1. Dynamics of 8-Oxoguanine in DNA: Decisive Effects of Base Pairing and Nucleotide Context

    Ovcherenko, S. S., Shernyukov, A. V., Nasonov, D. M., Endutkin, A. V., Zharkov, D. O. & Bagryanskaya, E. G., 15 мар. 2023, в: Journal of the American Chemical Society. 145, 10, стр. 5613-5617 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  2. Effect of DNA Methylation on the 3′→5′ Exonuclease Activity of Major Human Abasic Site Endonuclease APEX1

    Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D. & Zharkov, D. O., янв. 2022, в: Biochemistry (Moscow). 87, 1, стр. 10-20 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. Effects of brain reninangiotensin system inhibition in ISIAH rats with inherited stress-induced arterial hypertension

    Klimov, L. O., Ryazanova, M. A., Fedoseeva, L. A. & Markel, A. L., 2017, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 21, 6, стр. 735-741 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Effects of single-nucleotide polymorphisms in human NEIL2 gene on functional role in DNA repair

    Kakhkharova, Z. I., Khantakova, D. V. & Grin, I. R., июл. 2019, в: FEBS Open Bio. 9, стр. 157-158 2 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  5. EGFP Reporters for Direct and Sensitive Detection of Mutagenic Bypass of DNA Lesions

    Rodriguez-Alvarez, M., Kim, D. & Khobta, A., 13 июн. 2020, в: Biomolecules. 10, 6, стр. 1-19 19 стр., 902.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Enzyme processivity as a drug target: The case of poxvirus uracil-DNA glycosylase

    Zharkov, D., сент. 2017, в: FEBS Journal. 284, стр. 11-11 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  7. Evolutionary Origins of DNA Repair Pathways: Role of Oxygen Catastrophe in the Emergence of DNA Glycosylases

    Prorok, P., Grin, I. R., Matkarimov, B. T., Ishchenko, A. A., Laval, J., Zharkov, D. O. & Saparbaev, M., июл. 2021, в: Cells. 10, 7, 1591.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  8. Factors Affecting the Stability of the Trimer of 2'-Deoxyuridine 5'-Triphosphate Nucleotide Hydrolase from Escherichia coli

    Yudkina, A. V., Kovalenko, E. A., Endutkin, A. V., Panferova, E. P., Kirilenko, A. A., Kokhanenko, A. A. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 312-319 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. Fast Recombination of Charge-Transfer State in Organic Photovoltaic Composite of P3HT and Semiconducting Carbon Nanotubes Is the Reason for Its Poor Photovoltaic Performance

    Uvarov, M. N., Kobeleva, E. S., Degtyarenko, K. M., Zinovyev, V. A., Popov, A. A., Mostovich, E. A. & Kulik, L. V., 17 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 4098.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Genome-wide analysis of WD40 protein family and functional characterization of BvWD40-82 in sugar beet

    Wu, Z., Zhang, T., Li, J., Chen, S., Grin, I. R., Zharkov, D. O., Yu, B. & Li, H., 2 июн. 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 1185440.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Global DNA dynamics of 8-oxoguanine repair by human OGG1 revealed by stopped-flow kinetics and molecular dynamics simulation

    Lukina, M. V., Koval, V. V., Lomzov, A. A., Zharkov, D. O. & Fedorova, O. S., 1 окт. 2017, в: Molecular BioSystems. 13, 10, стр. 1954-1966 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. GO System, a DNA Repair Pathway to Cope with Oxidative Damage

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., мар. 2021, в: Molecular Biology. 55, 2, стр. 193-210 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  13. GO-система: путь репарации ДНК для борьбы с окислительными повреждениями

    Endutkin, A. V. & Zharkov, D. O., 1 мар. 2021, в: Molekuliarnaia biologiia. 55, 2, стр. 223-242 20 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  14. Guide RNA modification as a way to improve CRISPR/Cas9-based genome-editing systems

    Filippova, J., Matveeva, A., Zhuravlev, E. & Stepanov, G., 1 дек. 2019, в: Biochimie. 167, стр. 49-60 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  15. Impact of delivery method on antiviral activity of phosphodiester, phosphorothioate, and phosphoryl guanidine oligonucleotides in MDCK cells infected with H5N1 bird flu virus

    Levina, A. S., Repkova, M. N., Chelobanov, B. P., Bessudnova, E. V., Mazurkova, N. A., Stetsenko, D. A. & Zarytova, V. F., 1 июл. 2017, в: Molecular Biology. 51, 4, стр. 633-638 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. Impact of Delivery Method on Antiviral Activity of Phosphodiester, Phosphorothioate, and Phosphoryl Guanidine Oligonucleotides in MDCK Cells Infected with H5N1 Bird Flu Virus

    Levina, A. S., Repkova, M. N., Chelobanov, B. P., Bessudnova, E. V., Mazurkova, N. A., Stetsenko, D. A. & Zarytova, V. F., 1 июл. 2017, в: Molekuliarnaia biologiia. 51, 4, стр. 717-723 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Improving Stability and Specificity of CRISPR/Cas9 System by Selective Modification of Guide RNAs with 2'-fluoro and Locked Nucleic Acid Nucleotides

    Sakovina, L., Vokhtantsev, I., Vorobyeva, M., Vorobyev, P. & Novopashina, D., 3 нояб. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 21, 13460.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. Influence of modified nucleotides on the activity of the CRISPR/Cas9 system in vitro

    Prokhorova, D., Zhuravlev, E., Tolstova, P. & Stepanov, G., июл. 2021, в: FEBS Open Bio. 11, стр. 285-285 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  19. Influence of pyridine-like ligands on the structure, photochemical and biological properties of nitro-nitrosyl ruthenium complexes

    Kostin, G. A., Mikhailov, A. A., Kuratieva, N. V., Pischur, D. P., Zharkov, D. O. & Grin, I. R., 7 авг. 2017, в: New Journal of Chemistry. 41, 15, стр. 7758-7765 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. Inhibitors of DNA glycosylases as prospective drugs

    Mechetin, G. V., Endutkin, A. V., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., 28 апр. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 9, 30 стр., 3118.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  21. Interaction of DNA replication and DNA repair systems with AP sites adducts with proteins, peptides and low-molecular-weight compounds

    Юдкина, А. В., Шилкин, Е. С., Болдинова, Е. О., Макарова, А. В., Дворникова, А. П., Булгаков, Н. А., Ким, Д. В. & Жарков, Д. О., 2022, стр. 1026. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  22. Isoforms of base excision repair enzymes produced by alternative splicing

    Boldinova, E. O., Khairullin, R. F., Makarova, A. V. & Zharkov, D. O., 3 июл. 2019, в: International Journal of Molecular Sciences. 20, 13, 22 стр., 3279.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  23. Mechanism of stimulation of DNA binding of the transcription factors by human apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE1

    Bazlekowa-Karaban, M., Prorok, P., Baconnais, S., Taipakova, S., Akishev, Z., Zembrzuska, D., Popov, A. V., Endutkin, A. V., Groisman, R., Ishchenko, A. A., Matkarimov, B. T., Bissenbaev, A., Le Cam, E., Zharkov, D. O., Tudek, B. & Saparbaev, M., 1 окт. 2019, в: DNA Repair. 82, стр. 102698 18 стр., 102698.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Mechanisms of Coronavirus Genome Stability As Potential Targets for Antiviral Drugs

    Yuyukina, S. K. & Zharkov, D. O., авг. 2022, в: Herald of the Russian Academy of Sciences. 92, 4, стр. 470-478 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. Mechanisms of Sugar Beet Response to Biotic and Abiotic Stresses

    Yu, B., Chen, M., Grin, I. & Ma, C., 8 мая 2020, Mechanisms of Genome Protection and Repair. Zharkov, D. O. (ред.). Springer, Cham, Том 1241. стр. 167-194 28 стр. (Advances in experimental medicine and biology).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийглава/разделнаучнаяРецензирование

