1. 2023
  2. Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease

    Maria, G., Andrey, P., Artem, S., Nikita, T., Andrey, K., Evgeny, K., Oxana, R., Maxim, F. & Veniamin, F., 11 дек. 2023, в: Epigenetics & chromatin. 16, 1, 13 стр., 48.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. Lampbrush chromosome studies in the post-genomic era

    Krasikova, A., Fishman, V. & Kulikova, T., мая 2023, в: BioEssays. 45, 5, 7 стр., e2200250.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Cell type-specific interpretation of noncoding variants using deep learning-based methods

    Sindeeva, M., Chekanov, N., Avetisian, M., Shashkova, T. I., Baranov, N., Malkin, E., Lapin, A., Kardymon, O. & Fishman, V., 20 мар. 2023, в: GigaScience. 12, стр. 1-11 11 стр., giad015.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Function and Evolution of the Loop Extrusion Machinery in Animals

    Kabirova, E., Nurislamov, A., Shadskiy, A., Smirnov, A., Popov, A., Salnikov, P., Battulin, N. & Fishman, V., 6 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 5017.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  6. A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells

    Khabarova, A., Koksharova, G., Salnikov, P., Belokopytova, P., Mungalov, R., Pristyazhnuk, I., Nurislamov, A., Gridina, M. & Fishman, V., 26 февр. 2023, в: Chromosome Research. 31, 1, 15 стр., 11.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. Benefits of NGS for Genetic Testing of Primary Lymphedema

    Kokh, N. V., Sergeevna, K. G., Gridina, M., Ivanoshchuk, D., Fishman, V. & Nimaev, V., 2023, 2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine, CSGB 2023 - Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 133-136 4 стр. (2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine, CSGB 2023 - Proceedings).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  8. 2022
  9. Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects

    Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Taskina, A., Liang, J., Reijnders, M. J. M. F., Ruzzante, L., Feron, R., Waterhouse, R. M., Wu, Y., Mao, C., Tu, Z., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., дек. 2022, в: Nature Communications. 13, 1, 1960.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. FastContext: A tool for identification of adapters and other sequence patterns in next generation sequencing (NGS) data

    Viesná, Е. & Fishman, V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 806-809 4 стр., 10.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Method for the Isolation of “RNA-seq-Quality” RNA from Human Intervertebral Discs after Mortar and Pestle Homogenization

    Ivanov, A. A., Leonova, O. N., Wiebe, D. S., Krutko, A. V., Gridina, M. M., Fishman, V. S., Aulchenko, Y. S., Tsepilov, Y. A. & Golubeva, T. S., нояб. 2022, в: Cells. 11, 22, 3578.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes

    Nurislamov, A., Lagunov, T., Gridina, M., Krasikova, A. & Fishman, V., 20 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 12601.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Editorial: The role of high-order chromatin organization in gene regulation

    Fishman, V. & Pindyurin, A. V., 3 окт. 2022, в: Frontiers in Genetics. 13, 1045787.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхредакционная статьяРецензирование

  14. Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols

    Gridina, M., Taskina, A., Lagunov, T., Nurislamov, A., Kulikova, T., Krasikova, A. & Fishman, V., окт. 2022, в: Heliyon. 8, 10, 6 стр., e11023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. 3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics

    Belokopytova, P., Viesná, E., Chiliński, M., Qi, Y., Salari, H., Di Stefano, M., Esposito, A., Conte, M., Chiariello, A. M., Teif, V. B., Plewczynski, D., Zhang, B., Jost, D. & Fishman, V., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W4-W12

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. 2021
  17. Derivation of Ringed Seal (Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells

    Beklemisheva, V. R., Belokopytova, P. S., Fishman, V. S. & Menzorov, A. G., 1 дек. 2021, в: Cellular reprogramming. 23, 6, стр. 326-335 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Здесь и там: двусторонняя локализация интеграций трансгена

    Salnikov, P. A., Khabarova, A. A., Koksharova, G. S., Mungalov, R., Belokopytova, P. S., Pristyazhnuk, I. E., Nurislamov, A. R., Somatich, P., Gridina, M. M. & Fishman, V. S., окт. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 6, стр. 607-612 6 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. A cookbook for DNase Hi-C

    Gridina, M., Mozheiko, E., Valeev, E., Nazarenko, L. P., Lopatkina, M. E., Markova, Z. G., Yablonskaya, M. I., Voinova, V. Y., Shilova, N. V., Lebedev, I. N. & Fishman, V., 20 мар. 2021, в: Epigenetics and Chromatin. 14, 1, 15.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. Erythrocytes 3D genome organization in vertebrates

    Ryzhkova, A., Taskina, A., Khabarova, A., Fishman, V. & Battulin, N., февр. 2021, в: Scientific Reports. 11, 1, 4414.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions

    Belokopytova, P. & Fishman, V., 22 янв. 2021, в: Frontiers in Genetics. 11, 15 стр., 617202.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  22. Естественно-научные предметы. Практическая молекулярная генетика для начинающих: 8-9ые классы

    Аульченко, Ю. С., Баттулин, Н. Р., Бородин, П. М., Воронина, Е. Н., Карташов, М. Ю., Колесникова, Т. Д., Нижников, А. А., Пилипенко, А. С., Посух, О. В., Седых, С. Е., Соловьев, В. И., Торгашева, Н. А., Фишман, В. С., Хлесткина, Е. К., Цыбко, А. С., Шнайдер, Т. А. & Юнусова, А. М., 2021, Москва : Просвещение. 272 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборникиучебное пособиеРецензирование

  23. 2020
  24. DNA barcoding reveals that injected transgenes are predominantly processed by homologous recombination in mouse zygote

    Smirnov, A., Fishman, V., Yunusova, A., Korablev, A., Serova, I., Skryabin, B. V., Rozhdestvensky, T. S. & Battulin, N., 24 янв. 2020, в: Nucleic Acids Research. 48, 2, стр. 719-735 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions

    Belokopytova, P. S., Nuriddinov, M. A., Mozheiko, E. A., Fishman, D. & Fishman, V., 1 янв. 2020, в: Genome Research. 30, 1, стр. 72-84 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. 2019
  27. C-InterSecture-a computational tool for interspecies comparison of genome architecture

    Nuriddinov, M. & Fishman, V., 1 дек. 2019, в: Bioinformatics (Oxford, England). 35, 23, стр. 4912-4921 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Time origin and structural analysis of the induced CRISPR/cas9 megabase-sized deletions and duplications involving the Cntn6 gene in mice

    Pristyazhnyuk, I. E., Minina, J., Korablev, A., Serova, I., Fishman, V., Gridina, M., Rozhdestvensky, T. S., Gubar, L., Skryabin, B. V. & Serov, O. L., 2 окт. 2019, в: Scientific Reports. 9, 1, 1 стр., 14161.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Detection of Point Mutations and Chromosomal Translocations Based on Massive Parallel Sequencing of Enriched 3C Libraries

    Mozheiko, E. A. & Fishman, V. S., 1 окт. 2019, в: Russian Journal of Genetics. 55, 10, стр. 1273-1281 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Targeted genomic integration of EGFP under tubulin beta 3 class III promoter and mEos2 under tryptophan hydroxylase 2 promoter does not produce sufficient levels of reporter gene expression

    Menzorov, A. G., Orishchenko, K. E., Fishman, V. S., Shevtsova, A. A., Mungalov, R. V., Pristyazhnyuk, I. E., Kizilova, E. A., Matveeva, N. M., Alenina, N., Bader, M., Rubtsov, N. B. & Serov, O. L., окт. 2019, в: Journal of Cellular Biochemistry. 120, 10, стр. 17208-17218 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. 3D organization of chicken genome demonstrates evolutionary conservation of topologically associated domains and highlights unique architecture of erythrocytes' chromatin

    Fishman, V., Battulin, N., Nuriddinov, M., Maslova, A., Zlotina, A., Strunov, A., Chervyakova, D., Korablev, A., Serov, O. & Krasikova, A., 25 янв. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 2, стр. 648-665 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. 2018
  33. A mosaic intragenic microduplication of LAMA1 and a constitutional 18p11.32 microduplication in a patient with keratosis pilaris and intellectual disability

    Kashevarova, A. A., Nazarenko, L. P., Skryabin, N. A., Nikitina, T. V., Vasilyev, S. A., Tolmacheva, E. N., Lopatkina, M. E., Salyukova, O. A., Chechetkina, N. N., Vorotelyak, E. A., Kalabusheva, E. P., Fishman, V. S., Kzhyshkowska, J., Graziano, C., Magini, P., Romeo, G. & Lebedev, I. N., 1 нояб. 2018, в: American Journal of Medical Genetics, Part A. 176, 11, стр. 2395-2403 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. Allele-Specific Biased Expression of the CNTN6 Gene in iPS Cell-Derived Neurons from a Patient with Intellectual Disability and 3p26.3 Microduplication Involving the CNTN6 Gene

    Gridina, M. M., Matveeva, N. M., Fishman, V. S., Menzorov, A. G., Kizilova, H. A., Beregovoy, N. A., Kovrigin, I. I., Pristyazhnyuk, I. E., Oscorbin, I. P., Filipenko, M. L., Kashevarova, A. A., Skryabin, N. A., Nikitina, T. V., Sazhenova, E. A., Nazarenko, L. P., Lebedev, I. N. & Serov, O. L., 1 авг. 2018, в: Molecular Neurobiology. 55, 8, стр. 6533-6546 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Interpreting Chromosomal Rearrangements in the Context of 3-Dimentional Genome Organization: A Practical Guide for Medical Genetics

    Fishman, V. S., Salnikov, P. A. & Battulin, N. R., 1 апр. 2018, в: Biochemistry (Moscow). 83, 4, стр. 393-401 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  36. Analysis of differential expression of matrix metalloproteases in stable and unstable atherosclerotic lesions by a method of full genome sequencing of RNA: Pilot study

    Ivanoschuk, D. E., Ragino, Y. I., Shakhtshneider, E. V., Mikhailova, S. V., Fishman, V. S., Polonskaya, Y. V., Kashtanova, E. V., Chernyavsky, A. M., Murashov, I. S. & Voevoda, M. I., 1 янв. 2018, в: Russian Journal of Cardiology. 23, 8, стр. 52-58 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. 2017
  38. Alternative dominance of the parental genomes in hybrid cells generated through the fusion of mouse embryonic stem cells with fibroblasts

    Matveeva, N. M., Fishman, V. S., Zakharova, I. S., Shevchenko, A. I., Pristyazhnyuk, I. E., Menzorov, A. G. & Serov, O. L., 22 дек. 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 18094 14 стр., 18094.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Deterministic versus stochastic model of reprogramming: New evidence from cellular barcoding technique

    Yunusova, A. M., Fishman, V. S., Vasiliev, G. V. & Battulin, N. R., апр. 2017, в: Open Biology. 7, 4, 13 стр., 160311.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3445187