1. 2026
  2. Insertion-Site Proximity to AAV Inverted Terminal Repeats Increases Plasmid Recombination

    Makarenko, M., Semicheva, D. & Fishman, V., 26 авг. 2026, в: International Journal of Molecular Sciences. 27, 17, 16 стр., 7630.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  3. 2025
  4. An Exceptionally Complex Chromosome Rearrangement in the Great Tit (Parus major): Genetic Composition, Meiotic Behavior and Population Frequency

    Torgasheva, A., Malinovskaya, L., Nuriddinov, M., Zadesenets, K. S., Gridina, M., Nurislamov, A., Korableva, S., Pristyazhnyuk, I., Proskuryakova, A., Tishakova, K. V., Rubtsov, N. B., Fishman, V. S. & Borodin, P., 27 дек. 2025, в: Cells. 15, 1, 24 стр., 52.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. Chromatin landscape, transcriptomic and ChIP-seq profiling of Anopheles stephensi MSQ43 cell line

    Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Khabarova, A., Gridina, M., Popov, A., Belokopytova, P., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., 26 сент. 2025, в: Scientific Data. 12, 1, стр. 1566

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  6. Direction and modality of transcription changes caused by TAD boundary disruption in Slc29a3/Unc5b locus depends on tissue-specific epigenetic context

    Salnikov, P., Belokopytova, P., Yan, A., Viesná, E., Korablev, A., Serova, I., Lukyanchikova, V., Stepanchuk, Y., Torgunakov, N., Tikhomirov, S. & Fishman, V., 12 авг. 2025, в: Epigenetics & chromatin. 18, 1, 55.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. DNA and Histone Modifications Identify a Putative Controlling Element (CE) on the X Chromosome of Sciara coprophila

    Posukh, O. V., Shloma, V. V., Skrypnik, P. A., Maksimov, D. A., Antoshina, P. A., Kalashnikova, D. A., Nurislamov, A., Lukyanchikova, V. A., Torgunakov, N., Battulin, N. R., Fishman, V. S., Vyatkin, Y. V., Smelova, A. A., Romanov, S. E., Laktionov, P. P., Valishayev, D., Belyakin, S. N. & Singh, P. B., 12 авг. 2025, в: Cells. 14, 16, 16 стр., 1243.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. Charm is a flexible pipeline to simulate chromosomal rearrangements on Hi-C-like data

    Nuriddinov, M., Belokopytova, P. & Fishman, V., июн. 2025, в: NAR Genomics and Bioinformatics. 7, 2, стр. lqaf081 10 стр., lqaf081.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. Combining chromosome conformation capture and exome sequencing for simultaneous detection of structural and single-nucleotide variants

    Gridina, M., Lagunov, T., Belokopytova, P., Torgunakov, N., Nuriddinov, M., Nurislamov, A., Nazarenko, L. P., Kashevarova, A. A., Lopatkina, M. E., Vasilyev, S., Zuev, A., Belyaeva, E. O., Salyukova, O. A., Cheremnykh, A. D., Sukhanova, N. N., Minzhenkova, M. E., Markova, Z. G., Demina, N. A., Stepanchuk, Y., Khabarova, A., еще 22Yan, A., Valeev, E., Koksharova, G., Grigor’eva, E. V., Kokh, N., Lukjanova, T., Maximova, Y., Musatova, E., Shabanova, E., Kechin, A., Khrapov, E., Boyarskih, U., Ryzhkova, O., Suntsova, M., Matrosova, A., Karoli, M., Manakhov, A., Filipenko, M., Rogaev, E., Shilova, N. V., Lebedev, I. N. & Fishman, V., 7 мая 2025, в: Genome Medicine. 17, 1, стр. 47 47.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. 2024
  11. Кандидатные прогностические и предиктивные транслокации высоко агрессивных форм мозговых опухолей

    Фишман, В. С. & Гридина, М. М., 10 дек. 2024, Редакционно-издательский центр НГУ, Патент/Св-во № 118, 10 дек. 2024, Дата приоритета 10 дек. 2024

    Результаты исследований: Патенты/Свидетельства о регистрации › свидетельство о регистрации ноу-хау

  12. Structural variants in the Epb41l4a locus: TAD disruption and Nrep gene misregulation as hypothetical drivers of neurodevelopmental outcomes

    Salnikov, P., Korablev, A., Serova, I., Belokopytova, P., Yan, A., Stepanchuk, Y., Tikhomirov, S. & Fishman, V., дек. 2024, в: Scientific Reports. 14, 1, 8 стр., 5288.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  13. Сравнительный анализ первичной структуры и получение рекомбинантной поли(ADP-рибоза)полимеразы 1 долгоживущего Heterocephalus glaber

    Naumenko, K. N., Nurislamov, A. R., Nazarov, K. D., Fishman, V. S., Popov, A. A., Petruseva, I. O., Evdokimov, A. N. & Lavrik, O. I., нояб. 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 7, стр. 688-695 8 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. A HGF Mutation in the Familial Case of Primary Lymphedema: A Report

    Koksharova, G., Kokh, N., Gridina, M., Khapaev, R., Nimaev, V. & Fishman, V., мая 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 10, 5464.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  15. Modification of the Hi-C Technology for Molecular Genetic Analysis of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Sections of Tumor Tissues

    Gridina, M. M., Stepanchuk, Y. K., Nurridinov, M. A., Lagunov, T. A., Torgunakov, N. Y., Shadsky, A. A., Ryabova, A. I., Vasiliev, N. V., Vtorushin, S. V., Gerashchenko, T. S., Denisov, E. V., Travin, M. A., Korolev, M. A. & Fishman, V. S., апр. 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 4, стр. 637-652 16 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  16. Towards Development of the 4C-Based Method Detecting Interactions of Plasmid DNA with Host Genome

    Yan, A. P., Salnikov, P. A., Gridina, M. M., Belokopytova, P. S. & Fishman, V. S., апр. 2024, в: Biochemistry (Moscow). 89, 4, стр. 653-662 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. Differential gene expression in degenerative lumbar discs from the Russian disc degeneration study (RuDDS) biobank

    Тяпкин, А. В., Иванов, А. А., Леонова, О. Н., Krutko, A. V., Peleganchuk, A. V., Фишман, В. С., Елгаева, Е. Е. & Цепилов, Я. А., 2024, в: European journal of human genetics. 32, S2, стр. 996-997 2 стр., EP06.052.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  18. Разработка метода детекции пространственных контактов плазмидной ДНК с геномом в клетках человека

    Ян, А. П., Сальников, П. А., Гридина, М. М., Белокопытова, П. С. & Фишман, В. С., 2024, в: Биохимия. 89, 4, стр. 612-622 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. 2023
  20. Expanding the list of sequence-agnostic enzymes for chromatin conformation capture assays with S1 nuclease

    Maria, G., Andrey, P., Artem, S., Nikita, T., Andrey, K., Evgeny, K., Oxana, R., Maxim, F. & Veniamin, F., 11 дек. 2023, в: Epigenetics & chromatin. 16, 1, 13 стр., 48.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  21. Lampbrush chromosome studies in the post-genomic era

    Krasikova, A., Fishman, V. & Kulikova, T., мая 2023, в: BioEssays. 45, 5, 7 стр., e2200250.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  22. Cell type-specific interpretation of noncoding variants using deep learning-based methods

    Sindeeva, M., Chekanov, N., Avetisian, M., Shashkova, T. I., Baranov, N., Malkin, E., Lapin, A., Kardymon, O. & Fishman, V., 20 мар. 2023, в: GigaScience. 12, стр. 1-11 11 стр., giad015.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  23. Function and Evolution of the Loop Extrusion Machinery in Animals

    Kabirova, E., Nurislamov, A., Shadskiy, A., Smirnov, A., Popov, A., Salnikov, P., Battulin, N. & Fishman, V., 6 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 5017.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  24. A Cre-LoxP-based approach for combinatorial chromosome rearrangements in human HAP1 cells

    Khabarova, A., Koksharova, G., Salnikov, P., Belokopytova, P., Mungalov, R., Pristyazhnuk, I., Nurislamov, A., Gridina, M. & Fishman, V., 26 февр. 2023, в: Chromosome Research. 31, 1, 15 стр., 11.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. Benefits of NGS for Genetic Testing of Primary Lymphedema

    Kokh, N. V., Sergeevna, K. G., Gridina, M., Ivanoshchuk, D., Fishman, V. & Nimaev, V., 2023, 2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine, CSGB 2023 - Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 133-136 4 стр. (2023 IEEE Ural-Siberian Conference on Computational Technologies in Cognitive Science, Genomics and Biomedicine, CSGB 2023 - Proceedings).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  26. 2022
  27. Anopheles mosquitoes reveal new principles of 3D genome organization in insects

    Lukyanchikova, V., Nuriddinov, M., Belokopytova, P., Taskina, A., Liang, J., Reijnders, M. J. M. F., Ruzzante, L., Feron, R., Waterhouse, R. M., Wu, Y., Mao, C., Tu, Z., Sharakhov, I. V. & Fishman, V., дек. 2022, в: Nature Communications. 13, 1, 1960.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  28. FastContext: A tool for identification of adapters and other sequence patterns in next generation sequencing (NGS) data

