Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Роль аминокислотных остатков Arg243 и His239 в процессе узнавания поврежденного нуклеотида урацил-ДНК-гликозилазой человека SMUG1. / Яковлев, Данила Алексеевич; Алексеева, Ирина Владимировна; Кузнецов, Никита Александрович et al.
In: Биохимия, Vol. 85, No. 5, 8, 2020, p. 695-705.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Роль аминокислотных остатков Arg243 и His239 в процессе узнавания поврежденного нуклеотида урацил-ДНК-гликозилазой человека SMUG1
AU - Яковлев, Данила Алексеевич
AU - Алексеева, Ирина Владимировна
AU - Кузнецов, Никита Александрович
AU - Федорова, Ольга Семеновна
N1 - Яковлев Д.А., Алексеева И.В., Кузнецов Н.А., Федорова О.С. Роль аминокислотных остатков Arg243 и His239 в процессе узнавания поврежденного нуклеотида урацил-ДНК-гликозилазой человека SMUG1. // Биохимия. – 2020. – Т. 85. – № 5. - С. 695–705. Работа выполнена при поддержке Российского научного фонда (грант № 16-14-10038) и частичной поддержке бюджетного финансирования для обеспечения регламентных работ на использованном оборудовании № АААА-А17-117020210022-4.
PY - 2020
Y1 - 2020
N2 - Урацил-ДНК-гликозилаза человека SMUG1 удаляет из ДНК остатки урацила и некоторые другие неканонические или поврежденные основания. Несмотря на функциональную важность SMUG1, для нее до сих пор не получены рентгеноструктурные данные. Ранее нами проведено гомологичное моделирование структуры SMUG1 и сделан вывод о роли некоторых аминокислотных остатков в процессе узнавания поврежденных нуклеотидов и их удаления из ДНК. В настоящей работе методом «остановленного потока» в режиме реального времени по изменению интенсивности флуоресценции остатков Trp фермента и 2-аминопурина и флуорофоров, обеспечивающих резонансный перенос энергии флуоресценции (FRET), в ДНК изучена кинетика конформационных переходов в белке и ДНК-субстратах в ходе ферментативного процесса. Установлен кинетический механизм взаимодействия и рассчитаны кинетические параметры образования и распада интермедиатов реакции. Полученные результаты позволили уточнить роль а.о. His239 и Arg243 в процессе узнавания поврежденного нуклеотида и удаления повреждения при катализе урацил-ДНК-гликозилазой человека SMUG1.
AB - Урацил-ДНК-гликозилаза человека SMUG1 удаляет из ДНК остатки урацила и некоторые другие неканонические или поврежденные основания. Несмотря на функциональную важность SMUG1, для нее до сих пор не получены рентгеноструктурные данные. Ранее нами проведено гомологичное моделирование структуры SMUG1 и сделан вывод о роли некоторых аминокислотных остатков в процессе узнавания поврежденных нуклеотидов и их удаления из ДНК. В настоящей работе методом «остановленного потока» в режиме реального времени по изменению интенсивности флуоресценции остатков Trp фермента и 2-аминопурина и флуорофоров, обеспечивающих резонансный перенос энергии флуоресценции (FRET), в ДНК изучена кинетика конформационных переходов в белке и ДНК-субстратах в ходе ферментативного процесса. Установлен кинетический механизм взаимодействия и рассчитаны кинетические параметры образования и распада интермедиатов реакции. Полученные результаты позволили уточнить роль а.о. His239 и Arg243 в процессе узнавания поврежденного нуклеотида и удаления повреждения при катализе урацил-ДНК-гликозилазой человека SMUG1.
UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=42776231
UR - https://www.mendeley.com/catalogue/1c139edf-daf1-3c3c-915b-d95071a9798f/
U2 - 10.31857/S0320972520050085
DO - 10.31857/S0320972520050085
M3 - статья
VL - 85
SP - 695
EP - 705
JO - Биохимия
JF - Биохимия
SN - 0320-9725
IS - 5
M1 - 8
ER -
ID: 27138032