Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Молекулярно-генетический анализ персональных культур клеток увеальной меланомы. / Zhilnikova, Mariya V.; Atamanov, Vasilii V.; Zvereva, Sof'ya P. et al.
In: Fyodorov Journal of Ophthalmic Surgery, Vol. 140, No. 2s, 8, 2024, p. 63-71.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Молекулярно-генетический анализ персональных культур клеток увеальной меланомы
AU - Zhilnikova, Mariya V.
AU - Atamanov, Vasilii V.
AU - Zvereva, Sof'ya P.
AU - Gayner, Tat'yana A.
AU - Boyarskikh, Ul'yana A.
AU - Stanishevskaya, Ol'ga M.
AU - Chernykh, Dmitrii V.
AU - Kononova, Natal'ya V.
AU - Koval', Ol'ga A.
N1 - Молекулярно-генетический анализ персональных культур клеток увеальной меланомы / М.В. Жильникова, В.В. Атаманов, С.П. Зверева [и др.] // Офтальмохирургия. – 2024. – № S2. – С. 63-71. Исследование было поддержано грантом Российского Научного Фонда № 23-14-00285 и реализовано в рамках государственного задания ИХБФМ СО РАН № 121030200173-6 (NGS-секвенирование).
PY - 2024
Y1 - 2024
N2 - Актуальность. Увеальная меланома (УМ) является одним из подтипов меланом, на которую приходится основная доля онкологических заболеваний глаза у взрослых. У половины пациентов с УМ развиваются метастатические формы заболевания, которые имеют неблагоприятный прогноз. Редкая встречаемость заболевания не позволяет проводить широкомасштабные клинические испытания новых методов и препаратов, что ограничивает прогресс в его лечении. Перспективным подходом к определению молекулярно-генетических особенностей опухолевых меланоцитов и оценке эффективности новых противоопухолевых препаратов является использование с этой целью персональных культур клеток, полученных из опухолевого материала пациентов.Цель. Оценка агрессивности меланомы хориоидеи путем молекулярно-генетической характеристики выделенных из опухоли меланоцитов. Материал и методы. Исследование проведено на персональных культурах клеток УМ человека. Кариотипирование клеток выполнено на основе анализа GTG-окрашивания метафазных пластинок, мутационная нагрузка оценивалась по данным NGS-секвенирования, белковые продукты оценивались методом вестерн-блоттинга.Результаты. В работе из опухолевого материала пациентов с диагнозом УМ для изучения молекулярно-генетических особенностей были получены 3 персональные культуры клеток УМ человека - uMel1, uMel3 и uMel5, прошедшие не менее 22 пассажей. Поскольку развитие метастатической формы УМ коррелирует с хромосомными аномалиями в опухолевых меланоцитах, проведено кариотипирование культивируемых клеток, которое показало, что большинство из них имело околодиплоидный фенотип. Только в клетках культур uMell и uMel3 присутствовали характерные для УМ перестройки в хромосомах 3, 6 и 8. В клетках uMel5 выявлена делеция в районе длинного плеча хромосомы 11. Кроме того, у пациента с опухолью uMel5 ранее в анамнезе присутствовала меланома кожи, а профиль характерных соматических мутаций меланомы кожи отличается от такового для УМ. Методом NGS-секвенирования были проанализированы соматические мутации в горячих точках генов ALK, BRAF EGFR, HER2, IL17RA, KRAS, MET и NRAS. В исследуемых локусах в клетках всех исследуемых культур мутаций обнаружено не было. Анализ опухолевого супрессора BAP1 (BRCA-ассоциированный белок) показал его низкое содержание в культурах клеток uMel3 и uMel5, что может указывать на высокую вероятность метастазирования.Заключение. Полученные персональные культуры клеток УМ являются моделями заболевания, позволяющими исследовать in vitro и in vivo УМ с различными молекулярно-генетическими особенностями.
AB - Актуальность. Увеальная меланома (УМ) является одним из подтипов меланом, на которую приходится основная доля онкологических заболеваний глаза у взрослых. У половины пациентов с УМ развиваются метастатические формы заболевания, которые имеют неблагоприятный прогноз. Редкая встречаемость заболевания не позволяет проводить широкомасштабные клинические испытания новых методов и препаратов, что ограничивает прогресс в его лечении. Перспективным подходом к определению молекулярно-генетических особенностей опухолевых меланоцитов и оценке эффективности новых противоопухолевых препаратов является использование с этой целью персональных культур клеток, полученных из опухолевого материала пациентов.Цель. Оценка агрессивности меланомы хориоидеи путем молекулярно-генетической характеристики выделенных из опухоли меланоцитов. Материал и методы. Исследование проведено на персональных культурах клеток УМ человека. Кариотипирование клеток выполнено на основе анализа GTG-окрашивания метафазных пластинок, мутационная нагрузка оценивалась по данным NGS-секвенирования, белковые продукты оценивались методом вестерн-блоттинга.Результаты. В работе из опухолевого материала пациентов с диагнозом УМ для изучения молекулярно-генетических особенностей были получены 3 персональные культуры клеток УМ человека - uMel1, uMel3 и uMel5, прошедшие не менее 22 пассажей. Поскольку развитие метастатической формы УМ коррелирует с хромосомными аномалиями в опухолевых меланоцитах, проведено кариотипирование культивируемых клеток, которое показало, что большинство из них имело околодиплоидный фенотип. Только в клетках культур uMell и uMel3 присутствовали характерные для УМ перестройки в хромосомах 3, 6 и 8. В клетках uMel5 выявлена делеция в районе длинного плеча хромосомы 11. Кроме того, у пациента с опухолью uMel5 ранее в анамнезе присутствовала меланома кожи, а профиль характерных соматических мутаций меланомы кожи отличается от такового для УМ. Методом NGS-секвенирования были проанализированы соматические мутации в горячих точках генов ALK, BRAF EGFR, HER2, IL17RA, KRAS, MET и NRAS. В исследуемых локусах в клетках всех исследуемых культур мутаций обнаружено не было. Анализ опухолевого супрессора BAP1 (BRCA-ассоциированный белок) показал его низкое содержание в культурах клеток uMel3 и uMel5, что может указывать на высокую вероятность метастазирования.Заключение. Полученные персональные культуры клеток УМ являются моделями заболевания, позволяющими исследовать in vitro и in vivo УМ с различными молекулярно-генетическими особенностями.
KW - BAP1
KW - BRAF
KW - NGS-sequencing
KW - karyotype
KW - personalized cell cultures
KW - uveal melanoma
UR - https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85207624880&origin=inward&txGid=d467813f5fae0338f6b0406577ee4759
UR - https://www.elibrary.ru/item.asp?id=72797539
UR - https://www.mendeley.com/catalogue/7fe44e0d-5b18-3eda-9380-ca796e1afe89/
U2 - 10.25276/0235-4160-2024-2S-63-71
DO - 10.25276/0235-4160-2024-2S-63-71
M3 - статья
VL - 140
SP - 63
EP - 71
JO - Fyodorov Journal of Ophthalmic Surgery
JF - Fyodorov Journal of Ophthalmic Surgery
SN - 2312-4970
IS - 2s
M1 - 8
ER -
ID: 61307128