1 - 50 из 131Размер страницы: 50
Сортировать по:: Тип
  1. статья › научная › Прошло рецензирование

  2. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 июл. 2023, в: Nucleic Acids Research. 51, 12, стр. 6321-6336 16 стр., gkad423.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  3. Aberrant repair initiated by the adenine-DNA glycosylase does not play a role in UV-induced mutagenesis in Escherichia coli

    Zutterling, C., Mursalimov, A., Talhaoui, I., Koshenov, Z., Akishev, Z., Bissenbaev, A. K., Mazon, G., Geacintov, N. E., Gasparutto, D., Groisman, R., Zharkov, D. O., Matkarimov, B. T. & Saparbaev, M., 5 дек. 2018, в: PeerJ. 6, 12, 23 стр., 6029.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  4. Activity of nsp14 Exonuclease from SARS-CoV-2 towards RNAs with Modified 3'-Termini

    Yuyukina, S. K., Barmatov, A. E., Bizyaev, S. N., Stetsenko, D. A., Sergeeva, O. V., Zatsepin, T. S. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Doklady. Biochemistry and biophysics. 509, 1, стр. 65-69 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. A Low-Activity Polymorphic Variant of Human NEIL2 DNA Glycosylase

    Kakhkharova, Z. I., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 1 февр. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2212.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  6. Alternative Mechanisms of Mutagenesis at mCpG Sites during Replication and Repair

    Shilkin, E. S., Petrova, D. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., авг. 2023, в: Molecular Biology. 57, 4, стр. 584-592 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. A New Class of Uracil-DNA Glycosylase Inhibitors Active against Human and Vaccinia Virus Enzyme

    Grin, I. R., Mechetin, G., Kasymov, R. D., Diatlova, E. A., Yudkina, A., Shchelkunov, S. N., Gileva, I. P., Denisova, A. A., Stepanov, G. A., Chilov, G. G. & Zharkov, D. O., 1 нояб. 2021, в: Molecules. 26, 21, 15 стр., 6668.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., янв. 2024, в: DNA Repair. 133, 8 стр., 103605.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1

    Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., янв. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. Bypass of Abasic Site-Peptide Cross-Links by Human Repair and Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Bulgakov, N. A., Boldinova, E. O., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 29 июн. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 10877.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  11. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair

    Maltseva, E. A., Vasil'eva, I. A., Moor, N. A., Kim, D. V., Dyrkheeva, N. S., Kutuzov, M. M., Vokhtantsev, I. P., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Lavrik, O. I., 29 нояб. 2023, в: PLoS ONE. 18, 11, 26 стр., e0294683.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  12. Catalytically Competent Conformation of the Active Site of Human 8-Oxoguanine-DNA Glycosylase

    Popov, A. V., Yudkina, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 17 февр. 2020, в: Biochemistry (Moscow). 85, 2, стр. 192-204 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  13. Characterization of biochemical properties of an apurinic/apyrimidinic endonuclease from Helicobacter pylori

    Turgimbayeva, A., Abeldenov, S., Zharkov, D. O., Ishchenko, A. A., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Khassenov, B., 15 авг. 2018, в: PLoS ONE. 13, 8, стр. e0202232 26 стр., e0202232.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. Characterization of Recombinant Endonuclease IV from Mycobacterium tuberculosis

    Dymova, M. A., Endutkin, A. V., Polunovsky, V. V., Zakabunin, A. I., Khrapov, E. A., Torgasheva, N. A., Yudkina, A. V., Mechetin, G. V., Filipenko, M. L. & Zharkov, D. O., мар. 2021, в: Molecular Biology. 55, 2, стр. 225-233 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  15. Cloning and characterization of the major AP endonuclease from Staphylococcus aureus

    Turgimbayeva, A., Zein, U., Zharkov, D. O., Ramankulov, Y., Saparbaev, M. & Abeldenov, S., нояб. 2022, в: DNA Repair. 119, 10 стр., 103390.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  16. Conformational Dynamics of Damage Processing by Human DNA Glycosylase NEIL1

    Kladova, O. A., Grin, I. R., Fedorova, O. S., Kuznetsov, N. A. & Zharkov, D. O., 15 мар. 2019, в: Journal of Molecular Biology. 431, 6, стр. 1098-1112 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. Correlated target search by uracil-DNA glycosylase in the presence of bulky adducts and DNA-binding ligands

