TY - JOUR

T1 - Генная сеть и база знаний по терморегуляции организма человека

AU - Ignatieva, E. V.

AU - Demenkov, P. S.

AU - Bogomolov, A. G.

AU - Ivanov, R. A.

AU - Lashin, S. A.

AU - Mikhailova, A. D.

AU - Alekseeva, A. E.

AU - Yudin, N. S.

N1 - Генная сеть и база знаний по терморегуляции организма человека / Е.В. Игнатьева, П.С. Деменков, А.Г. Богомолов [и др.] // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2025. – Т. 29. - № 7. – С. 1009-1019. – DOI 10.18699/vjgb-25-106. – EDN KVENIG. Исследование выполнено за счет средств бюджетного проекта ФИЦ ИЦиГ СО РАН «Системная биология и биоинформатика: реконструкция, анализ и моделирование структурно-функциональной организации и эволюции генных сетей человека, животных, растений и микроорганизмов» № FWNR-2022-0020. Авторы выражают благодарность В.А. Иванисенко за консультации по использованию ANDSystem.

PY - 2025

Y1 - 2025

N2 - Реконструкция и анализ генных сетей, регулирующих биологические процессы, - один из эффективных подходов к исследованию сложных систем обеспечения жизнедеятельности организмов. Терморегуляция - важное эволюционное приобретение человека и других теплокровных животных. Терморегуляция осуществляется при участии многих физиологических систем организма (нервной, сердечно-сосудистой, эндокринной, дыхательной, мышечной и т. д.), что способствует поддержанию относительно постоянной температуры тела в условиях колебания температуры окружающей среды. Цель работы - компьютерная реконструкция генной сети терморегуляции человека и представление полученных результатов в соответствующей базе знаний Termo_Reg_Human 1.0. Генная сеть реконструирована с использованием программно-информационной системы ANDSystem, предназначенной для автоматизированного извлечения знаний и фактов из текстов научных публикаций и баз данных биомедицинской направленности, основанной на методах машинного обучения и искусственного интеллекта. База знаний Termo_ Reg_Human 1.0 (https://www.sysbio.ru/ThermoReg_Human/) содержит информацию о генной сети терморегуляции человека, включая описание 469 генов, 473 белков и 265 микроРНК, значимых для ее функционирования; взаимодействиях между этими объектами, а также эволюционные характеристики генов. С использованием программного инструмента ANDVisio (модуля системы ANDSystem) проведена приоритизация каждого гена, белка и микроРНК, участвующих в терморегуляции организма человека по их функциональной нагруженности - количеству связей с другими объектами реконструированной генной сети. Установлено, что к числу ключевых объектов, имеющих наибольшее количество функциональных связей в генной сети терморегуляции человека, относятся гены UCP1 , VEGFA , PPARG , DDIT3, белки STAT3, JUN, VEGFA, TLR4, TNFA и микроРНК hsa-mir-335 и hsa-mir-26b. Обнаружено обогащение генной сети терморегуляции генами, предковые варианты которых сформировались на эволюционных этапах появления одноклеточных организмов и дивергенции позвоночных.

AB - Реконструкция и анализ генных сетей, регулирующих биологические процессы, - один из эффективных подходов к исследованию сложных систем обеспечения жизнедеятельности организмов. Терморегуляция - важное эволюционное приобретение человека и других теплокровных животных. Терморегуляция осуществляется при участии многих физиологических систем организма (нервной, сердечно-сосудистой, эндокринной, дыхательной, мышечной и т. д.), что способствует поддержанию относительно постоянной температуры тела в условиях колебания температуры окружающей среды. Цель работы - компьютерная реконструкция генной сети терморегуляции человека и представление полученных результатов в соответствующей базе знаний Termo_Reg_Human 1.0. Генная сеть реконструирована с использованием программно-информационной системы ANDSystem, предназначенной для автоматизированного извлечения знаний и фактов из текстов научных публикаций и баз данных биомедицинской направленности, основанной на методах машинного обучения и искусственного интеллекта. База знаний Termo_ Reg_Human 1.0 (https://www.sysbio.ru/ThermoReg_Human/) содержит информацию о генной сети терморегуляции человека, включая описание 469 генов, 473 белков и 265 микроРНК, значимых для ее функционирования; взаимодействиях между этими объектами, а также эволюционные характеристики генов. С использованием программного инструмента ANDVisio (модуля системы ANDSystem) проведена приоритизация каждого гена, белка и микроРНК, участвующих в терморегуляции организма человека по их функциональной нагруженности - количеству связей с другими объектами реконструированной генной сети. Установлено, что к числу ключевых объектов, имеющих наибольшее количество функциональных связей в генной сети терморегуляции человека, относятся гены UCP1 , VEGFA , PPARG , DDIT3, белки STAT3, JUN, VEGFA, TLR4, TNFA и микроРНК hsa-mir-335 и hsa-mir-26b. Обнаружено обогащение генной сети терморегуляции генами, предковые варианты которых сформировались на эволюционных этапах появления одноклеточных организмов и дивергенции позвоночных.

KW - ТЕПЛО

KW - ХОЛОД

KW - ГЕННАЯ СЕТЬ

KW - БАЗА ДАННЫХ

KW - МИКРОРНК

KW - ЭВОЛЮЦИЯ

KW - ФИЛОСТРАТИГРАФИЯ

KW - ВОЗРАСТ ГЕНА

KW - HEAT

KW - COLD

KW - GENE NETWORK

KW - DATABASE

KW - MICRORNA

KW - EVOLUTION

KW - PHYLOSTRATIGRAPHY

KW - GENE AGE

UR - https://www.scopus.com/pages/publications/105024818675

UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=87328047

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/f85130ad-a38a-3dac-b133-2c804601a38d/

U2 - 10.18699/vjgb-25-106

DO - 10.18699/vjgb-25-106

M3 - статья

C2 - 41536788

VL - 29

SP - 1009

EP - 1019

JO - Вавиловский журнал генетики и селекции

JF - Вавиловский журнал генетики и селекции

SN - 2500-0462

IS - 7

M1 - 9

ER -