1 - 100 out of 173Page size: 100
  1. 2025

  2. Platinum Polyoxoniobate: Stability, Cytotoxicity, and Cellular Uptake

    Yudkina, A. V., Vokhtantsev, I. P., Rychkov, D. A., Volchek, V. V., Abramov, P. A., Sokolov, M. N. & Zharkov, D. O., 6 Apr 2025, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 51, 2, p. 693-701 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  3. The effect of methylation and hydroxymethylation of cytosine on activity and fidelity of Pol λ and Pol β

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Kruchinin, A. A., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Apr 2025, In: DNA Repair. 148, p. 103815 103815.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  4. The hidden elephant: Modified abasic sites and their consequences

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., Apr 2025, In: DNA Repair. 148, p. 103823 03823.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  5. Developing plant-derived DNA repair enzyme resources through studying the involvement of base excision repair DNA glycosylases in stress responses of plants

    Zhao, Y., Chen, D., Grin, I. R., Zharkov, D. O. & Yu, B., 20 Mar 2025, In: Physiologia Plantarum. 177, 2, e70162.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  6. Рекомбинантный штамм бактерий Escherichia coli – продуцент химерного белка формамидопиримидин-ДНК-гликозилазы с флуоресцентным репортерным белком

    Булгаков, Н. А., Дворникова, А. П., Петрова, Д. В. & Жарков, Д. О., 3 Feb 2025, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Patent No. 2834027, 12 Dec 2023, Priority date 12 Dec 2023, Priority No. 2023132878

    Research output: Patent › Patent for invention

  7. Polyamine Adducts with AP Sites: Interaction with DNA Polymerases and AP Endonucleases

    Yudkina, A. V., Amanova, M. M. & Zharkov, D. O., 20 Jan 2025, In: Chemical Research in Toxicology. 38, 1, p. 102-114 13 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  8. Bypass of Methoxyamine-Adducted Abasic Sites by Eukaryotic Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Novikova, A. A., Stolyarenko, A. D., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 14 Jan 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 2, 642.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  9. Position-Dependent Effects of AP Sites Within an hTERT Promoter G-Quadruplex Scaffold on Quadruplex Stability and Repair Activity of the APE1 Enzyme

    Savitskaya, V. Y., Novoselov, K. A., Dolinnaya, N. G., Monakhova, M. V., Snyga, V. G., Diatlova, E. A., Peskovatskova, E. S., Golyshev, V. M., Kitaeva, M. I., Eroshenko, D. A., Zvereva, M. I., Zharkov, D. O. & Kubareva, E. A., 2 Jan 2025, In: International Journal of Molecular Sciences. 26, 1, 337.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  10. 2024

  11. Photocleavable Guide crRNAs for a Light-Controllable CRISPR/Cas9 System

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Akhmetova, E., Vorobyeva, M., Vorobjev, P., Zharkov, D. O. & Novopashina, D., 19 Nov 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12392.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  12. The dual role of methylglyoxal in plant stress response and regulation of DJ-1 protein

    Sun, Y., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., Nov 2024, In: Physiologia Plantarum. 176, 6, 15 p., e14608.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  13. An Approach to the Synthesis of Cyclic Photocleavable RNA for Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

    Ivanskaya, E. V., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., Oct 2024, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 5, p. 1807-1821 15 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  14. Enhanced thermal stability enables human mismatch-specific thymine-DNA glycosylase to catalyse futile DNA repair

    Manapkyzy, D., Joldybayeva, B., Ishchenko, A. A., Matkarimov, B. T., Zharkov, D. O., Taipakova, S. & Saparbaev, M. K., Oct 2024, In: PLoS ONE. 19, 10, 32 p., e0304818.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  15. Error-Prone DNA Synthesis on Click-Ligated Templates

    Endutkin, A. V., Yakovlev, A. O., Zharkov, T. D., Golyshev, V. M., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., Oct 2024, In: Doklady Biochemistry and Biophysics. 518, 1, p. 376-381 6 p., 11.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  16. Methylation and hydroxymethylation of cytosine alter activity and fidelity of translesion DNA polymerases

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Novikova, A. A., Boldinova, E. O., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Sept 2024, In: DNA Repair. 141, 12 p., 103712.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  17. Photocleavable Guide RNA for Photocontrolled CRISPR/Cas9 System

    Akhmetova, E. A., Vokhtantsev, I. P., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., Aug 2024, In: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 4, p. 1314-1324 11 p., 12.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  18. Repair and DNA Polymerase Bypass of Clickable Pyrimidine Nucleotides

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Barmatov, A. E., Petrova, D. V., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 12 Jun 2024, In: Biomolecules. 14, 6, 681.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  19. Probing the Conformational Restraints of DNA Damage Recognition with β-L-Nucleotides

    Yudkina, A. V., Kim, D. V., Zharkov, T. D., Zharkov, D. O. & Endutkin, A. V., 30 May 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 11, 6006.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  20. Strategies of N-Glycosidic Bond Cleavage by DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Apr 2024, In: Moscow University Chemistry Bulletin. 79, 2, p. 121-126 6 p., 7.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  21. 8-Oxoadenine: A «New» Player of the Oxidative Stress in Mammals?

