Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами. / Булыгин, Анатолий Алексеевич; Кузнецова, А.А.; Федорова, Ольга Семеновна et al.
In: Molekulyarnaya Biologiya, Vol. 57, No. 2, 5, 2023, p. 185-196.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами
AU - Булыгин, Анатолий Алексеевич
AU - Кузнецова, А.А.
AU - Федорова, Ольга Семеновна
AU - Кузнецов, Никита Александрович
N1 - Булыгин А.А., Кузнецова А.А., Федорова О.С., Кузнецов Н.А. Сравнительный анализ ДНК-полимераз семейства А как инструмент поиска ферментов с новыми свойствами // Молекулярная биология. – 2023. – Т. 57. - № 2. – С. 185-196.
PY - 2023
Y1 - 2023
N2 - ДНК-полимеразы катализируют синтез ДНК при репликации, репарации и рекомбинации ДНК. Ряд ДНК-полимераз, например полимераза Taq из Thermus aquaticus, нашли применение в различных приложениях молекулярной биологии и биотехнологии, в частности, в качестве инструментов амплификации ДНК. Однако эффективность этих ферментов зависит от таких факторов, как происхождение ДНК, состав праймера, длина и GC-содержание матрицы, способность формировать стабильные вторичные структуры. Подобные ограничения делают актуальным поиск новых ферментов с улучшенными свойствами. В нашем обзоре рассмотрены основные структурные и молекулярно-кинетические особенности функционирования ДНК-полимераз, принадлежащих к структурному семейству А, включая Taq-полимеразу. Филогенетический анализ этих ферментов позволил установить высококонсервативный консенсусный “слепок”, содержащий 62 аминокислотных остатка, распределенных по структуре фермента. Сравнительный анализ этих аминокислотных остатков у малоизученных ДНК-полимераз позволил выявить семь ферментов, потенциально обладающих свойствами, необходимыми для их использования в амплификации ДНК.
AB - ДНК-полимеразы катализируют синтез ДНК при репликации, репарации и рекомбинации ДНК. Ряд ДНК-полимераз, например полимераза Taq из Thermus aquaticus, нашли применение в различных приложениях молекулярной биологии и биотехнологии, в частности, в качестве инструментов амплификации ДНК. Однако эффективность этих ферментов зависит от таких факторов, как происхождение ДНК, состав праймера, длина и GC-содержание матрицы, способность формировать стабильные вторичные структуры. Подобные ограничения делают актуальным поиск новых ферментов с улучшенными свойствами. В нашем обзоре рассмотрены основные структурные и молекулярно-кинетические особенности функционирования ДНК-полимераз, принадлежащих к структурному семейству А, включая Taq-полимеразу. Филогенетический анализ этих ферментов позволил установить высококонсервативный консенсусный “слепок”, содержащий 62 аминокислотных остатка, распределенных по структуре фермента. Сравнительный анализ этих аминокислотных остатков у малоизученных ДНК-полимераз позволил выявить семь ферментов, потенциально обладающих свойствами, необходимыми для их использования в амплификации ДНК.
KW - БЕЛКОВО-НУКЛЕИНОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
KW - ДНК-ПОЛИМЕРАЗА
KW - СТРУКТУРНОЕ СЕМЕЙСТВО
KW - КАТАЛИТИЧЕСКИЙ МЕХАНИЗМ
KW - АКТИВНЫЙ ЦЕНТР
KW - КИНЕТИКА
UR - https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85151575364&origin=inward&txGid=b887b8c03ea9e36b666075fb0ff27cd8
UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=50434613
UR - https://www.mendeley.com/catalogue/c7c3af76-c49c-3990-a18d-0315e3d05395/
U2 - 10.31857/S0026898423020040
DO - 10.31857/S0026898423020040
M3 - статья
VL - 57
SP - 185
EP - 196
JO - Molekulyarnaya Biologiya
JF - Molekulyarnaya Biologiya
SN - 0026-8984
IS - 2
M1 - 5
ER -
ID: 48781964