TY - JOUR

T1 - Случаи развития повторной перипротезной инфекции Staphylococcus aureus:

T2 - реинфекция или реактивация патогена?

AU - Kechin, Andrey A.

AU - Borobova, Victoria S.

AU - Sheraliev, Taalaibek U.

AU - Chretien, Svetlana O.

AU - Tromenshleger, Irina N.

AU - Pavlov, Vitaliy V.

AU - Filipenko, Maxim L.

N1 - Исследование выполнено в рамках государственного задания ФГБУН «ИХБФМ» СО РАН № 125012300671-8. Случаи развития повторной перипротезной инфекции Staphylococcus aureus: реинфекция или реактивация патогена? / А. А. Кечин, В. С. Боробова, Т. У. Шералиев [и др.] // Травматология и ортопедия России. – 2025. – Т. 31, № 2. – С. 18-32. – DOI 10.17816/2311-2905-17610. – EDN FDOTOI.

PY - 2025/6/11

Y1 - 2025/6/11

N2 - Актуальность. Staphylococcus aureus — один из наиболее частых возбудителей перипротезной инфекции (ППИ). Несмотря на высокое генетическое разнообразие штаммов S. aureus, определение филогенетических связей, а следовательно, и источника заражения является непростой задачей, которая может быть решена только при подробном сравнении геномов получаемых изолятов.Цель — используя полногеномное секвенирование с выявлением генетических и фенотипических отличий между изолятами, изучить возможность дифференцирования случаев заражения пациентов внутрибольничной перипротезной инфекцией с перспективой обоснованного выбора тактики лечения пациентов.Материал и методы. Были определены нуклеотидные последовательности геномов 20 изолятов S. aureus, полученных от 13 пациентов с перипротезной инфекцией. В работе были использованы стандартные микробиологические тесты и анализ геномов in silico программами ResFinder, KmerFinder, spaTyper и SCCmecFinder.Результаты. Применив филогенетический анализ с построением корового генома, были идентифицированы потенциальные случаи внутригоспитальной инфекции, а также исследованы случаи повторного развития инфекции. Показано родство изолятов, выделенных на протяжении 2012–2019 гг., а также эволюция их геномов с приобретением и потерей генов антибиотикорезистентности. Так, в одном из случаев повторного развития инфекции была обнаружена потеря нескольких генов за период ремиссии около 5 лет. При сравнении результатов фенотипического тестирования изолятов диско-диффузионным методом и предсказаний резистентности по данным анализа генома было выявлено несоответствие для трех изолятов, содержащих ген aac(6’)-aph(2’’) и резистентных к тобрамицину и гентамицину, но чувствительных к амикацину. На основании результатов лечения нескольких случаев с повторным развитием ППИ было выдвинуто предположение, что в случае развития инфекции, вызванной мультирезистентным внутригоспитальным штаммом, более эффективным может быть проведение радикального лечения.Заключение. Полногеномное секвенирование позволяет выявлять филогенетически родственные изоляты, общность генетических и фенотипических свойств которых подтверждает их родство. На фоне проводимой высокодозной антибактериальной терапии в геномах S. aureus накапливаются изменения, которые при молекулярно-генетическом тестировании могут помочь обосновать выбор радикальной тактики лечения перипротезной инфекции — удаление эндопротеза.

AB - Актуальность. Staphylococcus aureus — один из наиболее частых возбудителей перипротезной инфекции (ППИ). Несмотря на высокое генетическое разнообразие штаммов S. aureus, определение филогенетических связей, а следовательно, и источника заражения является непростой задачей, которая может быть решена только при подробном сравнении геномов получаемых изолятов.Цель — используя полногеномное секвенирование с выявлением генетических и фенотипических отличий между изолятами, изучить возможность дифференцирования случаев заражения пациентов внутрибольничной перипротезной инфекцией с перспективой обоснованного выбора тактики лечения пациентов.Материал и методы. Были определены нуклеотидные последовательности геномов 20 изолятов S. aureus, полученных от 13 пациентов с перипротезной инфекцией. В работе были использованы стандартные микробиологические тесты и анализ геномов in silico программами ResFinder, KmerFinder, spaTyper и SCCmecFinder.Результаты. Применив филогенетический анализ с построением корового генома, были идентифицированы потенциальные случаи внутригоспитальной инфекции, а также исследованы случаи повторного развития инфекции. Показано родство изолятов, выделенных на протяжении 2012–2019 гг., а также эволюция их геномов с приобретением и потерей генов антибиотикорезистентности. Так, в одном из случаев повторного развития инфекции была обнаружена потеря нескольких генов за период ремиссии около 5 лет. При сравнении результатов фенотипического тестирования изолятов диско-диффузионным методом и предсказаний резистентности по данным анализа генома было выявлено несоответствие для трех изолятов, содержащих ген aac(6’)-aph(2’’) и резистентных к тобрамицину и гентамицину, но чувствительных к амикацину. На основании результатов лечения нескольких случаев с повторным развитием ППИ было выдвинуто предположение, что в случае развития инфекции, вызванной мультирезистентным внутригоспитальным штаммом, более эффективным может быть проведение радикального лечения.Заключение. Полногеномное секвенирование позволяет выявлять филогенетически родственные изоляты, общность генетических и фенотипических свойств которых подтверждает их родство. На фоне проводимой высокодозной антибактериальной терапии в геномах S. aureus накапливаются изменения, которые при молекулярно-генетическом тестировании могут помочь обосновать выбор радикальной тактики лечения перипротезной инфекции — удаление эндопротеза.

KW - Staphylococcus aureus

KW - core genome

KW - nosocomial infection

KW - periprosthetic joint infection

KW - phylogenetic analysis

KW - whole-genome sequencing

KW - Staphylococcus aureus

KW - перипротезная инфекция

KW - внутригоспитальная инфекция

KW - полногеномное секвенирование

KW - филогенетический анализ

KW - коровый геном

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/6eccde92-3107-3970-927c-2fde963234d3/

UR - https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-105008406450&origin=inward&txGid=d810fa874e649b8931fd8e45ad253b0d

UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=82470417

U2 - 10.17816/2311-2905-17610

DO - 10.17816/2311-2905-17610

M3 - статья

VL - 31

SP - 18

EP - 32

JO - Travmatologiya i Ortopediya Rossii

JF - Travmatologiya i Ortopediya Rossii

SN - 2542-0933

IS - 2

ER -