1. 2024
  2. Hormone-regulated expansins: expression, localization, and cell wall biomechanics in Arabidopsis root growth

    Samalova, M., Melnikava, A., Elsayad, K., Peaucelle, A., Gahurova, E., Gumulec, J., Spyroglou, I., Zemlyanskaya, E. V., Ubogoeva, E. V., Balkova, D., Demko, M., Blavet, N., Alexiou, P., Benes, V., Mouille, G. & Hejatko, J., янв. 2024, в: Plant Physiology. 194, 1, стр. 209-228 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. 2023
  4. State-of the-Art Constraint-Based Modeling of Microbial Metabolism: From Basics to Context-Specific Models with a Focus on Methanotrophs

    Куляшов, М. А., Колмыков, С. К., Хлебодарова, Т. М. & Акбердин, И. Р., 14 дек. 2023, в: Microorganisms. 11, 12, 22 стр., 2987.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  5. Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei

    Bobrovskikh, A. V., Zubairova, U. S. & Doroshkov, A. V., 12 дек. 2023, в: Biology. 12, 12, 1516.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  6. Программа расшифровки аббревиатур сущностей в рефератах научных публикаций на основе их контекста (ЭНДДекрипт) / Program for decoding entity abbreviations in abstracts of scientific publications based on their context (ANDDecrypt)

    Иванисенко, Т. В., Деменков, П. С. & Иванисенко, В. А., 8 дек. 2023, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Патент/Св-во № 2023686851, 16 нояб. 2023, Дата приоритета 16 нояб. 2023, № приоритета 2023684403

    Результаты исследований: Патенты/Свидетельства о регистрациисвидетельство о регистрации программы для ЭВМ

  7. DyCeModel: a tool for 1D simulation for distribution of plant hormones controlling tissue patterning

    Azarova, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mironova, V. V., Zemlyanskaya, E. V. & Lavrekha, V. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 890-897 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. Gbs-dp: a bioinformatics pipeline for processing data coming from genotyping by sequencing

    Pronozin, A. Y., Salina, E. A. & Afonnikov, D. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 737-745 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. Gene networks for use in metabolomic data analysis of blood plasma from patients with postoperative delirium

    Ivanisenko, V. A., Basov, N. V., Makarova, A. A., Venzel, A. S., Rogachev, A. D., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Kleshchev, M. A., Gaisler, E. V., Moroz, G. B., Plesko, V. V., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Lomivorotov, V. V., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 768-775 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. InterTransViewer: a comparative description of differential gene expression profiles from different experiments

    Tyapkin, А. V., Lavrekha, V. V., Ubogoeva, E. V., Oshchepkov, D. Y., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1042-1052 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution

    Ivanov, R. A. & Lashin, S. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 815-819 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Laboratory information systems for research management in biology

    Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V. & Lashin, S. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 898-905 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Molecular-genetic pathways of hepatitis C virus regulation of the expression of cellular factors PREB and PLA2G4C, which play an important role in virus replication

    Mishchenko, E. L., Makarova, A. A., Antropova, E. A., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 776-783 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Prioritization of potential pharmacological targets for the development of anti-hepatocarcinoma drugs modulating the extrinsic apoptosis pathway: the reconstruction and analysis of associative gene networks help

    Demenkov, P. S., Antropova, E. A., Adamovskaya, A. V., Mishchenko, E. L., Khlebodarova, T. M., Ivanisenko, T. V., Ivanisenko, N. V., Venzel, A. S., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 784-793 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. Reconstruction and analysis of the gene regulatory network for cell wall function in Arabidopsis thaliana L. leaves in response to water deficit

    Volyanskaya, A. R., Antropova, E. A., Zubairova, U. S., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Orlov, Y. L., Makarova, A. A., Ivanisenko, T. V., Gorshkova, T. A., Aglyamova, A. R., Kolchanov, N. A., Chen, M. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1031-1041 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. The central regulatory circuit in the gene network controlling the morphogenesis of Drosophila mechanoreceptors: an in silico analysis

    Bukharina, T. A., Golubyatnikov, V. P. & Furman, D. P., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 746-754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Определение содержания меланина и антоцианов в зернах ячменя на основе анализа цифровых изображений методами машинного обучения

    Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Busov, I. D., Kozhekin, M. V., Artemenko, N. V., Glagoleva, A. Y., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 859-868 10 стр., 15.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Bioinformatic Analysis Reveals the Role of Translation Elongation Efficiency Optimisation in the Evolution of Ralstonia Genus

    Korenskaia, A. Y., Matushkin, Y. G., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2023, в: Biology. 12, 10, 1338.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder

    Uvarova, Y. E., Demenkov, P. S., Kuzmicheva, I. N., Venzel, A. S., Mischenko, E. L., Ivanisenko, T. V., Efimov, V. M., Bannikova, S. V., Vasilieva, A. R., Ivanisenko, V. A. & Peltek, S. E., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration

    Orlov, Y. L., Chen, M., Kolchanov, N. A. & Hofestädt, R., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 20230032.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Volianskaia, A. R., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Kolchanov, N. A., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. Central Regulatory Circuit of the Drosophila Mechanoreceptor Morphogenesis System: Effects of Mutations

    Furman, D. P., Bukharina, T. A. & Golubyatnikov, V. P., сент. 2023, в: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 17, 3, стр. 535-543 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Delay-differential SEIR modeling for improved modelling of infection dynamics

    Киселев, И., Акбердин, И. Р. & Колпаков, Ф., 18 авг. 2023, в: Scientific Reports. 13, 1, 15 стр., 13439.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Numerous Trigger-like Interactions of Kinases/Protein Phosphatases in Human Skeletal Muscles Can Underlie Transient Processes in Activation of Signaling Pathways during Exercise

    Vertyshev, A. Y., Akberdin, I. R. & Kolpakov, F. A., 7 июл. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 11223.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  25. Comparison of the evolutionary patterns of DNA repeats in ancient and young invertebrate species flocks of Lake Baikal

    Yuxiang, W., Peretolchina, T. E., Romanova, E. V. & Sherbakov, D. Y., июл. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 4, стр. 349-356 8 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. ICAnnoLncRNA: A Snakemake Pipeline for a Long Non-Coding-RNA Search and Annotation in Transcriptomic Sequences

    Pronozin, A. Y. & Afonnikov, D. A., 24 июн. 2023, в: Genes. 14, 7, 1331.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. A New Visualization and Analysis Method for a Convolved Representation of Mass Computational Experiments with Biological Models

    Klimenko, A. I., Vorobeva, D. A. & Lashin, S. A., июн. 2023, в: Mathematics. 11, 12, 2783.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Salina, E. A., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., июн. 2023, в: Agronomy. 13, 6, 1454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Research Topics of the Bioinformatics of Gene Regulation