    Viesná, Е. & Fishman, V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 806-809 4 стр., 10.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  29. Method for the Isolation of “RNA-seq-Quality” RNA from Human Intervertebral Discs after Mortar and Pestle Homogenization

    Ivanov, A. A., Leonova, O. N., Wiebe, D. S., Krutko, A. V., Gridina, M. M., Fishman, V. S., Aulchenko, Y. S., Tsepilov, Y. A. & Golubeva, T. S., нояб. 2022, в: Cells. 11, 22, 3578.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  30. Single-Cell DNA Methylation Analysis of Chicken Lampbrush Chromosomes

    Nurislamov, A., Lagunov, T., Gridina, M., Krasikova, A. & Fishman, V., 20 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 12601.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  31. Editorial: The role of high-order chromatin organization in gene regulation

    Fishman, V. & Pindyurin, A. V., 3 окт. 2022, в: Frontiers in Genetics. 13, 1045787.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › редакционная статья › Рецензирование

  32. Comparison and critical assessment of single-cell Hi-C protocols

    Gridina, M., Taskina, A., Lagunov, T., Nurislamov, A., Kulikova, T., Krasikova, A. & Fishman, V., окт. 2022, в: Heliyon. 8, 10, 6 стр., e11023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  33. 3DGenBench: a web-server to benchmark computational models for 3D Genomics

    Belokopytova, P., Viesná, E., Chiliński, M., Qi, Y., Salari, H., Di Stefano, M., Esposito, A., Conte, M., Chiariello, A. M., Teif, V. B., Plewczynski, D., Zhang, B., Jost, D. & Fishman, V., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W4-W12

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  34. 2021
  35. Derivation of Ringed Seal (Phoca hispida) Induced Multipotent Stem Cells

    Beklemisheva, V. R., Belokopytova, P. S., Fishman, V. S. & Menzorov, A. G., 1 дек. 2021, в: Cellular reprogramming. 23, 6, стр. 326-335 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  36. Здесь и там: двусторонняя локализация интеграций трансгена: the double-side transgene localization

    Salnikov, P. A., Khabarova, A. A., Koksharova, G. S., Mungalov, R., Belokopytova, P. S., Pristyazhnuk, I. E., Nurislamov, A. R., Somatich, P., Gridina, M. M. & Fishman, V. S., окт. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 6, стр. 607-612 6 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  37. A cookbook for DNase Hi-C

    Gridina, M., Mozheiko, E., Valeev, E., Nazarenko, L. P., Lopatkina, M. E., Markova, Z. G., Yablonskaya, M. I., Voinova, V. Y., Shilova, N. V., Lebedev, I. N. & Fishman, V., 20 мар. 2021, в: Epigenetics and Chromatin. 14, 1, 15.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  38. Erythrocytes 3D genome organization in vertebrates

    Ryzhkova, A., Taskina, A., Khabarova, A., Fishman, V. & Battulin, N., февр. 2021, в: Scientific Reports. 11, 1, 4414.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  39. Predicting Genome Architecture: Challenges and Solutions

    Belokopytova, P. & Fishman, V., 22 янв. 2021, в: Frontiers in Genetics. 11, 15 стр., 617202.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  40. Естественно-научные предметы. Практическая молекулярная генетика для начинающих: 8-9ые классы

    Аульченко, Ю. С., Баттулин, Н. Р., Бородин, П. М., Воронина, Е. Н., Карташов, М. Ю., Колесникова, Т. Д., Нижников, А. А., Пилипенко, А. С., Посух, О. В., Седых, С. Е., Соловьев, В. И., Торгашева, Н. А., Фишман, В. С., Хлесткина, Е. К., Цыбко, А. С., Шнайдер, Т. А. & Юнусова, А. М., 2021, Москва : Просвещение. 272 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборники › учебное пособие › Рецензирование

  41. 2020
  42. DNA barcoding reveals that injected transgenes are predominantly processed by homologous recombination in mouse zygote

    Smirnov, A., Fishman, V., Yunusova, A., Korablev, A., Serova, I., Skryabin, B. V., Rozhdestvensky, T. S. & Battulin, N., 24 янв. 2020, в: Nucleic Acids Research. 48, 2, стр. 719-735 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. Quantitative prediction of enhancer-promoter interactions

    Belokopytova, P. S., Nuriddinov, M. A., Mozheiko, E. A., Fishman, D. & Fishman, V., 1 янв. 2020, в: Genome Research. 30, 1, стр. 72-84 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  44. 2019
  45. C-InterSecture-a computational tool for interspecies comparison of genome architecture

    Nuriddinov, M. & Fishman, V., 1 дек. 2019, в: Bioinformatics (Oxford, England). 35, 23, стр. 4912-4921 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  46. Time origin and structural analysis of the induced CRISPR/cas9 megabase-sized deletions and duplications involving the Cntn6 gene in mice

