1 - 50 out of 170Page size: 50
  1. 2025

  2. The effect of methylation and hydroxymethylation of cytosine on activity and fidelity of Pol λ and Pol β

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Kruchinin, A. A., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Apr 2025, In: DNA Repair. 148, p. 103815 103815.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  3. The hidden elephant: Modified abasic sites and their consequences

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., Apr 2025, In: DNA Repair. 148, p. 103823 03823.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  4. Developing plant-derived DNA repair enzyme resources through studying the involvement of base excision repair DNA glycosylases in stress responses of plants

    Zhao, Y., Chen, D., Grin, I. R., Zharkov, D. O. & Yu, B., 20 Mar 2025, In: Physiologia Plantarum. 177, 2, e70162.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  5. Рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli – продуцент химерного белка формамидопиримидин-ДНК-гликозилазы с флуоресцентным репортерным белком

    Булгаков, Н. А., Дворникова, А. П., Петрова, Д. В. & Жарков, Д. О., 3 Feb 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2834027, 12 Dec 2023, Priority date 12 Dec 2023, Priority No. 2023132878

    Research output: Patent › Patent for invention

  6. Polyamine Adducts with AP Sites: Interaction with DNA Polymerases and AP Endonucleases

    Yudkina, A. V., Amanova, M. M. & Zharkov, D. O., 20 Jan 2025, In: Chemical Research in Toxicology. 38, 1, p. 102-114 13 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  7. Bypass of Methoxyamine-Adducted Abasic Sites by Eukaryotic Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Novikova, A. A., Stolyarenko, A. D., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 14 Jan 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 2, 642.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  8. Position-Dependent Effects of AP Sites Within an hTERT Promoter G-Quadruplex Scaffold on Quadruplex Stability and Repair Activity of the APE1 Enzyme

    Savitskaya, V. Y., Novoselov, K. A., Dolinnaya, N. G., Monakhova, M. V., Snyga, V. G., Diatlova, E. A., Peskovatskova, E. S., Golyshev, V. M., Kitaeva, M. I., Eroshenko, D. A., Zvereva, M. I., Zharkov, D. O. & Kubareva, E. A., 2 Jan 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 337.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  9. 2024

  10. Photocleavable Guide crRNAs for a Light-Controllable CRISPR/Cas9 System

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Akhmetova, E., Vorobyeva, M., Vorobjev, P., Zharkov, D. O. & Novopashina, D., 19 Nov 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12392.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  11. The dual role of methylglyoxal in plant stress response and regulation of DJ-1 protein

    Sun, Y., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., Nov 2024, In: Physiologia Plantarum. 176, 6, 15 p., e14608.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  12. An Approach to the Synthesis of Cyclic Photocleavable RNA for Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

    Ivanskaya, E. V., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., Oct 2024, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 5, p. 1807-1821 15 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  13. Enhanced thermal stability enables human mismatch-specific thymine-DNA glycosylase to catalyse futile DNA repair

    Manapkyzy, D., Joldybayeva, B., Ishchenko, A. A., Matkarimov, B. T., Zharkov, D. O., Taipakova, S. & Saparbaev, M. K., Oct 2024, In: PLoS ONE. 19, 10, 32 p., e0304818.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  14. Error-Prone DNA Synthesis on Click-Ligated Templates

    Endutkin, A. V., Yakovlev, A. O., Zharkov, T. D., Golyshev, V. M., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., Oct 2024, In: Doklady Biochemistry and Biophysics. 518, 1, p. 376-381 6 p., 11.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  15. Methylation and hydroxymethylation of cytosine alter activity and fidelity of translesion DNA polymerases

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Novikova, A. A., Boldinova, E. O., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Sept 2024, In: DNA Repair. 141, 12 p., 103712.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  16. Photocleavable Guide RNA for Photocontrolled CRISPR/Cas9 System

    Akhmetova, E. A., Vokhtantsev, I. P., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., Aug 2024, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 4, p. 1314-1324 11 p., 12.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  17. Repair and DNA Polymerase Bypass of Clickable Pyrimidine Nucleotides

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Barmatov, A. E., Petrova, D. V., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 12 Jun 2024, In: Biomolecules. 14, 6, 681.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  18. Probing the Conformational Restraints of DNA Damage Recognition with β-L-Nucleotides

    Yudkina, A. V., Kim, D. V., Zharkov, T. D., Zharkov, D. O. & Endutkin, A. V., 30 May 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 11, 6006.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  19. Strategies of N-Glycosidic Bond Cleavage by DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Apr 2024, In: Moscow University Chemistry Bulletin. 79, 2, p. 121-126 6 p., 7.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  20. 8-Oxoadenine: A «New» Player of the Oxidative Stress in Mammals?

