Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

Standard

Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli. / Yudkina, A V; Kovalenko, E A; Endutkin, A V и др.

в: Molekuliarnaia biologiia, Том 57, № 2, 17, 01.03.2023, стр. 330-339.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

BibTeX

@article{b43d423a03774bff9e42500121a25a01,

title = "Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli",

abstract = "Фермент 2'-дезоксиуридин-5′-трифосфатнуклеотидгидролаза (Dut), гидролизующий dUTP до dUMP и пирофосфата, предотвращает ошибочное включение dUMP в ДНК из метаболического пула dUTP и рассматривается как перспективная фармакологическая мишень для антиметаболитной терапии. Активный фермент Dut представляет собой тример, связывающий субстрат в межсубъединичной области. С использованием высокоскоростной наномасштабной дифференциальной сканирующей флуориметрии (nanoDSF) нами изучено влияние различных физико-химических факторов на стабильность тримера Dut Escherichia coli. В отличие от мономерных белков температурная денатурация Dut происходит в два этапа, первый из которых соответствует распаду тримера до мономерных субъединиц. Показано, что основной вклад в стабилизацию тримера вносят гидрофобные взаимодействия и водородные связи на интерфейсах взаимодействия между субъединицами. Тример Dut частично стабилизируется при связывании нуклеотидных лигандов. В целом метод nanoDSF удобен для скрининга низкомолекулярных соединений, способных дестабилизировать активный тример Dut.",

keywords = "DUTPАЗА, БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ, ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ, ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ СКАНИРУЮЩАЯ ФЛУОРИМЕТРИЯ",

author = "Yudkina, {A V} and Kovalenko, {E A} and Endutkin, {A V} and Panferova, {E P} and Kirilenko, {A A} and Kokhanenko, {A A} and Zharkov, {D O}",

note = "Юдкина А.В., Коваленко Е.А., Ендуткин А.В., Панфёрова Е.П., Кириленко А.А., Коханенко А.А., Жарков Д.О. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli // Молекулярная биология. – 2023. – Т. 57. - № 2. – С. 330-339.",

year = "2023",

month = mar,

day = "1",

doi = "10.31857/S0026898423020246",

language = "русский",

volume = "57",

pages = "330--339",

journal = "Molekulyarnaya Biologiya",

issn = "0026-8984",

publisher = "Russian Academy of Sciences",

number = "2",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

AU - Yudkina, A V

AU - Kovalenko, E A

AU - Endutkin, A V

AU - Panferova, E P

AU - Kirilenko, A A

AU - Kokhanenko, A A

AU - Zharkov, D O

N1 - Юдкина А.В., Коваленко Е.А., Ендуткин А.В., Панфёрова Е.П., Кириленко А.А., Коханенко А.А., Жарков Д.О. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli // Молекулярная биология. – 2023. – Т. 57. - № 2. – С. 330-339.

PY - 2023/3/1

Y1 - 2023/3/1

N2 - Фермент 2'-дезоксиуридин-5′-трифосфатнуклеотидгидролаза (Dut), гидролизующий dUTP до dUMP и пирофосфата, предотвращает ошибочное включение dUMP в ДНК из метаболического пула dUTP и рассматривается как перспективная фармакологическая мишень для антиметаболитной терапии. Активный фермент Dut представляет собой тример, связывающий субстрат в межсубъединичной области. С использованием высокоскоростной наномасштабной дифференциальной сканирующей флуориметрии (nanoDSF) нами изучено влияние различных физико-химических факторов на стабильность тримера Dut Escherichia coli. В отличие от мономерных белков температурная денатурация Dut происходит в два этапа, первый из которых соответствует распаду тримера до мономерных субъединиц. Показано, что основной вклад в стабилизацию тримера вносят гидрофобные взаимодействия и водородные связи на интерфейсах взаимодействия между субъединицами. Тример Dut частично стабилизируется при связывании нуклеотидных лигандов. В целом метод nanoDSF удобен для скрининга низкомолекулярных соединений, способных дестабилизировать активный тример Dut.

AB - Фермент 2'-дезоксиуридин-5′-трифосфатнуклеотидгидролаза (Dut), гидролизующий dUTP до dUMP и пирофосфата, предотвращает ошибочное включение dUMP в ДНК из метаболического пула dUTP и рассматривается как перспективная фармакологическая мишень для антиметаболитной терапии. Активный фермент Dut представляет собой тример, связывающий субстрат в межсубъединичной области. С использованием высокоскоростной наномасштабной дифференциальной сканирующей флуориметрии (nanoDSF) нами изучено влияние различных физико-химических факторов на стабильность тримера Dut Escherichia coli. В отличие от мономерных белков температурная денатурация Dut происходит в два этапа, первый из которых соответствует распаду тримера до мономерных субъединиц. Показано, что основной вклад в стабилизацию тримера вносят гидрофобные взаимодействия и водородные связи на интерфейсах взаимодействия между субъединицами. Тример Dut частично стабилизируется при связывании нуклеотидных лигандов. В целом метод nanoDSF удобен для скрининга низкомолекулярных соединений, способных дестабилизировать активный тример Dut.

KW - DUTPАЗА

KW - БЕЛОК-БЕЛКОВЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ

KW - ОЛИГОМЕРИЗАЦИЯ

KW - ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ СКАНИРУЮЩАЯ ФЛУОРИМЕТРИЯ

UR - https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85151574758&origin=inward&txGid=c5e29b5960834714f3edbaba968c464b

UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=50434628

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/763dd18c-80da-3d02-b736-e1629d9095b7/

U2 - 10.31857/S0026898423020246

DO - 10.31857/S0026898423020246

M3 - статья

C2 - 37000660

VL - 57

SP - 330

EP - 339

JO - Molekulyarnaya Biologiya

JF - Molekulyarnaya Biologiya

SN - 0026-8984

IS - 2

M1 - 17

ER -

ID: 46850401