1. 2024
  2. An Accurate and Efficient Approach to Knowledge Extraction from Scientific Publications Using Structured Ontology Models, Graph Neural Networks, and Large Language Models

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., 3 нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 21, 11811.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. AI-Assisted Identification of Primary and Secondary Metabolomic Markers for Postoperative Delirium

    Ivanisenko, V. A., Rogachev, A. D., Makarova, A-L. A., Basov, N. V., Gaisler, E. V., Kuzmicheva, I. N., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Antropova, E. A., Kolchanov, N. A., Plesko, V. V., Moroz, G. B., Lomivorotov, V. V. & Pokrovsky, A. G., нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 21, 11847.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. SmartCrop cognitive platform: modules for automatic knowledge extraction from scientific publications, patents and factual databases for reconstruction and analysis of gene networks of stress response in rice and wheat

    Иванисенко, В. А., Деменков, П. С., Иванисенко, Т. В., Антропова, Е. А., Волянская, А. Р., Зубаирова, У. С., Макарова, А-Л. А., Орлов, Ю. Л. & Chen, M., авг. 2024, Bioinformatics of Genome Regulation and Structure Systems Biology (BGRS/SB-2024): The 14th International Multiconference (05-10 August 2024, Novosibirsk, Russia). Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, стр. 2188-2190 3 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  5. Prediction of the Aggressive Clinical Course of Papillary Thyroid Carcinoma Based on Fine Needle Aspiration Biopsy Molecular Testing

    Lukyanov, S. A., Titov, S. E., Kozorezova, E. S., Demenkov, P. S., Veryaskina, Y. A., Korotovskii, D. V., Ilyina, T. E., Vorobyev, S. L., Zhivotov, V. A., Bondarev, N. S., Sleptsov, I. V. & Sergiyko, S. V., июл. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 13, 14 стр., 7090.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Сравнительная молекулярная оценка неизмененной слизистой оболочки сегментов толстой кишки как возможной основы аденом

    Korotkevich, A. G., Zhilina, N. M., Demenkov, P. S., Veryaskina, Y. A. & Titov, S. E., 2024, в: Экспериментальная и клиническая гастроэнтерология. 4 (224), стр. 20-29 10 стр., 3.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. 2023
  8. Программа расшифровки аббревиатур сущностей в рефератах научных публикаций на основе их контекста (ЭНДДекрипт) / Program for decoding entity abbreviations in abstracts of scientific publications based on their context (ANDDecrypt)

    Иванисенко, Т. В., Деменков, П. С. & Иванисенко, В. А., 8 дек. 2023, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Патент/Св-во № 2023686851, 16 нояб. 2023, Дата приоритета 16 нояб. 2023, № приоритета 2023684403

    Результаты исследований: Патенты/Свидетельства о регистрациисвидетельство о регистрации программы для ЭВМ

  9. Gene networks for use in metabolomic data analysis of blood plasma from patients with postoperative delirium

    Ivanisenko, V. A., Basov, N. V., Makarova, A. A., Venzel, A. S., Rogachev, A. D., Demenkov, P. S., Ivanisenko, T. V., Kleshchev, M. A., Gaisler, E. V., Moroz, G. B., Plesko, V. V., Sotnikova, Y. S., Patrushev, Y. V., Lomivorotov, V. V., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 768-775 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Molecular-genetic pathways of hepatitis C virus regulation of the expression of cellular factors PREB and PLA2G4C, which play an important role in virus replication

    Mishchenko, E. L., Makarova, A. A., Antropova, E. A., Venzel, A. S., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 776-783 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Prioritization of potential pharmacological targets for the development of anti-hepatocarcinoma drugs modulating the extrinsic apoptosis pathway: the reconstruction and analysis of associative gene networks help

    Demenkov, P. S., Antropova, E. A., Adamovskaya, A. V., Mishchenko, E. L., Khlebodarova, T. M., Ivanisenko, T. V., Ivanisenko, N. V., Venzel, A. S., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 784-793 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Reconstruction and analysis of the gene regulatory network for cell wall function in Arabidopsis thaliana L. leaves in response to water deficit

    Volyanskaya, A. R., Antropova, E. A., Zubairova, U. S., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Orlov, Y. L., Makarova, A. A., Ivanisenko, T. V., Gorshkova, T. A., Aglyamova, A. R., Kolchanov, N. A., Chen, M. & Ivanisenko, V. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1031-1041 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder

    Uvarova, Y. E., Demenkov, P. S., Kuzmicheva, I. N., Venzel, A. S., Mischenko, E. L., Ivanisenko, T. V., Efimov, V. M., Bannikova, S. V., Vasilieva, A. R., Ivanisenko, V. A. & Peltek, S. E., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Reconstruction of the regulatory hypermethylation network controlling hepatocellular carcinoma development during hepatitis C viral infection

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Volianskaia, A. R., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Kolchanov, N. A., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. Specifics of the Taxonomic Composition of Bacterial Microflora in the Respiratory Microbiome of Patients with Chronic Dust Bronchitis

    Paradnikova, S. A., Druzhinin, V. G., Baranova, E. D., Demenkov, P. S. & Larionov, A. V., июн. 2023, в: Molecular Genetics, Microbiology and Virology. 38, 2, стр. 70-78 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. Candidate SNP Markers Significantly Altering the Affinity of TATA-Binding Protein for the Promoters of Human Hub Genes for Atherogenesis, Atherosclerosis and Atheroprotection

    Bogomolov, A., Filonov, S., Chadaeva, I., Rasskazov, D., Khandaev, B., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Podkolodnyy, N., Kondratyuk, E., Ponomarenko, P., Podkolodnaya, O., Mustafin, Z., Savinkova, L., Kolchanov, N., Tverdokhleb, N. & Ponomarenko, M., 19 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 10, 9010.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Differentially Expressed Genes and Molecular Susceptibility to Human Age-Related Diseases

    Shikhevich, S., Chadaeva, I., Khandaev, B., Kozhemyakina, R., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Bogomolov, A., Klimova, N. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Mustafin, Z., Markel, A., Savinkova, L., Kolchanov, N. A., Kozlov, V. & Ponomarenko, M., 16 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 3996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Composition of bacterial microbiome in sputum of patients with localized forms of pulmonary tuberculosis

    Druzhinin, V. G., Baranova, E. D., Demenkov, P. S., Zakharova, J. V., Lavryashina, M. B., Larionov, A. V., Matskova, L. V., Shabaldin, A. V. & Pyanzova, T. V., 2023, в: Pulmonologiya. 33, 5, стр. 645-656 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. 2022
  20. Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients

    Ivanisenko, V. A., Gaisler, E. V., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Cheresiz, S. V., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Mishchenko, E. L., Khripko, O. P., Khripko, Y. I., Voevoda, S. M., Karpenko, T. N., Velichko, A. J., Voevoda, M. I., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 12 стр., 19977.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 14934.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. Chronic dust bronchitis: composition of the sputum bacterial microbiome and its association with chromosome damage in blood lymphocytes

    Druzhinin, V. G., Baranova, E. D., Demenkov, P. S., Matskova, L. V., Paradnikova, S. A., Volobaev, V. P. & Larionov, A. V., 2022, в: Ecological Genetics. 20, 4, стр. 325-337 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Validation of preoperative diagnosis of malignant thyroid tumors using a molecular classifier

    Titov, S. E., Lukyanov, S. A., Kozorezova, E. S., Demenkov, P. S., Sergiyko, S. V., Veryaskina, Y. A., Vorobyov, S. L., Sleptsov, I. V. & Gostimsky, A. V., 2022, в: Voprosy Onkologii. 68, 6, стр. 741-751 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 12582400