1. 2025
  2. Interplay Between DNA Polymerase, RNA Polymerase, and RNase H1 During Head-On Transcription-Replication Conflict

    Timofeyeva, N. A., Tsoi, E. I., Novopashina, D. S., Kuznetsov, N. A. & Kuznetsova, A. A., 27 нояб. 2025, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 23, 22 стр., 11515.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  3. Biochemical Characterization of R-Loop Degradation by Chloroplast-Localized RNase H1 from Arabidopsis thaliana

    Gavrilova, A. A., Kuznetsova, A. A., Novopashina, D. S., Zheng, C., Sun, Q. & Kuznetsov, N. A., 17 нояб. 2025, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 22, 13 стр., 11125.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  4. Масс-фотометрия для исследования комплексов системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Ендуткин, А. В., Новопашина, Д. С. & Жарков, Д. О., 2025.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  5. 2024
  6. CRISPR/Cas System Photocontrolled at the Guide RNA Level

    Sakovina, L. V., Gorlenko, E. S. & Novopashina, D. S., 20 дек. 2024, в: Biophysics (Russian Federation). 69, 3, стр. 349-358 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. Photocleavable Guide crRNAs for a Light-Controllable CRISPR/Cas9 System

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Akhmetova, E., Vorobyeva, M., Vorobjev, P., Zharkov, D. O. & Novopashina, D., 19 нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12392.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. Kinetic Features of Degradation of R-Loops by RNase H1 from Escherichia coli

    Kuznetsova, A. A., Kosarev, I. A., Timofeyeva, N. A., Novopashina, D. S. & Kuznetsov, N. A., 15 нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12263.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. Role of R-Loop Structure in Efficacy of RNA Elongation Synthesis by RNA Polymerase from Escherichia coli

    Timofeyeva, N. A., Tsoi, E. I., Novopashina, D. S., Kuznetsova, A. A. & Kuznetsov, N. A., 14 нояб. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 22, 12190.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. An Approach to the Synthesis of Cyclic Photocleavable RNA for Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

    Ivanskaya, E. V., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., окт. 2024, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 5, стр. 1807-1821 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  11. Photocleavable Guide RNA for Photocontrolled CRISPR/Cas9 System

    Akhmetova, E. A., Vokhtantsev, I. P., Meschaninova, M. I., Vorobyeva, M. A., Zharkov, D. O. & Novopashina, D. S., авг. 2024, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 50, 4, стр. 1314-1324 11 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  12. SNP-Associated Substitutions of Amino Acid Residues in the dNTP Selection Subdomain Decrease Polβ Polymerase Activity

    Kladova, O. A., Tyugashev, T. E., Miroshnikov, A. A., Novopashina, D. S., Kuznetsov, N. A. & Kuznetsova, A. A., 2 мая 2024, в: Biomolecules. 14, 5, 19 стр., 547.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  13. The Impact of SNP-Induced Amino Acid Substitutions L19P and G66R in the dRP-Lyase Domain of Human DNA Polymerase β on Enzyme Activities

    Kladova, O. A., Tyugashev, T. E., Yakimov, D. V., Mikushina, E. S., Novopashina, D. S., Kuznetsov, N. A. & Kuznetsova, A. A., 10 апр. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 8, 4182.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. The approaches for CRISPR/Cas9 regulation on the guide RNA level

    Новопашина, Д. С., Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Должикова, О. А. & Мещанинова, М. И., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, стр. 1724 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  15. Механизмы узнавания 5-метилцитозина ферментами системы активного эпигенетического деметилирования

    Петрова, Д. В., Новопашина, Д. С., Кузнецова, А. А., Кузнецов, Н. А., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 25

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  16. Модифицированные фоторасщепляемые направляющие РНК для создания регулируемой системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, стр. 68-69. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы

  17. Регуляция активности систем CRISPR/Cas9 на уровне направляющих РНК

    Новопашина, Д. С., Горленко, Е. С., Должикова, О. А., Саковина, Л. В. & Мещанинова, М. И., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 70

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  18. Фоторасщепляемые направляющие РНК для фоторегулируемой системы CRISPR/CAS9

    Ахметова, Е., Вохтанцев, И. П., Мещанинова, М. И., Воробьева, М. А., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, в: Биоорганическая химия. 50, 4, стр. 556-567 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. Фоторегулируемые на уровне направляющей РНК системы CRISPR/Cas

    Саковина, Л. В., Горленко, Е. С. & Новопашина, Д. С., 2024, в: Биофизика. 69, 3, стр. 421-431 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  20. Фоторегулируемые системы CRISPR/Cas9 с использованием фоточувствительных направляющих РНК

    Горленко, Е. С., Саковина, Л. В. & Новопашина, Д. С., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 87

