3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics

Belokopytova, P., Viesná, E., Chiliński, M., Qi, Y., Salari, H., Di Stefano, M., Esposito, A., Conte, M., Chiariello, A. M., Teif, V. B., Plewczynski, D., Zhang, B., Jost, D. & Fishman, V., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W4-W12

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells

Khabarova, A., Koksharova, G., Salnikov, P., Belokopytova, P., Mungalov, R., Pristyazhnuk, I., Nurislamov, A., Gridina, M. & Fishman, V., 26 февр. 2023, в: Chromosome Research. 31, 1, 15 стр., 11.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects

Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Taskina, A., Liang, J., Reijnders, M. J. M. F., Ruzzante, L., Feron, R., Waterhouse, R. M., Wu, Y., Mao, C., Tu, Z., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., дек. 2022, в: Nature Communications. 13, 1, 1960.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Charm is a flexible pipeline to simulate chromosomal rearrangements on Hi-C-like data

Nuriddinov, M., Belokopytova, P. & Fishman, V., июн. 2025, в: NAR Genomics and Bioinformatics. 7, 2, стр. lqaf081 10 стр., lqaf081.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Chromatin landscape, transcriptomic and ChIP-seq profiling of Anopheles stephensi MSQ43 cell line

Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Khabarova, A., Gridina, M., Popov, A., Belokopytova, P., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., 26 сент. 2025, в: Scientific Data. 12, 1, стр. 1566

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Combining chromosome conformation capture and exome sequencing for simultaneous detection of structural and single-nucleotide variants

Gridina, M., Lagunov, T., Belokopytova, P., Torgunakov, N., Nuriddinov, M., Nurislamov, A., Nazarenko, L. P., Kashevarova, A. A., Lopatkina, M. E., Vasilyev, S., Zuev, A., Belyaeva, E. O., Salyukova, O. A., Cheremnykh, A. D., Sukhanova, N. N., Minzhenkova, M. E., Markova, Z. G., Demina, N. A., Stepanchuk, Y., Khabarova, A., еще 22Yan, A., Valeev, E., Koksharova, G., Grigor’eva, E. V., Kokh, N., Lukjanova, T., Maximova, Y., Musatova, E., Shabanova, E., Kechin, A., Khrapov, E., Boyarskih, U., Ryzhkova, O., Suntsova, M., Matrosova, A., Karoli, M., Manakhov, A., Filipenko, M., Rogaev, E., Shilova, N. V., Lebedev, I. N. & Fishman, V., 7 мая 2025, в: Genome Medicine. 17, 1, стр. 47 47.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Derivation of Ringed Seal (Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells

Beklemisheva, V. R., Belokopytova, P. S., Fishman, V. S. & Menzorov, A. G., 1 дек. 2021, в: Cellular reprogramming. 23, 6, стр. 326-335 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Direction and modality of transcription changes caused by TAD boundary disruption in Slc29a3/Unc5b locus depends on tissue-specific epigenetic context

Salnikov, P., Belokopytova, P., Yan, A., Viesná, E., Korablev, A., Serova, I., Lukyanchikova, V., Stepanchuk, Y., Torgunakov, N., Tikhomirov, S. & Fishman, V., 12 авг. 2025, в: Epigenetics & chromatin. 18, 1, 55.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Generation of iTAF1-36-H8.1 and iTAF1-36-H8.2 Human-Induced Pluripotent Stem Cell Lines with HAR Deletion in the CNTN6 Gene by CRISPR/Cas9 Genome-Editing Technology

Chvileva, A. S., Yunusova, A. M., Pristyazhnyuk, I. E., Smirnov, A. V., Ryzhkova, A. S., Belokopytova, P. S. & Shnaider, T. A., 17 мар. 2025, в: Russian Journal of Developmental Biology. 55, 5, стр. 296-306 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions

Belokopytova, P. & Fishman, V., 22 янв. 2021, в: Frontiers in Genetics. 11, 15 стр., 617202.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование