1. 2025
  2. Chromatin landscape, transcriptomic and ChIP-seq profiling of Anopheles stephensi MSQ43 cell line

    Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Khabarova, A., Gridina, M., Popov, A., Belokopytova, P., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., 26 сент. 2025, в: Scientific Data. 12, 1, стр. 1566

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  3. Direction and modality of transcription changes caused by TAD boundary disruption in Slc29a3/Unc5b locus depends on tissue-specific epigenetic context

    Salnikov, P., Belokopytova, P., Yan, A., Viesná, E., Korablev, A., Serova, I., Lukyanchikova, V., Stepanchuk, Y., Torgunakov, N., Tikhomirov, S. & Fishman, V., 12 авг. 2025, в: Epigenetics & chromatin. 18, 1, 55.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  4. Charm is a flexible pipeline to simulate chromosomal rearrangements on Hi-C-like data

    Nuriddinov, M., Belokopytova, P. & Fishman, V., июн. 2025, в: NAR Genomics and Bioinformatics. 7, 2, стр. lqaf081 10 стр., lqaf081.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. Combining chromosome conformation capture and exome sequencing for simultaneous detection of structural and single-nucleotide variants

    Gridina, M., Lagunov, T., Belokopytova, P., Torgunakov, N., Nuriddinov, M., Nurislamov, A., Nazarenko, L. P., Kashevarova, A. A., Lopatkina, M. E., Vasilyev, S., Zuev, A., Belyaeva, E. O., Salyukova, O. A., Cheremnykh, A. D., Sukhanova, N. N., Minzhenkova, M. E., Markova, Z. G., Demina, N. A., Stepanchuk, Y., Khabarova, A., еще 22Yan, A., Valeev, E., Koksharova, G., Grigor’eva, E. V., Kokh, N., Lukjanova, T., Maximova, Y., Musatova, E., Shabanova, E., Kechin, A., Khrapov, E., Boyarskih, U., Ryzhkova, O., Suntsova, M., Matrosova, A., Karoli, M., Manakhov, A., Filipenko, M., Rogaev, E., Shilova, N. V., Lebedev, I. N. & Fishman, V., 7 мая 2025, в: Genome Medicine. 17, 1, стр. 47 47.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  6. Generation of iTAF1-36-H8.1 and iTAF1-36-H8.2 Human-Induced Pluripotent Stem Cell Lines with HAR Deletion in the CNTN6 Gene by CRISPR/Cas9 Genome-Editing Technology

    Chvileva, A. S., Yunusova, A. M., Pristyazhnyuk, I. E., Smirnov, A. V., Ryzhkova, A. S., Belokopytova, P. S. & Shnaider, T. A., 17 мар. 2025, в: Russian Journal of Developmental Biology. 55, 5, стр. 296-306 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. 2024
  8. Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes

    Salnikov, P., Korablev, A., Serova, I., Belokopytova, P., Yan, A., Stepanchuk, Y., Tikhomirov, S. & Fishman, V., дек. 2024, в: Scientific Reports. 14, 1, 8 стр., 5288.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. TAD border deletion at the Kit locus causes tissue-specific ectopic activation of a neighboring gene

    Kabirova, E., Ryzhkova, A., Lukyanchikova, V., Khabarova, A., Korablev, A., Shnaider, T., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Smirnov, A., Khotskin, N. V., Kontsevaya, G., Serova, I. & Battulin, N., дек. 2024, в: Nature Communications. 15, 1, 16 стр., 4521.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome

    Yan, A. P., Salnikov, P. A., Gridina, M. M., Belokopytova, P. S. & Fishman, V. S., апр. 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 4, стр. 653-662 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  11. Разработка метода детекции пространственных контактов плазмидной ДНК с геномом в клетках человека

    Ян, А. П., Сальников, П. А., Гридина, М. М., Белокопытова, П. С. & Фишман, В. С., 2024, в: Биохимия. 89, 4, стр. 612-622 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  12. 2023
  13. A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells

    Khabarova, A., Koksharova, G., Salnikov, P., Belokopytova, P., Mungalov, R., Pristyazhnuk, I., Nurislamov, A., Gridina, M. & Fishman, V., 26 февр. 2023, в: Chromosome Research. 31, 1, 15 стр., 11.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. 2022
  15. Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects

    Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Taskina, A., Liang, J., Reijnders, M. J. M. F., Ruzzante, L., Feron, R., Waterhouse, R. M., Wu, Y., Mao, C., Tu, Z., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., дек. 2022, в: Nature Communications. 13, 1, 1960.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  16. 3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics

    Belokopytova, P., Viesná, E., Chiliński, M., Qi, Y., Salari, H., Di Stefano, M., Esposito, A., Conte, M., Chiariello, A. M., Teif, V. B., Plewczynski, D., Zhang, B., Jost, D. & Fishman, V., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W4-W12

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. 2021
  18. Derivation of Ringed Seal (Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells

    Beklemisheva, V. R., Belokopytova, P. S., Fishman, V. S. & Menzorov, A. G., 1 дек. 2021, в: Cellular reprogramming. 23, 6, стр. 326-335 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. Здесь и там: двусторонняя локализация интеграций трансгена: the double-side transgene localization

    Salnikov, P. A., Khabarova, A. A., Koksharova, G. S., Mungalov, R., Belokopytova, P. S., Pristyazhnuk, I. E., Nurislamov, A. R., Somatich, P., Gridina, M. M. & Fishman, V. S., окт. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 6, стр. 607-612 6 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  20. Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions

    Belokopytova, P. & Fishman, V., 22 янв. 2021, в: Frontiers in Genetics. 11, 15 стр., 617202.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  21. 2020
  22. Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions

    Belokopytova, P. S., Nuriddinov, M. A., Mozheiko, E. A., Fishman, D. & Fishman, V., 1 янв. 2020, в: Genome Research. 30, 1, стр. 72-84 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

ID: 3502837