A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

DyCeModel: a tool for 1D simulation for distribution of plant hormones controlling tissue patterning

Azarova, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mironova, V. V., Zemlyanskaya, E. V. & Lavrekha, V. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 890-897 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fold-change-specific enrichment analysis (FSEA): Quantification of transcriptional response magnitude for functional gene groups

Wiebe, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mukhin, A. M., Grosse, I., Lashin, S. A., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V. V., 17 апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 14 стр., 434.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Hormone-regulated expansins: expression, localization, and cell wall biomechanics in Arabidopsis root growth

Samalova, M., Melnikava, A., Elsayad, K., Peaucelle, A., Gahurova, E., Gumulec, J., Spyroglou, I., Zemlyanskaya, E. V., Ubogoeva, E. V., Balkova, D., Demko, M., Blavet, N., Alexiou, P., Benes, V., Mouille, G. & Hejatko, J., янв. 2024, в: Plant Physiology. 194, 1, стр. 209-228 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

InterTransViewer: a comparative description of differential gene expression profiles from different experiments

Tyapkin, А. V., Lavrekha, V. V., Ubogoeva, E. V., Oshchepkov, D. Y., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 8, стр. 1042-1052 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Mechanisms regulating ethylene signal transduction in plants

Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ermakov, A. A. & Mironova, V. V., 1 мая 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 3, стр. 335-344 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Systems biology analysis of the WOX5 gene and its functions in the root stem cell niche

Oshchepkova, E. A., Omelyanchuk, N. A., Savina, M. S., Pasternak, T., Kolchanov, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., 1 июн. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 4, стр. 404-420 17 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование