1. 2023
  2. Application of the weighted histogram method for calculating the thermodynamic parameters of the formation of oligodeoxyribonucleotide duplexes

    Yushin, I. I., Golyshev, V. M., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., дек. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 7, стр. 807-814 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. 2022
  4. Structure- and Content-Dependent Efficiency of Cas9-Assisted DNA Cleavage in Genome-Editing Systems

    Baranova, S. V., Zhdanova, P. V., Lomzov, A. A., Koval, V. V. & Chernonosov, A. A., нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 22, 13889.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Thermodynamic Swings: How Ideal Complex of Cas9-RNA/DNA Forms

    Zhdanova, P. V., Lomzov, A. A., Prokhorova, D. V., Stepanov, G. A., Chernonosov, A. A. & Koval, V. V., 10 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8891.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. 2021
  7. Structure and hybridization properties of phosphoryl guanidine oligonucleotides under crowding conditions

    Kanarskaya, M. A., Golyshev, V. M., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., 5 нояб. 2021, в: Biochemical and Biophysical Research Communications. 577, стр. 110-115 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. Calculation of Energy for RNA/RNA and DNA/RNA Duplex Formation by Molecular Dynamics Simulation

    Golyshev, V. M., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., нояб. 2021, в: Molecular Biology. 55, 6, стр. 927-940 14 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. A structural mechanism of DNA polymerase lambda action that promotes error-free bypass of bulky modifications in DNA

    Zhdanova, P., Lomzov, A., Rechkunova, N. & Koval, V., июл. 2021, в: FEBS Open Bio. 11, стр. 180-181 2 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  10. Triazinylamidophosphate Oligonucleotides: Synthesis and Study of Their Interaction with Cells and DNA-Binding Proteins

    Kupryushkin, M. S., Zharkov, T. D., Ilina, E. S., Markov, O. V., Kochetkova, A. S., Akhmetova, M. M., Lomzov, A. A., Pyshnyi, D. V., Lavrik, O. I. & Khodyreva, S. N., мая 2021, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 47, 3, стр. 719-733 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Effects of Phosphoryl Guanidine Modification of Phosphate Residues on the Structure and Hybridization of Oligodeoxyribonucleotides

    Golyshev, V. M., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., 25 мар. 2021, в: The journal of physical chemistry. B. 125, 11, стр. 2841-2855 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. 2020
  13. A QCM-based rupture event scanning technique as a simple and reliable approach to study the kinetics of DNA duplex dissociation

    Kurus, N. N., Dultsev, F. N., Golyshev, V. M., Nekrasov, D. V., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., 14 авг. 2020, в: Analytical Methods. 12, 30, стр. 3771-3777 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. 2019
  15. Structure an Hybriization Properties of Glycine Morpholine Oligomers in Complexes with DNA an RNA: Experimental and Molecular Dynamics Studies

    Golyshev, V. M., Abramova, T. V., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., 19 дек. 2019, в: Journal of Physical Chemistry B. 123, 50, стр. 10571-10581 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. The structural and immunological properties of chimeric proteins containing HIV-1 MPER sites

    Rudometov, A. P., Rudometova, N. B., Shcherbakov, D. N., Lomzov, A. A., Kaplina, O. N., Shcherbakova, N. S., Ilyichev, A. A., Bakulina, A. Y. & Karpenko, L. I., 14 нояб. 2019, в: Acta Naturae. 11, 3, стр. 56-65 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Features of Determining Thermodynamic Parameters of Formation of Nucleic Acid Complexes Using Thermal Denaturation with Fluorimetric Signal Detection

    Shevelev, G. Y., Kabilov, M. R., Lomzov, A. A., Dovydenko, I. S. & Pyshnyi, D. V., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 684-698 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Novel Bisimidazole-Containing Peptidomimetic Molecules for Мetal-Independent RNA Cleavage: Synthesis and Solid-Phase Screening Method

    Pavlova, A. S., Ogurtsova, P. A., Koroleva, L. S., Serpokrylova, I. Y., Lomzov, A. A., Pyshnaya, I. A., Silnikov, V. N. & Pyshnyi, D. V., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 813-824 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. Physicochemical Properties of the Phosphoryl Guanidine Oligodeoxyribonucleotide Analogs

    Dyudeeva, E. S., Kupryushkin, M. S., Lomzov, A. A., Pyshnaya, I. A. & Pyshnyi, D. V., 1 нояб. 2019, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 45, 6, стр. 709-718 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. DNA complexes with human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1: structural insights revealed by pulsed dipolar EPR with orthogonal spin labeling

