Методика для стабильного выделения двуцепочечной РНК из штамма Escherichia coli нт115 без использования фенола

Standard

Методика для стабильного выделения двуцепочечной РНК из штамма Escherichia coli нт115 без использования фенола. / Иванов, Андрей Андреевич; Голубева, Татьяна Сергеевна.

In: Биоорганическая химия, Vol. 51, No. 4, 2025, p. 715-723.

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

BibTeX

@article{9df4530f5fbb474f9325e1fe07c65b60,

title = "Методика для стабильного выделения двуцепочечной РНК из штамма Escherichia coli нт115 без использования фенола",

abstract = "Получение фракции двуцепочечной РНК - неотъемлемая часть исследований РНК-интерференции, направленных на решение как фундаментальных, так и прикладных задач. Наработка дцРНК в культуре бактерий - распространенная методика в силу сравнительно невысокой стоимости и потенциала для масштабирования. В данной статье мы предлагаем новый метод для быстрого и эффективного выделения дцРНК из культуры бактерий в качестве альтернативы классической фенол-хлороформной экстракции. В разработанной нами методике фенол заменен на менее токсичный метанол, а выделенная таким образом бактериальная тотальная РНК содержит до 25% целевой молекулы, при этом примесь ДНК в ней отсутствует, что в том числе делает допустимым применение такой дцРНК без дополнительных этапов очистки. Применение разработанной методики будет оправдано в лабораториях, занимающихся как фундаментальными, так и прикладными исследованиями РНК-интерференции. Однако для масштабирования технологии для применения в сельском хозяйстве могут потребоваться корректировки описанного в данной работе протокола.",

keywords = "ДВУЦЕПОЧЕЧНАЯ РНК, ВЫДЕЛЕНИЕ РНК, НАРАБОТКА ДЦРНК В БАКТЕРИЯХ, РНК-ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ, СПРЕЙ-ИНДУЦИРОВАННЫЙ САЙЛЕНСИНГ ГЕНОВ",

author = "Иванов, {Андрей Андреевич} and Голубева, {Татьяна Сергеевна}",

note = "Иванов, А. А. Методика для стабильного выделения двуцепочечной РНК из штамма Escherichia coli нт115 без использования фенола / А. А. Иванов, Т. С. Голубева // Биоорганическая химия. – 2025. – Т. 51, № 4. – С. 715-723. – DOI 10.31857/S0132342325040158. – EDN LOLZTF. Исследование выполнено при поддержке проекта Министерства науки и высшего образования № FWNR-2022-0017. ",

year = "2025",

doi = "10.31857/S0132342325040158",

language = "русский",

volume = "51",

pages = "715--723",

journal = "Биоорганическая химия",

issn = "1998-2860",

publisher = "ФГБУ {"}Издательство {"}Наука{"}",

number = "4",

}

RIS

TY - JOUR

T1 - Методика для стабильного выделения двуцепочечной РНК из штамма Escherichia coli нт115 без использования фенола

AU - Иванов, Андрей Андреевич

AU - Голубева, Татьяна Сергеевна

N1 - Иванов, А. А. Методика для стабильного выделения двуцепочечной РНК из штамма Escherichia coli нт115 без использования фенола / А. А. Иванов, Т. С. Голубева // Биоорганическая химия. – 2025. – Т. 51, № 4. – С. 715-723. – DOI 10.31857/S0132342325040158. – EDN LOLZTF. Исследование выполнено при поддержке проекта Министерства науки и высшего образования № FWNR-2022-0017.

PY - 2025

Y1 - 2025

N2 - Получение фракции двуцепочечной РНК - неотъемлемая часть исследований РНК-интерференции, направленных на решение как фундаментальных, так и прикладных задач. Наработка дцРНК в культуре бактерий - распространенная методика в силу сравнительно невысокой стоимости и потенциала для масштабирования. В данной статье мы предлагаем новый метод для быстрого и эффективного выделения дцРНК из культуры бактерий в качестве альтернативы классической фенол-хлороформной экстракции. В разработанной нами методике фенол заменен на менее токсичный метанол, а выделенная таким образом бактериальная тотальная РНК содержит до 25% целевой молекулы, при этом примесь ДНК в ней отсутствует, что в том числе делает допустимым применение такой дцРНК без дополнительных этапов очистки. Применение разработанной методики будет оправдано в лабораториях, занимающихся как фундаментальными, так и прикладными исследованиями РНК-интерференции. Однако для масштабирования технологии для применения в сельском хозяйстве могут потребоваться корректировки описанного в данной работе протокола.

AB - Получение фракции двуцепочечной РНК - неотъемлемая часть исследований РНК-интерференции, направленных на решение как фундаментальных, так и прикладных задач. Наработка дцРНК в культуре бактерий - распространенная методика в силу сравнительно невысокой стоимости и потенциала для масштабирования. В данной статье мы предлагаем новый метод для быстрого и эффективного выделения дцРНК из культуры бактерий в качестве альтернативы классической фенол-хлороформной экстракции. В разработанной нами методике фенол заменен на менее токсичный метанол, а выделенная таким образом бактериальная тотальная РНК содержит до 25% целевой молекулы, при этом примесь ДНК в ней отсутствует, что в том числе делает допустимым применение такой дцРНК без дополнительных этапов очистки. Применение разработанной методики будет оправдано в лабораториях, занимающихся как фундаментальными, так и прикладными исследованиями РНК-интерференции. Однако для масштабирования технологии для применения в сельском хозяйстве могут потребоваться корректировки описанного в данной работе протокола.

KW - ДВУЦЕПОЧЕЧНАЯ РНК

KW - ВЫДЕЛЕНИЕ РНК

KW - НАРАБОТКА ДЦРНК В БАКТЕРИЯХ

KW - РНК-ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ

KW - СПРЕЙ-ИНДУЦИРОВАННЫЙ САЙЛЕНСИНГ ГЕНОВ

UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=82744023

U2 - 10.31857/S0132342325040158

DO - 10.31857/S0132342325040158

M3 - статья

VL - 51

SP - 715

EP - 723

JO - Биоорганическая химия

JF - Биоорганическая химия

SN - 1998-2860

IS - 4

ER -

ID: 74504444