Salicylic Acid Affects Root Meristem Patterning via Auxin Distribution in a Concentration-Dependent Manner

Pasternak, T., Groot, E. P., Kazantsev, F. V., Teale, W., Omelyanchuk, N., Kovrizhnykh, V., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 июл. 2019, в: Plant Physiology. 180, 3, стр. 1725-1739 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Insight into genetic and social aspects of modern communities of deaf people in Siberia for forecasting the prevalence of hereditary deafness

Posukh, O. L., Bady-Khoo, M. S., Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Smirnova, A. A., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Danilchenko, V. Y., Posukh, O. V. & Lashin, S. A., июл. 2019, в: European journal of human genetics. 27, стр. 1038-1038 1 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Capturing Auxin Response Factors Syntax Using DNA Binding Models

Stigliani, A., Martin-Arevalillo, R., Lucas, J., Bessy, A., Vinos-Poyo, T., Mironova, V., Vernoux, T., Dumas, R. & Parcy, F., 3 июн. 2019, в: Molecular Plant. 12, 6, стр. 822-832 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fluorescent labeling of ursolic acid with FITC for investigation of its cytotoxic activity using confocal microscopy

Frolova, T. S., Lipeeva, A. V., Baev, D. S., Baiborodin, S. I., Orishchenko, К. E., Kochetov, A. V. & Sinitsyna, O. I., 1 июн. 2019, в: Bioorganic Chemistry. 87, стр. 876-887 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes

Ershov, N. I., Mordvinov, V. A., Prokhortchouk, E. B., Pakharukova, M. Y., Gunbin, K. V., Ustyantsev, K., Genaev, M. A., Blinov, A. G., Mazur, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Khrameeva, E., Chekanov, N., Fan, G., Xiao, A., Zhang, H., Xu, X., Yang, H., Solovyev, V., Lee, S. M. Y., еще 3Liu, X., Afonnikov, D. A. & Skryabin, K. G., 22 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, 1, стр. 399 22 стр., 399.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study

Klimenko, A. I., Matushkin, Y. G., Kolchanov, N. A. & Lashin, S. A., 1 мая 2019, в: Ecological Modelling. 399, стр. 66-76 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genetic control of anthocyanin pigmentation of potato tissues

Strygina, K. V., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 18 мар. 2019, в: BMC Genetics. 20, Suppl 1, стр. 27 9 стр., 27.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development

Doroshkov, A. V., Konstantinov, D. K., Afonnikov, D. A. & Gunbin, K. V., 15 февр. 2019, в: BMC Plant Biology. 19, Suppl 1, 15 стр., 53.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MIGREW: Database on molecular identification of genes for resistance in wheat

Kazantsev, F. V., Skolotneva, E. S., Kelbin, V. N., Salina, E. A. & Lashin, S. A., 5 февр. 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, Suppl 1, 8 стр., 36.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Image-based analysis of quantitative morphological characteristics of wild potato tubers using the desktop application SeedСounter

Ivanova, K. A., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Egorova, A. A., Koloshina, K. A., Chalaya, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V., Rogozina, E. V. & Gerasimova, S. V., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 5, стр. 519-526 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Progress in plant genome sequencing: Research directions

Bragina, M. K., Afonnikov, D. A. & Salina, E. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 38-48 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Deciphering auxin-ethylene crosstalk at a systems level

Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V. & Mironova, V. V., 14 дек. 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 12, 15 стр., 4060.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Genetic Organization of Open Chromatin Domains Situated in Polytene Chromosome Interbands in Drosophila

Zykova, T. Y., Popova, O. O., Khoroshko, V. A., Levitsky, V. G., Lavrov, S. A. & Zhimulev, I. F., 1 нояб. 2018, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 483, 1, стр. 297-301 5 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Residue coevolution reveals functionally important intramolecular interactions in formamidopyrimidine-DNA glycosylase

Endutkin, A. V., Koptelov, S. S., Popov, A. V., Torgasheva, N. A., Lomzov, A. A., Tsygankova, A. R., Skiba, T. V., Afonnikov, D. A. & Zharkov, D. O., 1 сент. 2018, в: DNA Repair. 69, стр. 24-33 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Converting Hulled into Naked Barley through Targeted Knock-Out of the Nud1 Gene

