структуре фермента. Сравнительный анализ этих аминокислотных остатков у малоизученных ДНК-полимераз позволил выявить семь ферментов, потенциально обладающих свойствами, необходимыми для их использования в амплификации ДНК.

AB - ДНК-полимеразы катализируют синтез ДНК при репликации, репарации и рекомбинации ДНК. Ряд ДНК-полимераз, например полимераза Taq из Thermus aquaticus, нашли применение в различных приложениях молекулярной биологии и биотехнологии, в частности, в качестве инструментов амплификации ДНК. Однако эффективность этих ферментов зависит от таких факторов, как происхождение ДНК, состав праймера, длина и GC-содержание матрицы, способность формировать стабильные вторичные структуры. Подобные ограничения делают актуальным поиск новых ферментов с улучшенными свойствами. В нашем обзоре рассмотрены основные структурные и молекулярно-кинетические особенности функционирования ДНК-полимераз, принадлежащих к структурному семейству А, включая Taq-полимеразу. Филогенетический анализ этих ферментов позволил установить высококонсервативный консенсусный “слепок”, содержащий 62 аминокислотных остатка, распределенных по структуре фермента. Сравнительный анализ этих аминокислотных остатков у малоизученных ДНК-полимераз позволил выявить семь ферментов, потенциально обладающих свойствами, необходимыми для их использования в амплификации ДНК.

KW - БЕЛКОВО-НУКЛЕИНОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

KW - ДНК-ПОЛИМЕРАЗА

KW - СТРУКТУРНОЕ СЕМЕЙСТВО

KW - КАТАЛИТИЧЕСКИЙ МЕХАНИЗМ

KW - АКТИВНЫЙ ЦЕНТР

KW - КИНЕТИКА

UR - https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85151575364&origin=inward&txGid=b887b8c03ea9e36b666075fb0ff27cd8

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=50434613

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/c7c3af76-c49c-3990-a18d-0315e3d05395/

U2 - 10.31857/S0026898423020040

DO - 10.31857/S0026898423020040

M3 - статья

VL - 57

SP - 185

EP - 196

JO - Molekulyarnaya Biologiya

JF - Molekulyarnaya Biologiya

SN - 0026-8984

IS - 2

M1 - 5

ER -

ID: 48781964