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  21. 2023
  22. Inner Amino Acid Contacts Are Key Factors of Multistage Structural Rearrangements of DNA and Affect Substrate Specificity of Apurinic/Apyrimidinic Endonuclease APE1

    Bulygin, A. A., Syryamina, V. N., Kuznetsova, A. A., Novopashina, D. S., Dzuba, S. A. & Kuznetsov, N. A., 14 июл. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 14, 11474.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  23. The Activity of Natural Polymorphic Variants of Human DNA Polymerase β Having an Amino Acid Substitution in the Transferase Domain

    Kladova, O. A., Tyugashev, T. E., Mikushina, E. S., Kuznetsov, N. A., Novopashina, D. S. & Kuznetsova, A. A., 2 мая 2023, в: Cells. 12, 9, 1300.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  24. Aptamers for Addressed Boron Delivery in BNCT: Effect of Boron Cluster Attachment Site on Functional Activity

    Novopashina, D. S., Dymova, M. A., Davydova, A. S., Meschaninova, M. I., Malysheva, D. O., Kuligina, E. V., Richter, V. A., Kolesnikov, I. A., Taskaev, S. Y. & Vorobyeva, M. A., янв. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 1, 306.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. 2022
  26. Improving Stability and Specificity of CRISPR/Cas9 System by Selective Modification of Guide RNAs with 2'-fluoro and Locked Nucleic Acid Nucleotides

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Vorobyeva, M., Vorobyev, P. & Novopashina, D., 3 нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13460.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  27. The mechanism of damage recognition by apurinic/apyrimidinic endonuclease Nfo from Escherichia coli

    Senchurova, S. I., Syryamina, V. N., Kuznetsova, A. A., Novopashina, D. S., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M., Dzuba, S. A., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., нояб. 2022, в: Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects. 1866, 11, 130216.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  28. Photocaged Small Interfering RNA

    Akhmetova, E. A., Kim, D. V., Dome, A. S., Meschaninova, M. I. & Novopashina, D. S., окт. 2022, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 48, 5, стр. 1036-1042 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  29. Comparative Analysis of Exo-and Endonuclease Activities of APE1-like Enzymes

    Davletgildeeva, A. T., Kuznetsova, A. A., Novopashina, D. S., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 1 мар. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 5, 2869.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  30. Модифицированные направляющие РНК для создания специфичной и регулируемой системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., 2022, стр. 656. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы

  31. Циклические направляющие РНК для создания фотоактивируемой системы CRISPR/Cas9

    Иванская, Е. В., Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., 2022, стр. 160. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы

  32. Циклические направляющие РНК как компоненты фоторегулируемой системы геномного редактирования CRISPR/Cas9

    Иванская, Е. В., Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., 2022, стр. 182. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  33. 2021
  34. Photoactivatable nanocrispr/cas9 system based on crrna reversibly immobilized on carbon nanoparticles

    Semikolenova, O., Sakovina, L., Akhmetova, E., Kim, D., Vokhtantsev, I., Golyshev, V., Vorobyeva, M., Novopashin, S. & Novopashina, D., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 20, 10919.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  35. 2’-Модифицированные направляющие РНК как компоненты системы геномного редактирования CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Вохтанцев, И. П. & Новопашина, Д. С., окт. 2021, стр. 332. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  36. Tumor cell‐specific 2′‐fluoro rna aptamer conjugated with closo‐dodecaborate as a potential agent for boron neutron capture therapy

    Vorobyeva, M. A., Dymova, M. A., Novopashina, D. S., Kuligina, E. V., Timoshenko, V. V., Kolesnikov, I. A., Taskaev, S. Y., Richter, V. A. & Venyaminova, A. G., 2 июл. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 14, 7326.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  37. Comparative study of PyA-cluster system and excimer forming oligonucleotide probes for the detection of miRNA

    Semikolenova, O., Lee, H. J., Kim, B. H., Venyaminova, A. & Novopashina, D., июл. 2021, в: FEBS Open Bio. 11, стр. 241-241 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

  38. Novel approach to the delivery into the cells and light-activation of the guide RNA for the genome editing CRISPR/Cas9 system

    Яковлев, А., Ахметова, Е., Данилин, Н. А., Семиколенова, О. А., Вохтанцев, И. П., Ким, Д. В., Жарков, Д. О., Веньяминова, А. Г. & Новопашина, Д. С., июл. 2021, стр. 122. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  39. The prospective antibacterial conjugates of modified oligonucleotides

    Danilin, N., Novopashina, D., Matveyev, A., Bardasheva, A., Tikunova, N., Kupryushkin, M., Pyshnyi, D. & Venyaminova, A., июл. 2021, в: FEBS Open Bio. 11, стр. 307-307 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

