1. 2019
  2. Behavior and Depression Gene Networks Reconstruction and Analysis

    Ivanov, R. A., Zamyatin, V. I., Klimenko, A. I., Astakhova, T. N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. N. & Lashin, S. A., окт. 2019, SIBIRCON 2019 - International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences, Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 361-365 5 стр. 8958072. (SIBIRCON 2019 - International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences, Proceedings).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  3. Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities

    Ivanov, R., Zamyatin, V., Klimenko, A., Matushkin, Y., Savostyanov, A. & Lashin, S., 11 сент. 2019, в: Genes. 10, 9, 14 стр., 699.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  4. Candidate SNP Markers of Atherosclerosis That May Significantly Change the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Human Gene Promoters

    Ponomarenko, M. P., Rasskazov, D. A., Chadaeva, I. V., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Ponomarenko, P. M., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K. & Kolchanov, N. A., 1 сент. 2019, в: Russian Journal of Genetics. 55, 9, стр. 1137-1151 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. Shaping Ethylene Response: The Role of EIN3/EIL1 Transcription Factors

    Dolgikh, V. A., Pukhovaya, E. M. & Zemlyanskaya, E. V., 26 авг. 2019, в: Frontiers in Plant Science. 10, стр. 1030 9 стр., 1030.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  6. Candidate SNP-markers of rheumatoid arthritis that can significantly alter the affinity of the TATA-binding protein for human gene promoters

    Chadaeva, I. V., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K., Ponomarenko, P. M., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Kozlov, V. A., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 1047-1058 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. Single nucleotide polymorphism rs110861313 in the intergenic region of chromosome 23 is associated with the development of leukosis in the Russian Black Pied cattle

    Aitnazarov, R. B., Ignatieva, E. V., Agarkova, T. A., Dvoeglazov, N. G., Osipova, N. A., Khramtsov, V. V. & Yudin, N. S., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 999-1005 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. Morphometry of the wheat spike by analyzing 2D images

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Smirnov, N. V., Kruchinina, Y. V., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 17 июл. 2019, в: Agronomy. 9, 7, 390.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. BioUML: an integrated environment for systems biology and collaborative analysis of biomedical data

    Kolpakov, F., Akberdin, I., Kashapov, T., Kiselev, L., Kolmykov, S., Kondrakhin, Y., Kutumova, E., Mandrik, N., Pintus, S., Ryabova, A., Sharipov, R., Yevshin, I. & Kel, A., 1 июл. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, W1, стр. W225-W233 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. Insight into genetic and social aspects of modern communities of deaf people in Siberia for forecasting the prevalence of hereditary deafness

    Posukh, O. L., Bady-Khoo, M. S., Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Smirnova, A. A., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Danilchenko, V. Y., Posukh, O. V. & Lashin, S. A., июл. 2019, в: European journal of human genetics. 27, стр. 1038-1038 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

  11. Exome-wide search and functional annotation of genes associated in patients with severe tick-borne encephalitis in a Russian population

    Ignatieva, E. V., Yurchenko, A. A., Voevoda, M. I. & Yudin, N. S., 24 мая 2019, в: BMC Medical Genomics. 12, Suppl 3, стр. 61 23 стр., 61.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  12. New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes

    Ershov, N. I., Mordvinov, V. A., Prokhortchouk, E. B., Pakharukova, M. Y., Gunbin, K. V., Ustyantsev, K., Genaev, M. A., Blinov, A. G., Mazur, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Khrameeva, E., Chekanov, N., Fan, G., Xiao, A., Zhang, H., Xu, X., Yang, H., Solovyev, V., Lee, S. M. Y., еще 3Liu, X., Afonnikov, D. A. & Skryabin, K. G., 22 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, 1, стр. 399 22 стр., 399.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  13. Genomics research at Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology (BGRS\SB) conferences in Novosibirsk