    Krumkacheva, O. A., Shevelev, G. Y., Lomzov, A. A., Dyrkheeva, N. S., Kuzhelev, A. A., Koval, V. V., Tormyshev, V. M., Polienko, Y. F., Fedin, M. V., Pyshnyi, D. V., Lavrik, O. I. & Bagryanskaya, E. G., 5 сент. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 15, стр. 7767-7780 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Data for isolation and properties analysis of diastereomers of a mono-substituted phosphoryl guanidine trideoxyribonucleotide

    Lomzov, A. A., Kupryushkin, M. S., Shernyukov, A. V., Nekrasov, M. D., Dovydenko, I. S., Stetsenko, D. A. & Pyshnyi, D. V., 1 авг. 2019, в: Data in Brief. 25, стр. 104148 25 стр., 104148.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. DNA Binding to Gold Nanoparticles through the Prism of Molecular Selection: Sequence-Affinity Relation

    Vorobjev, P., Epanchintseva, A., Lomzov, A., Tupikin, A., Kabilov, M., Pyshnaya, I. & Pyshnyi, D., 18 июн. 2019, в: Langmuir. 35, 24, стр. 7916-7928 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Diastereomers of a mono-substituted phosphoryl guanidine trideoxyribonucleotide: Isolation and properties

    Lomzov, A. A., Kupryushkin, M. S., Shernyukov, A. V., Nekrasov, M. D., Dovydenko, I. S., Stetsenko, D. A. & Pyshnyi, D. V., 11 июн. 2019, в: Biochemical and Biophysical Research Communications. 513, 4, стр. 807-811 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Comparative physico chemical and biological studies of phosphorylguanidine oligonucleotide diasteriomers

    Lomzov, A. A., Apukhtina, V. S., Shernyukov, A. V., Kupryushkin, M. S., Shevelev, G. Y. & Pyshnyi, D. V., 10 мая 2019, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 37, стр. 76-76 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  25. Structure and hybridization properties of phosphorylguanidine oligonucleotides

    Lomzov, A. A., Golyshev, V. M., Dyudeeva, E. S., Kupryushkin, M. S. & Pyshnyi, D. V., 10 мая 2019, в: Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 37, стр. 83-84 2 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  26. Molecular Dynamics Simulation of Polarizable Gold Nanoparticles Interacting with Sodium Citrate

    Perfilieva, O. A., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., 12 февр. 2019, в: Journal of Chemical Theory and Computation. 15, 2, стр. 1278-1292 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. 2018
  28. Oxidative damage to epigenetically methylated sites affects DNA stability, dynamics and enzymatic demethylation

    Gruber, D. R., Toner, J. J., Miears, H. L., Shernyukov, A. V., Kiryutin, A. S., Lomzov, A. A., Endutkin, A. V., Grin, I. R., Petrova, D. V., Kupryushkin, M. S., Yurkovskaya, A. V., Johnson, E. C., Okon, M., Bagryanskaya, E. G., Zharkov, D. O. & Smirnov, S. L., 16 нояб. 2018, в: Nucleic Acids Research. 46, 20, стр. 10827-10839 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Nucleotide modifications decrease innate immune response induced by synthetic analogs of snRNAs and snoRNAs

    Stepanov, G., Zhuravlev, E., Shender, V., Nushtaeva, A., Balakhonova, E., Mozhaeva, E., Kasakin, M., Koval, V., Lomzov, A., Pavlyukov, M., Malyants, I., Zhorov, M., Kabilova, T., Chernolovskaya, E., Govorun, V., Kuligina, E., Semenov, D. & Richter, V., 2 нояб. 2018, в: Genes. 9, 11, 18 стр., 531.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Modified Oligonucleotides for Guiding RNA Cleavage Using Bacterial RNase P

    Novopashina, D. S., Nazarov, A. S., Vorobjeva, M. A., Kuprushkin, M. S., Davydova, A. S., Lomzov, A. A., Pyshnyi, D. V., Altman, S. & Venyaminova, A. G., 1 нояб. 2018, в: Molecular Biology. 52, 6, стр. 905-912 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Modified Oligonucleotides for Guiding RNA Cleavage Using Bacterial RNase P

    Novopashina, D. S., Nazarov, A. S., Vorobjeva, M. A., Kuprushkin, M. S., Davydova, A. S., Lomzov, A. A., Pyshnyi, D. V., Altman, S. & Venyaminova, A. G., 1 нояб. 2018, в: Molekuliarnaia biologiia. 52, 6, стр. 1045-1054 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Data on PAGE analysis and MD simulation for the interaction of endonuclease Apn1 from Saccharomyces cerevisiae with DNA substrates containing 5,6-dihydrouracyl and 2-aminopurine

    Dyakonova, E. S., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Ishchenko, A. A. & Fedorova, O. S., 1 окт. 2018, в: Data in Brief. 20, стр. 1515-1524 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. Apurinic/apyrimidinic endonuclease Apn1 from Saccharomyces cerevisiae is recruited to the nucleotide incision repair pathway: Kinetic and structural features

    Dyakonova, E. S., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Ishchenko, A. A. & Fedorova, O. S., 1 сент. 2018, в: Biochimie. 152, стр. 53-62 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. Effect of the relief on the measurement of bond rupture force with the help of AFM: The dynamics of interaction and optimization of the procedure

    Kurus, N. N., Dultsev, F. N., Shevelev, G., Lomzov, A. A. & Pyshnyi, D. V., 28 июл. 2018, в: Analytical Methods. 10, 28, стр. 3498-3505 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. A new approach to precise thermodynamic characterization of hybridization properties of modified oligonucleotides: Comparative studies of deoxyribo- and glycine morpholine pentaadenines

    Golyshev, V. M., Abramova, T. V., Pyshnyi, D. V. & Lomzov, A. A., 1 мар. 2018, в: Biophysical Chemistry. 234, стр. 24-33 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. A Versatile Approach to Attachment of Triarylmethyl Labels to DNA for Nanoscale Structural EPR Studies at Physiological Temperatures

    Shevelev, G. Y., Gulyak, E. L., Lomzov, A. A., Kuzhelev, A. A., Krumkacheva, O. A., Kupryushkin, M. S., Tormyshev, V. M., Fedin, M. V., Bagryanskaya, E. G. & Pyshnyi, D. V., 11 янв. 2018, в: Journal of Physical Chemistry B. 122, 1, стр. 137-143 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. Effect of laser UV radiation on the eye scleral tissue in patients with open-angle glaucoma

    Razhev, A. M., Iskakov, I. A., Churkin, D. S., Orishich, A. M., Maslov, N. A., Tsibul’skaya, E. O., Lomzov, A. A., Ermakova, O. V., Trunov, A. N. & Chernykh, V. V., 1 янв. 2018, в: Quantum Electronics. 48, 5, стр. 481-486 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Structural basis for the recognition and processing of DNA containing bulky lesions by the mammalian nucleotide excision repair system

    Evdokimov, A. N., Tsidulko, A. Y., Popov, A. V., Vorobiev, Y. N., Lomzov, A. A., Koroleva, L. S., Silnikov, V. N., Petruseva, I. O. & Lavrik, O. I., 1 янв. 2018, в: DNA Repair. 61, стр. 86-98 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. 2017
  40. Global DNA dynamics of 8-oxoguanine repair by human OGG1 revealed by stopped-flow kinetics and molecular dynamics simulation

    Lukina, M. V., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Zharkov, D. O. & Fedorova, O. S., 1 окт. 2017, в: Molecular BioSystems. 13, 10, стр. 1954-1966 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. Rational design and studies of excimer forming novel dual probes to target RNA

    Krasheninina, O. A., Lomzov, A. A., Fishman, V. S., Novopashina, D. S. & Venyaminova, A. G., 1 апр. 2017, в: Bioorganic and Medicinal Chemistry. 25, 7, стр. 2244-2250 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Processing of the abasic sites clustered with the benzo[a]pyrene adducts by the base excision repair enzymes

    Starostenko, L. V., Rechkunova, N. I., Lebedeva, N. A., Lomzov, A. A., Koval, V. V. & Lavrik, O. I., 1 февр. 2017, в: DNA Repair. 50, стр. 43-53 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. QCM-based rupture force measurement as a tool to study DNA dehybridization and duplex stability

    Dultsev, F. N., Kolosovsky, E. A., Lomzov, A. A. & Pyshnyi, D. V., февр. 2017, в: Analytical and Bioanalytical Chemistry. 409, 4, стр. 891-901 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  44. 2016
  45. Towards an understanding of crystallization from solution. DFT studies of multi-component serotonin crystals

    Rychkov, D. A., Hunter, S., Kovalskii, V. Y., Lomzov, A. A., Pulham, C. R. & Boldyreva, E. V., 15 июл. 2016, в: Computational and Theoretical Chemistry. 1088, стр. 52-61 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3433054