1. 2025
  2. MiceDEGdb: a knowledge base on differentially expressed mouse genes as a model object in biomedical research

    Podkolodnaya, O. A., Chadaeva, I. V., Filonov, S. V., Podkolodnyy, N. L., Rasskazov, D. A., Tverdokhleb, N. N., Zolotareva, K. A., Bogomolov, A. G., Kondratyuk, E. Y., Oshchepkov, D. Y. & Ponomarenko, M. P., 2025, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 29, 1, стр. 153-161 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. 2024
  4. Candidate SNP Markers Significantly Altering the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Promoters of Human Genes Associated with Primary Open-Angle Glaucoma

    Zolotareva, K., Dotsenko, P. A., Podkolodnyy, N., Ivanov, R., Makarova, A. L., Chadaeva, I., Bogomolov, A., Demenkov, P. S., Ivanisenko, V., Oshchepkov, D. & Ponomarenko, M., дек. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 23, 12802.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Genomic background sequences systematically outperform synthetic ones in de novo motif discovery for ChIP-seq data

    Raditsa, V. V., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G. & Levitsky, V. G., 1 сент. 2024, в: NAR Genomics and Bioinformatics. 6, 3, 15 стр., qae090.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. A Principal Components Analysis and Functional Annotation of Differentially Expressed Genes in Brain Regions of Gray Rats Selected for Tame or Aggressive Behavior

    Chadaeva, I., Kozhemyakina, R., Shikhevich, S., Bogomolov, A., Kondratyuk, E., Ощепков, Д. Ю., Orlov, Y. L. & Markel, A. L., мая 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 9, 16 стр., 4613.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. AtSNP_TATAdb: Candidate Molecular Markers of Plant Advantages Related to Single Nucleotide Polymorphisms within Proximal Promoters of Arabidopsis thaliana L.

    Bogomolov, A., Zolotareva, K., Filonov, S., Chadaeva, I., Rasskazov, D., Sharypova, E., Podkolodnyy, N., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Tverdokhleb, N., Khandaev, B., Kondratyuk, E., Podkolodnaya, O., Zemlyanskaya, E., Kolchanov, N. A. & Ponomarenko, M., янв. 2024, в: International Journal of Molecular Sciences. 25, 1, 607.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. PlantReg: the reconstruction of links between transcription factor regulatory networks and biological processes under their control

    Lavrekha, V. V., Omelyanchuk, N. A., Bogomolov, A. G. & Zemlyanskaya, E. V., 2024, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 28, 8, стр. 950-959 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. 2023
  10. Human_SNP_TATAdb: a database of SNPs that statistically significantly change the affinity of the TATA-binding protein to human gene promoters: genome-wide analysis and use cases

    Filonov, S. V., Podkolodnyy, N. L., Podkolodnaya, O. A., Tverdokhleb, N. N., Ponomarenko, P. M., Rasskazov, D. A., Bogomolov, A. G. & Ponomarenko, M. P., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 728-736 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. RatDEGdb: a knowledge base of differentially expressed genes in the rat as a model object in biomedical research

    Chadaeva, I. V., Filonov, S. V., Zolotareva, K. A., Khandaev, B. M., Ershov, N. I., Podkolodnyy, N. L., Kozhemyakina, R. V., Rasskazov, D. A., Bogomolov, A. G., Kondratyuk, E. Y., Klimova, N. V., Shikhevich, S. G., Ryazanova, M. A., Fedoseeva, L. A., Redina, О. Е., Kozhevnikova, O. S., Stefanova, N. A., Kolosova, N. G., Markel, A. L., Ponomarenko, M. P., еще 1Oshchepkov, D. Y., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 794-806 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. Candidate SNP Markers Significantly Altering the Affinity of TATA-Binding Protein for the Promoters of Human Hub Genes for Atherogenesis, Atherosclerosis and Atheroprotection

    Bogomolov, A., Filonov, S., Chadaeva, I., Rasskazov, D., Khandaev, B., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Podkolodnyy, N., Kondratyuk, E., Ponomarenko, P., Podkolodnaya, O., Mustafin, Z., Savinkova, L., Kolchanov, N., Tverdokhleb, N. & Ponomarenko, M., 19 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 10, 9010.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. Differentially Expressed Genes and Molecular Susceptibility to Human Age-Related Diseases