    Orlov, Y. L., Kochetov, A. V., Li, G. & Kolchanov, N. A., 8 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, Suppl 3, 5 стр., 322.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study

    Klimenko, A. I., Matushkin, Y. G., Kolchanov, N. A. & Lashin, S. A., 1 мая 2019, в: Ecological Modelling. 399, стр. 66-76 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  15. Genome analysis identifies the mutant genes for common industrial Silverblue and Hedlund white coat colours in American mink

    Manakhov, A. D., Andreeva, T. V., Trapezov, O. V., Kolchanov, N. A. & Rogaev, E. I., 14 мар. 2019, в: Scientific Reports. 9, 1, стр. 4581 8 стр., 4581.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  16. LSM-W 2: Laser scanning microscopy worker for wheat leaf surface morphology

    Zubairova, U. S., Verman, P. Y., Oshchepkova, P. A., Elsukova, A. S. & Doroshkov, A. V., 5 мар. 2019, в: BMC Systems Biology. 13, Suppl 1, стр. 22 12 стр., 22.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  18. Evolutionary biology and biodiversity research at BGRS-2018

    Orlov, Y. L., Baranova, A. V., Kolchanov, N. A. & Moroz, L. L., 26 февр. 2019, в: BMC Evolutionary Biology. 19, Suppl 1, стр. 43 3 стр., 43.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. Natural selection equally supports the human tendencies in subordination and domination: A Genome-wide study with in silico confirmation and in vivo validation in mice

    Chadaeva, I., Ponomarenko, P., Rasskazov, D., Sharypova, E., Kashina, E., Kleshchev, M., Ponomarenko, M., Naumenko, V., Savinkova, L., Kolchanov, N., Osadchuk, L. & Osadchuk, A., 20 февр. 2019, в: Frontiers in Genetics. 10, FEB, стр. 73 16 стр., 73.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  20. The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development

    Doroshkov, A. V., Konstantinov, D. K., Afonnikov, D. A. & Gunbin, K. V., 15 февр. 2019, в: BMC Plant Biology. 19, Suppl 1, 15 стр., 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  21. MIGREW: Database on molecular identification of genes for resistance in wheat

    Kazantsev, F. V., Skolotneva, E. S., Kelbin, V. N., Salina, E. A. & Lashin, S. A., 5 февр. 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, Suppl 1, 8 стр., 36.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  22. A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

    Kiselev, I. N., Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., D.V., P. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2019, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 14, 2, стр. 373-392 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  23. A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

    Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  24. Effect of neonatal dexamethasone treatment on cognitive abilities of adult male mice and gene expression in the hypothalamus

    Bondar, N. P., Reshetnikov, V. V., Burdeeva, K. V. & Merkulova, T. I., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 4, стр. 456-464 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. Image-based analysis of quantitative morphological characteristics of wild potato tubers using the desktop application SeedСounter

    Ivanova, K. A., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Egorova, A. A., Koloshina, K. A., Chalaya, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V., Rogozina, E. V. & Gerasimova, S. V., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 5, стр. 519-526 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  26. Progress in plant genome sequencing: Research directions

    Bragina, M. K., Afonnikov, D. A. & Salina, E. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 38-48 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  27. Web-Based Computational Tools for the Prediction and Analysis of Posttranslational Modifications of Proteins

    Ivanisenko, V. A., Ivanisenko, T. V., Saik, O. V., Demenkov, P. S., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2019, Methods in Molecular Biology. Humana Press, Том 1934. стр. 1-20 20 стр. (Methods in Molecular Biology; том 1934).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › глава/раздел › научная › Рецензирование

  28. 2018
  29. Deciphering auxin-ethylene crosstalk at a systems level

    Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V. & Mironova, V. V., 14 дек. 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 12, 15 стр., 4060.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  30. Regulatory SNPs and their widespread effects on the transcriptome

    Merkulov, V. M., Leberfarb, E. Y. & Merkulova, T. I., 1 дек. 2018, в: Journal of Biosciences. 43, 5, стр. 1069-1075 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  31. Rare Earth Elements alter redox balance in methylomicrobium alcaliphilum 20ZR

    Akberdin, I. R., Collins, D. A., Hamilton, R., Oshchepkov, D. Y., Shukla, A. K., Nicora, C. D., Nakayasu, E. S., Adkins, J. N. & Kalyuzhnaya, M. G., 27 нояб. 2018, в: Frontiers in Microbiology. 9, NOV, стр. 2735 12 стр., 2735.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  32. Genetic Organization of Open Chromatin Domains Situated in Polytene Chromosome Interbands in Drosophila

    Zykova, T. Y., Popova, O. O., Khoroshko, V. A., Levitsky, V. G., Lavrov, S. A. & Zhimulev, I. F., 1 нояб. 2018, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 483, 1, стр. 297-301 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  33. Residue coevolution reveals functionally important intramolecular interactions in formamidopyrimidine-DNA glycosylase

    Endutkin, A. V., Koptelov, S. S., Popov, A. V., Torgasheva, N. A., Lomzov, A. A., Tsygankova, A. R., Skiba, T. V., Afonnikov, D. A. & Zharkov, D. O., 1 сент. 2018, в: DNA Repair. 69, стр. 24-33 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  34. Novel approach to functional SNPs discovery from genome-wide data reveals promising variants for colon cancer risk

    Korbolina, E. E., Brusentsov, I. I., Bryzgalov, L. O., Leberfarb, E. Y., Degtyareva, A. O. & Merkulova, T. I., 1 июн. 2018, в: Human Mutation. 39, 6, стр. 851-859 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  35. A matrix metalloproteinase 9 (MMP9) gene single nucleotide polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced severe central nervous system disease

    Barkhash, A. V., Yurchenko, A. A., Yudin, N. S., Ignatieva, E. V., Kozlova, I. V., Borishchuk, I. A., Pozdnyakova, L. L., Voevoda, M. I. & Romaschenko, A. G., 1 мая 2018, в: Ticks and Tick-borne Diseases. 9, 4, стр. 763-767 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  36. Marital Structure, Genetic Fitness, and the GJB2 Gene Mutations among Deaf People in Yakutia (Eastern Siberia, Russia)

    Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Teryutin, F. M., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Pshennikova, V. G., Bondar, A. A., Morozov, I. V., Sazonov, N. N., Tomsky, M. I., Dzhemileva, L. U., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L. & Fedorova, S. A., 1 мая 2018, в: Russian Journal of Genetics. 54, 5, стр. 554-561 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  37. Human Genetic Predisposition to Diseases Caused by Viruses from Flaviviridae Family

    Yudin, N. S., Barkhash, A. V., Maksimov, V. N., Ignatieva, E. V. & Romaschenko, A. G., 27 апр. 2018, в: Molekuliarnaia biologiia. 52, 2, стр. 190-209 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  38. Haplotype analysis of APOE intragenic SNPs

    Babenko, V. N., Afonnikov, D. A., Ignatieva, E. V., Klimov, A. V., Gusev, F. E. & Rogaev, E. I., 19 апр. 2018, в: BMC Neuroscience. 19, Suppl 1, стр. 16 12 стр., 16.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  39. Novel functional variants at the GWAS-implicated loci might confer risk to major depressive disorder, bipolar affective disorder and schizophrenia

    Bryzgalov, L. O., Korbolina, E. E., Brusentsov, I. I., Leberfarb, E. Y., Bondar, N. P. & Merkulova, T. I., 19 апр. 2018, в: BMC Neuroscience. 19, Suppl 1, стр. 22 16 стр., 22.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  40. Molecular Adaptations to Social Defeat Stress and Induced Depression in Mice

    Bondar, N., Bryzgalov, L., Ershov, N., Gusev, F., Reshetnikov, V., Avgustinovich, D., Tenditnik, M., Rogaev, E. & Merkulova, T., 1 апр. 2018, в: Molecular Neurobiology. 55, 4, стр. 3394-3407 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  41. Polytene chromosomes – A portrait of functional organization of drosophila genome

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2018, в: Current Genomics. 19, 3, стр. 179-191 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  42. Pluripotency gene network dynamics: System views from parametric analysis

    Akberdin, I. R., Omelyanchuk, N. A., Fadeev, S. I., Leskova, N. E., Oschepkova, E. A., Kazantsev, F. V., Matushkin, Y. G., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 29 мар. 2018, в: PLoS ONE. 13, 3, стр. e0194464 24 стр., 0194464.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. Correction: Methane utilization in Methylomicrobium alcaliphilum 20ZR: A systems approach (Scientific Reports (2017) DOI: 10.1038/s41598-018-20574-z): a systems approach (vol 8, 2017)

    Akberdin, I. R., Thompson, M., Hamilton, R., Desai, N., Alexander, D., Henard, C. A., Guarnieri, M. T. & Kalyuzhnaya, M. G., 14 мар. 2018, в: Scientific Reports. 8, 1, стр. 4753 1 стр., 4753.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › комментарий, выступление › Рецензирование

  44. Human Genetic Predisposition to Diseases Caused by Viruses from Flaviviridae Family

    Yudin, N. S., Barkhash, A. V., Maksimov, V. N., Ignatieva, E. V. & Romaschenko, A. G., 1 мар. 2018, в: Molecular Biology. 52, 2, стр. 165-181 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  45. Candidate SNP markers of reproductive potential are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters

    Chadaeva, I. V., Ponomarenko, P. M., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Kashina, E. V., Zhechev, D. A., Drachkova, I. A., Arkova, O. V., Savinkova, L. K., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A., Osadchuk, L. V. & Osadchuk, A. V., 9 февр. 2018, в: BMC Genomics. 19, Suppl 3, стр. 0 23 стр., 0.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  46. Consequences of early life stress on genomic landscape of H3K4me3 in prefrontal cortex of adult mice

    Ershov, N. I., Bondar, N. P., Lepeshko, A. A., Reshetnikov, V. V., Ryabushkina, J. A. & Merkulova, T. I., 9 февр. 2018, в: BMC Genomics. 19, Suppl 3, стр. 93 11 стр., 93.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  47. Methane utilization in Methylomicrobium alcaliphilum 20ZR: A systems approach

    Akberdin, I. R., Thompson, M., Hamilton, R., Desai, N., Alexander, D., Henard, C. A., Guarnieri, M. T. & Kalyuzhnaya, M. G., 6 февр. 2018, в: Scientific Reports. 8, 1, стр. 2512 13 стр., 2512.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  48. Argo_CUDA: Exhaustive GPU based approach for motif discovery in large DNA datasets

    Vishnevsky, O. V., Bocharnikov, A. V. & Kolchanov, N. A., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 23 стр., 1740012.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. MAMMOTh: A new database for curated mathematical models of biomolecular systems

    Kazantsev, F., Akberdin, I., Lashin, S., Ree, N., Timonov, V., Ratushny, A., Khlebodarova, T. & Likhoshvai, V., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 16 стр., 1740010.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana

    Cherenkov, P., Novikova, D., Omelyanchuk, N., Levitsky, V., Grosse, I., Weijers, D. & Mironova, V., 4 янв. 2018, в: Journal of Experimental Botany. 69, 2, стр. 329-339 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  51. High temperature and pressure influence the interdomain orientation of Nip7 proteins from P. abyssi and P. furiosus: MD simulations

    Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 2 янв. 2018, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 36, 1, стр. 68-82 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  52. An experimental study of the effect of rare polymorphisms of human HBB, HBD and F9 promoter TATA boxes on the kinetics of interaction with the TATA-binding protein

    Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Kashina, E. V., Rasskazov, D. A., Ponomarenko, M. P., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Savinkova, L. K., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 145-152 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

ID: 3081871