    Mechetin, G. V., Dyatlova, E. A., Sinyakov, A. N., Ryabinin, V. A., Vorobjev, P. E. & Zharkov, D. O., 1 янв. 2017, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 43, 1, стр. 23-28 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  18. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. Critical Sites of DNA Backbone Integrity for Damaged Base Removal by Formamidopyrimidine-DNA Glycosylase

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 18 июн. 2019, в: Biochemistry. 58, 24, стр. 2740-2749 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  20. Dataset for dynamics and conformational changes in human NEIL2 protein analyzed by integrative structural biology approach

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., февр. 2022, в: Data in Brief. 40, 107760.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  21. Dihydroartemisinin counteracts fibrotic portal hypertension via farnesoid X receptor-dependent inhibition of hepatic stellate cell contraction

    Endutkin, A., Popov, A., Yudkina, A., Makasheva, K., Afonnikov, D., Simmerling, C. & Zharkov, D., 1 янв. 2017, в: FEBS Journal. 284, 1, стр. 114-133 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  22. Displacement of Slow-Turnover DNA Glycosylases by Molecular Traffic on DNA

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A., Moor, N. A., Vokhtantsev, I. P., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., авг. 2020, в: Genes. 11, 8, стр. 1-21 21 стр., 866.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  23. Distinct Mechanisms of Target Search by Endonuclease VIII-like DNA Glycosylases

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V. & Zharkov, D. O., окт. 2022, в: Cells. 11, 20, 3192.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  24. DNA Deformation-Coupled Recognition of 8-Oxoguanine: Conformational Kinetic Gating in Human DNA Glycosylase

    Li, H., Endutkin, A. V., Bergonzo, C., Fu, L., Grollman, A., Zharkov, D. O. & Simmerling, C., 22 февр. 2017, в: Journal of the American Chemical Society. 139, 7, стр. 2682-2692 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. DNA glycosylases for 8-oxoguanine repair in Staphylococcus aureus

    Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Barmatov, A. E. & Zharkov, D. O., сент. 2021, в: DNA Repair. 105, стр. 103160 103160.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  26. Dynamics and Conformational Changes in Human NEIL2 DNA Glycosylase Analyzed by Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry

    Zhdanova, P. V., Ishchenko, A. A., Chernonosov, A. A., Zharkov, D. O. & Koval, V. V., 30 янв. 2022, в: Journal of Molecular Biology. 434, 2, 167334.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  27. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 мар. 2023, в: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, стр. 5613-5617 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  28. Effect of DNA Methylation on the 3′→5′ Exonuclease Activity of Major Human Abasic Site Endonuclease APEX1

    Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D. & Zharkov, D. O., янв. 2022, в: Biochemistry (Moscow). 87, 1, стр. 10-20 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  29. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 312-319 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  30. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet

    Wu, Z., Zhang, T., Li, J., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., 2 июн. 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 1185440.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  31. Global DNA dynamics of 8-oxoguanine repair by human OGG1 revealed by stopped-flow kinetics and molecular dynamics simulation

    Lukina, M. V., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Zharkov, D. O. & Fedorova, O. S., 1 окт. 2017, в: Molecular BioSystems. 13, 10, стр. 1954-1966 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  32. Influence of pyridine-like ligands on the structure, photochemical and biological properties of nitro-nitrosyl ruthenium complexes

    Kostin, G. A., Mikhailov, A. A., Kuratieva, N. V., Pischur, D. P., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 7 авг. 2017, в: New Journal of Chemistry. 41, 15, стр. 7758-7765 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  33. Mechanism of stimulation of DNA binding of the transcription factors by human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE1

    Bazlekowa-Karaban, M., Prorok, P., Baconnais, S., Taipakova, S., Akishev, Z., Zembrzuska, D., Popov, A. V., Endutkin, A. V., Groisman, R., Ishchenko, A. A., Matkarimov, B. T., Bissenbaev, A., Le Cam, E., Zharkov, D. O., Tudek, B. & Saparbaev, M., 1 окт. 2019, в: DNA Repair. 82, стр. 102698 18 стр., 102698.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  34. Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

    Yuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., авг. 2022, в: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, стр. 470-478 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  35. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 258-271 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  36. Mild phenotype of knockouts of the major apurinic/apyrimidinic endonuclease APEX1 in a non-cancer human cell line

    Kim, D. V., Kulishova, L. M., Torgasheva, N. A., Melentyev, V. S., Dianov, G. L., Medvedev, S. P., Zakian, S. M. & Zharkov, D. O., сент. 2021, в: PLoS ONE. 16, 9 September, e0257473.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  37. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 февр. 2022, в: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, стр. 303-314 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  38. Molecular dynamics approach to identification of new OGG1 cancer-associated somatic variants with impaired activity

    Popov, A. V., Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D., Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Makasheva, K. A., Raspopova, D. Y., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., 1 янв. 2021, в: Journal of Biological Chemistry. 296, 100229.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  39. Molecular dynamics simulation of the opposite-base preference and interactions in the active site of formamidopyrimidine-DNA glycosylase

    Popov, A. V., Endutkin, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 8 мая 2017, в: BMC Structural Biology. 17, 1, стр. 1-19 19 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  40. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., дек. 2022, в: The CRISPR journal. 5, 6, стр. 799-812 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  41. Oxidative damage to epigenetically methylated sites affects DNA stability, dynamics and enzymatic demethylation

    Gruber, D. R., Toner, J. J., Miears, H. L., Shernyukov, A. V., Kiryutin, A. S., Lomzov, A. A., Endutkin, A. V., Grin, I. R., Petrova, D. V., Kupryushkin, M. S., Yurkovskaya, A. V., Johnson, E. C., Okon, M., Bagryanskaya, E. G., Zharkov, D. O. & Smirnov, S. L., 16 нояб. 2018, в: Nucleic Acids Research. 46, 20, стр. 10827-10839 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  42. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., еще 5Steinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., мар. 2023, в: DNA Repair. 123, 18 стр., 103448.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. Platinum Polyoxoniobates Form Adducts with DNA

    Yudkina, A. V., Sokolov, M. N., Abramov, P. A., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 641-646 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  44. Reading and misreading 8-oxoguanine, a paradigmatic ambiguous nucleobase

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Endutkin, A. V., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 1 мая 2019, в: Crystals. 9, 5, 31 стр., 269.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  45. Recognition but no repair of abasic site in single-stranded DNA by human ribosomal uS3 protein residing within intact 40S subunit

    Grosheva, A. S., Zharkov, D. O., Stahl, J., Gopanenko, A. V., Tupikin, A. E., Kabilov, M. R., Graifer, D. M. & Karpova, G. G., 20 апр. 2017, в: Nucleic Acids Research. 45, 7, стр. 3833-3843 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  46. Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  47. Relative Efficiency of Recognition of 5-Methylcytosine and 5-Hydroxymethylcytosine by Methyl-Dependent DNA Endonuclease GlaI

    Petrova, D. V., Naumenko, M. B., Khantakova, D. V., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 625-629 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  48. Requirements for DNA bubble structure for efficient cleavage by helix-two-turn-helix DNA glycosylases

    Makasheva, K. A., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., янв. 2020, в: Mutagenesis. 35, 1, стр. 119-128 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. Residue coevolution reveals functionally important intramolecular interactions in formamidopyrimidine-DNA glycosylase

    Endutkin, A. V., Koptelov, S. S., Popov, A. V., Torgasheva, N. A., Lomzov, A. A., Tsygankova, A. R., Skiba, T. V., Afonnikov, D. A. & Zharkov, D. O., 1 сент. 2018, в: DNA Repair. 69, стр. 24-33 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. Response of PRIMPOL-Knockout Human Lung Adenocarcinoma A549 Cells to Genotoxic Stress

    Gromova, A. S., Boldinova, E. O., Kim, D. V., Chuprov-Netochin, R. N., Leonov, S. V., Pustovalova, M. V., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., нояб. 2023, в: Biochemistry (Moscow). 88, 11, стр. 1933-1943 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  51. Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., февр. 2022, в: Genes. 13, 2, 166.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Назад 1 2 3 Далее

ID: 3458293