Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease

Maria, G., Andrey, P., Artem, S., Nikita, T., Andrey, K., Evgeny, K., Oxana, R., Maxim, F. & Veniamin, F., 11 дек. 2023, в: Epigenetics & chromatin. 16, 1, 13 стр., 48.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Ultrastructural Abnormalities in Induced Pluripotent Stem Cell-Derived Neural Stem Cells and Neurons of Two Cohen Syndrome Patients

Shnaider, T. A., Khabarova, A. A., Morozova, K. N., Yunusova, A. M., Yakovleva, S. A., Chvileva, A. S., Wolf, E. R., Kiseleva, E. V., Grigor'eva, E. V., Voinova, V. Y., Lagarkova, M. A., Pomerantseva, E. A., Musatova, E. V., Smirnov, A. V., Smirnova, A. V., Stoklitskaya, D. S., Arefieva, T. I., Larina, D. A., Nikitina, T. V. & Pristyazhnyuk, I. E., 25 нояб. 2023, в: Cells. 12, 23, 2702.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Functional Consequences of Pathogenic Variants of the GJB2 Gene (Cx26) Localized in Different Cx26 Domains

Posukh, O. L., Maslova, E. A., Danilchenko, V. Y., Zytsar, M. V. & Orishchenko, K. E., 13 окт. 2023, в: Biomolecules. 13, 10, 1521.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Robertsonian fusion triggers recombination suppression on sex chromosomes in Coleonyx geckos

Lisachov, A., Tishakova, K., Romanenko, S., Lisachova, L., Davletshina, G., Prokopov, D., Kratochvíl, L., O Brien, P., Ferguson-Smith, M., Borodin, P. & Trifonov, V., 19 сент. 2023, в: Scientific Reports. 13, 1, 10 стр., 15502.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Associations between the Efficiency of Hemispheric Verbal Memory Processes and the BDNF Val66Met Polymorphism in Men and Women

Volf, N. V., Privodnova, E. Y. & Bazovkina, D. V., мая 2023, в: Neuroscience and Behavioral Physiology. 53, 4, стр. 572-578 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Lampbrush chromosome studies in the post-genomic era

Krasikova, A., Fishman, V. & Kulikova, T., мая 2023, в: BioEssays. 45, 5, 7 стр., e2200250.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Chromosome Asynapsis Is the Main Cause of Male Sterility in the Interspecies Hybrids of East Asian Voles (Alexandromys, Rodentia, Arvicolinae)

Bikchurina, T., Pavlenko, M., Kizilova, E., Rubtsova, D., Sheremetyeva, I., Kartavtseva, I., Torgasheva, A. & Borodin, P., 30 апр. 2023, в: Genes. 14, 5, 1022.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The GJB2 (Cx26) Gene Variants in Patients with Hearing Impairment in the Baikal Lake Region (Russia)

Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Cherdonova, A. M., Borisova, T. V., Solovyev, A. V., Romanov, G. P., Morozov, I. V., Bondar, A. A., Posukh, O. L., Fedorova, S. A. & Barashkov, N. A., 28 апр. 2023, в: Genes. 14, 5, 1001.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Insight into the Natural History of Pathogenic Variant c.919-2A>G in the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss: The Evidence for Its Common Origin in Southern Siberia (Russia)

Danilchenko, V. Y., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Orishchenko, K. E. & Posukh, O. L., 17 апр. 2023, в: Genes. 14, 4, 928.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Cell type-specific interpretation of noncoding variants using deep learning-based methods

Sindeeva, M., Chekanov, N., Avetisian, M., Shashkova, T. I., Baranov, N., Malkin, E., Lapin, A., Kardymon, O. & Fishman, V., 20 мар. 2023, в: GigaScience. 12, стр. 1-11 11 стр., giad015.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Function and Evolution of the Loop Extrusion Machinery in Animals

Kabirova, E., Nurislamov, A., Shadskiy, A., Smirnov, A., Popov, A., Salnikov, P., Battulin, N. & Fishman, V., 6 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 5017.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells

Khabarova, A., Koksharova, G., Salnikov, P., Belokopytova, P., Mungalov, R., Pristyazhnuk, I., Nurislamov, A., Gridina, M. & Fishman, V., 26 февр. 2023, в: Chromosome Research. 31, 1, 15 стр., 11.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The Effect of Dietary Phospholipids on the Ultrastructure and Function of Intestinal Epithelial Cells