  40. Мутационный и кинетический анализ эндорибонуклеазной активности АРЕ1

    Kuznetsova, A. A., Gavrilova, A. A., Novopashina, D. S., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., 20 апр. 2021, в: Molekuliarnaia biologiia. 55, 2, стр. 243-257 15 стр., 6.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  41. Conjugates of RNase P-Guiding Oligonucleotides with Oligo(N-Methylpyrrole) as Prospective Antibacterial Agents

    Danilin, N. A., Matveev, A. L., Tikunova, N. V., Venyaminova, A. G. & Novopashina, D. S., мар. 2021, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 47, 2, стр. 469-477 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  42. Mutational and Kinetic Analysis of APE1 Endoribonuclease Activity

    Kuznetsova, A. A., Gavrilova, A. A., Novopashina, D. S., Fedorova, O. S. & Kuznetsov, N. A., мар. 2021, в: Molecular Biology. 55, 2, стр. 211-224 14 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. New Two-Component Pyrene Probes Based on Oligo(2'-O-Methylribonucleotides) for microRNA Detection

    Semikolenova, O. A., Golyshev, V. M., Kim, B. H., Venyaminova, A. G. & Novopashina, D. S., мар. 2021, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 47, 2, стр. 432-440 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  44. Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

    Akhmetova, E. A., Golyshev, V. M., Vokhtantcev, I. P., Meschaninova, M. I., Venyaminova, A. G. & Novopashina, D. S., мар. 2021, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 47, 2, стр. 496-504 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  45. 2020
  46. 5′-Monopyrene and 5′-Bispyrene 2′-O-methyl RNA Probes for Detection of RNA Mismatches

    Novopashina, D. S., Semikolenova, O. A. & Venyaminova, A. G., 1 янв. 2020, Nucleic Acid Detection and Structural Investigations. Astakhova, K. & Bukhari, S. A. (ред.). Humana Press, Том 2063. стр. 45-56 12 стр. (Methods in Molecular Biology; том 2063).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › глава/раздел › научная › Рецензирование

  47. 2019
  48. Novel Convenient Approach to the Solid-Phase Synthesis of Oligonucleotide Conjugates

    Meschaninova, M. I., Novopashina, D. S., Semikolenova, O. A., Silnikov, V. N. & Venyaminova, A. G., 22 нояб. 2019, в: Molecules (Basel, Switzerland). 24, 23, 14 стр., 4266.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. RNase P-Guiding Peptide Conjugates of Oligo(2'-O-methylribonucleotides) as Prospective Antibacterial Agents

    Danilin, N. A., Koroleva, L. S., Novopashina, D. S. & Venyaminova, A. G., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 825-832 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. Novel peptide conjugates of modified oligonucleotides for inhibition of bacterial RNase P

    Novopashina, D., Vorobyeva, M., Nazarov, A., Davydova, A., Danilin, N., Koroleva, L., Matveev, A., Bardasheva, A., Tikunova, N., Kupryushkin, M., Pyshnyi, D., Altman, S. & Venyaminova, A., 19 июл. 2019, в: Frontiers in Pharmacology. 10, 8 стр., 813.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  51. Photocleavable guide RNAs for controllable genome editing with CRISPR/Cas9 system

    Novopashina, D., Khabardina, E., Vokhtantsev, I., Kim, D., Venyaminova, A. & Zharkov, D., июл. 2019, в: FEBS Open Bio. 9, стр. 400-400 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

  52. 2018
  53. Modified Oligonucleotides for Guiding RNA Cleavage Using Bacterial RNase P

    Novopashina, D. S., Nazarov, A. S., Vorobjeva, M. A., Kuprushkin, M. S., Davydova, A. S., Lomzov, A. A., Pyshnyi, D. V., Altman, S. & Venyaminova, A. G., 1 нояб. 2018, в: Molecular Biology. 52, 6, стр. 905-912 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  54. Modified Oligonucleotides for Guiding RNA Cleavage Using Bacterial RNase P

    Novopashina, D. S., Nazarov, A. S., Vorobjeva, M. A., Kuprushkin, M. S., Davydova, A. S., Lomzov, A. A., Pyshnyi, D. V., Altman, S. & Venyaminova, A. G., 1 нояб. 2018, в: Molekuliarnaia biologiia. 52, 6, стр. 1045-1054 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  55. 2017
  56. Rational design and studies of excimer forming novel dual probes to target RNA

    Krasheninina, O. A., Lomzov, A. A., Fishman, V. S., Novopashina, D. S. & Venyaminova, A. G., 1 апр. 2017, в: Bioorganic and Medicinal Chemistry. 25, 7, стр. 2244-2250 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  57. Non-covalent anchoring of oligonucleotides on single-walled carbon nanotubes via short bioreducible linker

    Permyakova, E. S., Novopashina, D. S., Venyaminova, A. G. & Apartsin, E. K., 1 янв. 2017, в: RSC Advances. 7, 46, стр. 29212-29217 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

ID: 3441026