    Kruchinin, A. A., Kamzeeva, P. N., Zharkov, D. O., Aralov, A. V. & Makarova, A. V., 22 Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 2, 1342.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  22. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: DNA Repair. 133, 8 p., 103605.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  23. Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1

    Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  24. Aberrant Repair of 8-Oxoguanine in Short DNA Bulges

    Eroshenko, D. A., Diatlova, E. A., Golyshev, V. M., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 2024, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 513, Suppl 1, p. S82-S86 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  25. Activity of DNA glycosylases on non-canonical DNA structures

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  26. Analysis of critical amino acid residues in the active center of a novel DNA glycosylase Fpg-like protein 1 Streptomyces coelicolor superfamily “helix-2-turn-helix” DNA glycosylase

    Булгаков, Н. А., Юдкина, А. В., Жарков, Д. О. & Garcia-Diaz, M., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1971-1972 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  27. Order and disorder in base excision DNA repair

    Жарков, Д. О., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1981-1982 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  28. Structural biology of DNA repair

    Жарков, Д. О., 2024, SYNCHROTRON RADIATION TECHNIQUES FOR CATALYSTS AND FUNCTIONAL MATERIALS: III International Conference. Новосибирск: Издательский отдел Института катализа СО РАН, p. 14 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  29. Активность 8-оксогуанин-ДНК-гликозилаз Escherichia сoli и человека на коротких петлях ДНК

    Ерошенко, Д. А., Дятлова, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, p. 41. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  30. Биохимическая характеристика некоторых вариантов фермента урацил-ДНК-гликозилазы, обнаруженных в злокачественных опухолях человека

    Затеева, М. В., Дятлова, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 30

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  31. Взаимодействие неприродных нуклеиновых кислот, применяемых в синтетической биологии, с системой эксцизионной репарации оснований ДНК

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Ким, Д. В., Яковлев, А. О., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 19 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  32. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О. (ed.), 2024, Биология. Медицина. Психология: Материалы 62-й МНСК. Новосибирск: ИПЦ НГУ, p. 88 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  33. Интерферометрическая рассеивающая микроскопия для исследования комплекса эндонуклеазы SPYCAS9 с направляющей SGРНК

    Саковина, Л. В., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, XI МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И СПЕЦИАЛИСТОВ ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ - 2024: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, p. 544 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  34. Исследование транскрипционного мутагенеза и репарации 8-оксогуанина в клетках с использованием репортерных плазмид

    Чуприкова, М. С. & Жарков, Д. О., 2024, Современные вызовы структурной и синтетической биологии : материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 50

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  35. Механизмы узнавания 5-метилцитозина ферментами системы активного эпигенетического деметилирования

    Петрова, Д. В., Новопашина, Д. С., Кузнецова, А. А., Кузнецов, Н. А., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 25

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  36. Механизмы узнавания и превращения субстратов ДНК-гликозилазами

    Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 20 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  37. Модифицированные фоторасщепляемые направляющие РНК для создания регулируемой системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, p. 68-69. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  38. Неканонические функции ДНК-гликозилаз

    Жарков, Д. О., 2024, Международный Конгресс «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300‑летию российской науки и высшей школы». Саратов, 14–19 июня 2024 года. Санкт-Петербург: Издательский дом "Петрополис", p. 232

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  39. Репарация урацила в G-квадруплексных структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Савицкая, В. Ю., Новоселов, К. А., Кубарева, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ"

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  40. Сборник задач и упражнений по молекулярной биологии

    Грин, И. Р., Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Коваль, В. В., Коваль, О. А. & Жарков, Д. О., 2024, 72 p.

    Research output: Book/Report › Teaching manual

  41. Способность полимераз различных семейств процессировать субстраты, содержащие клик-химические модификации сахарофосфатного остова

    Яковлев, А. О., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, БИОИНФОРМАТИКА РЕГУЛЯЦИИ И СТРУКТУРЫ ГЕНОМОВ / СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ: Тезисы докладов Четырнадцатой международной мультиконференции. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, p. 1967-1970 4 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  42. Структурная биология репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2024.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  43. Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Чуприкова, М. С., Яковлев, А. О., Затеева, М. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 51 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  44. Точность действия ДНК-полимеразы RB69 на поврежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Яковлев, А. О., Жарков, Д. О. & Юдкина, А. В., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 59

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Foreword/postscript › Research

  45. 2023

  46. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair

    Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 Nov 2023, In: PLoS ONE. 18, 11, 26 p., e0294683.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  47. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress

    Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Nov 2023, In: Biochemistry (Moscow). 88, 11, p. 1933-1943 11 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  48. Base Excision DNA Repair in Plants: Arabidopsis and Beyond

    Grin, I. R., Petrova, D. V., Endutkin, A. V., Ma, C., Yu, B., Li, H. & Zharkov, D. O., 29 Sept 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 19, 14746.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  49. Alternative Mechanisms of Mutagenesis at mCpG Sites during Replication and Repair

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Aug 2023, In: Molecular Biology. 57, 4, p. 584-592 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  50. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 Jul 2023, In: Nucleic Acids Research. 51, 12, p. 6321-6336 16 p., gkad423.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  51. Bypass of Abasic Site-Peptide Cross-Links by Human Repair and Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Bulgakov, N. A., Boldinova, E. O., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 29 Jun 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 10877.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  52. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet

    Wu, Z., Zhang, T., Li, J., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., 2 Jun 2023, In: Frontiers in Plant Science. 14, 1185440.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  53. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 May 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  54. Activity of nsp14 Exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with Modified 3'-Termini

    Yuyukina, S. K., Barmatov, A. E., Bizyaev, S. N., Stetsenko, D. A., Sergeeva, O. V., Zatsepin, T. S. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 509, 1, p. 65-69 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  55. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 312-319 8 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  56. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 258-271 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  57. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 Mar 2023, In: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, p. 5613-5617 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  58. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., 1 Mar 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, p. 330-339 10 p., 17.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  59. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., & 5 othersSteinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., Mar 2023, In: DNA Repair. 123, 18 p., 103448.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  60. DNA Damage Response and Repair in Boron Neutron Capture Therapy

    Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., 2 Jan 2023, In: Genes. 14, 1, 127.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  61. Structural Biology in the Study of Enzyme Catalysis: An Example of DNA Glycosylases

    Жарков, Д. О., 2023, SYNCHROTRON RADIATION TECHNIQUES FOR CATALYSTS AND FUNCTIONAL MATERIALS: II International Conference, Abstracts. Новосибирск: Издательский отдел Института катализа СО РАН, p. 18 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  62. Активность ДНК-гликозилах на неканонических структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 70 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  63. Альтернативные механизмы мутагенеза в mCpG-сайтах при репликации и репарации

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 4, p. 587-596 10 p., 3.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  64. Анализ активности и специфичности рационально сконструированных вариантов белка CAS9 ИЗ Streptococcus pyogenes

    Вохтанцев, И. П., Кадцын, Е. Д., Аманова, М. М., Бакулина, А. Ю. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 57 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  65. Биоразнообразие микроорганизмов — источник новых ферментов репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2023, От микробиологии к генетическим технологиям. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 86-87 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  66. Влияние окислительного повреждения oxoGна стабильность дуплексов ДНК

    Насонов, Д. М., Овчеренко, С. С., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 181. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  67. ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ

    Овчеренко, С. С., Насонов, Д. М., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, p. 377-378 2 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  68. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О., 2023. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  69. Изучение состояния ионизируемых групп в активном центре комплекса Fpg-ДНК методом ЭПР

    Литвинов, И. А., Овчеренко, С. С., Булгаков, Н. А., Кирилюк, И. А., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 175. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  70. Механизм действия ДНК-полимераз на субстратах с модифицированными АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 161 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  71. Механизм прохождения модифицированных АП-сайтов ДНК-полимеразами

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2023, ОТ МИКРОБИОЛОГИИ К ГЕНЕТИЧЕСКИМ ТЕХНОЛОГИЯМ: Материалы всероссийской конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", p. 93 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research

  72. Механизмы ДНК-гликолилаз и проблема "избыточных реакций"

    Жарков, Д. О., 2023, Биокатализ. Фундаментальные исследования и применения: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 79 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  73. Механизмы специфичности системы CRISPR/Cas9 в геномном редактировании

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, p. 269-284 16 p., 12.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  74. ОСНОВЫ БЕЛКОВОЙ ИНЖЕНЕРИИ

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2023, (Accepted/In press) Редакционно-издательский центр НГУ. 178 p.

    Research output: Book/Report › Teaching materials

  75. Особенности ответа клеток карциномы легких человека A549 с нокаутированным геном PRIMPOL на генотоксический стресс

    Громова, А. С., Болдинова, Е. О., Ким, Д. В., Чупров-Неточин, Р. Н., Жарков, Д. О., Макарова, А. В., Леонов, С. В. & Пустовалова, М. В., 2023, In: Биохимия. 88, 11, p. 2340-2352 13 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  76. Передвижение ферментов репарации по ДНК: in vitro vs in vivo

    Жарков, Д. О. & Дятлова, Е. А., 2023. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  77. Субстратная специфичность ферментов эксцизионной репарации оснований в отношении искусственных нуклеотидов, применяемых в синтетической биологии

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", p. 74 1 p.

    Research output: Chapter in Book/Report/Conference proceeding › Conference contribution › Research › peer-review

  78. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2›ДЕЗОКСИУРИДИН-5›-ТРИФОСФАТНУКЛЕОТИДГИДРОЛАЗЫ ESCHERICHIA COLI

    Кириленко, А. А., Коваленко, Е. А., Юдкина, А. В., Ендуткин, А. В., Панфёрова, Е. П., Коханенко, А. А. & Жарков, Д. О., 2023, p. 184-185. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  79. 2022

  80. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., Dec 2022, In: The CRISPR journal. 5, 6, p. 799-812 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  81. Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

    Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., Nov 2022, In: DNA Repair. 119, 10 p., 103390.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  82. Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., Nov 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  83. Distinct Mechanisms of Target Search by Endonuclease VIII-like DNA Glycosylases

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., Oct 2022, In: Cells. 11, 20, 3192.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  84. Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

    Yuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., Aug 2022, In: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, p. 470-478 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  85. Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

    Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 Jul 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  86. Характеристика деметилирующей ДНК-гликозилазы ROS1 из Nicotiana tabacum L

    Петрова, Д. В., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., Jul 2022, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 26, 4, p. 341-348 8 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  87. Механизмы обеспечения стабильности генома коронавирусов как потенциальные мишени для противовирусных средств

    Ююкина, С. К. & Жарков, Д. О., 14 Mar 2022, In: Вестник РАН. 92, 8, p. 737-746 10 p., 5.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  88. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 Feb 2022, In: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, p. 303-314 12 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  89. A Low-Activity Polymorphic Variant of Human NEIL2 DNA Glycosylase

    Kakhkharova, Z. I., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 1 Feb 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2212.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  90. Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., Feb 2022, In: Data in Brief. 40, 107760.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  91. Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., Feb 2022, In: Genes. 13, 2, 166.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  92. Dynamics and Conformational Changes in Human NEIL2 DNA Glycosylase Analyzed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., 30 Jan 2022, In: Journal of Molecular Biology. 434, 2, 167334.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  93. Effect of DNA Methylation on the 3′→5′ Exonuclease Activity of Major Human Abasic Site Endonuclease APEX1

    Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D. & Zharkov, D. O., Jan 2022, In: Biochemistry (Moscow). 87, 1, p. 10-20 11 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  94. Base excision repair in non-canonical DNA structures

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2022, p. 977-978. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  95. Bioorthogonality in the light of cell defense mechanisms: Interaction of non-natural nucleic acids with the base excision DNA repair system

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2022, p. 982. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  96. Interaction of DNA replication and DNA repair systems with AP sites adducts with proteins, peptides and low-molecular-weight compounds

    Юдкина, А. В., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Дворникова, А. П., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, p. 1026. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  97. Structure and function evolution in DNA repair

    Жарков, Д. О., 2022, p. 1027. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  98. Transcriptional mutagenesis-based reporter system for the analysis of DNA repair

    Ким, Д. В., Khobta, A. & Жарков, Д. О., 2022, p. 987. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  99. Влияние метилирования ДНК на 3′→5′-экзонуклеазную активность основной апурин-апиримидиновой эндонуклеазы человека APEX1

    Ендуткин, А. В., Яценко, Д. Д. & Жарков, Д. О., 2022, In: Биохимия. 87, 1, p. 3-15 13 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  100. Генотоксичность и механизмы репарации ДНК-пептидных сшивок с АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, p. 728. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  101. Ингибиторы ДНК-гликозилаз как потенциальные терапевтические препараты

    Жарков, Д. О., 2022, p. 41. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  102. Оптимизация неадресующего фрагмента sgРНК для системы геномного редактирования CRISPR/Cas9 методом молекулярной селекции in vitro

    Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Мещанинова, М. И., Кабилов, М. Р., Жарков, Д. О. & Воробьева, М. А., 2022, p. 101. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  103. Оптимизация экспрессии и тестирования активности ДНК-гликозилазы MUTYH млекопитающих

    Кручинин, А. А., Шилкин, Е. С., Жарков, Д. О. & Макарова, А. В., 2022, p. 125-126. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  104. Химиотерапевтические подходы в фармакологии : в 2 ч.: учеб.-метод. пособие: Ч. I. Синтез нуклеотидов, репликация, клеточное деление.

    Жарков, Д. О. & Дворникова, А. П., 2022, Novosibirsk: Редакционно-издательский центр НГУ. 76 p.

    Research output: Book/Report › Teaching materials › peer-review

Previous 1 2 Next

ID: 3458293