Saydakova, S., Morozova, K., Snytnikova, O., Morozova, M., Boldyreva, L., Kiseleva, E., Tsentalovich, Y. & Kozhevnikova, E., 16 янв. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 2, 1788.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fourth Report on Chicken Genes and Chromosomes 2022

Smith, J., Alfieri, J. M., Anthony, N., Arensburger, P., Athrey, G. N., Balacco, J., Balic, A., Bardou, P., Barela, P., Bigot, Y., Blackmon, H., Borodin, P. M., Carroll, R., Casono, M. C., Charles, M., Cheng, H., Chiodi, M., Cigan, L., Coghill, L. M., Crooijmans, R., еще 104Das, N., Davey, S., Davidian, A., Degalez, F., Dekkers, J. M., Derks, M., Diack, A. B., Djikeng, A., Drechsler, Y., Dyomin, A., Fedrigo, O., Fiddaman, S. R., Formenti, G., Frantz, L. A. F., Fulton, J. E., Gaginskaya, E., Galkina, S., Gallardo, R. A., Geibel, J., Gheyas, A. A., Godinez, C. J. P., Goodell, A., Graves, J. A. M., Griffin, D. K., Haase, B., Han, J-L., Hanotte, O., Henderson, L. J., Hou, Z-C., Howe, K., Huynh, L., Ilatsia, E., Jarvis, E. D., Johnson, S. M., Kaufman, J., Kelly, T., Kemp, S., Kern, C., Keroack, J. H., Klopp, C., Lagarrigue, S., Lamont, S. J., Lange, M., Lanke, A., Larkin, D. M., Larson, G., Layos, J. K. N., Lebrasseur, O., Malinovskaya, L. P., Martin, R. J., Martin Cerezo, M. L., Mason, A. S., McCarthy, F. M., McGrew, M. J., Mountcastle, J., Muhonja, C. K., Muir, W., Muret, K., Murphy, T. D., Ng'ang'a, I., Nishibori, M., O'Connor, R. E., Ogugo, M., Okimoto, R., Ouko, O., Patel, H. R., Perini, F., Pigozzi, M. I., Potter, K. C., Price, P. D., Reimer, C., Rice, E. S., Rocos, N., Rogers, T. F., Saelao, P., Schauer, J., Schnabel, R. D., Schneider, V. A., Simianer, H., Smith, A., Stevens, M. P., Stiers, K., Tiambo, C. K., Tixier-Boichard, M., Torgasheva, A. A., Tracey, A., Tregaskes, C. A., Vervelde, L., Wang, Y., Warren, W. C., Waters, P. D., Webb, D., Weigend, S., Wolc, A., Wright, A. E., Wright, D., Wu, Z., Yamagata, M., Yang, C., Yin, Z-T., Young, M. C., Zhang, G., Zhao, B. & Zhou, H., 2023, в: Cytogenetic and Genome Research. 162, 8-9, стр. 405-528 124 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

The Precise Breakpoint Mapping in Paracentric Inversion 10q22.2q23.3 by Comprehensive Cytogenomic Analysis, Multicolor Banding, and Single-Copy Chromosome Sequencing

Карамышева, Т. В., Татьяна, Г., Елисафенко, Е. А., Трифонов, В. А., Закирова, Э. Г., Орищенко, К. Е., Мария, П. А., Лопаткина, М. Е., Скрябин, Н. А., Лебедев, И. Н. & Рубцов, Н. Б., 14 дек. 2022, в: Biomedicines. 10, 12, 3255.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Identification of Iguania Ancestral Syntenic Blocks and Putative Sex Chromosomes in the Veiled Chameleon (Chamaeleo calyptratus, Chamaeleonidae, Iguania)

Tishakova, K. V., Prokopov, D. Y., Davletshina, G. I., Rumyantsev, A. V., O'Brien, P. C. M., Ferguson-Smith, M. A., Giovannotti, M., Lisachov, A. P. & Trifonov, V. A., 13 дек. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 24, 15838.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects

Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Taskina, A., Liang, J., Reijnders, M. J. M. F., Ruzzante, L., Feron, R., Waterhouse, R. M., Wu, Y., Mao, C., Tu, Z., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., дек. 2022, в: Nature Communications. 13, 1, 1960.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Evaluation of the α-casein (CSN1S1) locus as a potential target for a site-specific transgene integration

