1. 2022
  2. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. Web-MCOT Server for Motif Co-Occurrence Search in ChIP-Seq Data

    Levitsky, V. G., Mukhin, A. M., Oshchepkov, D. Y., Zemlyanskaya, E. V. & Lashin, S. A., 11 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8981.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. 2021
  6. Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

    Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  7. Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

    Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2

    Tsukanov, A. V., Levitsky, V. G. & Merkulova, T. I., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 7-17 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. 2020
  10. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in drosophila interphase chromosomes

    Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Moshkin, Y. M. & Zhimulev, I. F., 1 дек. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 23, стр. 1-10 10 стр., 9282.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

    Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

    Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

    Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in drosophila melanogaster polytene chromosomes

    Khoroshko, V. A., Pokholkova, G. V., Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Antonenko, O. V., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 32 стр., 417.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

    Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2020, в: Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. 2019
  17. A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

    Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. 2018
  20. Genetic Organization of Open Chromatin Domains Situated in Polytene Chromosome Interbands in Drosophila

    Zykova, T. Y., Popova, O. O., Khoroshko, V. A., Levitsky, V. G., Lavrov, S. A. & Zhimulev, I. F., 1 нояб. 2018, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 483, 1, стр. 297-301 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Polytene chromosomes – A portrait of functional organization of drosophila genome

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2018, в: Current Genomics. 19, 3, стр. 179-191 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  22. Spatial specificity of auxin responses coordinates wood formation

    Brackmann, K., Qi, J., Gebert, M., Jouannet, V., Schlamp, T., Grünwald, K., Wallner, E. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Agustí, J., Sanchez, P., Lohmann, J. U. & Greb, T., 28 февр. 2018, в: Nature Communications. 9, 1, стр. 875 15 стр., 875.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana

    Cherenkov, P., Novikova, D., Omelyanchuk, N., Levitsky, V., Grosse, I., Weijers, D. & Mironova, V., 4 янв. 2018, в: Journal of Experimental Botany. 69, 2, стр. 329-339 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. 2017
  25. Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

    Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines

    Boldyreva, L. V., Goncharov, F. P., Demakova, O. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Kolesnikov, N. N., Pindyurin, A. V., Semeshin, V. F. & Zhimulev, I. F., 1 апр. 2017, в: Current Genomics. 18, 2, стр. 214-226 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. The interplay of chromatin landscape and DNA-binding context suggests distinct modes of EIN3 regulation in Arabidopsis thaliana

    Zemlyanskaya, E. V., Levitsky, V. G., Oshchepkov, D. Y., Grosse, I. & Mironova, V. V., 9 янв. 2017, в: Frontiers in Plant Science. 7, 9 стр., 2044.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3457791