1. 2023
  2. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 312-319 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 258-271 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 мар. 2023, в: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, стр. 5613-5617 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., 1 мар. 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, стр. 330-339 10 стр., 17.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., еще 5Steinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., мар. 2023, в: DNA Repair. 123, 18 стр., 103448.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. DNA Damage Response and Repair in Boron Neutron Capture Therapy

    Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., 2 янв. 2023, в: Genes. 14, 1, 127.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  8. Structural Biology in the Study of Enzyme Catalysis: An Example of DNA Glycosylases

    Жарков, Д. О., 2023, SYNCHROTRON RADIATION TECHNIQUES FOR CATALYSTS AND FUNCTIONAL MATERIALS: II International Conference, Abstracts. Новосибирск: Издательский отдел Института катализа СО РАН, стр. 18 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  9. Активность ДНК-гликозилах на неканонических структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 70 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  10. Альтернативные механизмы мутагенеза в mCpG-сайтах при репликации и репарации

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 4, стр. 587-596 10 стр., 3.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Анализ активности и специфичности рационально сконструированных вариантов белка CAS9 ИЗ Streptococcus pyogenes

    Вохтанцев, И. П., Кадцын, Е. Д., Аманова, М. М., Бакулина, А. Ю. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 57 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  12. Биоразнообразие микроорганизмов — источник новых ферментов репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2023, От микробиологии к генетическим технологиям. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 86-87 2 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  13. Влияние окислительного повреждения oxoGна стабильность дуплексов ДНК

    Насонов, Д. М., Овчеренко, С. С., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, стр. 181. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  14. ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ

    Овчеренко, С. С., Насонов, Д. М., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, стр. 377-378 2 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  15. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О., 2023. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  16. Изучение состояния ионизируемых групп в активном центре комплекса Fpg-ДНК методом ЭПР

    Литвинов, И. А., Овчеренко, С. С., Булгаков, Н. А., Кирилюк, И. А., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, стр. 175. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  17. Механизм действия ДНК-полимераз на субстратах с модифицированными АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 161 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  18. Механизм прохождения модифицированных АП-сайтов ДНК-полимеразами

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2023, ОТ МИКРОБИОЛОГИИ К ГЕНЕТИЧЕСКИМ ТЕХНОЛОГИЯМ: Материалы всероссийской конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 93 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  19. Механизмы ДНК-гликолилаз и проблема "избыточных реакций"

    Жарков, Д. О., 2023, Биокатализ. Фундаментальные исследования и применения: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 79 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  20. Механизмы специфичности системы CRISPR/Cas9 в геномном редактировании

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, стр. 269-284 16 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. ОСНОВЫ БЕЛКОВОЙ ИНЖЕНЕРИИ

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2023, (Принято в печать) Редакционно-издательский центр НГУ. 178 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное-методическое пособие

  22. Особенности ответа клеток карциномы легких человека A549 с нокаутированным геном PRIMPOL на генотоксический стресс

    Громова, А. С., Болдинова, Е. О., Ким, Д. В., Чупров-Неточин, Р. Н., Жарков, Д. О., Макарова, А. В., Леонов, С. В. & Пустовалова, М. В., 2023, в: Биохимия. 88, 11, стр. 2340-2352 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Передвижение ферментов репарации по ДНК: in vitro vs in vivo

    Жарков, Д. О. & Дятлова, Е. А., 2023. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  24. Субстратная специфичность ферментов эксцизионной репарации оснований в отношении искусственных нуклеотидов, применяемых в синтетической биологии

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 74 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  25. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2›ДЕЗОКСИУРИДИН-5›-ТРИФОСФАТНУКЛЕОТИДГИДРОЛАЗЫ ESCHERICHIA COLI

    Кириленко, А. А., Коваленко, Е. А., Юдкина, А. В., Ендуткин, А. В., Панфёрова, Е. П., Коханенко, А. А. & Жарков, Д. О., 2023, стр. 184-185. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  26. 2022
  27. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., дек. 2022, в: The CRISPR journal. 5, 6, стр. 799-812 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

    Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., нояб. 2022, в: DNA Repair. 119, 10 стр., 103390.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Distinct Mechanisms of Target Search by Endonuclease VIII-like DNA Glycosylases

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., окт. 2022, в: Cells. 11, 20, 3192.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

    Yuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., авг. 2022, в: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, стр. 470-478 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

    Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 июл. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  33. Характеристика деметилирующей ДНК-гликозилазы ROS1 из Nicotiana tabacum L

    Петрова, Д. В., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., июл. 2022, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 26, 4, стр. 341-348 8 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. Механизмы обеспечения стабильности генома коронавирусов как потенциальные мишени для противовирусных средств

    Ююкина, С. К. & Жарков, Д. О., 14 мар. 2022, в: Вестник РАН. 92, 8, стр. 737-746 10 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 февр. 2022, в: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, стр. 303-314 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. A Low-Activity Polymorphic Variant of Human NEIL2 DNA Glycosylase

    Kakhkharova, Z. I., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 1 февр. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2212.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., февр. 2022, в: Data in Brief. 40, 107760.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., февр. 2022, в: Genes. 13, 2, 166.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Dynamics and Conformational Changes in Human NEIL2 DNA Glycosylase Analyzed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., 30 янв. 2022, в: Journal of Molecular Biology. 434, 2, 167334.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  40. Effect of DNA Methylation on the 3′→5′ Exonuclease Activity of Major Human Abasic Site Endonuclease APEX1

    Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D. & Zharkov, D. O., янв. 2022, в: Biochemistry (Moscow). 87, 1, стр. 10-20 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. Base excision repair in non-canonical DNA structures

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 977-978. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  42. Bioorthogonality in the light of cell defense mechanisms: Interaction of non-natural nucleic acids with the base excision DNA repair system

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 982. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  43. Interaction of DNA replication and DNA repair systems with AP sites adducts with proteins, peptides and low-molecular-weight compounds

    Юдкина, А. В., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Дворникова, А. П., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 1026. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  44. Structure and function evolution in DNA repair

    Жарков, Д. О., 2022, стр. 1027. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  45. Transcriptional mutagenesis-based reporter system for the analysis of DNA repair

    Ким, Д. В., Khobta, A. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 987. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  46. Влияние метилирования ДНК на 3′→5′-экзонуклеазную активность основной апурин-апиримидиновой эндонуклеазы человека APEX1

    Ендуткин, А. В., Яценко, Д. Д. & Жарков, Д. О., 2022, в: Биохимия. 87, 1, стр. 3-15 13 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  47. Ингибиторы ДНК-гликозилаз как потенциальные терапевтические препараты

    Жарков, Д. О., 2022, стр. 41. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  48. Оптимизация неадресующего фрагмента sgРНК для системы геномного редактирования CRISPR/Cas9 методом молекулярной селекции in vitro

    Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Мещанинова, М. И., Кабилов, М. Р., Жарков, Д. О. & Воробьева, М. А., 2022, стр. 101. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  49. Оптимизация экспрессии и тестирования активности ДНК-гликозилазы MUTYH млекопитающих

    Кручинин, А. А., Шилкин, Е. С., Жарков, Д. О. & Макарова, А. В., 2022, стр. 125-126. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисы

  50. Химиотерапевтические подходы в фармакологии : в 2 ч.: учеб.-метод. пособие: Ч. I. Синтез нуклеотидов, репликация, клеточное деление.

    Жарков, Д. О. & Дворникова, А. П., 2022, Novosibirsk: Редакционно-издательский центр НГУ. 76 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное-методическое пособиеРецензирование

  51. 2021
  52. Translesion activity of PrimPol on DNA with cisplatin and DNA–protein cross-links

    Boldinova, E. O., Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Gagarinskaya, D. I., Baranovskiy, A. G., Tahirov, T. H., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., дек. 2021, в: Scientific Reports. 11, 1, 17588.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3458293