Smirnov, A. V., Kontsevaya, G. V., Shnaider, T. A., Yunusova, A. M., Feofanova, N. A., Gerlinskaya, L. A., Serova, I. A., Serov, O. L. & Battulin, N. R., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 7983.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

FastContext: A tool for identification of adapters and other sequence patterns in next generation sequencing (NGS) data

Viesná, Е. & Fishman, V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 806-809 4 стр., 10.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Method for the Isolation of “RNA-seq-Quality” RNA from Human Intervertebral Discs after Mortar and Pestle Homogenization

Ivanov, A. A., Leonova, O. N., Wiebe, D. S., Krutko, A. V., Gridina, M. M., Fishman, V. S., Aulchenko, Y. S., Tsepilov, Y. A. & Golubeva, T. S., нояб. 2022, в: Cells. 11, 22, 3578.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Selection of Diagnostically Significant Regions of the SLC26A4 Gene Involved in Hearing Loss

Danilchenko, V. Y., Zytsar, M. V., Maslova, E. A. & Posukh, O. L., нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13453.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes

Nurislamov, A., Lagunov, T., Gridina, M., Krasikova, A. & Fishman, V., 20 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 12601.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Editorial: The role of high-order chromatin organization in gene regulation

Fishman, V. & Pindyurin, A. V., 3 окт. 2022, в: Frontiers in Genetics. 13, 1045787.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › редакционная статья › Рецензирование

Germline-Restricted Chromosomes and Autosomal Variants Revealed by Pachytene Karyotyping of 17 Avian Species

Malinovskaya, L. P., Slobodchikova, A. Y., Grishko, E. O., Pristyazhnyuk, I. E., Torgasheva, A. A. & Borodin, P. M., 1 окт. 2022, в: Cytogenetic and Genome Research. 162, 3, стр. 148-160 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols

Gridina, M., Taskina, A., Lagunov, T., Nurislamov, A., Kulikova, T., Krasikova, A. & Fishman, V., окт. 2022, в: Heliyon. 8, 10, 6 стр., e11023.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The human EF1a promoter does not provide expression of the transgene in mice

Battulin, N., Korablev, A., Ryzhkova, A., Smirnov, A., Kabirova, E., Khabarova, A., Lagunov, T., Serova, I. & Serov, O., окт. 2022, в: Transgenic Research. 31, 4-5, стр. 525-535 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing

Arif, M. A. R., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Koval, V. S., Shmakov, N. A., Börner, A. & Afonnikov, D. A., авг. 2022, в: Plants. 11, 16, 2105.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics

Belokopytova, P., Viesná, E., Chiliński, M., Qi, Y., Salari, H., Di Stefano, M., Esposito, A., Conte, M., Chiariello, A. M., Teif, V. B., Plewczynski, D., Zhang, B., Jost, D. & Fishman, V., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W4-W12

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Establishment of the Primary Avian Gonadal Somatic Cell Lines for Cytogenetic Studies

Pristyazhnyuk, I. E., Malinovskaya, L. P. & Borodin, P. M., 1 июл. 2022, в: Animals. 12, 13, 1724.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Создание трансгенных мышей, восприимчивых к коронавирусам: платформа изучения вирусного патогенеза и тестирования вакцин

Battulin, N. R. & Serov, O. L., июл. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 4, стр. 402-408 7 стр., 9.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Manganese oxide nanoparticles inhibit selectively the in vitro and in vivo growth of human colorectal SW620 adenocarcinoma cells

Razumov, I. A., Troitskii, S. Y., Solovieva, O. I., Boldyrev, N. D. & Zavjalov, E. L., июн. 2022, в: Advances in Natural Sciences: Nanoscience and Nanotechnology. 13, 2, 025009.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Generation of iPS cell line (ICGi040-A) from skin fibroblasts of a patient with ring small supernumerary marker chromosome 4

Gridina, M. M., Nurislamov, A. R., Minina, J. M., Lopatkina, M. E., Drozdov, G. V., Vasilyev, S. A., Minaycheva, L. I., Belyaeva, E. O., Nikitina, T. V., Kashevarova, A. A., Lebedev, I. N., Karamysheva, T. V., Rubtsov, N. B. & Serov, O. L., мая 2022, в: Stem Cell Research. 61, 102740.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A common founder effect of the splice site variant c.-23 + 1G > A in GJB2 gene causing autosomal recessive deafness 1A (DFNB1A) in Eurasia

