Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MetArea: a software package for analysis of the mutually exclusive occurrence in pairs of motifs of transcription factor binding sites based on ChIP-seq data

Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V. & Merkulova, T. I., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 822-833 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genomic background sequences systematically outperform synthetic ones in de novo motif discovery for ChIP-seq data

Raditsa, V. V., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G. & Levitsky, V. G., 1 сент. 2024, в: NAR Genomics and Bioinformatics. 6, 3, 15 стр., qae090.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genetic Organization of Open Chromatin Domains Situated in Polytene Chromosome Interbands in Drosophila

Zykova, T. Y., Popova, O. O., Khoroshko, V. A., Levitsky, V. G., Lavrov, S. A. & Zhimulev, I. F., 1 нояб. 2018, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 483, 1, стр. 297-301 5 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in drosophila melanogaster polytene chromosomes

Khoroshko, V. A., Pokholkova, G. V., Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Antonenko, O. V., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 32 стр., 417.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2020, в: Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana

Cherenkov, P., Novikova, D., Omelyanchuk, N., Levitsky, V., Grosse, I., Weijers, D. & Mironova, V., 4 янв. 2018, в: Journal of Experimental Botany. 69, 2, стр. 329-339 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Asymmetry of Motif Conservation Within Their Homotypic Pairs Distinguishes DNA-Binding Domains of Target Transcription Factors in ChIP-Seq Data

Levitsky, V. G., Raditsa, V. V., Tsukanov, A. V., Mukhin, A. M., Zhimulev, I. F. & Merkulova, T. I., 4 янв. 2025, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 386.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование