Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Разработка метода детекции пространственных контактов плазмидной ДНК с геномом в клетках человека. / Ян, Александра Петровна; Сальников, Павел Александрович; Гридина, Мария Михайловна et al.
In: Биохимия, Vol. 89, No. 4, 2024, p. 612-622.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Разработка метода детекции пространственных контактов плазмидной ДНК с геномом в клетках человека
AU - Ян, Александра Петровна
AU - Сальников, Павел Александрович
AU - Гридина, Мария Михайловна
AU - Белокопытова, Полина Станиславовна
AU - Фишман, Вениамин Семенович
N1 - Работа выполнена при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (грант № FSUS-2024-0018). Разработка метода детекции пространственных контактов плазмидной ДНК с геномом в клеткахчеловека / А. П. Ян, П. А Сальников, М. М Гридина [и др.] // Биохимия. – 2024. – Т. 89, № 4. – С. 612-622. – DOI 10.31857/S0320972524040051. – EDN ZFUCFV.
PY - 2024
Y1 - 2024
N2 - Развитие методов захвата конформации хромосом кардинально изменило наше представление об архитектуре и динамике хроматина. Применение этих технологий для исследования разных организмов позволило раскрыть основные принципы организации хромосом. Однако структурная организация внехромосомных элементов, таких как вирусные геномы или плазмиды, и их взаимодействия с геномом хозяина остаются недостаточно исследованными. В данной работе мы представляем усовершенствованный протокол 4C, предназначенный для изучения взаимодействий ДНК плазмиды с ядерной ДНК. Мы разработали специфический плазмидный вектор и оптимизировали протокол для обеспечения высокой эффективности детекции контактов между плазмидой и ДНК хозяина.
AB - Развитие методов захвата конформации хромосом кардинально изменило наше представление об архитектуре и динамике хроматина. Применение этих технологий для исследования разных организмов позволило раскрыть основные принципы организации хромосом. Однако структурная организация внехромосомных элементов, таких как вирусные геномы или плазмиды, и их взаимодействия с геномом хозяина остаются недостаточно исследованными. В данной работе мы представляем усовершенствованный протокол 4C, предназначенный для изучения взаимодействий ДНК плазмиды с ядерной ДНК. Мы разработали специфический плазмидный вектор и оптимизировали протокол для обеспечения высокой эффективности детекции контактов между плазмидой и ДНК хозяина.
KW - Организация хроматина
KW - Плазмида
KW - Экстрахромосомные последовательности
KW - Взаимодействия плазмида-геном
KW - Захват конформации хромосом
KW - ТРАНСФЕКЦИЯ
KW - CHROMATIN INTERACTIONS
KW - 4C
KW - Plasmid
KW - extrachromosomal sequences
KW - plasmid-genome interactions
KW - chromosome conformation capture
KW - TRANSFECTION
UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=73525964
U2 - 10.31857/S0320972524040051
DO - 10.31857/S0320972524040051
M3 - статья
VL - 89
SP - 612
EP - 622
JO - Биохимия
JF - Биохимия
SN - 0320-9725
IS - 4
ER -
ID: 72009418