TY - JOUR

T1 - Исследование инсектицидного и фунгицидного потенциала бактерий эндофитов пшеницы, сои и рапса методами биоинформатического анализа

AU - Lakhova, T. N.

AU - Klimenko, A. I.

AU - Vasiliev, G. V.

AU - Gyrnets, E. Yu

AU - Asaturova, A. M.

AU - Lashin, S. A.

N1 - Исследование инсектицидного и фунгицидного потенциала бактерий эндофитов пшеницы, сои и рапса методами биоинформатического анализа / Т.Н. Лахова, А.И. Клименко, Г.В. Васильев [и др.] // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2025. – Т. 29. - № 8. – С. 1304-1317. – DOI 10.18699/vjgb-25-137. – EDN ZLJWMR. Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 23-16-00260, https://rscf.ru/en/project/23-16-00260; тж при поддержке бюджетного проекта № FWNR-2022-0020.

PY - 2025

Y1 - 2025

N2 - Эндофитные бактерии способны влиять на доступность различных соединений, урожайность и рост сельскохозяйственных растений, а также обеспечивать устойчивость к болезням и вредителям. Поэтому исследование эндофитов сельско-хозяйственно значимых культурных растений является перспективной задачей в области биологической защиты растений. В данной работе рассмотрены изоляты штаммов бактерий, полученные из листьев и/или корней пшеницы, рапса и сои. Было произведено полногеномное секвенирование изолятов. С помощью аналитического конвейера собраны и охарактеризованы геномы 15 штаммов бактерий- эндофитов культурных растений, проанализирован их инсектицидный и фунгицидный потенциал. Анализ генного репертуара с помощью программы GenAPI показал высокую степень соответствия между генным репертуаром штамма BZR 585 относительно Alcaligenes phenolicus , BZR 762 и BZR 278 относительно Alcaligenes sp., BZR 588 и BZR 201P относительно Paenochrobactrum pullorum . Во всех штаммах, за исключением BZR 162, BZR 588 и BZR 201P, найдены гены, кодирующие белки, обладающие фунгицидной активностью, такие как итурины, фенгицины и сурфактины. Также во всех штаммах найдены гены, кодирующие белки с инсектицидной активностью, а именно: GroEL, Spp1Aa1, Spp1Aa2, Vpb1Ab1, Vpb4Ca1, HldE, фенгицин, микосубтилин и бацилломицин. Полученные геномные данные подтверждены экспериментальными испытаниями: ранее показана высокая инсектицидная активность штаммов BZR 1159, BZR 936, BZR 920 и др. против Galleria mellonella , Tenebrio molitor и Cydia pomonella , а также фунгицидные свойства против Fusarium , Alternaria , Trichothecium . Это демонстрирует практическую значимость выявленных генетических детерминант для создания новых агентов биоконтроля.

AB - Эндофитные бактерии способны влиять на доступность различных соединений, урожайность и рост сельскохозяйственных растений, а также обеспечивать устойчивость к болезням и вредителям. Поэтому исследование эндофитов сельско-хозяйственно значимых культурных растений является перспективной задачей в области биологической защиты растений. В данной работе рассмотрены изоляты штаммов бактерий, полученные из листьев и/или корней пшеницы, рапса и сои. Было произведено полногеномное секвенирование изолятов. С помощью аналитического конвейера собраны и охарактеризованы геномы 15 штаммов бактерий- эндофитов культурных растений, проанализирован их инсектицидный и фунгицидный потенциал. Анализ генного репертуара с помощью программы GenAPI показал высокую степень соответствия между генным репертуаром штамма BZR 585 относительно Alcaligenes phenolicus , BZR 762 и BZR 278 относительно Alcaligenes sp., BZR 588 и BZR 201P относительно Paenochrobactrum pullorum . Во всех штаммах, за исключением BZR 162, BZR 588 и BZR 201P, найдены гены, кодирующие белки, обладающие фунгицидной активностью, такие как итурины, фенгицины и сурфактины. Также во всех штаммах найдены гены, кодирующие белки с инсектицидной активностью, а именно: GroEL, Spp1Aa1, Spp1Aa2, Vpb1Ab1, Vpb4Ca1, HldE, фенгицин, микосубтилин и бацилломицин. Полученные геномные данные подтверждены экспериментальными испытаниями: ранее показана высокая инсектицидная активность штаммов BZR 1159, BZR 936, BZR 920 и др. против Galleria mellonella , Tenebrio molitor и Cydia pomonella , а также фунгицидные свойства против Fusarium , Alternaria , Trichothecium . Это демонстрирует практическую значимость выявленных генетических детерминант для создания новых агентов биоконтроля.

KW - biocontrol

KW - bioinformatics

KW - comparative genomics

KW - endophytes

KW - БИОИНФОРМАТИКА

KW - СРАВНИТЕЛЬНАЯ ГЕНОМИКА

KW - ЭНДОФИТЫ

KW - БИОКОНТРОЛЬ

UR - https://www.scopus.com/pages/publications/105028940548

UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=88850565

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/9e295921-2019-3107-8753-e9ef7545a66c/

U2 - 10.18699/vjgb-25-137

DO - 10.18699/vjgb-25-137

M3 - статья

C2 - 41660598

VL - 29

SP - 1304

EP - 1317

JO - Вавиловский журнал генетики и селекции

JF - Вавиловский журнал генетики и селекции

SN - 2500-0462

IS - 8

M1 - 16

ER -