    Orlov, Y. L., Anashkina, A. A., Kumeiko, V. V., Chen, M. & Kolchanov, N. A., 15 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 10, 8774.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Vasiliev, G. V., Toshchakov, S. V., Shmakov, N. A., Genaev, M. A., Nesterov, M. A., Ibragimova, S. M., Rybakov, D. A., Gavrilenko, T. A., Salina, E. A., Patrushev, M. V., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., 16 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 6, 5713.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Impact of Negative Feedbacks on De Novo Pyrimidines Biosynthesis in Escherichia coli

    Akberdin, I. R., Kozlov, K. N., Kazantsev, F. V., Fadeev, S. I., Likhoshvai, V. A. & Khlebodarova, T. M., 2 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 4806.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato

    Kochetov, A. V., Shmakov, N., Afonnikov, D. A., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Egorova, A. A., Mironenko, N. V., Lashina, N. M., Khiutti, A. V. & Afanasenko, O. S., мар. 2023, в: Agronomy. 13, 3, 684.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. Differentially Expressed Genes and Molecular Susceptibility to Human Age-Related Diseases

    Shikhevich, S., Chadaeva, I., Khandaev, B., Kozhemyakina, R., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Bogomolov, A., Klimova, N. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Mustafin, Z., Markel, A., Savinkova, L., Kolchanov, N. A., Kozlov, V. & Ponomarenko, M., 16 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 3996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. Trait-Based Method of Quantitative Assessment of Ecological Functional Groups in the Human Intestinal Microbiome

    Kropochev, A. I., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G. & Klimenko, A. I., 11 янв. 2023, в: Biology. 12, 1, 115.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Antitumor efficacy of multi-target in situ vaccinations with CpG oligodeoxynucleotides, anti-OX40, anti-PD1 antibodies, and aptamers

    Proskurina, A. S., Рузанова, В. С., Риттер, Г. С., Ефремов, Я. Р., Mustafin, Z. S., Лашин, С. А., Буракова, Е. А., Фокина, А. А., Zatsepin, T. S., Стеценко, Д. А., Леплина, О. Ю., Останин, А. А., Черных, Е. Р. & Bogachev, S. S., 2023, в: Journal of Biomedical Research. 37, 3, стр. 194-212 19 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks

    Artemenko, N. V., Genaev, M. A., Epifanov, R. U., Komyshev, E. G., Kruchinina, Y. V., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 16 стр., 1336192.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. 2022
  38. Algorithm for the Reconstruction of Mathematical Frame Models of Bacterial Transcription Regulation

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Mukhin, A. M., Kolchanov, N. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2022, в: Mathematics. 10, 23, 4480.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients

    Ivanisenko, V. A., Gaisler, E. V., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Cheresiz, S. V., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Mishchenko, E. L., Khripko, O. P., Khripko, Y. I., Voevoda, S. M., Karpenko, T. N., Velichko, A. J., Voevoda, M. I., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 12 стр., 19977.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  40. The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 14934.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. Компьютерный анализ особенностей регуляции гиперметилированных маркерных генов гепатокарциномы вирусными белками гепатита С

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 733-742 10 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Контекстные сигналы в митохондриальных микроРНК млекопитающих

    Vishnevsky, O. V., Vorozheykin, P. S. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 819-825 7 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. Молекулярные механизмы детерминации клеток сосудистой системы корня Arabidopsis thaliana L

    Sidorenko, A. D., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 721-732 12 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  44. Свойства малого мира научных организаций определяют динамику публикационной активности в области миРНК

    Firsov, A. B. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 826-829 4 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  45. Фосфолипазы A2 человека: функциональный и эволюционный анализ

    Turnaev, I. I., Bocharnikova, M. E. & Afonnikov, D. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 787-797 11 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. Genomic analysis reveals cryptic diversity in aphelids and sheds light on the emergence of Fungi

    Mikhailov, K. V., Karpov, S. A., Letcher, P. M., Lee, P. A., Logacheva, M. D., Penin, A. A., Nesterenko, M. A., Pozdnyakov, I. R., Potapenko, E. V., Sherbakov, D. Y., Panchin, Y. V. & Aleoshin, V. V., 7 нояб. 2022, в: Current Biology. 32, 21, стр. 4607-4619.e7 21 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  47. Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling of Nanoparticle Biodistribution: A Review of Existing Models, Simulation Software, and Data Analysis Tools

    Кутумова, Е. О., Акбердин, И. Р., Киселев, И. Н., Шарипов, Р. Н., Егорова, В. С., Сырочева, А. О., Parodi, A., Замятнин, А. А. & Колпаков, Ф. А., 19 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 22 стр., 12560.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  48. Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes

    Korenskaia, A. E., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 19, 11996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  49. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  50. Web-MCOT Server for Motif Co-Occurrence Search in ChIP-Seq Data

    Levitsky, V. G., Mukhin, A. M., Oshchepkov, D. Y., Zemlyanskaya, E. V. & Lashin, S. A., 11 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8981.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  51. QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing

    Arif, M. A. R., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Koval, V. S., Shmakov, N. A., Börner, A. & Afonnikov, D. A., авг. 2022, в: Plants. 11, 16, 2105.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  52. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  53. BioUML—towards a universal research platform

    Колпаков, Ф., Акбердин, И. Р., Киселев, И., Колмыков, С. К., Кондрахин, Ю., Куляшов, М. А., Кутумова, Е., Пинтус, С. С., Рябова, А., Шарипов, Р. Н., Евшин, И., Жатченко, С. & Кель, А., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W124-W131 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  54. Multicompartmental Mathematical Model of SARS-CoV-2 Distribution in Human Organs and Their Treatment

    Afonyushkin, V. N., Акбердин, И. Р., Kozlova, Y., Щукин, И. А., Mironova, T., Bobikova, A., Cherepushkina, V., Donchenko, N., Poletaeva, Y. E. & Колпаков, Ф., 1 июн. 2022, в: Mathematics. 10, 11, 1925.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  55. Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus

    Zubairova, U. S., Kravtsova, A. Y., Romashchenko, A. V., Pushkareva, A. A. & Doroshkov, A. V., 1 июн. 2022, в: Plants. 11, 12, 1533.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  56. Modular Representation of Physiologically Based Pharmacokinetic Models: Nanoparticle Delivery to Solid Tumors in Mice as an Example

    Kutumova, E., Akberdin, I., Kiselev, I., Sharipov, R. & Kolpakov, F., 1 апр. 2022, в: Mathematics. 10, 7, 20 стр., 1176.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  57. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses

    Kirichenko, A. D., Poroshina, A. A., Sherbakov, D. Y., Sadovsky, M. G. & Krutovsky, K. V., мар. 2022, в: PLoS ONE. 17, 3, e0264640.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  58. Isolation and transcriptome analysis of a biotechnologically promising Black Sea protist, Thraustochytrium aureum ssp. Strugatskii