Gerasimova, S., Hertig, C., Korotkova, A., Otto, I., Hiekel, S., Kochetov, A., Kumlehn, J. & Khlestkina, E., авг. 2018, в: In Vitro Cellular and Developmental Biology - Plant. 54, стр. S101-S101 1 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Marital Structure, Genetic Fitness, and the GJB2 Gene Mutations among Deaf People in Yakutia (Eastern Siberia, Russia)

Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Teryutin, F. M., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Pshennikova, V. G., Bondar, A. A., Morozov, I. V., Sazonov, N. N., Tomsky, M. I., Dzhemileva, L. U., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L. & Fedorova, S. A., 1 мая 2018, в: Russian Journal of Genetics. 54, 5, стр. 554-561 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Haplotype analysis of APOE intragenic SNPs

Babenko, V. N., Afonnikov, D. A., Ignatieva, E. V., Klimov, A. V., Gusev, F. E. & Rogaev, E. I., 19 апр. 2018, в: BMC Neuroscience. 19, Suppl 1, стр. 16 12 стр., 16.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Polytene chromosomes – A portrait of functional organization of drosophila genome

Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2018, в: Current Genomics. 19, 3, стр. 179-191 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Pluripotency gene network dynamics: System views from parametric analysis

Akberdin, I. R., Omelyanchuk, N. A., Fadeev, S. I., Leskova, N. E., Oschepkova, E. A., Kazantsev, F. V., Matushkin, Y. G., Afonnikov, D. A. & Kolchanov, N. A., 29 мар. 2018, в: PLoS ONE. 13, 3, стр. e0194464 24 стр., 0194464.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Spatial specificity of auxin responses coordinates wood formation

Brackmann, K., Qi, J., Gebert, M., Jouannet, V., Schlamp, T., Grünwald, K., Wallner, E. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Agustí, J., Sanchez, P., Lohmann, J. U. & Greb, T., 28 февр. 2018, в: Nature Communications. 9, 1, стр. 875 15 стр., 875.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MAMMOTh: A new database for curated mathematical models of biomolecular systems

Kazantsev, F., Akberdin, I., Lashin, S., Ree, N., Timonov, V., Ratushny, A., Khlebodarova, T. & Likhoshvai, V., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 16 стр., 1740010.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

High temperature and pressure influence the interdomain orientation of Nip7 proteins from P. abyssi and P. furiosus: MD simulations

Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 2 янв. 2018, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 36, 1, стр. 68-82 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

An integrated information system on bioresource collections of the FASO of Russia

Lashin, S. A., Afonnikov, D. A., Genaev, M. A., Kazantsev, F. V., Komyshev, E. G., Oschepkova, E. A., Petrov, A. V., Rasskazov, D. A., Smirnova, A. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 3, стр. 386-393 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Informational resources on potato germplasm collections

Afonnikov, D. A., Totsky, I. V. & Stasevski, Z., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 115-121 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Information system on microbial collections as a part of bioresource collections portal for Russia’s FASO organizations: A working protocol

Kazantsev, F. V., Smirnova, A. A., Rozanov, A. S., Uvarova, Y. E., Afonnikov, D. A., Peltek, S. E. & Lashin, S. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 2, стр. 279-284 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Leaf hairiness in potato Solanum tuberosum: Morphology, function and methods of analysis

Doroshkov, A. V. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 46-53 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

SpikeDroidDB: An information system for annotation of morphometric characteristics of wheat spike

Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Hao, F., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 132-140 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The morphogenic potential of Siberian potato cultivars in tissue cultures

Ibragimova, S. M., Romanova, A. V., Myzgina, G. K. & Kochetov, A. V., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 3, стр. 316-320 5 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Differential expression of NBS-LRR-encoding genes in the root transcriptomes of two Solanum phureja genotypes with contrasting resistance to Globodera rostochiensis

Kochetov, A. V., Glagoleva, A. Y., Strygina, K. V., Khlestkina, E. K., Gerasimova, S. V., Ibragimova, S. M., Shatskaya, N. V., Vasilyev, G. V., Afonnikov, D. A., Shmakov, N. A., Antonova, O. Y., Gavrilenko, T. A., Alpatyeva, N. V., Khiutti, A. & Afanasenko, O. S., 28 дек. 2017, в: BMC Plant Biology. 17, Suppl 2, стр. 251 10 стр., 251.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and diarch symmetry in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem

Lavrekha, V. V., Pasternak, T., Ivanov, V. B., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 дек. 2017, в: Plant Journal. 92, 5, стр. 834-845 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A database on genes increasing the resistance of wheat and its related species against pathogenic fungi

Smirnova, O. G. & Kochetov, A. V., 1 дек. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 8, стр. 816-821 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Metabolic pathways and genes identified by RNA-seq analysis of barley near-isogenic lines differing by allelic state of the Black lemma and pericarp (Blp) gene

Glagoleva, A. Y., Shmakov, N. A., Shoeva, O. Y., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Börner, A., Afonnikov, D. A. & Khlestkina, E. K., 14 нояб. 2017, в: BMC Plant Biology. 17, Suppl 1, стр. 182 9 стр., 182.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Achievements and prospects of applying high-throughput sequencing techniques to potato genetics and breeding

Bykova, I. V., Shmakov, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 1 нояб. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 7, стр. 736-743 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Diversity of leaf pubescence in bread wheat and relative species

Pshenichnikova, T. A., Doroshkov, A. V., Simonov, A. V., Afonnikov, D. A. & Börner, A., 1 окт. 2017, в: Genetic Resources and Crop Evolution. 64, 7, стр. 1761-1773 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Sacrifice-for-Survival Mechanism Protects Root Stem Cell Niche from Chilling Stress

Hong, J. H., Savina, M., Du, J., Devendran, A., Kannivadi Ramakanth, K., Tian, X., Sim, W. S., Mironova, V. V. & Xu, J., 29 июн. 2017, в: Cell. 170, 1, стр. 102-113.e14 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Systems biology analysis of the WOX5 gene and its functions in the root stem cell niche

Oshchepkova, E. A., Omelyanchuk, N. A., Savina, M. S., Pasternak, T., Kolchanov, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., 1 июн. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 4, стр. 404-420 17 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Mutational signatures and mutable motifs in cancer genomes

Rogozin, I. B., Pavlov, Y. I., Goncearenco, A., De, S., Lada, A. G., Poliakov, E., Panchenko, A. R. & Cooper, D. N., 30 мая 2017, в: Briefings in Bioinformatics. 19, 6, стр. 1085-1101 17 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Mechanisms regulating ethylene signal transduction in plants

Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ermakov, A. A. & Mironova, V. V., 1 мая 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 3, стр. 335-344 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Identification of residues of the archaeal RNA-binding Nip7 proteins specific to environmental conditions

Medvedev, K. E., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 апр. 2017, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 15, 2, стр. 1650036 18 стр., 1650036.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Protein and genetic composition of four chromatin types in Drosophila melanogaster cell lines

Boldyreva, L. V., Goncharov, F. P., Demakova, O. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Kolesnikov, N. N., Pindyurin, A. V., Semeshin, V. F. & Zhimulev, I. F., 1 апр. 2017, в: Current Genomics. 18, 2, стр. 214-226 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs

Kochetov, A. V., Allmer, J., Klimenko, A. I., Zuraev, B. S., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Hancock, J., 15 мар. 2017, в: Bioinformatics. 33, 6, стр. 923-925 3 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genome editing system CRISPR/CAS9 and peculiarities of its application in monocots

Gerasimova, S. V., Khlestkina, E. K., Kochetov, A. V. & Shumny, V. K., 1 мар. 2017, в: Russian Journal of Plant Physiology. 64, 2, стр. 141-155 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Status and prospects of marker-assisted and genomic plant breeding

Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Salina, E. A., Pershina, L. A., Khlestkina, E. K. & Shumny, V. K., 1 мар. 2017, в: Herald of the Russian Academy of Sciences. 87, 2, стр. 125-131 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The Systems Biology of Auxin in Developing Embryos

Mironova, V., Teale, W., Shahriari, M., Dawson, J. & Palme, K., 1 мар. 2017, в: Trends in Plant Science. 22, 3, стр. 225-235 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Orthoscape: A cytoscape application for grouping and visualization KEGG based gene networks by taxonomy and homology principles

Mustafin, Z. S., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G., Gunbin, K. V. & Afonnikov, D. A., 27 янв. 2017, в: Bioinformatics. 18, Suppl 1, стр. 1-9 9 стр., 28.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование