1 - 50 out of 184Page size: 50
  1. 2024

  2. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: DNA Repair. 133, 8 p., 103605.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  3. Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1

    Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., Jan 2024, In: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  4. 2023

  5. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair

    Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 Nov 2023, In: PLoS ONE. 18, 11, 26 p., e0294683.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  6. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress

    Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Nov 2023, In: Biochemistry (Moscow). 88, 11, p. 1933-1943 11 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  7. Base Excision DNA Repair in Plants: Arabidopsis and Beyond

    Grin, I. R., Petrova, D. V., Endutkin, A. V., Ma, C., Yu, B., Li, H. & Zharkov, D. O., 29 Sept 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 19, 14746.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  8. Alternative Mechanisms of Mutagenesis at mCpG Sites during Replication and Repair

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., Aug 2023, In: Molecular Biology. 57, 4, p. 584-592 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  9. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 Jul 2023, In: Nucleic Acids Research. 51, 12, p. 6321-6336 16 p., gkad423.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  10. Bypass of Abasic Site-Peptide Cross-Links by Human Repair and Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Bulgakov, N. A., Boldinova, E. O., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 29 Jun 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 10877.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  11. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet

    Wu, Z., Zhang, T., Li, J., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., 2 Jun 2023, In: Frontiers in Plant Science. 14, 1185440.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  12. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 May 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  13. Activity of nsp14 Exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with Modified 3'-Termini

    Yuyukina, S. K., Barmatov, A. E., Bizyaev, S. N., Stetsenko, D. A., Sergeeva, O. V., Zatsepin, T. S. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Doklady. Biochemistry and biophysics. 509, 1, p. 65-69 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  14. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 312-319 8 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  15. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., Apr 2023, In: Molecular Biology. 57, 2, p. 258-271 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  16. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 Mar 2023, In: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, p. 5613-5617 5 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  17. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., 1 Mar 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, p. 330-339 10 p., 17.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  18. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., & 5 othersSteinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., Mar 2023, In: DNA Repair. 123, 18 p., 103448.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  19. Fast Recombination of Charge-Transfer State in Organic Photovoltaic Composite of P3HT and Semiconducting Carbon Nanotubes Is the Reason for Its Poor Photovoltaic Performance

    Uvarov, M. N., Kobeleva, E. S., Degtyarenko, K. M., Zinovyev, V. A., Popov, A. A., Mostovich, E. A. & Kulik, L. V., 17 Feb 2023, In: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 4098.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  20. DNA Damage Response and Repair in Boron Neutron Capture Therapy

    Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., 2 Jan 2023, In: Genes. 14, 1, 127.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  21. Structural Biology in the Study of Enzyme Catalysis: An Example of DNA Glycosylases

    Жарков, Д. О., 2023, p. 18. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  22. АКТИВНОСТЬ ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗ НА НЕКАНОНИЧЕСКИХ СТРУКТУРАХ ДНК

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2023, p. 70.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  23. Альтернативные механизмы мутагенеза в mCpG-сайтах при репликации и репарации

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 4, p. 587-596 10 p., 3.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  24. АНАЛИЗ АКТИВНОСТИ И СПЕЦИФИЧНОСТИ РАЦИОНАЛЬНО СКОНСТРУИРОВАННЫХ ВАРИАНТОВ БЕЛКА CAS9 ИЗ STREPTOCOCCUS PYOGENES

    Вохтанцев, И. П., Кадцын, Е. Д., Аманова, М. М., Бакулина, А. Ю. & Жарков, Д. О., 2023, p. 57. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  25. Биоразнообразие микроорганизмов — источник новых ферментов репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2023, p. 86. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  26. Влияние окислительного повреждения oxoGна стабильность дуплексов ДНК

    Насонов, Д. М., Овчеренко, С. С., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 181. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  27. ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ

    Овчеренко, С. С., Насонов, Д. М., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 377-378. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  28. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О., 2023. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  29. Изучение состояния ионизируемых групп в активном центре комплекса Fpg-ДНК методом ЭПР

    Литвинов, И. А., Овчеренко, С. С., Булгаков, Н. А., Кирилюк, И. А., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, p. 175. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  30. МЕХАНИЗМ ДЕЙСТВИЯ ДНК-ПОЛИМЕРАЗ НА СУБСТРАТАХ С МОДИФИЦИРОВАННЫМИ АП-САЙТАМИ

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2023, p. 161. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  31. Механизм прохождения модифицированных АП-сайтов ДНК-полимеразами

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2023, p. 93. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract

  32. МЕХАНИЗМЫ ДНК-ГЛИКОЗИЛАЗ И ПРОБЛЕМА «ИЗБЫТОЧНЫХ РЕАКЦИЙ»

    Жарков, Д. О., 2023, p. 79. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  33. Механизмы специфичности системы CRISPR/Cas9 в геномном редактировании

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 2023, In: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, p. 269-284 16 p., 12.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  34. ОСНОВЫ БЕЛКОВОЙ ИНЖЕНЕРИИ

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2023, (Accepted/In press) Редакционно-издательский центр НГУ. 178 p.

