CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Web-MCOT Server for Motif Co-Occurrence Search in ChIP-Seq Data

Levitsky, V. G., Mukhin, A. M., Oshchepkov, D. Y., Zemlyanskaya, E. V. & Lashin, S. A., 11 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8981.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2

Tsukanov, A. V., Levitsky, V. G. & Merkulova, T. I., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 7-17 11 стр., 1.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in drosophila interphase chromosomes

Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Moshkin, Y. M. & Zhimulev, I. F., 1 дек. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 23, стр. 1-10 10 стр., 9282.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование