Standard

Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы. / Shifon, S A; Karpets, I O; Chesnokova, A S et al.

In: Molekuliarnaia biologiia, Vol. 59, No. 4, 4, 2025, p. 572-586.

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

Harvard

APA

Vancouver

Shifon SA, Karpets IO, Chesnokova AS, Karitskaya PE, Ukladov EO, Evgenov IV et al. Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы. Molekuliarnaia biologiia. 2025;59(4):572-586. 4. doi: 10.31857/S0026898425040041

Author

Shifon, S A ; Karpets, I O ; Chesnokova, A S et al. / Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы. In: Molekuliarnaia biologiia. 2025 ; Vol. 59, No. 4. pp. 572-586.

BibTeX

@article{0f31eaca235c42bda7c4d8b8f14c1f89,
title = "Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы",
abstract = "Формирование резистентности к трастузумабу при HER2-положительном раке молочной железы представляет серьезную проблему, ограничивающую эффективность таргетной терапии. В качестве модели для изучения механизмов развития устойчивости опухолевых клеток к трастузумабу выбрали HER2-положительную клеточную линию BT-474 рака молочной железы люминального B подтипа. Молекулярные механизмы резистентности изучали с использованием комплексного транскриптомного анализа, основанного на сравнении данных RNA-seq трех независимых наборов данных, включающих как чувствительные, так и резистентные к трастузумабу варианты. Проведен многоступенчатый биоинформатический анализ с последующей идентификацией регуляторных взаимодействий. В результате были идентифицированы гены с повышенной (FUCA2, HSPE1, SHLD1, NMD3) и с пониженной экспрессией (GPC5, FSTL1, ATG16L2, POLD2) в резистентных клетках. Установлены ключевые транскрипционные факторы (E2F1, MYC, YBX1, HEY1, NFIC, TFAP2A, AP-1/JUN, NCOA1), регулирующие экспрессию обнаруженных генов при развитии резистентности к трастузумабу. Выявленные изменения указывают на комплексное перепрограммирование транскрипционной активности, затрагивающее процессы, связанные с прохождением клеточного цикла, репарацией ДНК, метаболизмом и эпителиально-мезенхимальным переходом. Полученные результаты расширяют понимание молекулярных механизмов резистентности к трастузумабу и открывают перспективы для разработки новых терапевтических стратегий, направленных на преодоление лекарственной устойчивости при HER2-положительном раке молочной железы.",
keywords = "РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ, HER2+ КЛЕТОЧНАЯ ЛИНИЯ BT-474, ТРАСТУЗУМАБ, РЕЗИСТЕНТНОСТЬ, RNA-SEQ, Humans, Trastuzumab/pharmacology, Drug Resistance, Neoplasm/genetics, Breast Neoplasms/genetics, Cell Line, Tumor, Female, Gene Expression Regulation, Neoplastic/drug effects, Transcriptome, Neoplasm Proteins/genetics, Gene Expression Profiling",
author = "Shifon, {S A} and Karpets, {I O} and Chesnokova, {A S} and Karitskaya, {P E} and Ukladov, {E O} and Evgenov, {I V} and Sidorov, {S V} and Gulyaeva, {L F}",
note = "Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы / С.А. Шифон, И.О. Карпец, А.С. Чеснокова [и др.] // Молекулярная биология. – 2025. – Т. 59. - № 4. – С. 572-586. – DOI 10.31857/S0026898425040041. – EDN HZHZNB. Исследование выполнено в рамках бюджетного проекта ФИЦ ФТМ № 1021050601085-9-1.6.4;3.1.6 «Изучение молекулярных механизмов канцерогенеза, поиск новых диагностических маркеров и терапевтических мишеней».",
year = "2025",
doi = "10.31857/S0026898425040041",
language = "русский",
volume = "59",
pages = "572--586",
journal = "Molekulyarnaya Biologiya",
issn = "0026-8984",
publisher = "Russian Academy of Sciences",
number = "4",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы

AU - Shifon, S A

AU - Karpets, I O

AU - Chesnokova, A S

AU - Karitskaya, P E

AU - Ukladov, E O

AU - Evgenov, I V

AU - Sidorov, S V

AU - Gulyaeva, L F

N1 - Транскриптомный профиль резистентной к трастузумабу линии клеток BT-474 рака молочной железы / С.А. Шифон, И.О. Карпец, А.С. Чеснокова [и др.] // Молекулярная биология. – 2025. – Т. 59. - № 4. – С. 572-586. – DOI 10.31857/S0026898425040041. – EDN HZHZNB. Исследование выполнено в рамках бюджетного проекта ФИЦ ФТМ № 1021050601085-9-1.6.4;3.1.6 «Изучение молекулярных механизмов канцерогенеза, поиск новых диагностических маркеров и терапевтических мишеней».

