1. 2025
  2. Metabolomic and gene networks approaches reveal the role of mitochondrial membrane proteins in response of human melanoma cells to THz radiation

    Butikova, E. A., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Gaisler, E. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P. S., Makarova, A. L. A., Ivanisenko, T. V., Razumov, I. A., Kolomeyets, D. A., Cheresiz, S. V., Solovieva, O. I., Larionov, K. P., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Kolchanov, N. A., Pokrovsky, A. G., Vinokurov, N. A., Kanygin, V. V., Popik, V. M., еще 1Shevchenko, O. A., мар. 2025, в: Biochimica et Biophysica Acta - Molecular and Cell Biology of Lipids. 1870, 2, 159595.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. Plant Detection in RGB Images from Unmanned Aerial Vehicles Using Segmentation by Deep Learning and an Impact of Model Accuracy on Downstream Analysis

    Kozhekin, M. V., Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Zavyalov, Z. A. & Afonnikov, D. A., 20 янв. 2025, в: Journal of Imaging. 11, 1, 28.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. The Role of Long Noncoding RNAs in Plants

    Pronozin, A. Y. & Afonnikov, D. A., 20 янв. 2025, в: Russian Journal of Genetics. 61, 1, стр. 1-18 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Asymmetry of Motif Conservation Within Their Homotypic Pairs Distinguishes DNA-Binding Domains of Target Transcription Factors in ChIP-Seq Data

    Levitsky, V. G., Raditsa, V. V., Tsukanov, A. V., Mukhin, A. M., Zhimulev, I. F. & Merkulova, T. I., 4 янв. 2025, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 386.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Pharmacological targeting of caspase-8/c-FLIPL heterodimer enhances complex II assembly and elimination of pancreatic cancer cells

    König, C., Ivanisenko, N. V., Ivanisenko, V. A., Kulms, D. & Lavrik, I. N., 3 янв. 2025, в: Communications Biology. 8, 1, 4.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. The Effect of Codon Reassignment on the Properties and Structure of the Mitochondrial Proteins of the Baikal Amphipods

    Yudinceva, A. V., Romanova, E. V., Sherbakov, D. Y. & Bukin, Y. S., 2025, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 20, 1, стр. 54-70 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. 2024
  9. A software module to assess the metabolic potential of mutant strains of the bacterium Corynebacterium glutamicum

    Kazantsev, F. V., Trofimova, M. F., Khlebodarova, T. M., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 897-903 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Candidate SNP markers of changes in the expression levels of the human SCN9A gene as a hub gene for pain generation, perception, response and anesthesia

    Dotsenko, P. A., Zolotareva, K. A., Ivanov, R. A., Chadaeva, I. V., Podkolodnyy, N. L., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P. S., Lashin, S. A. & Ponomarenko, M. P., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 808-821 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Candidate SNP Markers Significantly Altering the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Promoters of Human Genes Associated with Primary Open-Angle Glaucoma

    Zolotareva, K., Dotsenko, P. A., Podkolodnyy, N., Ivanov, R., Makarova, A. L., Chadaeva, I., Bogomolov, A., Demenkov, P. S., Ivanisenko, V., Oshchepkov, D. & Ponomarenko, M., дек. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 23, 12802.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Computer analysis shows differences between mitochondrial miRNAs and other miRNAs

    Vorozheykin, P. S. & Titov, I. I., дек. 2024, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, стр. 834-842 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. MetArea: a software package for analysis of the mutually exclusive occurrence in pairs of motifs of transcription factor binding sites based on ChIP-seq data

    Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V. & Merkulova, T. I., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 822-833 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Nearly complete genome sequences of the first two identified Colorado potato beetle viruses

    Antonets, M., Bodnev, S., Rotskaya, U., Kosman, E., Tregubchak, T., Bauer, T., Azaev, M., Kryukov, V. & Antonets, D., дек. 2024, в: Scientific Reports. 14, 1, 9 стр., 352.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. Reconstruction and computational analysis of the microRNA regulation gene network in wheat drought response mechanisms

    Kleshchev, M. A., Maltseva, A. V., Antropova, E. A., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Orlov, Y. L., Chao, H., Chen, M., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 904-917 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. Root cap border cells as regulators of rhizosphere microbiota

    Omelyanchuk, N. A., Cherenko, V. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 918-926 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Search for and functional annotation of multi-domain PLA2 family proteins in flatworms

