1. 2024
  2. Интерферометрическая рассеивающая микроскопия для исследования комплекса эндонуклеазы SPYCAS9 с направляющей SGРНК

    Саковина, Л. В., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, XI МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ, МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ И СПЕЦИАЛИСТОВ ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ - 2024: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, стр. 544 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  3. Исследование транскрипционного мутагенеза и репарации 8-оксогуанина в клетках с использованием репортерных плазмид

    Чуприкова, М. С. & Жарков, Д. О., 2024, Современные вызовы структурной и синтетической биологии : материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 50

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  4. Механизмы узнавания 5-метилцитозина ферментами системы активного эпигенетического деметилирования

    Петрова, Д. В., Новопашина, Д. С., Кузнецова, А. А., Кузнецов, Н. А., Пермякова, Н. В., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 25

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  5. Механизмы узнавания и превращения субстратов ДНК-гликозилазами

    Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 20 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  6. Модифицированные фоторасщепляемые направляющие РНК для создания регулируемой системы CRISPR/Cas9

    Саковина, Л. В., Горленко, Е. С., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, стр. 68-69. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисы

  7. Неканонические функции ДНК-гликозилаз

    Жарков, Д. О., 2024, Международный Конгресс «VIII Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300‑летию российской науки и высшей школы». Саратов, 14–19 июня 2024 года. Санкт-Петербург: Издательский дом "Петрополис", стр. 232

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  8. Основы белковой инженерии

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2024, Новосибирск: ИПЦ НГУ. 214 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное-методическое пособиеРецензирование

  9. Репарация урацила в G-квадруплексных структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Савицкая, В. Ю., Новоселов, К. А., Кубарева, Е. А. & Жарков, Д. О., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ"

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  10. Сборник задач и упражнений по молекулярной биологии

    Грин, И. Р., Воробьев, П. Е., Вохтанцев, И. П., Коваль, В. В., Коваль, О. А. & Жарков, Д. О., 2024, 72 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное пособие

  11. Способность полимераз различных семейств процессировать субстраты, содержащие клик-химические модификации сахарофосфатного остова

    Яковлев, А. О., Ендуткин, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, БИОИНФОРМАТИКА РЕГУЛЯЦИИ И СТРУКТУРЫ ГЕНОМОВ / СИСТЕМНАЯ БИОЛОГИЯ: Тезисы докладов Четырнадцатой международной мультиконференции. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, стр. 1967-1970 4 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  12. Стратегии расщепления N-гликозидной связи ферментами репарации ДНК

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 2024, в: Lomonosov chemistry journal. 65, №2, 2024, стр. 136-143 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Структурная биология репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2024.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисы

  14. Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Чуприкова, М. С., Яковлев, А. О., Затеева, М. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 51 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  15. Точность действия ДНК-полимеразы RB69 на поврежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Яковлев, А. О., Жарков, Д. О. & Юдкина, А. В., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 59

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийпредисловие, научный комментарий, послесловиенаучная

  16. Фоторасщепляемые направляющие РНК для фоторегулируемой системы CRISPR/CAS9

    Ахметова, Е., Вохтанцев, И. П., Мещанинова, М. И., Воробьева, М. А., Жарков, Д. О. & Новопашина, Д. С., 2024, в: Биоорганическая химия. 50, 4, стр. 556-567 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. 2023
  18. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair

    Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 нояб. 2023, в: PLoS ONE. 18, 11, 26 стр., e0294683.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress

    Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., нояб. 2023, в: Biochemistry (Moscow). 88, 11, стр. 1933-1943 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. Base Excision DNA Repair in Plants: Arabidopsis and Beyond

    Grin, I. R., Petrova, D. V., Endutkin, A. V., Ma, C., Yu, B., Li, H. & Zharkov, D. O., 29 сент. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 19, 14746.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  21. Alternative Mechanisms of Mutagenesis at mCpG Sites during Replication and Repair

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., авг. 2023, в: Molecular Biology. 57, 4, стр. 584-592 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 июл. 2023, в: Nucleic Acids Research. 51, 12, стр. 6321-6336 16 стр., gkad423.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Bypass of Abasic Site-Peptide Cross-Links by Human Repair and Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Bulgakov, N. A., Boldinova, E. O., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 29 июн. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 10877.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet

    Wu, Z., Zhang, T., Li, J., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., 2 июн. 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 1185440.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. Activity of nsp14 Exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with Modified 3'-Termini

    Yuyukina, S. K., Barmatov, A. E., Bizyaev, S. N., Stetsenko, D. A., Sergeeva, O. V., Zatsepin, T. S. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Doklady. Biochemistry and biophysics. 509, 1, стр. 65-69 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 312-319 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 258-271 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 мар. 2023, в: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, стр. 5613-5617 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., 1 мар. 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, стр. 330-339 10 стр., 17.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., еще 5Steinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., мар. 2023, в: DNA Repair. 123, 18 стр., 103448.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. DNA Damage Response and Repair in Boron Neutron Capture Therapy

    Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., 2 янв. 2023, в: Genes. 14, 1, 127.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  33. Structural Biology in the Study of Enzyme Catalysis: An Example of DNA Glycosylases

    Жарков, Д. О., 2023, SYNCHROTRON RADIATION TECHNIQUES FOR CATALYSTS AND FUNCTIONAL MATERIALS: II International Conference, Abstracts. Новосибирск: Издательский отдел Института катализа СО РАН, стр. 18 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  34. Активность ДНК-гликозилах на неканонических структурах ДНК

    Дятлова, Е. А., Ерошенко, Д. А. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 70 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  35. Альтернативные механизмы мутагенеза в mCpG-сайтах при репликации и репарации

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 4, стр. 587-596 10 стр., 3.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. Анализ активности и специфичности рационально сконструированных вариантов белка CAS9 ИЗ Streptococcus pyogenes

    Вохтанцев, И. П., Кадцын, Е. Д., Аманова, М. М., Бакулина, А. Ю. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 57 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  37. Биоразнообразие микроорганизмов — источник новых ферментов репарации ДНК

    Жарков, Д. О., 2023, От микробиологии к генетическим технологиям. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 86-87 2 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  38. Влияние окислительного повреждения oxoGна стабильность дуплексов ДНК

    Насонов, Д. М., Овчеренко, С. С., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, стр. 181. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  39. ДИНАМИКА ОТКРЫТИЯ ПАР ОСНОВАНИЙ OXOG:C И OXOG:A ПО ДАННЫМ МЕТОДИКИ ЯМР ПЕРЕНОСА НАМАГНИЧЕННОСТИ С ВОДЫ

    Овчеренко, С. С., Насонов, Д. М., Шернюков, А. В., Ендуткин, А. В., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, X МЕЖДУНАРОДНАЯ КОНФЕРЕНЦИЯ МОЛОДЫХ УЧЕНЫХ: БИОИНФОРМАТИКОВ, БИОТЕХНОЛОГОВ, БИОФИЗИКОВ, ВИРУСОЛОГОВ И МОЛЕКУЛЯРНЫХ БИОЛОГОВ: Сборник тезисов. Новосибирск: ИПЦ НГУ, стр. 377-378 2 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  40. Изучение роли C-концевого фрагмента 8-оксогуанин-ДНК-гликозилазы 1 человека (OGG1) в связывании и расщеплении специфических субстратов

    Яковлев, А. О. & Жарков, Д. О., 2023. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  41. Изучение состояния ионизируемых групп в активном центре комплекса Fpg-ДНК методом ЭПР

    Литвинов, И. А., Овчеренко, С. С., Булгаков, Н. А., Кирилюк, И. А., Жарков, Д. О. & Багрянская, Е. Г., 2023, стр. 175. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  42. Механизм действия ДНК-полимераз на субстратах с модифицированными АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 161 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  43. Механизм прохождения модифицированных АП-сайтов ДНК-полимеразами

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2023, ОТ МИКРОБИОЛОГИИ К ГЕНЕТИЧЕСКИМ ТЕХНОЛОГИЯМ: Материалы всероссийской конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 93 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучная

  44. Механизмы ДНК-гликолилаз и проблема "избыточных реакций"

    Жарков, Д. О., 2023, Биокатализ. Фундаментальные исследования и применения: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 79 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  45. Механизмы специфичности системы CRISPR/Cas9 в геномном редактировании

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, стр. 269-284 16 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. Основы белковой инженерии

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2023, (Принято в печать) Новосибирск: Редакционно-издательский центр НГУ. 181 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное-методическое пособиеРецензирование

  47. Особенности ответа клеток карциномы легких человека A549 с нокаутированным геном PRIMPOL на генотоксический стресс

    Громова, А. С., Болдинова, Е. О., Ким, Д. В., Чупров-Неточин, Р. Н., Жарков, Д. О., Макарова, А. В., Леонов, С. В. & Пустовалова, М. В., 2023, в: Биохимия. 88, 11, стр. 2340-2352 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  48. Передвижение ферментов репарации по ДНК: in vitro vs in vivo

    Жарков, Д. О. & Дятлова, Е. А., 2023. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  49. Субстратная специфичность ферментов эксцизионной репарации оснований в отношении искусственных нуклеотидов, применяемых в синтетической биологии

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 74 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  50. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2›ДЕЗОКСИУРИДИН-5›-ТРИФОСФАТНУКЛЕОТИДГИДРОЛАЗЫ ESCHERICHIA COLI

    Кириленко, А. А., Коваленко, Е. А., Юдкина, А. В., Ендуткин, А. В., Панфёрова, Е. П., Коханенко, А. А. & Жарков, Д. О., 2023, стр. 184-185. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  51. 2022
  52. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., дек. 2022, в: The CRISPR journal. 5, 6, стр. 799-812 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  53. Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

    Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., нояб. 2022, в: DNA Repair. 119, 10 стр., 103390.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3458293