1 - 50 out of 176Page size: 50
  1. 2025

  2. Uracil-DNA Glycosylase from Beta vulgaris: Properties and Response to Abiotic Stress

    Petrova, D. V., Zateeva, M. V., Zhang, L., Zhang, J., Zhao, Y., Permyakova, N. V., Zagorskaya, A. A., Zharkov, V. D., Endutkin, A. V., Yu, B., Ma, C., Li, H., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 24 Aug 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 17, p. 8221 21 p., 8221.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  3. Thymines opposite to bulky aristolactam-DNA adducts in duplex DNA are not targeted by human thymine-DNA glycosylase

    Manapkyzy, D., Zhamanbayeva, G., Sidorenko, V., Bonala, R., Johnson, F., Matkarimov, B. T., Zharkov, D., Saparbaev, M. K. & Taipakova, S., 4 Jul 2025, In: PeerJ. 13, p. e19577

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  4. Platinum Polyoxoniobate: Stability, Cytotoxicity, and Cellular Uptake

    Yudkina, A. V., Vokhtantsev, I. P., Rychkov, D. A., Volchek, V. V., Abramov, P. A., Sokolov, M. N. & Zharkov, D. O., 6 Apr 2025, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 51, 2, p. 693-701 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  5. The effect of methylation and hydroxymethylation of cytosine on activity and fidelity of Pol λ and Pol β

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Kruchinin, A. A., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Apr 2025, In: DNA Repair. 148, 103815.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  6. The hidden elephant: Modified abasic sites and their consequences

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., Apr 2025, In: DNA Repair. 148, p. 103823 03823.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  7. Developing plant-derived DNA repair enzyme resources through studying the involvement of base excision repair DNA glycosylases in stress responses of plants

    Zhao, Y., Chen, D., Grin, I. R., Zharkov, D. O. & Yu, B., 20 Mar 2025, In: Physiologia Plantarum. 177, 2, 12 p., e70162.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  8. Рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli – продуцент химерного белка формамидопиримидин-ДНК-гликозилазы с флуоресцентным репортерным белком

    Булгаков, Н. А., Дворникова, А. П., Петрова, Д. В. & Жарков, Д. О., 3 Feb 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2834027, 12 Dec 2023, Priority date 12 Dec 2023, Priority No. 2023132878

    Research output: Patent › Patent for invention

  9. Polyamine Adducts with AP Sites: Interaction with DNA Polymerases and AP Endonucleases

    Yudkina, A. V., Amanova, M. M. & Zharkov, D. O., 20 Jan 2025, In: Chemical Research in Toxicology. 38, 1, p. 102-114 13 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  10. Bypass of Methoxyamine-Adducted Abasic Sites by Eukaryotic Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Novikova, A. A., Stolyarenko, A. D., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 14 Jan 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 2, 642.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  11. Position-Dependent Effects of AP Sites Within an hTERT Promoter G-Quadruplex Scaffold on Quadruplex Stability and Repair Activity of the APE1 Enzyme

    Savitskaya, V. Y., Novoselov, K. A., Dolinnaya, N. G., Monakhova, M. V., Snyga, V. G., Diatlova, E. A., Peskovatskova, E. S., Golyshev, V. M., Kitaeva, M. I., Eroshenko, D. A., Zvereva, M. I., Zharkov, D. O. & Kubareva, E. A., 2 Jan 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 337.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  12. 2024

  13. Photocleavable Guide crRNAs for a Light-Controllable CRISPR/Cas9 System

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Akhmetova, E., Vorobyeva, M., Vorobjev, P., Zharkov, D. O. & Novopashina, D., 19 Nov 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12392.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  14. The dual role of methylglyoxal in plant stress response and regulation of DJ-1 protein

    Sun, Y., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., Nov 2024, In: Physiologia Plantarum. 176, 6, 15 p., e14608.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  15. An Approach to the Synthesis of Cyclic Photocleavable RNA for Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

    Ivanskaya, E. V., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., Oct 2024, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 5, p. 1807-1821 15 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  16. Enhanced thermal stability enables human mismatch-specific thymine-DNA glycosylase to catalyse futile DNA repair

    Manapkyzy, D., Joldybayeva, B., Ishchenko, A. A., Matkarimov, B. T., Zharkov, D. O., Taipakova, S. & Saparbaev, M. K., Oct 2024, In: PLoS ONE. 19, 10, 32 p., e0304818.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  17. Error-Prone DNA Synthesis on Click-Ligated Templates

    Endutkin, A. V., Yakovlev, A. O., Zharkov, T. D., Golyshev, V. M., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., Oct 2024, In: Doklady Biochemistry and Biophysics. 518, 1, p. 376-381 6 p., 11.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  18. Methylation and hydroxymethylation of cytosine alter activity and fidelity of translesion DNA polymerases

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Novikova, A. A., Boldinova, E. O., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Sept 2024, In: DNA Repair. 141, 12 p., 103712.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  19. Photocleavable Guide RNA for Photocontrolled CRISPR/Cas9 System

    Akhmetova, E. A., Vokhtantsev, I. P., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., Aug 2024, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 4, p. 1314-1324 11 p., 12.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  20. Repair and DNA Polymerase Bypass of Clickable Pyrimidine Nucleotides

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Barmatov, A. E., Petrova, D. V., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 12 Jun 2024, In: Biomolecules. 14, 6, 681.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  21. Probing the Conformational Restraints of DNA Damage Recognition with β-L-Nucleotides

    Yudkina, A. V., Kim, D. V., Zharkov, T. D., Zharkov, D. O. & Endutkin, A. V., 30 May 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 11, 6006.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  22. Strategies of N-Glycosidic Bond Cleavage by DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Apr 2024, In: Moscow University Chemistry Bulletin. 79, 2, p. 121-126 6 p., 7.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  23. 8-Oxoadenine: A «New» Player of the Oxidative Stress in Mammals?