    Konstantinov, D. K., Menzorov, A., Krivenko, O. & Doroshkov, A. V., мар. 2022, в: PeerJ. 10, e12737.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  59. Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Shishkina, O. D., Adonyeva, N. V., Karpova, E. K., Gruntenko, N. E., Zakharenko, L. P., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., 1 февр. 2022, в: Mathematics. 10, 3, 295.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  60. Salicylic Acid in Root Growth and Development

    Bagautdinova, Z. Z., Omelyanchuk, N., Tyapkin, A. V., Kovrizhnykh, V. V., Lavrekha, V. V. & Zemlyanskaya, E. V., 1 февр. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2228.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  61. Agent-Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population

    Romanov, G. P., Smirnova, A. A., Zamyatin, V. I., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Solovyev, A. V., Fedorova, S. A., Posukh, O. L., Lashin, S. A. & Barashkov, N. A., февр. 2022, в: Biology. 11, 2, 257.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  62. The functional insight into the geneticsof cardiovascular disease: results from the post-GWAS study

    Bryzgalov, L. O., Korbolina, E. E., Damarov, I. S. & Merkulova, T., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 65-73 9 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  63. ДНК-метабаркодинг бентосных водорослей и ассоциированных с ними эукариот оз. Байкал в условиях быстрых экологических изменений

    Bukin, Y. S., Kravtsova, L. S., Peretolchina, T. E., Fedotov, A. P., Tupikin, A. E., Kabilov, M. R., Sherbakov, D. Y. & Mincheva, E., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 86-95 10 стр., 10.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  64. Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders

    Trifonova, E. A., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 янв. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 2, 967.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  65. Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination

    Afonnikov, D. A., Komyshev, E. G., Efimov, V. M., Genaev, M. A., Koval, V. S., Gierke, P. U. & Börner, A., 1 янв. 2022, в: Plants. 11, 1, 35.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  66. ICBrainDB: An Integrated Database for Finding Associations between Genetic Factors and EEG Markers of Depressive Disorders

    Ivanov, R., Kazantsev, F., Zavarzin, E., Klimenko, A., Milakhina, N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. & Lashin, S., янв. 2022, в: Journal of Personalized Medicine. 12, 1, 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  67. Wheat yield estimation based on analysis of UAV images at low altitude

    Kozhekin, M., Genaev, M., Koval, V., Slobodchikov, A. & Afonnikov, D., 2022, в: BIO Web of Conferences. 47, стр. 05006

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  68. 2021
  69. NLR genes related transcript sets in potato cultivars bearing genetic material of wild Mexican solanum species

    Kochetov, A. V., Afonnikov, D. A., Shmakov, N., Vasiliev, G. V., Antonova, O. Y., Shatskaya, N. V., Glagoleva, A. Y., Ibragimova, S. M., Khiutti, A., Afanasenko, O. S. & Gavrilenko, T. A., дек. 2021, в: Agronomy. 11, 12, 2426.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  70. The mitochondrial genome of a freshwater pelagic amphipod Macrohectopus branickii is among the longest in Metazoa

    Romanova, E. V., Bukin, Y. S., Mikhailov, K. V., Logacheva, M. D., Aleoshin, V. V. & Sherbakov, D. Y., дек. 2021, в: Genes. 12, 12, 2030.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  71. Mechanisms of stress response in the root stem cell niche

    Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Xu, J. & Mironova, V., 13 окт. 2021, в: Journal of Experimental Botany. 72, 19, стр. 6746-6754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  72. A modular mathematical model of exercise-induced changes in metabolism, signaling, and gene expression in human skeletal muscle

    Akberdin, I. R., Kiselev, I. N., Pintus, S. S., Sharipov, R. N., Vertyshev, A. Y., Vinogradova, O. L., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 19, 10353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  73. Leave or stay: Simulating motility and fitness of microorganisms in dynamic aquatic ecosystems

    Klimenko, A., Matushkin, Y., Kolchanov, N. & Lashin, S., окт. 2021, в: Biology. 10, 10, 1019.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  74. Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

    Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  75. Prioritization of biological processes based on the reconstruction and analysis of associative gene networks describing the response of plants to adverse environmental factors

    Demenkov, P. S., Oshchepkova, E. A., Ivanisenko, T. V. & Ivanisenko, V. A., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 580-592 13 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  76. Комплексный анализ влияния аллельного полиморфизма 5-HTTLPR на поведенческие и нейрофизиологические показатели исполнительного контроля у людей из разных этнических групп в Сибири

    Savostyanov, A. N., Bazovkina, D. V., Lashin, S. A., Tamozhnikov, S. S., Saprygin, A. E., Astakhova, T. N., Kavai-Ool, U. N., Borisova, N. V. & Karpova, A. G., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 593-602 10 стр., 14.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  77. Image-based wheat fungi diseases identification by deep learning

    Genaev, M. A., Skolotneva, E. S., Gultyaeva, E. I., Orlova, E. A., Bechtold, N. P. & Afonnikov, D. A., авг. 2021, в: Plants. 10, 8, 1500.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  78. A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes

    Ignatieva, E. V., Osadchuk, A. V., Kleshchev, M. A., Bogomolov, A. G. & Osadchuk, L. V., 5 июл. 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, 662770.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  79. A panel of rsnps demonstrating allelic asymmetry in both chip-seq and rna-seq data and the search for their phenotypic outcomes through analysis of degs

    Korbolina, E. E., Bryzgalov, L. O., Ustrokhanova, D. Z., Postovalov, S. N., Poverin, D. V., Damarov, I. S. & Merkulova, T. I., 2 июл. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 14, 7240.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  80. Experimental comparison of the in vivo efficacy of two novel anticancer therapies

    Ruzanova, V. S., Proskurina, A. S., Ritter, G. S., Efremov, Y. R., Nikolin, V. P., Popova, N. A., Naprimerov, V. A., Dolgova, E. V., Potter, E. A., Kirikovich, S. S., Levites, E. V., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A., Burakova, E. A., Stetsenko, D. A., Ostanin, A. A., Chernykh, E. R. & Bogachev, S. S., июл. 2021, в: Anticancer research. 41, 7, стр. 3371-3387 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  81. Regulatory SPNs: Altered transcription factor binding sites implicated in complex traits and diseases

    Degtyareva, A. O., Antontseva, E. V. & Merkulova, T. I., 2 июн. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 12, 6454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  82. Genome-wide atlas of promoter expression reveals contribution of transcribed regulatory elements to genetic control of disuse-mediated atrophy of skeletal muscle

    Pintus, S. S., Akberdin, I. R., Yevshin, I., Makhnovskii, P., Tyapkina, O., Nigmetzyanov, I., Nurullin, L., Devyatiyarov, R., Shagimardanova, E., Popov, D., Kolpakov, F. A., Gusev, O. & Gazizova, G. R., июн. 2021, в: Biology. 10, 6, 557.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  83. A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis

    Bobrovskikh, A., Doroshkov, A., Mazzoleni, S., Cartenì, F., Giannino, F. & Zubairova, U., 21 мая 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, стр. 652974 652974.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  84. Do autism spectrum and autoimmune disorders share predisposition gene signature due to mtor signaling pathway controlling expression?

    Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 мая 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 10, 5248.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  85. Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress

    Konstantinov, D. K., Zubairova, U. S., Ermakov, A. A. & Doroshkov, A. V., мая 2021, в: PeerJ. 9, стр. e11428 e11428.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  86. Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

    Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  87. Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы

    Afonnikov, D. A., Sinitsyna, O. I., Golubeva, T. S., Shmakov, N. A. & Kochetov, A. V., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 251-259 9 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  88. Технологии поиска и исследования потенциально осциллирующих ферментативных систем

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 318-330 13 стр., 9.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  89. Геномная изменчивость в регуляторных районах генов, ассоциированная с заболеваниями человека: механизмы влияния на транскрипцию генов и полногеномные информационные ресурсы, обеспечивающие исследование этих механизмов

    Ignatieva, E. V. & Matrosova, E. A., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 18-29 12 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  90. Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2

    Tsukanov, A. V., Levitsky, V. G. & Merkulova, T. I., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 7-17 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  91. Филостратиграфический анализ генных сетей заболеваний человека

    Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., янв. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 46-56 11 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  92. Hypoxia exerts oxidative stress and changes in expression of antioxidant enzyme genes in gills of Mytilus galloprovincialis (Lamarck, 1819)

    Andreyeva, A. Y., Gostyukhina, O. L., Kladchenko, E. S., Afonnikov, D. A., Rasskazov, D. A., Lantushenko, A. O. & Vodiasova, E. A., 2021, в: Marine Biology Research. 17, 4, стр. 369-379 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  93. The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains

    Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Klimenko, A. I., Lakhova, T. N., Demenkov, P. S. & Lashin, S. A., 2021, Parallel Computing Technologies - 16th International Conference, PaCT 2021, Proceedings. Malyshkin, V. (ред.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, стр. 445-450 6 стр. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); том 12942 LNCS).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  94. Вироид веретеновидности клубней картофеля

    Kochetov, A. V., Pronozin, A. Y., Shatskaya, N. V., Afonnikov, D. A. & Afanasenko, O. S., 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 269-275 7 стр., 3.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  95. Определение количественного содержания хлорофиллов в листьях по спектрам отражения алгоритмом случайного леса

    Urbanovich, E. A., Afonnikov, D. A. & Nikolaev, S. V., 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 64-70 7 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  96. 2020
  97. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in drosophila interphase chromosomes

    Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Moshkin, Y. M. & Zhimulev, I. F., 1 дек. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 23, стр. 1-10 10 стр., 9282.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  98. A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: An analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia

    Romanov, G. P., Pshennikova, V. G., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Teryutin, F. M., Cherdonova, A. M., Borisova, T. V., Sazonov, N. N., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L., Fedorova, S. A. & Barashkov, N. A., нояб. 2020, в: PLoS ONE. 15, 11 November, стр. e0242219 e0242219.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  99. Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

    Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  100. The phylogeny of class b flavoprotein monooxygenases and the origin of the yucca protein family

    Turnaev, I. I., Gunbin, K. V., Suslov, V. V., Akberdin, I. R., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 сент. 2020, в: Plants. 9, 9, стр. 1-22 22 стр., 1092.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  101. Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

    Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  102. The Effects of Chronic Stress on Brain Myelination in Humans and in Various Rodent Models

    Antontseva, E., Bondar, N., Reshetnikov, V. & Merkulova, T., 10 авг. 2020, в: Neuroscience. 441, стр. 226-238 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  103. Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview

    Bobrovskikh, A., Zubairova, U., Kolodkin, A. & Doroshkov, A., 16 июл. 2020, в: PeerJ. 8, стр. e9451 27 стр., e9451.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  104. A genome-scale metabolic model of 2,3-butanediol production by thermophilic bacteria geobacillus icigianus

    Kulyashov, M., Peltek, S. E. & Akberdin, I. R., 1 июл. 2020, в: Microorganisms. 8, 7, стр. 1-13 13 стр., 1002.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  105. Analysis of color and texture characteristics of cereals on digital images

    Komyshev, E. G., Genaev, M. A. & Afonnikov, D. A., июл. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 4, стр. 340-347 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  106. Application of neural networks to image recognition of wheat rust diseases

    Genaev, M., Ekaterina, S. & Afonnikov, D., июл. 2020, Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 40-42 3 стр. 9214703. (Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  107. GPU Based Composite Elements Discovery in Large DNADatasets

    Vishnevsky, O., Bocharnikov, A. & Kolchanov, N., июл. 2020, Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 135-138 4 стр. 9214777. (Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  108. Mathematical and Numerical Models of the Central Regulatory Circuit of the Morphogenesis System of Drosophila

    Bukharina, T. A., Akinshin, A. A., Golubyatnikov, V. P. & Furman, D. P., 1 мая 2020, в: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 14, 2, стр. 249-255 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  109. rs2072580T>A Polymorphism in the Overlapping Promoter Regions of the SART3 and ISCU Genes Associated with the Risk of Breast Cancer

    Degtyareva, A. O., Leberfarb, E. Y., Efimova, E. G., Brusentsov, I. I., Usova, A. V., Lushnikova, E. L. & Merkulova, T. I., 1 мая 2020, в: Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 169, 1, стр. 81-84 4 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  110. Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

    Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  111. Fold-change-specific enrichment analysis (FSEA): Quantification of transcriptional response magnitude for functional gene groups

    Wiebe, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mukhin, A. M., Grosse, I., Lashin, S. A., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V. V., 17 апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 14 стр., 434.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  112. Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in drosophila melanogaster polytene chromosomes

    Khoroshko, V. A., Pokholkova, G. V., Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Antonenko, O. V., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 32 стр., 417.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  113. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

    Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2020, в: Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  114. Использование гиперспектральной камеры Specim IQ для анализа растений

    Alt, V. V., Gurova, T. A., Elkin, O. V., Klimenko, D. N., Maximov, L. V., Pestunov, I. A., Dubrovskaya, O. A., Genaev, M. A., Erst, T. V., Genaev, K. A., Komyshev, E. G., Khlestkin, V. K. & Afonnikov, D. A., 1 мар. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 3, стр. 259-266 8 стр., 6.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  115. Candidate snp markers of atherogenesis significantly shifting the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters show stabilizing natural selection as a sum of neutral drift accelerating atherogenesis and directional natural selection slowing it