PY - 2025

Y1 - 2025

N2 - Формирование резистентности к трастузумабу при HER2-положительном раке молочной железы представляет серьезную проблему, ограничивающую эффективность таргетной терапии. В качестве модели для изучения механизмов развития устойчивости опухолевых клеток к трастузумабу выбрали HER2-положительную клеточную линию BT-474 рака молочной железы люминального B подтипа. Молекулярные механизмы резистентности изучали с использованием комплексного транскриптомного анализа, основанного на сравнении данных RNA-seq трех независимых наборов данных, включающих как чувствительные, так и резистентные к трастузумабу варианты. Проведен многоступенчатый биоинформатический анализ с последующей идентификацией регуляторных взаимодействий. В результате были идентифицированы гены с повышенной (FUCA2, HSPE1, SHLD1, NMD3) и с пониженной экспрессией (GPC5, FSTL1, ATG16L2, POLD2) в резистентных клетках. Установлены ключевые транскрипционные факторы (E2F1, MYC, YBX1, HEY1, NFIC, TFAP2A, AP-1/JUN, NCOA1), регулирующие экспрессию обнаруженных генов при развитии резистентности к трастузумабу. Выявленные изменения указывают на комплексное перепрограммирование транскрипционной активности, затрагивающее процессы, связанные с прохождением клеточного цикла, репарацией ДНК, метаболизмом и эпителиально-мезенхимальным переходом. Полученные результаты расширяют понимание молекулярных механизмов резистентности к трастузумабу и открывают перспективы для разработки новых терапевтических стратегий, направленных на преодоление лекарственной устойчивости при HER2-положительном раке молочной железы.

AB - Формирование резистентности к трастузумабу при HER2-положительном раке молочной железы представляет серьезную проблему, ограничивающую эффективность таргетной терапии. В качестве модели для изучения механизмов развития устойчивости опухолевых клеток к трастузумабу выбрали HER2-положительную клеточную линию BT-474 рака молочной железы люминального B подтипа. Молекулярные механизмы резистентности изучали с использованием комплексного транскриптомного анализа, основанного на сравнении данных RNA-seq трех независимых наборов данных, включающих как чувствительные, так и резистентные к трастузумабу варианты. Проведен многоступенчатый биоинформатический анализ с последующей идентификацией регуляторных взаимодействий. В результате были идентифицированы гены с повышенной (FUCA2, HSPE1, SHLD1, NMD3) и с пониженной экспрессией (GPC5, FSTL1, ATG16L2, POLD2) в резистентных клетках. Установлены ключевые транскрипционные факторы (E2F1, MYC, YBX1, HEY1, NFIC, TFAP2A, AP-1/JUN, NCOA1), регулирующие экспрессию обнаруженных генов при развитии резистентности к трастузумабу. Выявленные изменения указывают на комплексное перепрограммирование транскрипционной активности, затрагивающее процессы, связанные с прохождением клеточного цикла, репарацией ДНК, метаболизмом и эпителиально-мезенхимальным переходом. Полученные результаты расширяют понимание молекулярных механизмов резистентности к трастузумабу и открывают перспективы для разработки новых терапевтических стратегий, направленных на преодоление лекарственной устойчивости при HER2-положительном раке молочной железы.

KW - РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

KW - HER2+ КЛЕТОЧНАЯ ЛИНИЯ BT-474

KW - ТРАСТУЗУМАБ

KW - РЕЗИСТЕНТНОСТЬ

KW - RNA-SEQ

KW - Humans

KW - Trastuzumab/pharmacology

KW - Drug Resistance, Neoplasm/genetics

KW - Breast Neoplasms/genetics

KW - Cell Line, Tumor

KW - Female

KW - Gene Expression Regulation, Neoplastic/drug effects

KW - Transcriptome

KW - Neoplasm Proteins/genetics

KW - Gene Expression Profiling

UR - https://www.scopus.com/inward/record.uri?partnerID=HzOxMe3b&scp=105018659740&origin=inward

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=82937984

U2 - 10.31857/S0026898425040041

DO - 10.31857/S0026898425040041

M3 - статья

C2 - 41090333

VL - 59

SP - 572

EP - 586

JO - Molekulyarnaya Biologiya

JF - Molekulyarnaya Biologiya

SN - 0026-8984

IS - 4

M1 - 4

ER -

ID: 71023535