    Bocharnikova, M. E., Turnaev, I. I. & Afonnikov, D. A., дек. 2024, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, стр. 854-863 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Программа для проведения филостратиграфического анализа генных сетей Homo sapiens, полученных с помощью ANDSystem (ЭНДФилострат) / A program for conducting phylostratigraphic analysis of Homo sapiens gene networks obtained using ANDSystem (ANDPhylostrat)

    Яцык, И. В., Иванисенко, Т. В., Деменков, П. С. & Иванисенко, В. А., 27 нояб. 2024, Патент/Св-во № 2024688299, 24 окт. 2024, Дата приоритета 24 окт. 2024, № приоритета 2024685094

    Результаты исследований: Патенты/Свидетельства о регистрациисвидетельство о регистрации программы для ЭВМ

  19. Targeting type I DED interactions at the DED filament serves as a sensitive switch for cell fate decisions

    König, C., Ivanisenko, N. V., Hillert-Richter, L. K., Namjoshi, D., Natu, K., Espe, J., Reinhold, D., Kolchanov, N. A., Ivanisenko, V. A., Kähne, T., Bose, K. & Lavrik, I. N., 21 нояб. 2024, в: Cell Chemical Biology. 31, 11, стр. 1969-1985.e6 24 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. Design of Ctenophore Ca2+-Regulated Photoprotein Berovin Capable of Being Converted into Active Protein Under Physiological Conditions: Computational and Experimental Approaches

    Burakova, L. P., Ivanisenko, N. V., Rukosueva, N. V., Ivanisenko, V. A. & Vysotski, E. S., 19 нояб. 2024, в: Life. 14, 11, 1508.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Cytokinins regulate spatially specific ethylene production to control root growth in Arabidopsis

    Yamoune, A., Zdarska, M., Depaepe, T., Rudolfova, A., Skalak, J., Berendzen, K. W., Mira-Rodado, V., Fitz, M., Pekarova, B., Nicolas Mala, K. L., Tarr, P., Spackova, E., Tomovicova, L., Parizkova, B., Franczyk, A., Kovacova, I., Dolgikh, V., Zemlyanskaya, E., Pernisova, M., Novak, O., еще 4Meyerowitz, E., Harter, K., Van Der Straeten, D. & Hejatko, J., 11 нояб. 2024, в: Plant Communications. 5, 11, 17 стр., 101013.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. An Accurate and Efficient Approach to Knowledge Extraction from Scientific Publications Using Structured Ontology Models, Graph Neural Networks, and Large Language Models

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., 3 нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 21, 11811.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Image-Based Quantitative Analysis of Epidermal Morphology in Wild Potato Leaves

    Zubairova, U. S., Fomin, I. N., Koloshina, K. A., Barchuk, A. I., Erst, T. V., Chalaya, N. A., Gerasimova, S. V. & Doroshkov, A. V., 1 нояб. 2024, в: Plants. 13, 21, 14 стр., 3084.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. AI-Assisted Identification of Primary and Secondary Metabolomic Markers for Postoperative Delirium

    Ivanisenko, V. A., Rogachev, A. D., Makarova, A-L. A., Basov, N. V., Gaisler, E. V., Kuzmicheva, I. N., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Antropova, E. A., Kolchanov, N. A., Plesko, V. V., Moroz, G. B., Lomivorotov, V. V. & Pokrovsky, A. G., нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 21, 11847.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. Primary multistep phosphorelay activation comprises both cytokinin and abiotic stress responses: insights from comparative analysis of Brassica type-A response regulators

    Nicolas Mala, K. L., Skalak, J., Zemlyanskaya, E., Dolgikh, V., Jedlickova, V., Robert, H. S., Havlickova, L., Panzarova, K., Trtilek, M., Bancroft, I. & Hejatko, J., 1 окт. 2024, в: Journal of Experimental Botany. 75, 20, стр. 6346-6368 23 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. Catching the Big Fish in Big Data: A Meta-Analysis of Zebrafish Kidney scRNA-Seq Datasets Highlights Conserved Molecular Profiles of Macrophages and Neutrophils in Vertebrates

    Bobrovskikh, A. V., Zubairova, U. S., Naumenko, L. G. & Doroshkov, A. V., окт. 2024, в: Biology. 13, 10, 773.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. Evaluation of the Spike Diversity of Seven Hexaploid Wheat Species and an Artificial Amphidiploid Using a Quadrangle Model Obtained from 2D Images

    Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Kruchinina, Y. V., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., окт. 2024, в: Plants. 13, 19, 2736.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Genomic background sequences systematically outperform synthetic ones in de novo motif discovery for ChIP-seq data

    Raditsa, V. V., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G. & Levitsky, V. G., 1 сент. 2024, в: NAR Genomics and Bioinformatics. 6, 3, 15 стр., qae090.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. SmartCrop cognitive platform: modules for automatic knowledge extraction from scientific publications, patents and factual databases for reconstruction and analysis of gene networks of stress response in rice and wheat

    Иванисенко, В. А., Деменков, П. С., Иванисенко, Т. В., Антропова, Е. А., Волянская, А. Р., Зубаирова, У. С., Макарова, А-Л. А., Орлов, Ю. Л. & Chen, M., авг. 2024, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure Systems Biology (BGRS/SB-2024): The 14th International Multiconference (05-10 August 2024, Novosibirsk, Russia). Новосибирск: Institute of Cytology and Genetics of Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, стр. 2188-2190 3 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  30. Assembly and Genome Annotation of Different Strains of Apple Fruit Moth Virus (Cydia pomonella granulovirus)

    Лахова, Т. Н., Цыгичко, А., Клименко, А. И., Исмаилов, В., Васильев, Г., Асатурова, А. & Лашин, С. А., июл. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 13, 7146.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Computational Reconstruction of the Transcription Factor Regulatory Network Induced by Auxin in Arabidopsis thaliana L.

    Omelyanchuk, N. A., Lavrekha, V. V., Bogomolov, A. G., Dolgikh, V. A., Sidorenko, A. D. & Zemlyanskaya, E. V., июл. 2024, в: Plants. 13, 14, 1905.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Конвейер обработки гиперспектральных изображений на примере исследования зерен ячменя, содержащих меланин

    Busov, I. D., Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Koval, V. S., Zykova, T. E., Glagoleva, A. Y. & Afonnikov, D. A., июл. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 4, стр. 443-455 13 стр., 9.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. A bird's-eye overview of molecular mechanisms regulating feed intake in chickens—with mammalian comparisons

    Volyanskaya, A. R., Akberdin, I. R., Kulyashov, M. A., Yevshin, I. S., Romanov, M. N., Shagimardanova, E. I., Gusev, O. A. & Kolpakov, F. A., июн. 2024, в: Animal Nutrition. 17, стр. 61-74 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  34. Enrichment of Grain Anthocyanin Content through Marker-Assisted Breeding for Ant1, Ant2 or HvMyc2 Genes in Barley (Hordeum vulgare L.)

    Kukoeva, T. V., Molobekova, C. A., Totsky, I. V., Vasiliev, G. V., Pronozin, A. Y., Afonnikov, D. A., Khlestkina, E. K. & Shoeva, O. Y., июн. 2024, в: Agronomy. 14, 6, 1231.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Lake Baikal amphipods and their genomes, great and small

    Drozdova, P. B., Madyarova, E. V., Gurkov, A. N., Saranchina, A. E., Romanova, E. V., Petunina, J. V., Peretolchina, T. E., Sherbakov, D. Y. & Timofeyev, M. A., июн. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 3, стр. 317-325 9 стр., 6.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. Physiologically based pharmacokinetic model for predicting the biodistribution of albumin nanoparticles after induction and recovery from acute lung injury

    Кутумова, Е. О., Акбердин, И. Р., Egorova, V. S., Kolesova, E. P., Parodi, A., Pokrovsky, V. S., Zamyatnin Jr., A. A. & Колпаков, Ф. А., 30 мая 2024, в: Heliyon. 10, 10, 16 стр., e30962.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. Identification of Novel Loci Precisely Modulating Pre-Harvest Sprouting Resistance and Red Color Components of the Seed Coat in T. aestivum L.

    Afonnikova, S. D., Kiseleva, A. A., Fedyaeva, A. V., Komyshev, E. G., Koval, V. S., Afonnikov, D. A. & Salina, E. A., 9 мая 2024, в: Plants. 13, 10, 21 стр., 1309.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Biochemical, Genetic, and Grain Digital Evaluation of Soft Winter Wheat Varieties with Different Germination Index

    Fedyaeva, A. V., Afonnikova, S. D., Afonnikov, D. A., Smirnova, O. G., Deeva, V. N., Pryanishnikov, A. I. & Salina, E. A., апр. 2024, в: Russian Journal of Plant Physiology. 71, 2, 10 стр., 56.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Genetic Mechanisms Regulating Root Cap Cell Renewal in Arabidopsis thaliana L.

