Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Трансгенная клеточная линия с индуцируемой транскрипцией для исследования механизмов экспансии (CGG)n повторов. / Grishchenko, I. V.; Tulupov, A. A.; Rymareva, Y. M. et al.
In: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii, Vol. 25, No. 1, 12, 01.2021, p. 117-124.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Трансгенная клеточная линия с индуцируемой транскрипцией для исследования механизмов экспансии (CGG)n повторов
AU - Grishchenko, I. V.
AU - Tulupov, A. A.
AU - Rymareva, Y. M.
AU - Petrovskiy, E. D.
AU - Savelov, A. A.
AU - Korostyshevskaya, A. M.
AU - Maksimova, Y. V.
AU - Shorina, A. R.
AU - Shitik, E. M.
AU - Yudkin, D. V.
N1 - Грищенко И.В., Тулупов А.А., Рымарева Ю.М., Петровский Е.Д., Савелов А.А., Коростышевская А.М., Максимова Ю.В., Шорина А.Р., Шитик Е.М., Юдкин Д.В. Трансгенная клеточная линия с индуцируемой транскрипцией для исследования механизмов экспансии (CGG)n повторов // Вавиловский журнал генетики и селекции. - 2021. - Т. 25. - № 1. - С. 117-124
PY - 2021/1
Y1 - 2021/1
N2 - Существует ряд наследственных заболеваний человека, причиной которых является экспансия тандемных повторов. К ним относятся миотоническая дистрофия первого типа, болезнь Хантингтона, заболевания, ассоциированные с ломкой Х-хромосомой. Синдром ломкой Х-хромосомы - наиболее распространенная причина наследственной умственной отсталости у человека. На сегодняшний день причины развития экспансии остаются неисследованными. Важная особенность протяженных повторов - их способность формировать альтернативные вторичные структуры ДНК. Существуют гипотезы, объясняющие природу нестабильности повторов, однако все они предполагают возникновение устойчивых вторичных структур ДНК на различных этапах клеточного цикла. Источником нестабильности считаются нарушения в различных процессах метаболизма ДНК (репликация, репарация и рекомбинация), вызванные образованием вторичных структур. Однако ни одна из гипотез до конца не подтверждена и, видимо, не является единственно верной. Вероятно, в различных типах клеток и на определенных стадиях клеточного цикла источником нестабильности выступает множество процессов. В настоящей работе мы предлагаем экспериментальную систему для изучения вклада транскрипции и ассоциированной с ней репарации в нестабильность повтора (CGG)n, поскольку это наименее изученный механизм возникновения нестабильности. Однако предложенные модели могут учитывать вклад и других процессов метаболизма ДНК, например репликации, что делает полученные системы универсальными и применимыми в разных исследованиях. Нами были созданы трансгенные клеточные линии, несущие повтор нормальной и премутантной длины под тетрациклин-индуцируемым промотором. Один тип линий содержит плазмиду с экзогенным повтором, интегрированным в геном посредством транспозона Sleeping Beauty, в другой клеточной линии вектор поддерживается в виде эписомы благодаря ориджину репликации SV40. Такие трансгенные клеточные линии могут служить экспериментальной системой для поиска причин нестабильности и создания терапевтических средств. Кроме того, был разработан критерий для оценки нестабильности экзогенного (CGG)n повтора в геноме трансгенных клеточных линий, расчет которого не зависит от эффективности синтеза протяженных повторов.
AB - Существует ряд наследственных заболеваний человека, причиной которых является экспансия тандемных повторов. К ним относятся миотоническая дистрофия первого типа, болезнь Хантингтона, заболевания, ассоциированные с ломкой Х-хромосомой. Синдром ломкой Х-хромосомы - наиболее распространенная причина наследственной умственной отсталости у человека. На сегодняшний день причины развития экспансии остаются неисследованными. Важная особенность протяженных повторов - их способность формировать альтернативные вторичные структуры ДНК. Существуют гипотезы, объясняющие природу нестабильности повторов, однако все они предполагают возникновение устойчивых вторичных структур ДНК на различных этапах клеточного цикла. Источником нестабильности считаются нарушения в различных процессах метаболизма ДНК (репликация, репарация и рекомбинация), вызванные образованием вторичных структур. Однако ни одна из гипотез до конца не подтверждена и, видимо, не является единственно верной. Вероятно, в различных типах клеток и на определенных стадиях клеточного цикла источником нестабильности выступает множество процессов. В настоящей работе мы предлагаем экспериментальную систему для изучения вклада транскрипции и ассоциированной с ней репарации в нестабильность повтора (CGG)n, поскольку это наименее изученный механизм возникновения нестабильности. Однако предложенные модели могут учитывать вклад и других процессов метаболизма ДНК, например репликации, что делает полученные системы универсальными и применимыми в разных исследованиях. Нами были созданы трансгенные клеточные линии, несущие повтор нормальной и премутантной длины под тетрациклин-индуцируемым промотором. Один тип линий содержит плазмиду с экзогенным повтором, интегрированным в геном посредством транспозона Sleeping Beauty, в другой клеточной линии вектор поддерживается в виде эписомы благодаря ориджину репликации SV40. Такие трансгенные клеточные линии могут служить экспериментальной системой для поиска причин нестабильности и создания терапевтических средств. Кроме того, был разработан критерий для оценки нестабильности экзогенного (CGG)n повтора в геноме трансгенных клеточных линий, расчет которого не зависит от эффективности синтеза протяженных повторов.
KW - Fragile X syndrome
KW - Hereditary intellectual disability
KW - Repeat expansion
KW - Replication
KW - Somatic instability
KW - Transcription
KW - Transgenic cell lines
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85103784504&partnerID=8YFLogxK
UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=44831865
U2 - 10.18699/VJ21.014
DO - 10.18699/VJ21.014
M3 - статья
C2 - 34901709
AN - SCOPUS:85103784504
VL - 25
SP - 117
EP - 124
JO - Вавиловский журнал генетики и селекции
JF - Вавиловский журнал генетики и селекции
SN - 2500-0462
IS - 1
M1 - 12
ER -
ID: 28318175