    Kruchinin, A. A., Kamzeeva, P. N., Zharkov, D. O., Aralov, A. V. & Makarova, A. V., 22 Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 1342.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  24. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: DNA Repair. 133, 8 p., 103605.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  25. Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1

    Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  26. Aberrant Repair of 8-Oxoguanine in Short DNA Bulges

    Eroshenko, D. A., Diatlova, E. A., Golyshev, V. M., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 2024, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 513, Suppl 1, p. S82-S86 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  27. Activity of DNA glycosylases on non-canonical DNA structures

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  28. Analysis of critical amino acid residues in the active center of a novel DNA glycosylase Fpg-like protein 1 Streptomyces coelicolor superfamily “helix-2-turn-helix” DNA glycosylase

    Булгаков, Н. А., Юдкина, А. В., Жарков, Д. О. & Garcia-Diaz, M., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1971-1972 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  29. Order and disorder in base excision DNA repair

    Жарков, Д. О., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1981-1982 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  30. Structural biology of DNA repair

    Жарков, Д. О., 2024, SYNCHROTRON RADIATION TECHNIQUES FOR CATALYSTS AND FUNCTIONAL MATERIALS: III International Conference. Новосибирск: Издательский отдел Института катализа СО РАН, p. 14 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  31. Активность 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаз Escherichia сoli и человека на коротких петлях ДНК

    Ерошенко, Д. А., Дятлова, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, p. 41. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  32. Биохимическая характеристика некоторых вариантов фермента урацил-ДНК-гликозилазы, обнаруженных в злокачественных опухолях человека

    Затеева, М. В., Дятлова, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 30

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  33. Взаимодействие неприродных нуклеиновых кислот, применяемых в синтетической биологии, с системой эксцизионной репарации оснований ДНК

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Ким, Д. В., Яковлев, А. О., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 19 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  34. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О. (ed.), 2024, Биология. Медицина. Психология: Материалы 62-й МНСК. Новосибирск: ИПЦ НГУ, p. 88 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  35. Интерферометрическая рассеивающая микроскопия для исследования комплекса эндонуклеазы SPYCAS9 с направляющей SGРНК

    Саковина, Л. В., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, XI МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И СПЕЦИАЛИСТОВ ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ - 2024: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, p. 544 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  36. Исследование транскрипционного мутагенеза и репарации 8-оксогуанина в клетках с использованием репортерных плазмид

    Чуприкова, М. С. & Жарков, Д. О., 2024, Современные вызовы структурной и синтетической биологии : материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 50

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  37. Механизмы узнавания 5-метилцитозина ферментами системы активного эпигенетического деметилирования

    Петрова, Д. В., Новопашина, Д. С., Кузнецова, А. А., Кузнецов, Н. А., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 25

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  38. Механизмы узнавания и превращения субстратов ДНК-гликозилазами

    Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 20 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  39. Модифицированные фоторасщепляемые направляющие РНК для создания регулируемой системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, p. 68-69. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  40. Неканонические функции ДНК-гликозилаз

    Жарков, Д. О., 2024, Международный Конгресс «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300‑летию российской науки и высшей школы». Саратов, 14–19 июня 2024 года. Санкт-Петербург: Издательский дом "Петрополис", p. 232

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  41. Основы белковой инженерии

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2024, Новосибирск: ИПЦ НГУ. 214 p.

    Research output: Book/Report › Teaching materials › peer-review

  42. Репарация урацила в G-квадруплексных структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Савицкая, В. Ю., Новоселов, К. А., Кубарева, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ"

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  43. Сборник задач и упражнений по молекулярной биологии

    Грин, И. Р., Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Коваль, В. В., Коваль, О. А. & Жарков, Д. О., 2024, 72 p.

    Research output: Book/Report › Teaching manual

  44. Способность полимераз различных семейств процессировать субстраты, содержащие клик-химические модификации сахарофосфатного остова

    Яковлев, А. О., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, БИОИНФОРМАТИКА РЕГУЛЯЦИИ И СТРУКТУРЫ ГЕНОМОВ / СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ: Тезисы докладов Четырнадцатой международной мультиконференции. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1967-1970 4 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  45. Структурная биология репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  46. Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Чуприкова, М. С., Яковлев, А. О., Затеева, М. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 51 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  47. Точность действия ДНК-полимеразы RB69 на поврежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Яковлев, А. О., Жарков, Д. О. & Юдкина, А. В., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 59

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Foreword/postscript › Research

  48. 2023

  49. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair

    Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 Nov 2023, In: PLoS ONE. 18, 11, 26 p., e0294683.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  50. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress

    Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Nov 2023, In: Biochemistry (Moscow). 88, 11, p. 1933-1943 11 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  51. Base Excision DNA Repair in Plants: Arabidopsis and Beyond

    Grin, I. R., Petrova, D. V., Endutkin, A. V., Ma, C., Yu, B., Li, H. & Zharkov, D. O., 29 Sept 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 19, 14746.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  52. Alternative Mechanisms of Mutagenesis at mCpG Sites during Replication and Repair

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Aug 2023, In: Molecular Biology. 57, 4, p. 584-592 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  53. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 Jul 2023, In: Nucleic Acids Research. 51, 12, p. 6321-6336 16 p., gkad423.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Previous 1 2 3 4 Next

ID: 3458293