    Ponomarenko, M., Rasskazov, D., Chadaeva, I., Sharypova, E., Drachkova, I., Oshchepkov, D., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Oshchepkova, E., Nazarenko, M. & Kolchanov, N., 5 февр. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 3, 41 стр., 1045.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  116. Computer Simulation of the Evolution of Microbial Population: Overcoming Local Minima When Reaching a Peak on the Fitness Landscape

    Lashin, S. A., Mustafin, Z. S., Klimenko, A. I., Afonnikov, D. A. & Matushkin, Y. G., 1 февр. 2020, в: Russian Journal of Genetics. 56, 2, стр. 242-252 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  117. Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain

    Pavlova, A. S., Ozhegov, G. D., Arapidi, G. P., Butenko, I. O., Fomin, E. S., Alemasov, N. A., Afonnikov, D. A., Yarullina, D. R., Ivanov, V. T., Govorun, V. M. & Kayumov, A. R., 1 февр. 2020, в: Protein Journal. 39, 1, стр. 73-84 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  118. The Effect of Meditation on Comprehension of Statements About One-Self and Others: A Pilot ERP and Behavioral Study

    Savostyanov, A., Tamozhnikov, S., Bocharov, A., Saprygin, A., Matushkin, Y., Lashin, S., Kolpakova, G., Sudobin, K. & Knyazev, G., 9 янв. 2020, в: Frontiers in Human Neuroscience. 13, 12 стр., 437.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  119. A mathematical model linking Ca2+-dependent signaling pathway and gene expression regulation in Human Skeletal Muscle

    Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., Pintus, S. S., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 1, стр. 20-39 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  120. Potential regulatory SNPs in the ATXN7L3B and KRT15 genes are associated with gender-specific colorectal cancer risk

    Leberfarb, E. Y., Degtyareva, A. O., Brusentsov, I. I., Maximov, V. N., Voevoda, M. I., Autenshlus, A. I., Morozov, D. V., Sokolov, A. V. & Merkulova, T. I., янв. 2020, в: Personalized Medicine. 17, 1, стр. 43-54 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  121. Rdbms And Nosql Based Hybrid Technology for Transcriptome Data Structuring and Processing

    Mukhin, A. M., Genaev, M. A., Rasskazov, D. A., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 2, стр. 455-470 16 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  122. 2019
  123. The mTOR signaling pathway activity and vitamin d availability control the expression of most autism predisposition genes

    Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 15 дек. 2019, в: International Journal of Molecular Sciences. 20, 24, 14 стр., 6332.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  124. A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

    Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  125. Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.)

    Ermakov, A., Bobrovskikh, A., Zubairova, U., Konstantinov, D. & Doroshkov, A., 29 нояб. 2019, в: PeerJ. 7, 11, 28 стр., e7791.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  126. Phylostratigraphic analysis shows the earliest origination of the abiotic stress associated genes in a. Thaliana

    Mustafin, Z. S., Zamyatin, V. I., Konstantinov, D. K., Doroshkov, A. V., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 22 нояб. 2019, в: Genes. 10, 12, 27 стр., 963.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  127. Behavior and Depression Gene Networks Reconstruction and Analysis

    Ivanov, R. A., Zamyatin, V. I., Klimenko, A. I., Astakhova, T. N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. N. & Lashin, S. A., окт. 2019, SIBIRCON 2019 - International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences, Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 361-365 5 стр. 8958072. (SIBIRCON 2019 - International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences, Proceedings).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  128. Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities

    Ivanov, R., Zamyatin, V., Klimenko, A., Matushkin, Y., Savostyanov, A. & Lashin, S., 11 сент. 2019, в: Genes. 10, 9, 14 стр., 699.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  129. Candidate SNP Markers of Atherosclerosis That May Significantly Change the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Human Gene Promoters

    Ponomarenko, M. P., Rasskazov, D. A., Chadaeva, I. V., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Ponomarenko, P. M., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K. & Kolchanov, N. A., 1 сент. 2019, в: Russian Journal of Genetics. 55, 9, стр. 1137-1151 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  130. Shaping Ethylene Response: The Role of EIN3/EIL1 Transcription Factors

    Dolgikh, V. A., Pukhovaya, E. M. & Zemlyanskaya, E. V., 26 авг. 2019, в: Frontiers in Plant Science. 10, стр. 1030 9 стр., 1030.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  131. Candidate SNP-markers of rheumatoid arthritis that can significantly alter the affinity of the TATA-binding protein for human gene promoters

    Chadaeva, I. V., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K., Ponomarenko, P. M., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Kozlov, V. A., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 1047-1058 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  132. Single nucleotide polymorphism rs110861313 in the intergenic region of chromosome 23 is associated with the development of leukosis in the Russian Black Pied cattle

    Aitnazarov, R. B., Ignatieva, E. V., Agarkova, T. A., Dvoeglazov, N. G., Osipova, N. A., Khramtsov, V. V. & Yudin, N. S., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 999-1005 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  133. Morphometry of the wheat spike by analyzing 2D images

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Smirnov, N. V., Kruchinina, Y. V., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 17 июл. 2019, в: Agronomy. 9, 7, 390.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  134. BioUML: an integrated environment for systems biology and collaborative analysis of biomedical data

    Kolpakov, F., Akberdin, I., Kashapov, T., Kiselev, L., Kolmykov, S., Kondrakhin, Y., Kutumova, E., Mandrik, N., Pintus, S., Ryabova, A., Sharipov, R., Yevshin, I. & Kel, A., 1 июл. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, W1, стр. W225-W233 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  135. Insight into genetic and social aspects of modern communities of deaf people in Siberia for forecasting the prevalence of hereditary deafness

    Posukh, O. L., Bady-Khoo, M. S., Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Smirnova, A. A., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Danilchenko, V. Y., Posukh, O. V. & Lashin, S. A., июл. 2019, в: European journal of human genetics. 27, стр. 1038-1038 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  136. Exome-wide search and functional annotation of genes associated in patients with severe tick-borne encephalitis in a Russian population

    Ignatieva, E. V., Yurchenko, A. A., Voevoda, M. I. & Yudin, N. S., 24 мая 2019, в: BMC Medical Genomics. 12, Suppl 3, стр. 61 23 стр., 61.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  137. New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes

    Ershov, N. I., Mordvinov, V. A., Prokhortchouk, E. B., Pakharukova, M. Y., Gunbin, K. V., Ustyantsev, K., Genaev, M. A., Blinov, A. G., Mazur, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Khrameeva, E., Chekanov, N., Fan, G., Xiao, A., Zhang, H., Xu, X., Yang, H., Solovyev, V., Lee, S. M. Y., еще 3Liu, X., Afonnikov, D. A. & Skryabin, K. G., 22 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, 1, стр. 399 22 стр., 399.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  138. Genomics research at Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology (BGRS\SB) conferences in Novosibirsk

    Orlov, Y. L., Kochetov, A. V., Li, G. & Kolchanov, N. A., 8 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, Suppl 3, 5 стр., 322.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  139. Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study