    Shikhevich, S., Chadaeva, I., Khandaev, B., Kozhemyakina, R., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Bogomolov, A., Klimova, N. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Mustafin, Z., Markel, A., Savinkova, L., Kolchanov, N. A., Kozlov, V. & Ponomarenko, M., 16 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 3996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. 2022
  15. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. 2021
  17. A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes

    Ignatieva, E. V., Osadchuk, A. V., Kleshchev, M. A., Bogomolov, A. G. & Osadchuk, L. V., 5 июл. 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, 662770.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. A bioinformatics model of human diseases on the basis of differentially expressed genes (Of domestic versus wild animals) that are orthologs of human genes associated with reproductive‐potential changes

    Vasiliev, G., Chadaeva, I., Rasskazov, D., Ponomarenko, P., Sharypova, E., Drachkova, I., Bogomolov, A., Savinkova, L., Ponomarenko, M., Kolchanov, N., Osadchuk, A., Oshchepkov, D. & Osadchuk, L., 1 мар. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 5, стр. 1-17 17 стр., 2346.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. 2020
  20. Reproductive potential of the male (RPM): the computer database of phenotypic and molecular genetic data for Russian men with impaired and normal fertility

    Bogomolov, A., Osadchuk, A. & Osadchuk, L., дек. 2020, в: Journal of integrative bioinformatics. 17, 4, 9 стр., 20200032.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Disruptive natural selection by male reproductive potential prevents underexpression of protein-coding genes on the human Y chromosome as a self-domestication syndrome

    Ponomarenko, M., Kleshchev, M., Ponomarenko, P., Chadaeva, I., Sharypova, E., Rasskazov, D., Kolmykov, S., Drachkova, I., Vasiliev, G., Gutorova, N., Ignatieva, E., Savinkova, L., Bogomolov, A., Osadchuk, L., Osadchuk, A. & Oshchepkov, D., 1 окт. 2020, в: BMC Genetics. 21, Suppl 1, 17 стр., 89.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. Computer methods for visualization chromosome-specific DNA sequences in FISH images

    Bogomolov, A., Karamysheva, T. & Rubtsov, N., июл. 2020, Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 76-79 4 стр. 9214751. (Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  23. 2018
  24. CpG islands’ clustering uncovers early development genes in the human genome

    Babenko, V. N., Bogomolov, A. G., Babenko, R. O., Galieva, E. R. & Orlov, Y. L., июн. 2018, в: Computer Science and Information Systems. 15, 2, стр. 473-485 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. 2017
  26. Origin and evolution of the neo-sex chromosomes in pamphagidae grasshoppers through chromosome fusion and following heteromorphization

    Yerkinovich, I., Bugrov, A. G., Buleu, O. G., Bogomolov, A. G. & Rubtsov, N. B., 13 нояб. 2017, в: Genes. 8, 11, 20 стр., 323.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. Spatial organization of fibroblast and spermatocyte nuclei with different B-chromosome content in Korean field mouse, Apodemus peninsulae (Rodentia, Muridae)

    Karamysheva, T. V., Torgasheva, A. A., Yefremov, Y. R., Bogomolov, A. G., Liehr, T., Borodin, P. M., Rubtsov, N. B. & Puertas, M., окт. 2017, в: Genome. 60, 10, стр. 815-824 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Компьютерные методы анализа хромосомных контактов в ядре клетки по данным технологий секвенирования

    Orlov, Y. L., Thierry, O., Bogomolov, A. G., Tsukanov, A. V., Kulakova, E. V., Galieva, E. R., Bragin, A. O. & Li, G., окт. 2017, в: Biomeditsinskaya Khimiya. 63, 5, стр. 418-422 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Development of software and modification of Q-FISH protocol for estimation of individual telomere length in immunopathology

    Barkovskaya, M. S., Bogomolov, A. G., Knauer, N. Y., Rubtsov, N. B. & Kozlov, V. A., 1 апр. 2017, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 15, 2, 18 стр., 1650041.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3450442