1. 2026
  2. Unique structural mode for opposite-base tolerance in endonuclease VIII

    Bulgakov, N. A., Endutkin, A. V., MacCarthy, C., Shevtsov, M. B., Kapranov, I. A., Yudkina, A. V., Borshchevskiy, V. I. & Zharkov, D. O., нояб. 2026, в: DNA Repair. 167, 11 стр., 103962.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  3. 2025
  4. Platinum Polyoxoniobate: Stability, Cytotoxicity, and Cellular Uptake

    Yudkina, A. V., Vokhtantsev, I. P., Rychkov, D. A., Volchek, V. V., Abramov, P. A., Sokolov, M. N. & Zharkov, D. O., 6 апр. 2025, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 51, 2, стр. 693-701 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. The hidden elephant: Modified abasic sites and their consequences

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., апр. 2025, в: DNA Repair. 148, стр. 103823 03823.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  6. Polyamine Adducts with AP Sites: Interaction with DNA Polymerases and AP Endonucleases

    Yudkina, A. V., Amanova, M. M. & Zharkov, D. O., 20 янв. 2025, в: Chemical Research in Toxicology. 38, 1, стр. 102-114 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. Bypass of Methoxyamine-Adducted Abasic Sites by Eukaryotic Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Novikova, A. A., Stolyarenko, A. D., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 14 янв. 2025, в: International Journal of Molecular Sciences. 26, 2, 642.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. Выделение и характеристика обратной транскриптазы интрона группы II Roseburia intestinalis

    Чернышева, Д. А., Жарков, Д. О. & Юдкина, А. В., 2025.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы

  9. Изучение структурных и динамических особенностей ДНК с CU-парой как модели для исследования AП-сайтов

    Кунина, Е. И., Шернюков, А. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2025.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы

  10. Полиоксониобат платины: стабильность, цитотоксичность и поглощение клетками © 2025

    Юдкина, А. В., Вохтанцев, И. П., Рычков, Д. А., Волчек, В. В., Абрамов, П. А., Соколов, М. Н. & Жарков, Д. О., 2025, в: Биоорганическая химия. 51, 2, стр. 362-372

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  11. Сравнительная характеристика мутагенеза, вызванного 8-оксогуанином, in vitro и in vivo

    Чуприкова, М. С., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2025.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы

  12. 2024
  13. Error-Prone DNA Synthesis on Click-Ligated Templates

    Endutkin, A. V., Yakovlev, A. O., Zharkov, T. D., Golyshev, V. M., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., окт. 2024, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 518, 1, стр. 376-381 6 стр., 11.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. Repair and DNA Polymerase Bypass of Clickable Pyrimidine Nucleotides

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Barmatov, A. E., Petrova, D. V., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., 12 июн. 2024, в: Biomolecules. 14, 6, 681.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  15. Probing the Conformational Restraints of DNA Damage Recognition with β-L-Nucleotides

    Yudkina, A. V., Kim, D. V., Zharkov, T. D., Zharkov, D. O. & Endutkin, A. V., 30 мая 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 11, 6006.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  16. A non-canonical nucleotide from viral genomes interferes with the oxidative DNA damage repair system

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., янв. 2024, в: DNA Repair. 133, 8 стр., 103605.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. Back-Up Base Excision DNA Repair in Human Cells Deficient in the Major AP Endonuclease, APE1

    Kim, D. V., Diatlova, E. A., Zharkov, T. D., Melentyev, V. S., Yudkina, A. V., Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., янв. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 64.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  18. Analysis of critical amino acid residues in the active center of a novel DNA glycosylase Fpg-like protein 1 Streptomyces coelicolor superfamily “helix-2-turn-helix” DNA glycosylase

    Булгаков, Н. А., Юдкина, А. В., Жарков, Д. О. & Garcia-Diaz, M., 2024, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE / SYSTEMS BIOLOGY: Abstracts of the Fourteenth International Multiconference. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, стр. 1971-1972 2 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  19. Взаимодействие неприродных нуклеиновых кислот, применяемых в синтетической биологии, с системой эксцизионной репарации оснований ДНК

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Ким, Д. В., Яковлев, А. О., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 19 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  20. Основы белковой инженерии

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2024, Новосибирск: ИПЦ НГУ. 214 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборники › учебное-методическое пособие › Рецензирование

  21. Точность действия ДНК-полимераз на поврежденных и неповрежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Чуприкова, М. С., Яковлев, А. О., Затеева, М. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2024, ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКАЯ БИОЛОГИЯ: Материалы V всероссийской конференции, приуроченной к 40-летию ИХБФМ СО РАН. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 51 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  22. Точность действия ДНК-полимеразы RB69 на поврежденных ДНК-матрицах при синтезе с вытеснением цепи

    Яковлев, А. О., Жарков, Д. О. & Юдкина, А. В., 2024, СОВРЕМЕННЫЕ ВЫЗОВЫ СТРУКТУРНОЙ И СИНТЕТИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ: материалы всероссийской школы-конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 59

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › предисловие, научный комментарий, послесловие › научная

