TY - JOUR

T1 - Анализ влияния на сплайсинг вариантов гена SLC26A4, выявленных у пациентов с потерей слуха из Республик Тыва и Алтай (Южная Сибирь)

AU - Данильченко, Валерия Юрьевна

AU - Панина, Екатерина Алексеевна

AU - Зыцарь, Марина Вячеславовна

AU - Орищенко, Константин Евгеньевич

AU - Посух, Ольга Леонидовна

N1 - Анализ влияния на сплайсинг вариантов гена SLC26A4, выявленных у пациентов с потерей слуха из Республик Тыва и Алтай (Южная Сибирь) / В. Ю. Данильченко, Е. А. Панина, М. В. Зыцарь [и др.] // Медицинская генетика. – 2025. – Т. 24, № 4. – С. 53-55. – DOI 10.25557/2073-7998.2025.04.53-55. – EDN AAJNOT. Исследование выполнено при финансовой поддержке Российского научного фонда (грант № 24-75-00029, https://rscf.ru/project/24-75-00029/) и Министерства науки и высшего образования РФ (грант №FSUS-2024-0018).

PY - 2025

Y1 - 2025

N2 - Ген SLC26A4 является одним из наиболее значимых в этиологии наследственных форм потери слуха во многих популяциях мира. В настоящее время известно около 600 патогенных SLC26A4-вариантов и, по-видимому, не менее чем 25% из них приводят к нарушению сплайсинга. В работе представлены результаты экспериментального in vitro анализа влияния на сплайсинг нескольких редких вариантов гена SLC26A4, выявленных у пациентов с потерей слуха из Республик Тыва и Алтай (Южная Сибирь), с использованием системы минигенов. Выбор этих вариантов обусловлен неоднозначностью оценок, полученных с помощью биоинформатических прогностических программ. Экспериментально подтвержден патогенный эффект интронного варианта c.2034+1G>A, приводящего к аберрантному сплайсингу. Функциональный анализ интронного варианта c.1708-18T>A показал, что нарушение акцепторного сайта и пропуск экзона 16 наблюдался только в небольшой части транскриптов с этим вариантом, а три интронных варианта c.1545-168A>G, c.1708-125T>C, c.1804-31C>T и экзонный вариант c.1545T>G не влияют на процесс сплайсинга в системе in vitro. Полученные данные подчеркивают важность комплексного подхода при оценке эффектов генетических вариантов, сочетающего прогнозы in silico с функциональным анализом in vitro, что необходимо для корректной интерпретации выявленных генетических нарушений и постановки точного молекулярно-генетического диагноза.

AB - Ген SLC26A4 является одним из наиболее значимых в этиологии наследственных форм потери слуха во многих популяциях мира. В настоящее время известно около 600 патогенных SLC26A4-вариантов и, по-видимому, не менее чем 25% из них приводят к нарушению сплайсинга. В работе представлены результаты экспериментального in vitro анализа влияния на сплайсинг нескольких редких вариантов гена SLC26A4, выявленных у пациентов с потерей слуха из Республик Тыва и Алтай (Южная Сибирь), с использованием системы минигенов. Выбор этих вариантов обусловлен неоднозначностью оценок, полученных с помощью биоинформатических прогностических программ. Экспериментально подтвержден патогенный эффект интронного варианта c.2034+1G>A, приводящего к аберрантному сплайсингу. Функциональный анализ интронного варианта c.1708-18T>A показал, что нарушение акцепторного сайта и пропуск экзона 16 наблюдался только в небольшой части транскриптов с этим вариантом, а три интронных варианта c.1545-168A>G, c.1708-125T>C, c.1804-31C>T и экзонный вариант c.1545T>G не влияют на процесс сплайсинга в системе in vitro. Полученные данные подчеркивают важность комплексного подхода при оценке эффектов генетических вариантов, сочетающего прогнозы in silico с функциональным анализом in vitro, что необходимо для корректной интерпретации выявленных генетических нарушений и постановки точного молекулярно-генетического диагноза.

KW - НАСЛЕДСТВЕННАЯ ГЛУХОТА

KW - ГЕН SLC26A4

KW - БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ

KW - СПЛАЙСИНГ

KW - МИНИГЕНЫ

UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=82678833

U2 - 10.25557/2073-7998.2025.04.53-55

DO - 10.25557/2073-7998.2025.04.53-55

M3 - статья

VL - 24

SP - 53

EP - 55

JO - Медицинская генетика

JF - Медицинская генетика

SN - 2073-7998

IS - 4

ER -