    Cherenko, V. A., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., апр. 2024, в: Russian Journal of Plant Physiology. 71, 2, 12 стр., 51.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  40. AtSNP_TATAdb: Candidate Molecular Markers of Plant Advantages Related to Single Nucleotide Polymorphisms within Proximal Promoters of Arabidopsis thaliana L.

    Bogomolov, A., Zolotareva, K., Filonov, S., Chadaeva, I., Rasskazov, D., Sharypova, E., Podkolodnyy, N., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Tverdokhleb, N., Khandaev, B., Kondratyuk, E., Podkolodnaya, O., Zemlyanskaya, E., Kolchanov, N. A. & Ponomarenko, M., янв. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 607.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. Hormone-regulated expansins: expression, localization, and cell wall biomechanics in Arabidopsis root growth

    Samalova, M., Melnikava, A., Elsayad, K., Peaucelle, A., Gahurova, E., Gumulec, J., Spyroglou, I., Zemlyanskaya, E. V., Ubogoeva, E. V., Balkova, D., Demko, M., Blavet, N., Alexiou, P., Benes, V., Mouille, G. & Hejatko, J., янв. 2024, в: Plant Physiology. 194, 1, стр. 209-228 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Peak Scores Significantly Depend on the Relationships between Contextual Signals in ChIP-Seq Peaks

    Vishnevsky, O. V., Bocharnikov, A. V. & Ignatieva, E. V., янв. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 1011.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. Computational identification of promising genetic markers associated with molecular mechanisms of reduced rice resistance to Rhizoctonia solani under excess nitrogen fertilization using gene network reconstruction and analysis methods

    Antropova, E. A., Volyanskaya, A. R., Adamovskaya, A. V., Demenkov, P. S., Yatsyk, I. V., Ivanisenko, T. V., Orlov, Y. L., Haoyu, C., Chen, M. & Ivanisenko, V. A., 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 960-973 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  44. Gene networks and metabolomic screening analysis revealed specific pathways of amino acid and acylcarnitine profile alterations in blood plasma of patients with Parkinson’s disease and vascular parkinsonism

    Makarova, A. A., Melnikova, P. M., Rogachev, A. D., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Predtechenskaya, E. V., Karmanov, S. Y., Koval, V. V., Pokrovsky, A. G., Lavrik, I. N., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., 2024, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, стр. 927-939 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  45. Investigation of metabolic features of glioblastoma tissue and the peritumoral environment using targeted metabolomics screening by LC-MS/MS and gene network analysis

    Basov, N. V., Adamovskaya, A. V., Rogachev, A. D., Gaisler, E. V., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Venzel, A. S., Mishinov, S. V., Stupak, V. V., Cheresiz, S. V., Oleshko, O. S., Butikova, E. A., Osechkova, A. E., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Pozdnyakov, A. S., Lavrik, I. N., Ivanisenko, V. A. & Pokrovsky, A. G., 2024, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, стр. 882-896 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. Orthoweb: a software package for evolutionary analysis of gene networks

    Ivanov, R. A., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Mustafin, Z. S., Afonnikov, D. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., 2024, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, стр. 874-881 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  47. PlantReg: the reconstruction of links between transcription factor regulatory networks and biological processes under their control

    Lavrekha, V. V., Omelyanchuk, N. A., Bogomolov, A. G. & Zemlyanskaya, E. V., 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 950-959 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  48. Reconstruction and computer analysis of the structural and functional organization of the gene network regulating cholesterol biosynthesis in humans and the evolutionary characteristics of the genes involved in the network

    Mikhailova, A. D., Lashin, S. A., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P. S. & Игнатьева, Е. В., 2024, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 28, 8, стр. 864-873 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  49. Reconstruction of gene regulatory networks from single cell transcriptomic data

    Rybakov, M. A., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 974-981 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  50. 2023
  51. State-of the-Art Constraint-Based Modeling of Microbial Metabolism: From Basics to Context-Specific Models with a Focus on Methanotrophs

    Куляшов, М. А., Колмыков, С. К., Хлебодарова, Т. М. & Акбердин, И. Р., 14 дек. 2023, в: Microorganisms. 11, 12, 22 стр., 2987.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  52. Fishing Innate Immune System Properties through the Transcriptomic Single-Cell Data of Teleostei

    Bobrovskikh, A. V., Zubairova, U. S. & Doroshkov, A. V., 12 дек. 2023, в: Biology. 12, 12, 1516.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  53. Программа расшифровки аббревиатур сущностей в рефератах научных публикаций на основе их контекста (ЭНДДекрипт) / Program for decoding entity abbreviations in abstracts of scientific publications based on their context (ANDDecrypt)

    Иванисенко, Т. В., Деменков, П. С. & Иванисенко, В. А., 8 дек. 2023, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Патент/Св-во № 2023686851, 16 нояб. 2023, Дата приоритета 16 нояб. 2023, № приоритета 2023684403

    Результаты исследований: Патенты/Свидетельства о регистрациисвидетельство о регистрации программы для ЭВМ

  54. DyCeModel: a tool for 1D simulation for distribution of plant hormones controlling tissue patterning

    Azarova, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mironova, V. V., Zemlyanskaya, E. V. & Lavrekha, V. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 890-897 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  55. Gbs-dp: a bioinformatics pipeline for processing data coming from genotyping by sequencing

    Pronozin, A. Y., Salina, E. A. & Afonnikov, D. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 737-745 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  56. Gene networks for use in metabolomic data analysis of blood plasma from patients with postoperative delirium

    Ivanisenko, V. A., Basov, N. V., Makarova, A. A., Venzel, A. S., Rogachev, A. D., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Kleshchev, M. A., Gaisler, E. V., Moroz, G. B., Plesko, V. V., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Lomivorotov, V. V., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 768-775 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  57. InterTransViewer: a comparative description of differential gene expression profiles from different experiments

    Tyapkin, А. V., Lavrekha, V. V., Ubogoeva, E. V., Oshchepkov, D. Y., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1042-1052 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  58. Intratumor heterogeneity: models of malignancy emergence and evolution

    Ivanov, R. A. & Lashin, S. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 815-819 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  59. Laboratory information systems for research management in biology

    Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V. & Lashin, S. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 898-905 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  60. Molecular-genetic pathways of hepatitis C virus regulation of the expression of cellular factors PREB and PLA2G4C, which play an important role in virus replication

    Mishchenko, E. L., Makarova, A. A., Antropova, E. A., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 776-783 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  61. Prioritization of potential pharmacological targets for the development of anti-hepatocarcinoma drugs modulating the extrinsic apoptosis pathway: the reconstruction and analysis of associative gene networks help

    Demenkov, P. S., Antropova, E. A., Adamovskaya, A. V., Mishchenko, E. L., Khlebodarova, T. M., Ivanisenko, T. V., Ivanisenko, N. V., Venzel, A. S., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 784-793 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  62. Reconstruction and analysis of the gene regulatory network for cell wall function in Arabidopsis thaliana L. leaves in response to water deficit

    Volyanskaya, A. R., Antropova, E. A., Zubairova, U. S., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Orlov, Y. L., Makarova, A. A., Ivanisenko, T. V., Gorshkova, T. A., Aglyamova, A. R., Kolchanov, N. A., Chen, M. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1031-1041 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  63. The central regulatory circuit in the gene network controlling the morphogenesis of Drosophila mechanoreceptors: an in silico analysis

    Bukharina, T. A., Golubyatnikov, V. P. & Furman, D. P., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 746-754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  64. Определение содержания меланина и антоцианов в зернах ячменя на основе анализа цифровых изображений методами машинного обучения

    Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Busov, I. D., Kozhekin, M. V., Artemenko, N. V., Glagoleva, A. Y., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 859-868 10 стр., 15.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  65. Bioinformatic Analysis Reveals the Role of Translation Elongation Efficiency Optimisation in the Evolution of Ralstonia Genus

    Korenskaia, A. Y., Matushkin, Y. G., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., 16 окт. 2023, в: Biology. 12, 10, 1338.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  66. Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder

    Uvarova, Y. E., Demenkov, P. S., Kuzmicheva, I. N., Venzel, A. S., Mischenko, E. L., Ivanisenko, T. V., Efimov, V. M., Bannikova, S. V., Vasilieva, A. R., Ivanisenko, V. A. & Peltek, S. E., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  67. BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration

    Orlov, Y. L., Chen, M., Kolchanov, N. A. & Hofestädt, R., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 20230032.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  68. Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Volianskaia, A. R., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Kolchanov, N. A., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  69. Central Regulatory Circuit of the Drosophila Mechanoreceptor Morphogenesis System: Effects of Mutations

    Furman, D. P., Bukharina, T. A. & Golubyatnikov, V. P., сент. 2023, в: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 17, 3, стр. 535-543 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  70. Delay-differential SEIR modeling for improved modelling of infection dynamics

    Киселев, И., Акбердин, И. Р. & Колпаков, Ф., 18 авг. 2023, в: Scientific Reports. 13, 1, 15 стр., 13439.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  71. Numerous Trigger-like Interactions of Kinases/Protein Phosphatases in Human Skeletal Muscles Can Underlie Transient Processes in Activation of Signaling Pathways during Exercise

    Vertyshev, A. Y., Akberdin, I. R. & Kolpakov, F. A., 7 июл. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 11223.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  72. Comparison of the evolutionary patterns of DNA repeats in ancient and young invertebrate species flocks of Lake Baikal

    Yuxiang, W., Peretolchina, T. E., Romanova, E. V. & Sherbakov, D. Y., июл. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 4, стр. 349-356 8 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  73. ICAnnoLncRNA: A Snakemake Pipeline for a Long Non-Coding-RNA Search and Annotation in Transcriptomic Sequences

    Pronozin, A. Y. & Afonnikov, D. A., 24 июн. 2023, в: Genes. 14, 7, 1331.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  74. A New Visualization and Analysis Method for a Convolved Representation of Mass Computational Experiments with Biological Models

    Klimenko, A. I., Vorobeva, D. A. & Lashin, S. A., июн. 2023, в: Mathematics. 11, 12, 2783.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  75. Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Salina, E. A., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., июн. 2023, в: Agronomy. 13, 6, 1454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  76. Research Topics of the Bioinformatics of Gene Regulation

    Orlov, Y. L., Anashkina, A. A., Kumeiko, V. V., Chen, M. & Kolchanov, N. A., 15 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 10, 8774.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  77. Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Vasiliev, G. V., Toshchakov, S. V., Shmakov, N. A., Genaev, M. A., Nesterov, M. A., Ibragimova, S. M., Rybakov, D. A., Gavrilenko, T. A., Salina, E. A., Patrushev, M. V., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., 16 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 6, 5713.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  78. Impact of Negative Feedbacks on De Novo Pyrimidines Biosynthesis in Escherichia coli

    Akberdin, I. R., Kozlov, K. N., Kazantsev, F. V., Fadeev, S. I., Likhoshvai, V. A. & Khlebodarova, T. M., 2 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 4806.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  79. Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato

    Kochetov, A. V., Shmakov, N., Afonnikov, D. A., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Egorova, A. A., Mironenko, N. V., Lashina, N. M., Khiutti, A. V. & Afanasenko, O. S., мар. 2023, в: Agronomy. 13, 3, 684.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  80. Differentially Expressed Genes and Molecular Susceptibility to Human Age-Related Diseases

    Shikhevich, S., Chadaeva, I., Khandaev, B., Kozhemyakina, R., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Bogomolov, A., Klimova, N. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Mustafin, Z., Markel, A., Savinkova, L., Kolchanov, N. A., Kozlov, V. & Ponomarenko, M., 16 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 3996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  81. Trait-Based Method of Quantitative Assessment of Ecological Functional Groups in the Human Intestinal Microbiome

    Kropochev, A. I., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G. & Klimenko, A. I., 11 янв. 2023, в: Biology. 12, 1, 115.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  82. Antitumor efficacy of multi-target in situ vaccinations with CpG oligodeoxynucleotides, anti-OX40, anti-PD1 antibodies, and aptamers

    Proskurina, A. S., Рузанова, В. С., Риттер, Г. С., Ефремов, Я. Р., Mustafin, Z. S., Лашин, С. А., Буракова, Е. А., Фокина, А. А., Zatsepin, T. S., Стеценко, Д. А., Леплина, О. Ю., Останин, А. А., Черных, Е. Р. & Bogachev, S. S., 2023, в: Journal of Biomedical Research. 37, 3, стр. 194-212 19 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  83. Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks

    Artemenko, N. V., Genaev, M. A., Epifanov, R. U., Komyshev, E. G., Kruchinina, Y. V., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 16 стр., 1336192.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  84. 2022
  85. Algorithm for the Reconstruction of Mathematical Frame Models of Bacterial Transcription Regulation

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Mukhin, A. M., Kolchanov, N. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2022, в: Mathematics. 10, 23, 4480.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  86. Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients

    Ivanisenko, V. A., Gaisler, E. V., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Cheresiz, S. V., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Mishchenko, E. L., Khripko, O. P., Khripko, Y. I., Voevoda, S. M., Karpenko, T. N., Velichko, A. J., Voevoda, M. I., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 12 стр., 19977.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  87. The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 14934.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  88. Компьютерный анализ особенностей регуляции гиперметилированных маркерных генов гепатокарциномы вирусными белками гепатита С

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 733-742 10 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  89. Контекстные сигналы в митохондриальных микроРНК млекопитающих

    Vishnevsky, O. V., Vorozheykin, P. S. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 819-825 7 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  90. Молекулярные механизмы детерминации клеток сосудистой системы корня Arabidopsis thaliana L

    Sidorenko, A. D., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 721-732 12 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  91. Свойства малого мира научных организаций определяют динамику публикационной активности в области миРНК

    Firsov, A. B. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 826-829 4 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  92. Фосфолипазы A2 человека: функциональный и эволюционный анализ

    Turnaev, I. I., Bocharnikova, M. E. & Afonnikov, D. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 787-797 11 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  93. Genomic analysis reveals cryptic diversity in aphelids and sheds light on the emergence of Fungi

    Mikhailov, K. V., Karpov, S. A., Letcher, P. M., Lee, P. A., Logacheva, M. D., Penin, A. A., Nesterenko, M. A., Pozdnyakov, I. R., Potapenko, E. V., Sherbakov, D. Y., Panchin, Y. V. & Aleoshin, V. V., 7 нояб. 2022, в: Current Biology. 32, 21, стр. 4607-4619.e7 21 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  94. Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling of Nanoparticle Biodistribution: A Review of Existing Models, Simulation Software, and Data Analysis Tools

    Кутумова, Е. О., Акбердин, И. Р., Киселев, И. Н., Шарипов, Р. Н., Егорова, В. С., Сырочева, А. О., Parodi, A., Замятнин, А. А. & Колпаков, Ф. А., 19 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 22 стр., 12560.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  95. Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes

    Korenskaia, A. E., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 19, 11996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  96. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  97. Web-MCOT Server for Motif Co-Occurrence Search in ChIP-Seq Data

    Levitsky, V. G., Mukhin, A. M., Oshchepkov, D. Y., Zemlyanskaya, E. V. & Lashin, S. A., 11 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8981.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  98. QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing

    Arif, M. A. R., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Koval, V. S., Shmakov, N. A., Börner, A. & Afonnikov, D. A., авг. 2022, в: Plants. 11, 16, 2105.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  99. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  100. BioUML—towards a universal research platform

    Колпаков, Ф., Акбердин, И. Р., Киселев, И., Колмыков, С. К., Кондрахин, Ю., Куляшов, М. А., Кутумова, Е., Пинтус, С. С., Рябова, А., Шарипов, Р. Н., Евшин, И., Жатченко, С. & Кель, А., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W124-W131 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  101. Multicompartmental Mathematical Model of SARS-CoV-2 Distribution in Human Organs and Their Treatment

    Afonyushkin, V. N., Акбердин, И. Р., Kozlova, Y., Щукин, И. А., Mironova, T., Bobikova, A., Cherepushkina, V., Donchenko, N., Poletaeva, Y. E. & Колпаков, Ф., 1 июн. 2022, в: Mathematics. 10, 11, 1925.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  102. Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus

    Zubairova, U. S., Kravtsova, A. Y., Romashchenko, A. V., Pushkareva, A. A. & Doroshkov, A. V., 1 июн. 2022, в: Plants. 11, 12, 1533.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  103. Modular Representation of Physiologically Based Pharmacokinetic Models: Nanoparticle Delivery to Solid Tumors in Mice as an Example

    Kutumova, E., Akberdin, I., Kiselev, I., Sharipov, R. & Kolpakov, F., 1 апр. 2022, в: Mathematics. 10, 7, 20 стр., 1176.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  104. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses

    Kirichenko, A. D., Poroshina, A. A., Sherbakov, D. Y., Sadovsky, M. G. & Krutovsky, K. V., мар. 2022, в: PLoS ONE. 17, 3, e0264640.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

Назад 1 2 3 Далее

ID: 3081871