    Klimenko, A. I., Matushkin, Y. G., Kolchanov, N. A. & Lashin, S. A., 1 мая 2019, в: Ecological Modelling. 399, стр. 66-76 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  140. Genome analysis identifies the mutant genes for common industrial Silverblue and Hedlund white coat colours in American mink

    Manakhov, A. D., Andreeva, T. V., Trapezov, O. V., Kolchanov, N. A. & Rogaev, E. I., 14 мар. 2019, в: Scientific Reports. 9, 1, стр. 4581 8 стр., 4581.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  141. LSM-W 2: Laser scanning microscopy worker for wheat leaf surface morphology

    Zubairova, U. S., Verman, P. Y., Oshchepkova, P. A., Elsukova, A. S. & Doroshkov, A. V., 5 мар. 2019, в: BMC Systems Biology. 13, Suppl 1, стр. 22 12 стр., 22.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  142. Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  143. Evolutionary biology and biodiversity research at BGRS-2018

    Orlov, Y. L., Baranova, A. V., Kolchanov, N. A. & Moroz, L. L., 26 февр. 2019, в: BMC Evolutionary Biology. 19, Suppl 1, стр. 43 3 стр., 43.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  144. Natural selection equally supports the human tendencies in subordination and domination: A Genome-wide study with in silico confirmation and in vivo validation in mice

    Chadaeva, I., Ponomarenko, P., Rasskazov, D., Sharypova, E., Kashina, E., Kleshchev, M., Ponomarenko, M., Naumenko, V., Savinkova, L., Kolchanov, N., Osadchuk, L. & Osadchuk, A., 20 февр. 2019, в: Frontiers in Genetics. 10, FEB, 16 стр., 73.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  145. The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development

    Doroshkov, A. V., Konstantinov, D. K., Afonnikov, D. A. & Gunbin, K. V., 15 февр. 2019, в: BMC Plant Biology. 19, Suppl 1, 15 стр., 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  146. MIGREW: Database on molecular identification of genes for resistance in wheat

    Kazantsev, F. V., Skolotneva, E. S., Kelbin, V. N., Salina, E. A. & Lashin, S. A., 5 февр. 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, Suppl 1, 8 стр., 36.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  147. A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

    Kiselev, I. N., Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., D.V., P. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2019, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 14, 2, стр. 373-392 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  148. A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

    Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  149. Effect of neonatal dexamethasone treatment on cognitive abilities of adult male mice and gene expression in the hypothalamus

    Bondar, N. P., Reshetnikov, V. V., Burdeeva, K. V. & Merkulova, T. I., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 4, стр. 456-464 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  150. Image-based analysis of quantitative morphological characteristics of wild potato tubers using the desktop application SeedСounter

    Ivanova, K. A., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Egorova, A. A., Koloshina, K. A., Chalaya, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V., Rogozina, E. V. & Gerasimova, S. V., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 5, стр. 519-526 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  151. Progress in plant genome sequencing: Research directions

    Bragina, M. K., Afonnikov, D. A. & Salina, E. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 38-48 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  152. Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins

    Ivanisenko, V. A., Ivanisenko, T. V., Saik, O. V., Demenkov, P. S., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2019, Methods in Molecular Biology. Humana Press Inc., Том 1934. стр. 1-20 20 стр. (Methods in Molecular Biology; том 1934).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийглава/разделнаучнаяРецензирование

  153. 2018
  154. Deciphering auxin-ethylene crosstalk at a systems level

    Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V. & Mironova, V. V., 14 дек. 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 12, 15 стр., 4060.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  155. Regulatory SNPs and their widespread effects on the transcriptome

    Merkulov, V. M., Leberfarb, E. Y. & Merkulova, T. I., 1 дек. 2018, в: Journal of Biosciences. 43, 5, стр. 1069-1075 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  156. Rare Earth Elements alter redox balance in methylomicrobium alcaliphilum 20ZR

    Akberdin, I. R., Collins, D. A., Hamilton, R., Oshchepkov, D. Y., Shukla, A. K., Nicora, C. D., Nakayasu, E. S., Adkins, J. N. & Kalyuzhnaya, M. G., 27 нояб. 2018, в: Frontiers in Microbiology. 9, NOV, стр. 2735 12 стр., 2735.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  157. Genetic Organization of Open Chromatin Domains Situated in Polytene Chromosome Interbands in Drosophila

    Zykova, T. Y., Popova, O. O., Khoroshko, V. A., Levitsky, V. G., Lavrov, S. A. & Zhimulev, I. F., 1 нояб. 2018, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 483, 1, стр. 297-301 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  158. Residue coevolution reveals functionally important intramolecular interactions in formamidopyrimidine-DNA glycosylase

    Endutkin, A. V., Koptelov, S. S., Popov, A. V., Torgasheva, N. A., Lomzov, A. A., Tsygankova, A. R., Skiba, T. V., Afonnikov, D. A. & Zharkov, D. O., 1 сент. 2018, в: DNA Repair. 69, стр. 24-33 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  159. Novel approach to functional SNPs discovery from genome-wide data reveals promising variants for colon cancer risk

    Korbolina, E. E., Brusentsov, I. I., Bryzgalov, L. O., Leberfarb, E. Y., Degtyareva, A. O. & Merkulova, T. I., 1 июн. 2018, в: Human Mutation. 39, 6, стр. 851-859 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  160. A matrix metalloproteinase 9 (MMP9) gene single nucleotide polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced severe central nervous system disease

    Barkhash, A. V., Yurchenko, A. A., Yudin, N. S., Ignatieva, E. V., Kozlova, I. V., Borishchuk, I. A., Pozdnyakova, L. L., Voevoda, M. I. & Romaschenko, A. G., 1 мая 2018, в: Ticks and Tick-borne Diseases. 9, 4, стр. 763-767 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  161. Marital Structure, Genetic Fitness, and the GJB2 Gene Mutations among Deaf People in Yakutia (Eastern Siberia, Russia)

    Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Teryutin, F. M., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Pshennikova, V. G., Bondar, A. A., Morozov, I. V., Sazonov, N. N., Tomsky, M. I., Dzhemileva, L. U., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L. & Fedorova, S. A., 1 мая 2018, в: Russian Journal of Genetics. 54, 5, стр. 554-561 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  162. Human Genetic Predisposition to Diseases Caused by Viruses from Flaviviridae Family

    Yudin, N. S., Barkhash, A. V., Maksimov, V. N., Ignatieva, E. V. & Romaschenko, A. G., 27 апр. 2018, в: Molekuliarnaia biologiia. 52, 2, стр. 190-209 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  163. Haplotype analysis of APOE intragenic SNPs