    Pristyazhnyuk, I. E., Minina, J., Korablev, A., Serova, I., Fishman, V., Gridina, M., Rozhdestvensky, T. S., Gubar, L., Skryabin, B. V. & Serov, O. L., 2 окт. 2019, в: Scientific Reports. 9, 1, 1 стр., 14161.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  47. Detection of Point Mutations and Chromosomal Translocations Based on Massive Parallel Sequencing of Enriched 3C Libraries

    Mozheiko, E. A. & Fishman, V. S., 1 окт. 2019, в: Russian Journal of Genetics. 55, 10, стр. 1273-1281 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  48. Targeted genomic integration of EGFP under tubulin beta 3 class III promoter and mEos2 under tryptophan hydroxylase 2 promoter does not produce sufficient levels of reporter gene expression

    Menzorov, A. G., Orishchenko, K. E., Fishman, V. S., Shevtsova, A. A., Mungalov, R. V., Pristyazhnyuk, I. E., Kizilova, E. A., Matveeva, N. M., Alenina, N., Bader, M., Rubtsov, N. B. & Serov, O. L., окт. 2019, в: Journal of Cellular Biochemistry. 120, 10, стр. 17208-17218 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. 3D organization of chicken genome demonstrates evolutionary conservation of topologically associated domains and highlights unique architecture of erythrocytes' chromatin

    Fishman, V., Battulin, N., Nuriddinov, M., Maslova, A., Zlotina, A., Strunov, A., Chervyakova, D., Korablev, A., Serov, O. & Krasikova, A., 25 янв. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 2, стр. 648-665 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. 2018
  51. A mosaic intragenic microduplication of LAMA1 and a constitutional 18p11.32 microduplication in a patient with keratosis pilaris and intellectual disability

    Kashevarova, A. A., Nazarenko, L. P., Skryabin, N. A., Nikitina, T. V., Vasilyev, S. A., Tolmacheva, E. N., Lopatkina, M. E., Salyukova, O. A., Chechetkina, N. N., Vorotelyak, E. A., Kalabusheva, E. P., Fishman, V. S., Kzhyshkowska, J., Graziano, C., Magini, P., Romeo, G. & Lebedev, I. N., 1 нояб. 2018, в: American Journal of Medical Genetics, Part A. 176, 11, стр. 2395-2403 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  52. Allele-Specific Biased Expression of the CNTN6 Gene in iPS Cell-Derived Neurons from a Patient with Intellectual Disability and 3p26.3 Microduplication Involving the CNTN6 Gene

    Gridina, M. M., Matveeva, N. M., Fishman, V. S., Menzorov, A. G., Kizilova, H. A., Beregovoy, N. A., Kovrigin, I. I., Pristyazhnyuk, I. E., Oscorbin, I. P., Filipenko, M. L., Kashevarova, A. A., Skryabin, N. A., Nikitina, T. V., Sazhenova, E. A., Nazarenko, L. P., Lebedev, I. N. & Serov, O. L., 1 авг. 2018, в: Molecular Neurobiology. 55, 8, стр. 6533-6546 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  53. Interpreting Chromosomal Rearrangements in the Context of 3-Dimentional Genome Organization: A Practical Guide for Medical Genetics

    Fishman, V. S., Salnikov, P. A. & Battulin, N. R., 1 апр. 2018, в: Biochemistry (Moscow). 83, 4, стр. 393-401 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  54. Analysis of differential expression of matrix metalloproteases in stable and unstable atherosclerotic lesions by a method of full genome sequencing of RNA: Pilot study

    Ivanoschuk, D. E., Ragino, Y. I., Shakhtshneider, E. V., Mikhailova, S. V., Fishman, V. S., Polonskaya, Y. V., Kashtanova, E. V., Chernyavsky, A. M., Murashov, I. S. & Voevoda, M. I., 1 янв. 2018, в: Russian Journal of Cardiology. 23, 8, стр. 52-58 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  55. 2017
  56. Alternative dominance of the parental genomes in hybrid cells generated through the fusion of mouse embryonic stem cells with fibroblasts

    Matveeva, N. M., Fishman, V. S., Zakharova, I. S., Shevchenko, A. I., Pristyazhnyuk, I. E., Menzorov, A. G. & Serov, O. L., 22 дек. 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 18094 14 стр., 18094.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  57. Deterministic versus stochastic model of reprogramming: New evidence from cellular barcoding technique

    Yunusova, A. M., Fishman, V. S., Vasiliev, G. V. & Battulin, N. R., апр. 2017, в: Open Biology. 7, 4, 13 стр., 160311.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

ID: 3445187