1. 2023
  2. DyCeModel: a tool for 1D simulation for distribution of plant hormones controlling tissue patterning

    Azarova, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mironova, V. V., Zemlyanskaya, E. V. & Lavrekha, V. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 890-897 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. 2022
  4. Meet your MAKR: the membrane-associated kinase regulator protein family in the regulation of plant development

    Novikova, D. D., Korosteleva, A. L., Mironova, V. & Jaillais, Y., окт. 2022, в: FEBS Journal. 289, 20, стр. 6172-6186 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  5. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. A PLETHORA/PIN-FORMED/auxin network mediates prehaustorium formation in the parasitic plant Striga hermonthica

    Xiao, T. T., Kirschner, G. K., Kountche, B. A., Jamil, M., Savina, M., Lube, V., Mironova, V., Al Babili, S. & Blilou, I., авг. 2022, в: Plant Physiology. 189, 4, стр. 2281-2297 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. 2021
  9. Mechanisms of stress response in the root stem cell niche

    Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Xu, J. & Mironova, V., 13 окт. 2021, в: Journal of Experimental Botany. 72, 19, стр. 6746-6754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  10. Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

    Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  11. Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

    Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. 2020
  13. Meta-analysis of transcriptome data detected new potential players in response to dioxin exposure in humans

    Oshchepkova, E., Sizentsova, Y., Wiebe, D., Mironova, V. & Kolchanov, N., 23 окт. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 21, стр. 1-20 20 стр., 7858.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Cell Dynamics in WOX5-Overexpressing Root Tips: The Impact of Local Auxin Biosynthesis

    Savina, M. S., Pasternak, T., Omelyanchuk, N. A., Novikova, D. D., Palme, K., Mironova, V. V. & Lavrekha, V. V., 22 окт. 2020, в: Frontiers in Plant Science. 11, 13 стр., 560169.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

    Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. Rocks in the auxin stream: Wound-induced auxin accumulation and ERF115 expression synergistically drive stem cell regeneration

    Canher, B., Heyman, J., Savina, M., Devendran, A., Eekhout, T., Vercauteren, I., Prinsen, E., Matosevich, R., Xu, J., Mironova, V. & de Veylder, L., 14 июл. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 28, стр. 16667-16677 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. metaRE R package for meta-analysis of transcriptome data to identify the cis-regulatory code behind the transcriptional reprogramming

    Novikova, D. D., Cherenkov, P. A., Sizentsova, Y. G. & Mironova, V. V., 1 июн. 2020, в: Genes. 11, 6, стр. 1-14 14 стр., 634.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

    Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. Fold-change-specific enrichment analysis (FSEA): Quantification of transcriptional response magnitude for functional gene groups

    Wiebe, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mukhin, A. M., Grosse, I., Lashin, S. A., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V. V., 17 апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 14 стр., 434.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. 3D Analysis of Mitosis Distribution Pattern in the Plant Root Tip with iRoCS Toolbox

    Lavrekha, V. V., Pasternak, T., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 янв. 2020, в: Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2094, стр. 119-125 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. PlantLayout pipeline to model tissue patterning

    Savina, M. S. & Mironova, V. V., 1 янв. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 1, стр. 102-107 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. 2019
  23. A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

    Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. A single-cell view of tissue regeneration in plants

    Mironova, V. & Xu, J., дек. 2019, в: Current Opinion in Plant Biology. 52, стр. 149-154 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  25. Salicylic Acid Affects Root Meristem Patterning via Auxin Distribution in a Concentration-Dependent Manner

    Pasternak, T., Groot, E. P., Kazantsev, F. V., Teale, W., Omelyanchuk, N., Kovrizhnykh, V., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 июл. 2019, в: Plant Physiology. 180, 3, стр. 1725-1739 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. Capturing Auxin Response Factors Syntax Using DNA Binding Models

    Stigliani, A., Martin-Arevalillo, R., Lucas, J., Bessy, A., Vinos-Poyo, T., Mironova, V., Vernoux, T., Dumas, R. & Parcy, F., 3 июн. 2019, в: Molecular Plant. 12, 6, стр. 822-832 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. 2018
  28. Deciphering auxin-ethylene crosstalk at a systems level

    Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V. & Mironova, V. V., 14 дек. 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 12, 15 стр., 4060.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  29. Функциональная аннотация дифференциально экспрессирующихся генов с учетом степени изменения экспрессии (FoldGO)

    Вибе, Д. С., Омельянчук, Н. А. & Миронова, В. В., 6 дек. 2018, Роспатент - Федеральная служба по интеллектуальной собственности, Патент/Св-во № 2018665628, Дата приоритета 19 нояб. 2018, № приоритета 2018663038

    Результаты исследований: Патенты/Свидетельства о регистрациисвидетельство о регистрации программы для ЭВМ

  30. Diversity of cis-regulatory elements associated with auxin response in Arabidopsis thaliana

    Cherenkov, P., Novikova, D., Omelyanchuk, N., Levitsky, V., Grosse, I., Weijers, D. & Mironova, V., 4 янв. 2018, в: Journal of Experimental Botany. 69, 2, стр. 329-339 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. 2017
  32. 3D analysis of mitosis distribution highlights the longitudinal zonation and diarch symmetry in proliferation activity of the Arabidopsis thaliana root meristem

    Lavrekha, V. V., Pasternak, T., Ivanov, V. B., Palme, K. & Mironova, V. V., 1 дек. 2017, в: Plant Journal. 92, 5, стр. 834-845 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. A Sacrifice-for-Survival Mechanism Protects Root Stem Cell Niche from Chilling Stress

    Hong, J. H., Savina, M., Du, J., Devendran, A., Kannivadi Ramakanth, K., Tian, X., Sim, W. S., Mironova, V. V. & Xu, J., 29 июн. 2017, в: Cell. 170, 1, стр. 102-113.e14 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

    Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Mechanisms regulating ethylene signal transduction in plants

    Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ermakov, A. A. & Mironova, V. V., 1 мая 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 3, стр. 335-344 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. The Systems Biology of Auxin in Developing Embryos

    Mironova, V., Teale, W., Shahriari, M., Dawson, J. & Palme, K., 1 мар. 2017, в: Trends in Plant Science. 22, 3, стр. 225-235 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  37. The interplay of chromatin landscape and DNA-binding context suggests distinct modes of EIN3 regulation in Arabidopsis thaliana

    Zemlyanskaya, E. V., Levitsky, V. G., Oshchepkov, D. Y., Grosse, I. & Mironova, V. V., 9 янв. 2017, в: Frontiers in Plant Science. 7, 9 стр., 2044.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3457985