Solovyev, A. V., Kushniarevich, A., Bliznetz, E., Bady-Khoo, M., Lalayants, M. R., Markova, T. G., Minárik, G., Kádasi, L., Metspalu, E., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Khusnutdinova, E. K., Poliakov, A., Metspalu, M., Posukh, O. L., Barashkov, N. A. & Fedorova, S. A., апр. 2022, в: Human Genetics. 141, 3-4, стр. 697-707 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genetic etiology of hearing loss in Russia

Posukh, O. L., апр. 2022, в: Human Genetics. 141, 3-4, стр. 649-663 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network

Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Shishkina, O. D., Adonyeva, N. V., Karpova, E. K., Gruntenko, N. E., Zakharenko, L. P., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., 1 февр. 2022, в: Mathematics. 10, 3, 295.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Agent-Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population

Romanov, G. P., Smirnova, A. A., Zamyatin, V. I., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Solovyev, A. V., Fedorova, S. A., Posukh, O. L., Lashin, S. A. & Barashkov, N. A., февр. 2022, в: Biology. 11, 2, 257.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination

Afonnikov, D. A., Komyshev, E. G., Efimov, V. M., Genaev, M. A., Koval, V. S., Gierke, P. U. & Börner, A., 1 янв. 2022, в: Plants. 11, 1, 35.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

In Vivo Accelerator-Based Boron Neutron Capture Therapy for Spontaneous Tumors in Large Animals: Case Series

Kanygin, V., Kichigin, A., Zaboronok, A., Kasatova, A., Petrova, E., Tsygankova, A., Zavjalov, E., Mathis, B. J. & Taskaev, S., янв. 2022, в: Biology. 11, 1, 138.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Social behavior and spatial orientation in rat strains with genetic predisposition to catatonia (GC) and stereotypes (PM)

Plekanchuk, V. S., Prokudina, O. I. & Ryazanova, M. A., 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 3, стр. 281-289 9 стр., 7.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Ассоциации между эффективностью полушарных процессов вербальной памяти и BDNF-VAL66MET-полиморфизмом у мужчин и женщин

Volf, N. Y., Privodnova, E. Y. & Bazovkina, D. V., 2022, в: Zhurnal Vysshei Nervnoi Deyatelnosti Imeni I.P. Pavlova. 72, 6, стр. 826-835 10 стр., 5.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Derivation of Ringed Seal (Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells

Beklemisheva, V. R., Belokopytova, P. S., Fishman, V. S. & Menzorov, A. G., 1 дек. 2021, в: Cellular reprogramming. 23, 6, стр. 326-335 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Concatenation of transgenic DNA: Random or orchestrated?

Smirnov, A. & Battulin, N., дек. 2021, в: Genes. 12, 12, 1969.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Different Rates of the SLC26A4-Related Hearing Loss in Two Indigenous Peoples of Southern Siberia (Russia)

Danilchenko, V. Y., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Bady-Khoo, M. S., Barashkov, N. A., Morozov, I. V., Bondar, A. A. & Posukh, O. L., дек. 2021, в: Diagnostics. 11, 12, 2378.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genetic interplay between transcription factor Pou4f1/Brn3a and neurotrophin receptor Ret in retinal ganglion cell type specification

Muzyka, V. V. & Badea, T. C., дек. 2021, в: Neural Development. 16, 1, 5.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Evaluation of the OsTIR1 and AtAFB2 AID Systems for Genome Architectural Protein Degradation in Mammalian Cells

Yunusova, A., Smirnov, A., Shnaider, T., Lukyanchikova, V., Afonnikova, S. & Battulin, N., 4 нояб. 2021, в: Frontiers in Molecular Biosciences. 8, 757394.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Dose-dependent suppression of human glioblastoma xenograft growth by accelerator-based boron neutron capture therapy with simultaneous use of two boron-containing compounds

Kanygin, V., Razumov, I., Zaboronok, A., Zavjalov, E., Kichigin, A., Solovieva, O., Tsygankova, A., Guselnikova, T., Kasatov, D., Sycheva, T., Mathis, B. J. & Taskaev, S., нояб. 2021, в: Biology. 10, 11, 1124.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Ultrastructural heterogeneity of the mitochondrial population in rat embryonic and induced pluripotent stem cells

Suldina, L. A., Sorokina, A. E. & Morozova, K. N., нояб. 2021, в: Cell Biology International. 45, 11, стр. 2238-2250 13 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование