Reconstruction and analysis of the gene regulatory network for cell wall function in Arabidopsis thaliana L. leaves in response to water deficit

Volyanskaya, A. R., Antropova, E. A., Zubairova, U. S., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Orlov, Y. L., Makarova, A. A., Ivanisenko, T. V., Gorshkova, T. A., Aglyamova, A. R., Kolchanov, N. A., Chen, M. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1031-1041 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Meet your MAKR: the membrane-associated kinase regulator protein family in the regulation of plant development

Novikova, D. D., Korosteleva, A. L., Mironova, V. & Jaillais, Y., окт. 2022, в: FEBS Journal. 289, 20, стр. 6172-6186 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

A PLETHORA/PIN-FORMED/auxin network mediates prehaustorium formation in the parasitic plant Striga hermonthica

Xiao, T. T., Kirschner, G. K., Kountche, B. A., Jamil, M., Savina, M., Lube, V., Mironova, V., Al Babili, S. & Blilou, I., авг. 2022, в: Plant Physiology. 189, 4, стр. 2281-2297 17 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Prioritization of biological processes based on the reconstruction and analysis of associative gene networks describing the response of plants to adverse environmental factors

Demenkov, P. S., Oshchepkova, E. A., Ivanisenko, T. V. & Ivanisenko, V. A., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 580-592 13 стр., 13.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Комплексный анализ влияния аллельного полиморфизма 5-HTTLPR на поведенческие и нейрофизиологические показатели исполнительного контроля у людей из разных этнических групп в Сибири

Savostyanov, A. N., Bazovkina, D. V., Lashin, S. A., Tamozhnikov, S. S., Saprygin, A. E., Astakhova, T. N., Kavai-Ool, U. N., Borisova, N. V. & Karpova, A. G., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 593-602 10 стр., 14.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Image-based wheat fungi diseases identification by deep learning

Genaev, M. A., Skolotneva, E. S., Gultyaeva, E. I., Orlova, E. A., Bechtold, N. P. & Afonnikov, D. A., авг. 2021, в: Plants. 10, 8, 1500.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы

Afonnikov, D. A., Sinitsyna, O. I., Golubeva, T. S., Shmakov, N. A. & Kochetov, A. V., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 251-259 9 стр., 1.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2

Tsukanov, A. V., Levitsky, V. G. & Merkulova, T. I., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 7-17 11 стр., 1.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Поиск участников сигнального пути ауксина к его транспортерам PIN на основе метаанализа транскриптомов, индуцированных ауксином

Kovrizhnykh, V. V., Mustafin, Z. S. & Bagautdinova, Z. Z., янв. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 39-45 7 стр., 4.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Филостратиграфический анализ генных сетей заболеваний человека

Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., янв. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 46-56 11 стр., 5.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Hypoxia exerts oxidative stress and changes in expression of antioxidant enzyme genes in gills of Mytilus galloprovincialis (Lamarck, 1819)

Andreyeva, A. Y., Gostyukhina, O. L., Kladchenko, E. S., Afonnikov, D. A., Rasskazov, D. A., Lantushenko, A. O. & Vodiasova, E. A., 2021, в: Marine Biology Research. 17, 4, стр. 369-379 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Вироид веретеновидности клубней картофеля

Kochetov, A. V., Pronozin, A. Y., Shatskaya, N. V., Afonnikov, D. A. & Afanasenko, O. S., 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 269-275 7 стр., 3.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Определение количественного содержания хлорофиллов в листьях по спектрам отражения алгоритмом случайного леса

Urbanovich, E. A., Afonnikov, D. A. & Nikolaev, S. V., 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 64-70 7 стр., 7.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Complex assessment of pathogenicity of novel variant c.516G > C (p.Trp172Cys) in the GJB2 gene associated with hearing loss in indigenous peoples of Southern Siberia (Russia)

Maslova, E. A., Zytsar, M. V., Danilchenko, V. Y., Orishchenko, K. E. & Posukh, O. L., 1 дек. 2020, в: European journal of human genetics. 28, Suppl 1, стр. 191-192 2 стр., P02.27.B.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in drosophila interphase chromosomes

Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Moshkin, Y. M. & Zhimulev, I. F., 1 дек. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 23, стр. 1-10 10 стр., 9282.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: An analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia

Romanov, G. P., Pshennikova, V. G., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Teryutin, F. M., Cherdonova, A. M., Borisova, T. V., Sazonov, N. N., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L., Fedorova, S. A. & Barashkov, N. A., нояб. 2020, в: PLoS ONE. 15, 11 November, стр. e0242219 e0242219.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Meta-analysis of transcriptome data detected new potential players in response to dioxin exposure in humans

Oshchepkova, E., Sizentsova, Y., Wiebe, D., Mironova, V. & Kolchanov, N., 23 окт. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 21, стр. 1-20 20 стр., 7858.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Cell Dynamics in WOX5-Overexpressing Root Tips: The Impact of Local Auxin Biosynthesis

Savina, M. S., Pasternak, T., Omelyanchuk, N. A., Novikova, D. D., Palme, K., Mironova, V. V. & Lavrekha, V. V., 22 окт. 2020, в: Frontiers in Plant Science. 11, 13 стр., 560169.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The phylogeny of class b flavoprotein monooxygenases and the origin of the yucca protein family

Turnaev, I. I., Gunbin, K. V., Suslov, V. V., Akberdin, I. R., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 сент. 2020, в: Plants. 9, 9, стр. 1-22 22 стр., 1092.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Rocks in the auxin stream: Wound-induced auxin accumulation and ERF115 expression synergistically drive stem cell regeneration

Canher, B., Heyman, J., Savina, M., Devendran, A., Eekhout, T., Vercauteren, I., Prinsen, E., Matosevich, R., Xu, J., Mironova, V. & de Veylder, L., 14 июл. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 28, стр. 16667-16677 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

High rates of three common GJB2 mutations c.516g>c, c.-23+1g>a, c.235delc in deaf patients from southern siberia are due to the founder effect

Zytsar, M. V., Bady-Khoo, M. S., Danilchenko, V. Y., Maslova, E. A., Barashkov, N. A., Morozov, I. V., Bondar, A. A. & Posukh, O. L., 1 июл. 2020, в: Genes. 11, 7, стр. 1-17 17 стр., 833.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Analysis of color and texture characteristics of cereals on digital images

Komyshev, E. G., Genaev, M. A. & Afonnikov, D. A., июл. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 4, стр. 340-347 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

metaRE R package for meta-analysis of transcriptome data to identify the cis-regulatory code behind the transcriptional reprogramming

Novikova, D. D., Cherenkov, P. A., Sizentsova, Y. G. & Mironova, V. V., 1 июн. 2020, в: Genes. 11, 6, стр. 1-14 14 стр., 634.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

On-target CRISPR/CAS9 activity can cause undesigned large deletion in mouse zygotes

Korablev, A., Lukyanchikova, V., Serova, I. & Battulin, N., 20 мая 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 10, 14 стр., 3604.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fold-change-specific enrichment analysis (FSEA): Quantification of transcriptional response magnitude for functional gene groups

Wiebe, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mukhin, A. M., Grosse, I., Lashin, S. A., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V. V., 17 апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 14 стр., 434.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in drosophila melanogaster polytene chromosomes

Khoroshko, V. A., Pokholkova, G. V., Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Antonenko, O. V., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 32 стр., 417.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2020, в: Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Использование гиперспектральной камеры Specim IQ для анализа растений

Alt, V. V., Gurova, T. A., Elkin, O. V., Klimenko, D. N., Maximov, L. V., Pestunov, I. A., Dubrovskaya, O. A., Genaev, M. A., Erst, T. V., Genaev, K. A., Komyshev, E. G., Khlestkin, V. K. & Afonnikov, D. A., 1 мар. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 3, стр. 259-266 8 стр., 6.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Computer Simulation of the Evolution of Microbial Population: Overcoming Local Minima When Reaching a Peak on the Fitness Landscape

Lashin, S. A., Mustafin, Z. S., Klimenko, A. I., Afonnikov, D. A. & Matushkin, Y. G., 1 февр. 2020, в: Russian Journal of Genetics. 56, 2, стр. 242-252 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain

Pavlova, A. S., Ozhegov, G. D., Arapidi, G. P., Butenko, I. O., Fomin, E. S., Alemasov, N. A., Afonnikov, D. A., Yarullina, D. R., Ivanov, V. T., Govorun, V. M. & Kayumov, A. R., 1 февр. 2020, в: Protein Journal. 39, 1, стр. 73-84 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The Effect of Meditation on Comprehension of Statements About One-Self and Others: A Pilot ERP and Behavioral Study

Savostyanov, A., Tamozhnikov, S., Bocharov, A., Saprygin, A., Matushkin, Y., Lashin, S., Kolpakova, G., Sudobin, K. & Knyazev, G., 9 янв. 2020, в: Frontiers in Human Neuroscience. 13, 12 стр., 437.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

3D Analysis of Mitosis Distribution Pattern in the Plant Root Tip with iRoCS Toolbox

Lavrekha, V. V., Pasternak, T., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 янв. 2020, в: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2094, стр. 119-125 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

PlantLayout pipeline to model tissue patterning

Savina, M. S. & Mironova, V. V., 1 янв. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 1, стр. 102-107 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Rdbms And Nosql Based Hybrid Technology for Transcriptome Data Structuring and Processing

Mukhin, A. M., Genaev, M. A., Rasskazov, D. A., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 2, стр. 455-470 16 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Изучение функциональной значимости варианта с.516G>C (p.Trp172Cys) гена GJB2, ассоциированного с потерей слуха у коренного населения Южной Сибири

Маслова, Е. А., Зыцарь, М. В., Danilchenko, V. Y., Орищенко, К. Е. & Посух, О. Л., 2020, в: Медицинская генетика. 19, 7, стр. 51-53 3 стр., 21.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The mTOR signaling pathway activity and vitamin d availability control the expression of most autism predisposition genes

Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 15 дек. 2019, в: International Journal of Molecular Sciences. 20, 24, 14 стр., 6332.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A single-cell view of tissue regeneration in plants

Mironova, V. & Xu, J., дек. 2019, в: Current Opinion in Plant Biology. 52, стр. 149-154 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Phylostratigraphic analysis shows the earliest origination of the abiotic stress associated genes in a. Thaliana

Mustafin, Z. S., Zamyatin, V. I., Konstantinov, D. K., Doroshkov, A. V., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 22 нояб. 2019, в: Genes. 10, 12, 27 стр., 963.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genotoxic activity of 1,2,3-triazolyl modified furocoumarins and 2,3-dihydrofurocoumarins

Kremis, S. A., Baev, D. S., Lipeeva, A. V., Shults, E. E., Tolstikova, T. G., Sinitsyna, O. I., Kochetov, A. V. & Frolova, T. S., 1 нояб. 2019, в: Journal of Biochemical and Molecular Toxicology. 33, 11, стр. e22396 6 стр., e22396.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities

Ivanov, R., Zamyatin, V., Klimenko, A., Matushkin, Y., Savostyanov, A. & Lashin, S., 11 сент. 2019, в: Genes. 10, 9, 14 стр., 699.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Shaping Ethylene Response: The Role of EIN3/EIL1 Transcription Factors

Dolgikh, V. A., Pukhovaya, E. M. & Zemlyanskaya, E. V., 26 авг. 2019, в: Frontiers in Plant Science. 10, стр. 1030 9 стр., 1030.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Morphometry of the wheat spike by analyzing 2D images

Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Smirnov, N. V., Kruchinina, Y. V., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 17 июл. 2019, в: Agronomy. 9, 7, 390.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A new version of the large pressure jump (T-LPJ)method for dynamic study of pressure-initiated adsorptive cycles for heat storage and transformation

Tokarev, M. M., Zlobin, A. A. & Aristov, Y. I., 15 июл. 2019, в: Energy. 179, стр. 542-548 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Salicylic Acid Affects Root Meristem Patterning via Auxin Distribution in a Concentration-Dependent Manner

Pasternak, T., Groot, E. P., Kazantsev, F. V., Teale, W., Omelyanchuk, N., Kovrizhnykh, V., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 июл. 2019, в: Plant Physiology. 180, 3, стр. 1725-1739 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Insight into genetic and social aspects of modern communities of deaf people in Siberia for forecasting the prevalence of hereditary deafness

Posukh, O. L., Bady-Khoo, M. S., Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Smirnova, A. A., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Danilchenko, V. Y., Posukh, O. V. & Lashin, S. A., июл. 2019, в: European journal of human genetics. 27, стр. 1038-1038 1 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Capturing Auxin Response Factors Syntax Using DNA Binding Models

Stigliani, A., Martin-Arevalillo, R., Lucas, J., Bessy, A., Vinos-Poyo, T., Mironova, V., Vernoux, T., Dumas, R. & Parcy, F., 3 июн. 2019, в: Molecular Plant. 12, 6, стр. 822-832 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fluorescent labeling of ursolic acid with FITC for investigation of its cytotoxic activity using confocal microscopy

Frolova, T. S., Lipeeva, A. V., Baev, D. S., Baiborodin, S. I., Orishchenko, К. E., Kochetov, A. V. & Sinitsyna, O. I., 1 июн. 2019, в: Bioorganic Chemistry. 87, стр. 876-887 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes

Ershov, N. I., Mordvinov, V. A., Prokhortchouk, E. B., Pakharukova, M. Y., Gunbin, K. V., Ustyantsev, K., Genaev, M. A., Blinov, A. G., Mazur, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Khrameeva, E., Chekanov, N., Fan, G., Xiao, A., Zhang, H., Xu, X., Yang, H., Solovyev, V., Lee, S. M. Y., еще 3Liu, X., Afonnikov, D. A. & Skryabin, K. G., 22 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, 1, стр. 399 22 стр., 399.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study

Klimenko, A. I., Matushkin, Y. G., Kolchanov, N. A. & Lashin, S. A., 1 мая 2019, в: Ecological Modelling. 399, стр. 66-76 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genetic control of anthocyanin pigmentation of potato tissues

Strygina, K. V., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 18 мар. 2019, в: BMC Genetics. 20, Suppl 1, стр. 27 9 стр., 27.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development

Doroshkov, A. V., Konstantinov, D. K., Afonnikov, D. A. & Gunbin, K. V., 15 февр. 2019, в: BMC Plant Biology. 19, Suppl 1, 15 стр., 53.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MIGREW: Database on molecular identification of genes for resistance in wheat

Kazantsev, F. V., Skolotneva, E. S., Kelbin, V. N., Salina, E. A. & Lashin, S. A., 5 февр. 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, Suppl 1, 8 стр., 36.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Image-based analysis of quantitative morphological characteristics of wild potato tubers using the desktop application SeedСounter

Ivanova, K. A., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Egorova, A. A., Koloshina, K. A., Chalaya, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V., Rogozina, E. V. & Gerasimova, S. V., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 5, стр. 519-526 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Progress in plant genome sequencing: Research directions

Bragina, M. K., Afonnikov, D. A. & Salina, E. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 38-48 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Deciphering auxin-ethylene crosstalk at a systems level

Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V. & Mironova, V. V., 14 дек. 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 12, 15 стр., 4060.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Genetic Organization of Open Chromatin Domains Situated in Polytene Chromosome Interbands in Drosophila

Zykova, T. Y., Popova, O. O., Khoroshko, V. A., Levitsky, V. G., Lavrov, S. A. & Zhimulev, I. F., 1 нояб. 2018, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 483, 1, стр. 297-301 5 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Residue coevolution reveals functionally important intramolecular interactions in formamidopyrimidine-DNA glycosylase

Endutkin, A. V., Koptelov, S. S., Popov, A. V., Torgasheva, N. A., Lomzov, A. A., Tsygankova, A. R., Skiba, T. V., Afonnikov, D. A. & Zharkov, D. O., 1 сент. 2018, в: DNA Repair. 69, стр. 24-33 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Converting Hulled into Naked Barley through Targeted Knock-Out of the Nud1 Gene

Gerasimova, S., Hertig, C., Korotkova, A., Otto, I., Hiekel, S., Kochetov, A., Kumlehn, J. & Khlestkina, E., авг. 2018, в: In Vitro Cellular and Developmental Biology - Plant. 54, стр. S101-S101 1 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Marital Structure, Genetic Fitness, and the GJB2 Gene Mutations among Deaf People in Yakutia (Eastern Siberia, Russia)

Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Teryutin, F. M., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Pshennikova, V. G., Bondar, A. A., Morozov, I. V., Sazonov, N. N., Tomsky, M. I., Dzhemileva, L. U., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L. & Fedorova, S. A., 1 мая 2018, в: Russian Journal of Genetics. 54, 5, стр. 554-561 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Haplotype analysis of APOE intragenic SNPs

Babenko, V. N., Afonnikov, D. A., Ignatieva, E. V., Klimov, A. V., Gusev, F. E. & Rogaev, E. I., 19 апр. 2018, в: BMC Neuroscience. 19, Suppl 1, стр. 16 12 стр., 16.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Polytene chromosomes – A portrait of functional organization of drosophila genome

Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2018, в: Current Genomics. 19, 3, стр. 179-191 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Pluripotency gene network dynamics: System views from parametric analysis

Akberdin, I. R., Omelyanchuk, N. A., Fadeev, S. I., Leskova, N. E., Oschepkova, E. A., Kazantsev, F. V., Matushkin, Y. G., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 29 мар. 2018, в: PLoS ONE. 13, 3, стр. e0194464 24 стр., 0194464.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Spatial specificity of auxin responses coordinates wood formation

Brackmann, K., Qi, J., Gebert, M., Jouannet, V., Schlamp, T., Grünwald, K., Wallner, E. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Agustí, J., Sanchez, P., Lohmann, J. U. & Greb, T., 28 февр. 2018, в: Nature Communications. 9, 1, стр. 875 15 стр., 875.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MAMMOTh: A new database for curated mathematical models of biomolecular systems

Kazantsev, F., Akberdin, I., Lashin, S., Ree, N., Timonov, V., Ratushny, A., Khlebodarova, T. & Likhoshvai, V., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 16 стр., 1740010.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

High temperature and pressure influence the interdomain orientation of Nip7 proteins from P. abyssi and P. furiosus: MD simulations

Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 2 янв. 2018, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 36, 1, стр. 68-82 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

An integrated information system on bioresource collections of the FASO of Russia

Lashin, S. A., Afonnikov, D. A., Genaev, M. A., Kazantsev, F. V., Komyshev, E. G., Oschepkova, E. A., Petrov, A. V., Rasskazov, D. A., Smirnova, A. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 3, стр. 386-393 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Informational resources on potato germplasm collections

Afonnikov, D. A., Totsky, I. V. & Stasevski, Z., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 115-121 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Information system on microbial collections as a part of bioresource collections portal for Russia’s FASO organizations: A working protocol

Kazantsev, F. V., Smirnova, A. A., Rozanov, A. S., Uvarova, Y. E., Afonnikov, D. A., Peltek, S. E. & Lashin, S. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 2, стр. 279-284 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Leaf hairiness in potato Solanum tuberosum: Morphology, function and methods of analysis

Doroshkov, A. V. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 46-53 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

SpikeDroidDB: An information system for annotation of morphometric characteristics of wheat spike

Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Hao, F., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 132-140 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The morphogenic potential of Siberian potato cultivars in tissue cultures

Ibragimova, S. M., Romanova, A. V., Myzgina, G. K. & Kochetov, A. V., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 3, стр. 316-320 5 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis

Kochetov, A. V., Glagoleva, A. Y., Strygina, K. V., Khlestkina, E. K., Gerasimova, S. V., Ibragimova, S. M., Shatskaya, N. V., Vasilyev, G. V., Afonnikov, D. A., Shmakov, N. A., Antonova, O. Y., Gavrilenko, T. A., Alpatyeva, N. V., Khiutti, A. & Afanasenko, O. S., 28 дек. 2017, в: BMC Plant Biology. 17, Suppl 2, стр. 251 10 стр., 251.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and diarch symmetry in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem

Lavrekha, V. V., Pasternak, T., Ivanov, V. B., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 дек. 2017, в: Plant Journal. 92, 5, стр. 834-845 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A database on genes increasing the resistance of wheat and its related species against pathogenic fungi

Smirnova, O. G. & Kochetov, A. V., 1 дек. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 8, стр. 816-821 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene

Glagoleva, A. Y., Shmakov, N. A., Shoeva, O. Y., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Börner, A., Afonnikov, D. A. & Khlestkina, E. K., 14 нояб. 2017, в: BMC Plant Biology. 17, Suppl 1, стр. 182 9 стр., 182.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Achievements and prospects of applying high-throughput sequencing techniques to potato genetics and breeding

Bykova, I. V., Shmakov, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 1 нояб. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 7, стр. 736-743 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Diversity of leaf pubescence in bread wheat and relative species

Pshenichnikova, T. A., Doroshkov, A. V., Simonov, A. V., Afonnikov, D. A. & Börner, A., 1 окт. 2017, в: Genetic Resources and Crop Evolution. 64, 7, стр. 1761-1773 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Sacrifice-for-Survival Mechanism Protects Root Stem Cell Niche from Chilling Stress

Hong, J. H., Savina, M., Du, J., Devendran, A., Kannivadi Ramakanth, K., Tian, X., Sim, W. S., Mironova, V. V. & Xu, J., 29 июн. 2017, в: Cell. 170, 1, стр. 102-113.e14 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Systems biology analysis of the WOX5 gene and its functions in the root stem cell niche

Oshchepkova, E. A., Omelyanchuk, N. A., Savina, M. S., Pasternak, T., Kolchanov, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., 1 июн. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 4, стр. 404-420 17 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Mutational signatures and mutable motifs in cancer genomes

Rogozin, I. B., Pavlov, Y. I., Goncearenco, A., De, S., Lada, A. G., Poliakov, E., Panchenko, A. R. & Cooper, D. N., 30 мая 2017, в: Briefings in Bioinformatics. 19, 6, стр. 1085-1101 17 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Mechanisms regulating ethylene signal transduction in plants

Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ermakov, A. A. & Mironova, V. V., 1 мая 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 3, стр. 335-344 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Identification of residues of the archaeal RNA-binding Nip7 proteins specific to environmental conditions

Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 апр. 2017, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 15, 2, стр. 1650036 18 стр., 1650036.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines

Boldyreva, L. V., Goncharov, F. P., Demakova, O. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Kolesnikov, N. N., Pindyurin, A. V., Semeshin, V. F. & Zhimulev, I. F., 1 апр. 2017, в: Current Genomics. 18, 2, стр. 214-226 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs

Kochetov, A. V., Allmer, J., Klimenko, A. I., Zuraev, B. S., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Hancock, J., 15 мар. 2017, в: Bioinformatics. 33, 6, стр. 923-925 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genome editing system CRISPR/CAS9 and peculiarities of its application in monocots

Gerasimova, S. V., Khlestkina, E. K., Kochetov, A. V. & Shumny, V. K., 1 мар. 2017, в: Russian Journal of Plant Physiology. 64, 2, стр. 141-155 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Status and prospects of marker-assisted and genomic plant breeding

Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Salina, E. A., Pershina, L. A., Khlestkina, E. K. & Shumny, V. K., 1 мар. 2017, в: Herald of the Russian Academy of Sciences. 87, 2, стр. 125-131 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The Systems Biology of Auxin in Developing Embryos

Mironova, V., Teale, W., Shahriari, M., Dawson, J. & Palme, K., 1 мар. 2017, в: Trends in Plant Science. 22, 3, стр. 225-235 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Orthoscape: A cytoscape application for grouping and visualization KEGG based gene networks by taxonomy and homology principles

Mustafin, Z. S., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G., Gunbin, K. V. & Afonnikov, D. A., 27 янв. 2017, в: Bioinformatics. 18, Suppl 1, стр. 1-9 9 стр., 28.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование