Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review
ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ. / Овчеренко, Сергей Сергеевич; Насонов, Дмитрий Михайлович; Шернюков, Андрей Владимирович et al.
X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ: Сборник тезисов. Новосибирск : ИПЦ НГУ, 2023. p. 377-378.Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review
}
TY - GEN
T1 - ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ
AU - Овчеренко, Сергей Сергеевич
AU - Насонов, Дмитрий Михайлович
AU - Шернюков, Андрей Владимирович
AU - Ендуткин, Антон Валентинович
AU - Жарков, Дмитрий Олегович
AU - Багрянская, Елена Григорьевна
N1 - Работа выполнена при поддержке гранта РНФ № 21-14-00219. Динамика открытия пар оснований oxog:C и oxog:A по данным методики ЯМР переноса намагниченности с воды / С. С. Овчеренко, Д. М. Насонов, А. В. Шернюков [и др.] // X международная конференция молодых ученых: биоинформатиков, биотехнологов, биофизиков, вирусологов и молекулярных биологов : Сборник тезисов, Новосибирск, 26–29 сентября 2023 года. – Новосибирск: Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, 2023. – С. 377-378. – DOI 10.25205/978-5-4437-1526-1-199.
PY - 2023
Y1 - 2023
N2 - Мы адаптировали протокол ЯМР CLEANEX-PM, чтобы измерить обмен иминопротонов ДНК с протонами воды и изучить динамику открытия пар оснований с 8-оксогуанином (oxoG): oxoG:C и oxoG:A и пар G:C и G:A в модельных дуплексах ДНК. По нашим данным пары oxoG:C не открываются легче G:C, что является аргументом против внеспирального захвата oxoG гликозилазами Fpg/OGG1. В парах oxoG:A равновесие сдвигается на 3-4 порядка в сторону открытого состояния, из чего предполагается внеспиральное распознавание MutY/MUTYH.
AB - Мы адаптировали протокол ЯМР CLEANEX-PM, чтобы измерить обмен иминопротонов ДНК с протонами воды и изучить динамику открытия пар оснований с 8-оксогуанином (oxoG): oxoG:C и oxoG:A и пар G:C и G:A в модельных дуплексах ДНК. По нашим данным пары oxoG:C не открываются легче G:C, что является аргументом против внеспирального захвата oxoG гликозилазами Fpg/OGG1. В парах oxoG:A равновесие сдвигается на 3-4 порядка в сторону открытого состояния, из чего предполагается внеспиральное распознавание MutY/MUTYH.
KW - Химический обмен
KW - Иминопротоны
KW - Намагниченность
KW - Протоны воды
UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=67362161&pff=1
UR - https://www.mendeley.com/catalogue/a61d8a8d-ad03-3bc0-9536-2de9acfb51c3/
U2 - 10.25205/978-5-4437-1526-1-199
DO - 10.25205/978-5-4437-1526-1-199
M3 - статья в сборнике материалов конференции
SN - 978-5-4437-1526-1
SP - 377
EP - 378
BT - X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ
PB - ИПЦ НГУ
CY - Новосибирск
T2 - X Международная конференция молодых ученых: биоинформатиков, биотехнологов, биофизиков, вирусологов и молекулярных биологов OpenBio-2023
Y2 - 26 September 2023 through 29 September 2023
ER -
ID: 65214014