    Babenko, V. N., Afonnikov, D. A., Ignatieva, E. V., Klimov, A. V., Gusev, F. E. & Rogaev, E. I., 19 апр. 2018, в: BMC Neuroscience. 19, Suppl 1, стр. 16 12 стр., 16.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  164. Novel functional variants at the GWAS-implicated loci might confer risk to major depressive disorder, bipolar affective disorder and schizophrenia

    Bryzgalov, L. O., Korbolina, E. E., Brusentsov, I. I., Leberfarb, E. Y., Bondar, N. P. & Merkulova, T. I., 19 апр. 2018, в: BMC Neuroscience. 19, Suppl 1, стр. 22 16 стр., 22.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  165. Molecular Adaptations to Social Defeat Stress and Induced Depression in Mice

    Bondar, N., Bryzgalov, L., Ershov, N., Gusev, F., Reshetnikov, V., Avgustinovich, D., Tenditnik, M., Rogaev, E. & Merkulova, T., 1 апр. 2018, в: Molecular Neurobiology. 55, 4, стр. 3394-3407 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  166. Polytene chromosomes – A portrait of functional organization of drosophila genome

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2018, в: Current Genomics. 19, 3, стр. 179-191 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  167. Pluripotency gene network dynamics: System views from parametric analysis

    Akberdin, I. R., Omelyanchuk, N. A., Fadeev, S. I., Leskova, N. E., Oschepkova, E. A., Kazantsev, F. V., Matushkin, Y. G., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 29 мар. 2018, в: PLoS ONE. 13, 3, стр. e0194464 24 стр., 0194464.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  168. Correction: Methane utilization in Methylomicrobium alcaliphilum 20ZR: A systems approach (Scientific Reports (2017) DOI: 10.1038/s41598-018-20574-z): a systems approach (vol 8, 2017)

    Akberdin, I. R., Thompson, M., Hamilton, R., Desai, N., Alexander, D., Henard, C. A., Guarnieri, M. T. & Kalyuzhnaya, M. G., 14 мар. 2018, в: Scientific Reports. 8, 1, стр. 4753 1 стр., 4753.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхкомментарий, выступлениеРецензирование

  169. Human Genetic Predisposition to Diseases Caused by Viruses from Flaviviridae Family

    Yudin, N. S., Barkhash, A. V., Maksimov, V. N., Ignatieva, E. V. & Romaschenko, A. G., 1 мар. 2018, в: Molecular Biology. 52, 2, стр. 165-181 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  170. Candidate SNP markers of reproductive potential are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters

    Chadaeva, I. V., Ponomarenko, P. M., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Kashina, E. V., Zhechev, D. A., Drachkova, I. A., Arkova, O. V., Savinkova, L. K., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A., Osadchuk, L. V. & Osadchuk, A. V., 9 февр. 2018, в: BMC Genomics. 19, Suppl 3, стр. 0 23 стр., 0.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  171. Consequences of early life stress on genomic landscape of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice

    Ershov, N. I., Bondar, N. P., Lepeshko, A. A., Reshetnikov, V. V., Ryabushkina, J. A. & Merkulova, T. I., 9 февр. 2018, в: BMC Genomics. 19, Suppl 3, стр. 93 11 стр., 93.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  172. Methane utilization in Methylomicrobium alcaliphilum 20ZR: A systems approach

    Akberdin, I. R., Thompson, M., Hamilton, R., Desai, N., Alexander, D., Henard, C. A., Guarnieri, M. T. & Kalyuzhnaya, M. G., 6 февр. 2018, в: Scientific Reports. 8, 1, стр. 2512 13 стр., 2512.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  173. Argo_CUDA: Exhaustive GPU based approach for motif discovery in large DNA datasets

    Vishnevsky, O. V., Bocharnikov, A. V. & Kolchanov, N. A., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 23 стр., 1740012.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  174. MAMMOTh: A new database for curated mathematical models of biomolecular systems

    Kazantsev, F., Akberdin, I., Lashin, S., Ree, N., Timonov, V., Ratushny, A., Khlebodarova, T. & Likhoshvai, V., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 16 стр., 1740010.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  175. Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana

    Cherenkov, P., Novikova, D., Omelyanchuk, N., Levitsky, V., Grosse, I., Weijers, D. & Mironova, V., 4 янв. 2018, в: Journal of Experimental Botany. 69, 2, стр. 329-339 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  176. High temperature and pressure influence the interdomain orientation of Nip7 proteins from P. abyssi and P. furiosus: MD simulations

    Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 2 янв. 2018, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 36, 1, стр. 68-82 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  177. An experimental study of the effect of rare polymorphisms of human HBB, HBD and F9 promoter TATA boxes on the kinetics of interaction with the TATA-binding protein

    Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Kashina, E. V., Rasskazov, D. A., Ponomarenko, M. P., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Savinkova, L. K., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 145-152 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  178. An integrated information system on bioresource collections of the FASO of Russia

    Lashin, S. A., Afonnikov, D. A., Genaev, M. A., Kazantsev, F. V., Komyshev, E. G., Oschepkova, E. A., Petrov, A. V., Rasskazov, D. A., Smirnova, A. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 3, стр. 386-393 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  179. Informational resources on potato germplasm collections

    Afonnikov, D. A., Totsky, I. V. & Stasevski, Z., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 115-121 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  180. Information system on microbial collections as a part of bioresource collections portal for Russia’s FASO organizations: A working protocol

    Kazantsev, F. V., Smirnova, A. A., Rozanov, A. S., Uvarova, Y. E., Afonnikov, D. A., Peltek, S. E. & Lashin, S. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 2, стр. 279-284 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  181. Leaf hairiness in potato Solanum tuberosum: Morphology, function and methods of analysis

    Doroshkov, A. V. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 46-53 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  182. Prioritization of genes associated with the pathogenesis of leukosis in cattle

    Yudin, N. S., Podkolodnyy, N. L., Agarkova, T. A. & Ignatieva, E. V., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 8, стр. 1063-1069 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  183. SpikeDroidDB: An information system for annotation of morphometric characteristics of wheat spike

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Hao, F., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 132-140 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  184. The bristle pattern development in Drosophila melanogaster: The prepattern and achaete-scute genes

    Furman, D. P. & Bukharina, T. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 8, стр. 1046-1054 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  185. The impact of early-life stress on the expression of HPA-associated genes in the adult murine brain

    Reshetnikov, V. V., Studenikina, A. A., Ryabushkina, J. A., Merkulova, T. I. & Bondar, N. P., 1 янв. 2018, в: Behaviour. 155, 2-3, стр. 181-203 23 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  186. Using the methods of systems biology for predicting perspective target genes to select C3 and C4 cereals for oxidative stress resistance

    Doroshkov, A. V. & Bobrovskikh, A. V., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 122-131 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  187. Wheat leaf epidermal pattern as a model for studying the influence of stress conditions on morphogenesis

    Zubairova, U. S. & Doroshkov, A. V., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 7, стр. 837-844 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  188. 2017
  189. A compendium and functional characterization of mammalian genes involved in adaptation to Arctic or Antarctic environments

    Yudin, N. S., Larkin, D. M. & Ignatieva, E. V., 28 дек. 2017, в: BMC Genetics. 18, Suppl 1, стр. 111 11 стр., 111.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  190. A database of human genes and a gene network involved in response to tick-borne encephalitis virus infection

    Ignatieva, E. V., Igoshin, A. V. & Yudin, N. S., 28 дек. 2017, в: BMC Evolutionary Biology. 17, Suppl 2, стр. 259 14 стр., 259.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  191. Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene

    Glagoleva, A. Y., Shmakov, N. A., Shoeva, O. Y., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Börner, A., Afonnikov, D. A. & Khlestkina, E. K., 14 нояб. 2017, в: BMC Plant Biology. 17, Suppl 1, стр. 182 9 стр., 182.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  192. Achievements and prospects of applying high-throughput sequencing techniques to potato genetics and breeding

    Bykova, I. V., Shmakov, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 1 нояб. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 7, стр. 736-743 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  193. Diversity of leaf pubescence in bread wheat and relative species

    Pshenichnikova, T. A., Doroshkov, A. V., Simonov, A. V., Afonnikov, D. A. & Börner, A., 1 окт. 2017, в: Genetic Resources and Crop Evolution. 64, 7, стр. 1761-1773 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  194. Candidate SNP markers of familial and sporadic Alzheimer's diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters

    Ponomarenko, P., Chadaeva, I., Rasskazov, D. A., Sharypova, E., Kashina, E. V., Drachkova, I., Zhechev, D., Ponomarenko, M. P., Savinkova, L. K. & Kolchanov, N., 20 июл. 2017, в: Frontiers in Aging Neuroscience. 9, JUL, стр. 231 24 стр., 231.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  195. Analysis of the neurogenesis: Prepattern gene network controlling first stage of bristle pattern development in Drosophila melanogaster

    Furman, D. P. & Bukharina, T. A., 1 июл. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 5, стр. 550-557 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  196. Expression dynamics of the REL, RELA, and IRF1 transcription factors in U937 macrophages after dioxin exposure

    Kashina, E. V., Oshchepkov, D. Y., Antontseva, E. V., Shamanina, M. Y., Furman, D. P. & Mordvinov, V. A., 1 июл. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 5, стр. 580-584 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  197. SNP_TATA_Comparator: genomewide landmarks for preventive personalized medicine

    Ponomarenko, M., Rasskazov, D., Chadaeva, I., Sharypova, E., Ponomarenko, P., Arkova, O., Kashina, E., Ivanisenko, N., Zhechev, D., Savinkova, L. & Kolchanov, N., 1 июн. 2017, в: Frontiers in bioscience (Scholar edition). 9, стр. 276-306 31 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  198. Systems biology analysis of the WOX5 gene and its functions in the root stem cell niche

    Oshchepkova, E. A., Omelyanchuk, N. A., Savina, M. S., Pasternak, T., Kolchanov, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., 1 июн. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 4, стр. 404-420 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  199. Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

    Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  200. Identification of residues of the archaeal RNA-binding Nip7 proteins specific to environmental conditions

    Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 апр. 2017, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 15, 2, стр. 1650036 18 стр., 1650036.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  201. Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines

    Boldyreva, L. V., Goncharov, F. P., Demakova, O. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Kolesnikov, N. N., Pindyurin, A. V., Semeshin, V. F. & Zhimulev, I. F., 1 апр. 2017, в: Current Genomics. 18, 2, стр. 214-226 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  202. AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs

    Kochetov, A. V., Allmer, J., Klimenko, A. I., Zuraev, B. S., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Hancock, J., 15 мар. 2017, в: Bioinformatics. 33, 6, стр. 923-925 3 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  203. Status and prospects of marker-assisted and genomic plant breeding

    Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Salina, E. A., Pershina, L. A., Khlestkina, E. K. & Shumny, V. K., 1 мар. 2017, в: Herald of the Russian Academy of Sciences. 87, 2, стр. 125-131 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  204. Orthoscape: A cytoscape application for grouping and visualization KEGG based gene networks by taxonomy and homology principles

    Mustafin, Z. S., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G., Gunbin, K. V. & Afonnikov, D. A., 27 янв. 2017, в: Bioinformatics. 18, Suppl 1, стр. 1-9 9 стр., 28.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  205. The interplay of chromatin landscape and DNA-binding context suggests distinct modes of EIN3 regulation in Arabidopsis thaliana

    Zemlyanskaya, E. V., Levitsky, V. G., Oshchepkov, D. Y., Grosse, I. & Mironova, V. V., 9 янв. 2017, в: Frontiers in Plant Science. 7, 9 стр., 2044.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  206. Evaluation of the SeedCounter, a mobile application for grain phenotyping

    Komyshev, E., Genaev, M. & Afonnikov, D., 4 янв. 2017, в: Frontiers in Plant Science. 7, стр. 1990 9 стр., 1990.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  207. Achievements and prospects of applying high-throughput sequencing techniques to potato genetics and breeding

    Bykova, I. V., Shmakov, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 1 янв. 2017, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 21, 1, стр. 96-103 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  208. Dihydroartemisinin counteracts fibrotic portal hypertension via farnesoid X receptor-dependent inhibition of hepatic stellate cell contraction

    Endutkin, A., Popov, A., Yudkina, A., Makasheva, K., Afonnikov, D., Simmerling, C. & Zharkov, D., 1 янв. 2017, в: FEBS Journal. 284, 1, стр. 114-133 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  209. Modern opportunities for improving quality of bakery products via realizing the bread wheat genetic potential-by-environment interactions (review)

    Khlestkina, E. K., Zhuravleva, E. V., Pshenichnikova, T. A., Usenko, N. I., Morozova, E. V., Osipova, S. V., Permyakova, M. D., Afonnikov, D. A. & Otmakhova, Y. S., 1 янв. 2017, в: Sel'skokhozyaistvennaya Biologiya. 52, 3, стр. 501-514 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  210. Online resources on gene networks containing human and animal data

    Ignatieva, E. V., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2017, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 21, 8, стр. 895-902 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  211. 2016
  212. Mechanical behavior of cells within a cell-based model of wheat leaf growth

    Zubairova, U., Nikolaev, S., Penenko, A., Podkolodnyy, N., Golushko, S., Afonnikov, D. & Kolchanov, N., 15 дек. 2016, в: Frontiers in Plant Science. 7, DECEMBER2016, 15 стр., 1878.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  213. 2015
  214. Development of artificial cognitive systems based on models of the brain of living organisms

    Putintsev, N. I., Vishnevsky, O. V. & Vityaev, E. E., 1 нояб. 2015, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 5, 6, стр. 589-600 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3081871