  23. 2023
  24. Abasic site-peptide cross-links are blocking lesions repaired by AP endonucleases

    Yudkina, A. V., Bulgakov, N. A., Kim, D. V., Baranova, S. V., Ishchenko, A. A., Saparbaev, M. K., Koval, V. V. & Zharkov, D. O., 7 июл. 2023, в: Nucleic Acids Research. 51, 12, стр. 6321-6336 16 стр., gkad423.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. Bypass of Abasic Site-Peptide Cross-Links by Human Repair and Translesion DNA Polymerases

    Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Bulgakov, N. A., Boldinova, E. O., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 29 июн. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 10877.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  26. Correlated Target Search by Vaccinia Virus Uracil-DNA Glycosylase, a DNA Repair Enzyme and a Processivity Factor of Viral Replication Machinery

    Diatlova, E. A., Mechetin, G. V., Yudkina, A. V., Zharkov, V. D., Torgasheva, N. A., Endutkin, A. V., Shulenina, O. V., Konevega, A. L., Gileva, I. P., Shchelkunov, S. N. & Zharkov, D. O., 23 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 11, 9113.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  27. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 312-319 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  28. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2'-дезоксиуридин-5'-трифосфатнуклеотидгидролазы Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., 1 мар. 2023, в: Molekuliarnaia biologiia. 57, 2, стр. 330-339 10 стр., 17.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  29. Механизм действия ДНК-полимераз на субстратах с модифицированными АП-сайтами

    Юдкина, А. В., Булгаков, Н. А., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ: Тезисы докладов 13-ой Международной научной конференции. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 161 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  30. Механизм прохождения модифицированных АП-сайтов ДНК-полимеразами

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2023, ОТ МИКРОБИОЛОГИИ К ГЕНЕТИЧЕСКИМ ТЕХНОЛОГИЯМ: Материалы всероссийской конференции. Новосибирск: ООО "Офсет ТМ", стр. 93 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная

  31. Основы белковой инженерии

    Юдкина, А. В., Петрова, Д. В., Торгашева, Н. А., Вохтанцев, И. П., Дятлова, Е. А., Ендуткин, А. В., Байков, И. К., Дворникова, А. П. & Жарков, Д. О., 2023, (Принято в печать) Новосибирск: Редакционно-издательский центр НГУ. 181 стр.

    Результаты исследований: Книги, отчёты, сборники › учебное-методическое пособие › Рецензирование

  32. Субстратная специфичность ферментов эксцизионной репарации оснований в отношении искусственных нуклеотидов, применяемых в синтетической биологии

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В., Барматов, А. Е. & Жарков, Д. О., 2023, БИОКАТАЛИЗ. ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ И ПРИМЕНЕНИЯ. Москва: ООО "АДМИРАЛ ПРИНТ", стр. 74 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  33. Факторы, влияющие на стабильность тримерной формы 2›ДЕЗОКСИУРИДИН-5›-ТРИФОСФАТНУКЛЕОТИДГИДРОЛАЗЫ ESCHERICHIA COLI

    Кириленко, А. А., Коваленко, Е. А., Юдкина, А. В., Ендуткин, А. В., Панфёрова, Е. П., Коханенко, А. А. & Жарков, Д. О., 2023, стр. 184-185. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  34. 2022
  35. Recognition of a Clickable Abasic Site Analog by DNA Polymerases and DNA Repair Enzymes

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Zharkov, T. D., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  36. Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

    Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 июл. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  37. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 февр. 2022, в: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, стр. 303-314 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  38. Stalling of Eukaryotic Translesion DNA Polymerases at DNA-Protein Cross-Links

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., февр. 2022, в: Genes. 13, 2, 166.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  39. Bioorthogonality in the light of cell defense mechanisms: Interaction of non-natural nucleic acids with the base excision DNA repair system

    Ендуткин, А. В., Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 982. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  40. Interaction of DNA replication and DNA repair systems with AP sites adducts with proteins, peptides and low-molecular-weight compounds

    Юдкина, А. В., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Дворникова, А. П., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 1026. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  41. 2021
  42. Translesion activity of PrimPol on DNA with cisplatin and DNA–protein cross-links

    Boldinova, E. O., Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Gagarinskaya, D. I., Baranovskiy, A. G., Tahirov, T. H., Zharkov, D. O. & Makarova, A. V., дек. 2021, в: Scientific Reports. 11, 1, 17588.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. A New Class of Uracil-DNA Glycosylase Inhibitors Active against Human and Vaccinia Virus Enzyme

    Grin, I. R., Mechetin, G., Kasymov, R. D., Diatlova, E. A., Yudkina, A., Shchelkunov, S. N., Gileva, I. P., Denisova, A. A., Stepanov, G. A., Chilov, G. G. & Zharkov, D. O., 1 нояб. 2021, в: Molecules. 26, 21, 15 стр., 6668.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  44. Кодирующие свойства метоксиамина — ингибитора репарации ДНК с противоопухолевой активностью

    Юдкина, А. В. & Жарков, Д. О., окт. 2021, стр. 401. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  45. Структура новой атипичной ДНК-гликозилазы суперсемейства H2TH из Bacteroides thetaiotaomicron

