Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
Роль длинных некодирующих РНК в растениях. / Пронозин, Артем Юрьевич; Афонников, Дмитрий Аркадьевич.
In: Генетика, Vol. 61, No. 1, 2025, p. 3-23.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
}
TY - JOUR
T1 - Роль длинных некодирующих РНК в растениях
AU - Пронозин, Артем Юрьевич
AU - Афонников, Дмитрий Аркадьевич
N1 - Пронозин, А. Ю. Роль длинных некодирующих РНК в растениях / А. Ю. Пронозин, Д. А. Афонников // Генетика. – 2025. – Т. 61, № 1. – С. 3-23. – DOI 10.31857/S0016675825010016. – EDN VFMYSM. Работа выполнена при поддержке бюджетного проекта FWNR-2022-0020.
PY - 2025
Y1 - 2025
N2 - Длинные некодирующие РНК (днРНК) представляют собой класс линейных или кольцевых молекул РНК длиной более 200 нуклеотидов без открытых рамок считывания. Экспериментальные исследования показали участие днРНК в регуляции устойчивости к холодовому, солевому, тепловому стрессу, в развитии плодов, корня и листьев. Однако экспериментальные методы являются трудоемкими и дорогостоящими подходами и пока еще не могут быть использованы для массового изучения днРНК в масштабах всего генома. Для этих целей применяют биоинформатические подходы, которые направлены на широкомасштабное распознавание последовательностей днРНК в геномах и транскриптомах. Несмотря на растущее число исследований, посвященных структурно-функциональному анализу днРНК, данный тип молекул по-прежнему остается малоизученным. Это связано со множеством факторов, которые нужно учитывать при идентификации днРНК. Применение пан-геномов и пан-транскриптомов позволит повысить эффективность исследования и общее количество предсказанных днРНК по сравнению с использованием генома одного представителя вида. Настоящий обзор посвящен описанию молекулярных и биологических функций днРНК, экспериментальных и биоинформатических методов идентификации, а также закономерностям эволюции, выявлению и анализу днРНК в масштабах пан-геномов и пан-транскриптомов.
AB - Длинные некодирующие РНК (днРНК) представляют собой класс линейных или кольцевых молекул РНК длиной более 200 нуклеотидов без открытых рамок считывания. Экспериментальные исследования показали участие днРНК в регуляции устойчивости к холодовому, солевому, тепловому стрессу, в развитии плодов, корня и листьев. Однако экспериментальные методы являются трудоемкими и дорогостоящими подходами и пока еще не могут быть использованы для массового изучения днРНК в масштабах всего генома. Для этих целей применяют биоинформатические подходы, которые направлены на широкомасштабное распознавание последовательностей днРНК в геномах и транскриптомах. Несмотря на растущее число исследований, посвященных структурно-функциональному анализу днРНК, данный тип молекул по-прежнему остается малоизученным. Это связано со множеством факторов, которые нужно учитывать при идентификации днРНК. Применение пан-геномов и пан-транскриптомов позволит повысить эффективность исследования и общее количество предсказанных днРНК по сравнению с использованием генома одного представителя вида. Настоящий обзор посвящен описанию молекулярных и биологических функций днРНК, экспериментальных и биоинформатических методов идентификации, а также закономерностям эволюции, выявлению и анализу днРНК в масштабах пан-геномов и пан-транскриптомов.
KW - ДЛИННЫЕ НЕКОДИРУЮЩИЕ РНК
KW - МИКРОРНК
KW - РЕГУЛЯЦИЯ ТРАНСКРИПЦИИ
KW - ПАН-ГЕНОМ
UR - https://elibrary.ru/item.asp?id=80453049
U2 - 10.31857/S0016675825010016
DO - 10.31857/S0016675825010016
M3 - статья
VL - 61
SP - 3
EP - 23
JO - Генетика
JF - Генетика
SN - 0016-6758
IS - 1
ER -
ID: 74347672