    Research output: Book/Report › Teaching materials

  35. Передвижение ферментов репарации по ДНК: in vitro vs in vivo

    Жарков, Д. О. & Дятлова, Е. А., 2023. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  36. СУБСТРАТНАЯ СПЕЦИФИЧНОСТЬ ФЕРМЕНТОВ ЭКСЦИЗИОННОЙ РЕПАРАЦИИ ОСНОВАНИЙ В ОТНОШЕНИИ ИСКУССТВЕННЫХ НУКЛЕОТИДОВ, ПРИМЕНЯЕМЫХ В СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2023, p. 74. 1 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  37. ФАКТОРЫ, ВЛИЯЮЩИЕ НА СТАБИЛЬНОСТЬ ТРИМЕРНОЙ ФОРМЫ 2›ДЕЗОКСИУРИДИН-5›-ТРИФОСФАТНУКЛЕОТИДГИДРОЛАЗЫ ESCHERICHIA COLI

    Кириленко, А. А., Коваленко, Е. А., Юдкина, А. В., Ендуткин, А. В., Панфёрова, Е. П., Коханенко, А. А. & Жарков, Д. О., 2023, p. 184-185. 2 p.

    Research output: Contribution to conference › Abstract › peer-review

  38. 2022

  39. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., Dec 2022, In: The CRISPR journal. 5, 6, p. 799-812 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  40. Improving Stability and Specificity of CRISPR/Cas9 System by Selective Modification of Guide RNAs with 2'-fluoro and Locked Nucleic Acid Nucleotides

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Vorobyeva, M., Vorobyev, P. & Novopashina, D., 3 Nov 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13460.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  41. Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

    Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., Nov 2022, In: DNA Repair. 119, 10 p., 103390.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  42. Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., Nov 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  43. Distinct Mechanisms of Target Search by Endonuclease VIII-like DNA Glycosylases

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., Oct 2022, In: Cells. 11, 20, 3192.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  44. Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

    Yuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., Aug 2022, In: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, p. 470-478 9 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  45. Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

    Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 Jul 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

    Research output: Contribution to journal › Review article › peer-review

  46. Характеристика деметилирующей ДНК-гликозилазы ROS1 из Nicotiana tabacum L

    Петрова, Д. В., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., Jul 2022, In: Вавиловский журнал генетики и селекции. 26, 4, p. 341-348 8 p., 1.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  47. Symmetric Spirenes: Promising Building Blocks for New Generation Opto-Electronic Materials

    Шеповалов, К. М., Пешков, Р. Ю., Бенасси, Э. & Мостович, Е. А., 20 Jun 2022, In: Physical Chemistry Chemical Physics. 24, 27, p. 16836-16851 16 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  48. Механизмы обеспечения стабильности генома коронавирусов как потенциальные мишени для противовирусных средств

    Ююкина, С. К. & Жарков, Д. О., 14 Mar 2022, In: Вестник РАН. 92, 8, p. 737-746 10 p., 5.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  49. P2O5-Promoted Cyclization of Di[aryl(hetaryl)methyl] Malonic Acids as a Pathway to Fused Spiro[4.4]nonane-1,6-Diones

    Ivanov, K. S., Riesebeck, T., Skolyapova, A., Liakisheva, I., Kazantsev, M. S., Sonina, A. A., Peshkov, R. Y. & Mostovich, E. A., 4 Mar 2022, In: Journal of Organic Chemistry. 87, 5, p. 2456-2469 14 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  50. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 Feb 2022, In: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, p. 303-314 12 p.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  51. A Low-Activity Polymorphic Variant of Human NEIL2 DNA Glycosylase

    Kakhkharova, Z. I., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 1 Feb 2022, In: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2212.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  52. Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., Feb 2022, In: Data in Brief. 40, 107760.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

  53. Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., Feb 2022, In: Genes. 13, 2, 166.

    Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Previous 1 2 3 4 Next

ID: 3086315