    Kruchinin, A. A., Kamzeeva, P. N., Zharkov, D. O., Aralov, A. V. & Makarova, A. V., 22 Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 1342.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  21. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: DNA Repair. 133, 8 p., 103605.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  22. Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1

    Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  23. Aberrant Repair of 8-Oxoguanine in Short DNA Bulges

    Eroshenko, D. A., Diatlova, E. A., Golyshev, V. M., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 2024, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 513, Suppl 1, p. S82-S86 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  24. Activity of DNA glycosylases on non-canonical DNA structures

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  25. Analysis of critical amino acid residues in the active center of a novel DNA glycosylase Fpg-like protein 1 Streptomyces coelicolor superfamily “helix-2-turn-helix” DNA glycosylase

    Булгаков, Н. А., Юдкина, А. В., Жарков, Д. О. & Garcia-Diaz, M., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  26. Order and disorder in base excision DNA repair

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  27. Structural biology of DNA repair

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  28. Активность 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаз Escherichia сoli и человека на коротких петлях ДНК

    Ерошенко, Д. А., Дятлова, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  29. Биохимическая характеристика некоторых вариантов фермента урацил-ДНК-гликозилазы, обнаруженных в злокачественных опухолях человека

    Затеева, М. В., Дятлова, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  30. Взаимодействие неприродных нуклеиновых кислот, применяемых в синтетической биологии, с системой эксцизионной репарации оснований ДНК

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Ким, Д. В., Яковлев, А. О., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  31. ИНТЕРФЕРОМЕТРИЧЕСКАЯ РАССЕИВАЮЩАЯ МИКРОСКОПИЯ ДЛЯ ИССЛЕДОВАНИЯ КОМПЛЕКСА ЭНДОНУКЛЕАЗЫ SPYCAS9 С НАПРАВЛЯЮЩЕЙ SGРНК

    Саковина, Л. В., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  32. Исследование транскрипционного мутагенеза и репарации 8-оксогуанина в клетках с использованием репортерных плазмид

    Чуприкова, М. С. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  33. Механизмы узнавания 5-метилцитозина ферментами системы активного эпигенетического деметилирования

    Петрова, Д. В., Новопашина, Д. С., Кузнецова, А. А., Кузнецов, Н. А., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  34. Механизмы узнавания и превращения субстратов ДНК-гликозилазами

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  35. Модифицированные фоторасщепляемые направляющие РНК для создания регулируемой системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  36. Неканонические функции ДНК-гликозилаз

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  37. Репарация урацила в G-квадруплексных структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Савицкая, В. Ю., Новоселов, К. А., Кубарева, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  38. Сборник задач и упражнений по молекулярной биологии

    Грин, И. Р., Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Коваль, В. В., Коваль, О. А. & Жарков, Д. О., 2024, 72 p.

    Research output: Book/Report › Teaching manual

  39. Способность полимераз различных семейств процессировать субстраты, содержащие клик-химические модификации сахарофосфатного остова

    Яковлев, А. О., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  40. Структурная биология репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  41. Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Чуприкова, М. С., Яковлев, А. О., Затеева, М. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  42. Точность действия ДНК-полимеразы RB69 на поврежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Яковлев, А. О., Жарков, Д. О. & Юдкина, А. В., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  43. 2023

  44. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair

    Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 Nov 2023, In: PLoS ONE. 18, 11, 26 p., e0294683.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  45. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress

    Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Nov 2023, In: Biochemistry (Moscow). 88, 11, p. 1933-1943 11 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  46. Base Excision DNA Repair in Plants: Arabidopsis and Beyond

    Grin, I. R., Petrova, D. V., Endutkin, A. V., Ma, C., Yu, B., Li, H. & Zharkov, D. O., 29 Sept 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 19, 14746.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  47. Alternative Mechanisms of Mutagenesis at mCpG Sites during Replication and Repair

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Aug 2023, In: Molecular Biology. 57, 4, p. 584-592 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  48. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 Jul 2023, In: Nucleic Acids Research. 51, 12, p. 6321-6336 16 p., gkad423.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  49. Bypass of Abasic Site-Peptide Cross-Links by Human Repair and Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Bulgakov, N. A., Boldinova, E. O., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 29 Jun 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 10877.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  50. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet

    Wu, Z., Zhang, T., Li, J., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., 2 Jun 2023, In: Frontiers in Plant Science. 14, 1185440.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  51. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 May 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  52. Activity of nsp14 Exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with Modified 3'-Termini

    Yuyukina, S. K., Barmatov, A. E., Bizyaev, S. N., Stetsenko, D. A., Sergeeva, O. V., Zatsepin, T. S. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 509, 1, p. 65-69 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  53. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 312-319 8 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Previous 1 2 3 4 Next

ID: 3458293