    Юдкина, А. В., Гарсиа-Диаз, М. & Жарков, Д. О., сент. 2021, стр. 286-287. 2 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференций › тезисы › Рецензирование

  46. Miscoding properties of abasic site adducts with methoxyamine, an antitumor base excision repair inhibitor

    Yudkina, A., Shilkin, E., Boldinova, E., Makarova, A. & Zharkov, D., июл. 2021, в: FEBS Open Bio. 11, стр. 87-87 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

  47. Изучение свойств рекомбинантной эндонуклеазы IV Mycobacterium tuberculosis

    Dymova, M. A., Endutkin, A. V., Polunovsky, V. V., Zakabunin, A. I., Khrapov, E. A., Torgasheva, N. A., Yudkina, A. V., Mechetin, G. V., Filipenko, M. L. & Zharkov, D. O., 20 апр. 2021, в: Molekuliarnaia biologiia. 55, 2, стр. 258-268 11 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  48. Characterization of Recombinant Endonuclease IV from Mycobacterium tuberculosis

    Dymova, M. A., Endutkin, A. V., Polunovsky, V. V., Zakabunin, A. I., Khrapov, E. A., Torgasheva, N. A., Yudkina, A. V., Mechetin, G. V., Filipenko, M. L. & Zharkov, D. O., мар. 2021, в: Molecular Biology. 55, 2, стр. 225-233 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. Molecular dynamics approach to identification of new OGG1 cancer-associated somatic variants with impaired activity

    Popov, A. V., Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D., Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Makasheva, K. A., Raspopova, D. Y., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., 1 янв. 2021, в: Journal of Biological Chemistry. 296, 100229.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. Boron-containing nucleosides as tools for boron-neutron capture therapy

    Zharkov, D. O., Yudkina, A., Riesebeck, T., Loshchenova, P. S., Mostovich, E. A. & Dianov, G. L., 2021, в: American journal of cancer research. 11, 10, стр. 4668-4682 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  51. 2020
  52. Displacement of Slow-Turnover DNA Glycosylases by Molecular Traffic on DNA

    Yudkina, A. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A., Moor, N. A., Vokhtantsev, I. P., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., авг. 2020, в: Genes. 11, 8, стр. 1-21 21 стр., 866.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  53. Protein Engineering of DNA-Dependent Enzymes

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 8 мая 2020, Mechanisms of Genome Protection and Repair. Zharkov, D. O. (ред.). Springer, Том 1241. стр. 19-33 15 стр. (Advances in experimental medicine and biology).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › глава/раздел › научная › Рецензирование

  54. Catalytically Competent Conformation of the Active Site of Human 8-Oxoguanine-DNA Glycosylase

    Popov, A. V., Yudkina, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 17 февр. 2020, в: Biochemistry (Moscow). 85, 2, стр. 192-204 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  55. Platinum polyoxoniobates have a potential as an anticancer agent

    Юдкина, А. В., Вохтанцев, И. П., Соколов, М. Н., Абрамов, П. А., Абрамов, П. А., Грин, И. Р. & Жарков, Д. О., 2020, BIOINFORMATICS OF GENOME REGULATION AND STRUCTURE/SYSTEMS BIOLOGY (BGRS/SB-2020): The Twelfth International Multiconference Abstracts. Новосибирск: Институт цитологии и генетики СО РАН, стр. 604 1 стр.

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  56. 2019
  57. Transient protein–protein complexes in base excision repair

    Endutkin, A. V., Yudkina, A. V., Sidorenko, V. S. & Zharkov, D. O., 22 нояб. 2019, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 37, 17, стр. 4407-4418 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  58. Platinum Polyoxoniobates Form Adducts with DNA

    Yudkina, A. V., Sokolov, M. N., Abramov, P. A., Grin, I. R. & Zharkov, D. O., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 641-646 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  59. Structural and biochemical insights of new atypical Fpg/Nei DNA-glycosylases

    Yudkina, A., Garcia-Diaz, M. & Zharkov, D., июл. 2019, в: FEBS Open Bio. 9, стр. 252-252 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

  60. Reading and misreading 8-oxoguanine, a paradigmatic ambiguous nucleobase

    Yudkina, A. V., Shilkin, E. S., Endutkin, A. V., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 1 мая 2019, в: Crystals. 9, 5, 31 стр., 269.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  61. 2018
  62. Variable termination sites of DNA polymerases encountering a DNA–protein cross-link

    Yudkina, A. V., Dvornikova, A. P. & Zharkov, D. O., 1 июн. 2018, в: PLoS ONE. 13, 6, стр. e0198480 17 стр., 0198480.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  63. 2017
  64. Dihydroartemisinin counteracts fibrotic portal hypertension via farnesoid X receptor-dependent inhibition of hepatic stellate cell contraction

    Endutkin, A., Popov, A., Yudkina, A., Makasheva, K., Afonnikov, D., Simmerling, C. & Zharkov, D., 1 янв. 2017, в: FEBS Journal. 284, 1, стр. 114-133 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

ID: 3556512