  26. Mechanisms of the Specificity of the CRISPR/Cas9 System in Genome Editing

    Kulishova, L. M., Vokhtantsev, I. P., Kim, D. V. & Zharkov, D. O., апр. 2023, в: Molecular Biology. 57, 2, стр. 258-271 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. Mechanistic insight into the role of Poly(ADP-ribosyl)ation in DNA topology modulation and response to DNA damage

    Matkarimov, B. T., Zharkov, D. O. & Saparbaev, M. K., янв. 2020, в: Mutagenesis. 35, 1, стр. 107-118 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  28. Methods of the synthesis of silicon-containing nanoparticles intended for nucleic acid delivery

    Levina, A. S., Repkova, M. N., Ismagilov, Z. R. & Zarytova, V. F., 7 сент. 2018, в: Eurasian Chemico-Technological Journal. 20, 3, стр. 177-194 18 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Mild phenotype of knockouts of the major apurinic/apyrimidinic endonuclease APEX1 in a non-cancer human cell line

    Kim, D. V., Kulishova, L. M., Torgasheva, N. A., Melentyev, V. S., Dianov, G. L., Medvedev, S. P., Zakian, S. M. & Zharkov, D. O., сент. 2021, в: PLoS ONE. 16, 9 September, e0257473.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Mild phenotype of knockouts of the major apurinic/apyrimidinic endonuclease APEX1 in a noncancer human cell line

    Ким, Д. В., Кулишова, Л. М., Торгашева, Н. А. & Жарков, Д. О., авг. 2021, стр. 92. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  31. Miscoding and DNA Polymerase Stalling by Methoxyamine-Adducted Abasic Sites

    Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 21 февр. 2022, в: Chemical Research in Toxicology. 35, 2, стр. 303-314 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Miscoding properties of abasic site adducts with methoxyamine, an antitumor base excision repair inhibitor

    Yudkina, A., Shilkin, E., Boldinova, E., Makarova, A. & Zharkov, D., июл. 2021, в: FEBS Open Bio. 11, стр. 87-87 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  33. Molecular dynamic and kinetic characterization of Cas9 mutants for improving specificity of genome editing tools

    Вохтанцев, И. П. & Кадцын, Е. Д., 2020, стр. 55. 1 стр.

    Результаты исследований: Материалы конференцийтезисыРецензирование

  34. Molecular dynamics approach to identification of new OGG1 cancer-associated somatic variants with impaired activity

    Popov, A. V., Endutkin, A. V., Yatsenko, D. D., Yudkina, A. V., Barmatov, A. E., Makasheva, K. A., Raspopova, D. Y., Diatlova, E. A. & Zharkov, D. O., 1 янв. 2021, в: Journal of Biological Chemistry. 296, 100229.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Molecular dynamics simulation of the opposite-base preference and interactions in the active site of formamidopyrimidine-DNA glycosylase

    Popov, A. V., Endutkin, A. V., Vorobjev, Y. N. & Zharkov, D. O., 8 мая 2017, в: BMC Structural Biology. 17, 1, стр. 1-19 19 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. NANOCOMPOSITE (SI-ODN-II), CONTAINING ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDES TARGETED TO MRNA OF THE BETA-1-ADRENORECEPTORS FOR HYPERTENSION THERAPY IN RATS WITH STRESS-SENSITIVE ARTERIAL HYPERTENSION (ISIAH RATS)

    Ryazanova, M., Klimov, L., Seryapina, A., Zarytova, V., Repkova, M., Levina, A. & Markel, A., окт. 2018, в: Journal of Hypertension. 36, стр. E81-E82 2 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  37. Natural Nucleoside Modifications in Guide RNAs Can Modulate the Activity of the CRISPR-Cas9 System In Vitro.

    Prokhorova, D. V., Vokhtantsev, I. P., Tolstova, P. O., Zhuravlev, E. S., Kulishova, L. M., Zharkov, D. O. & Stepanov, G. A., дек. 2022, в: The CRISPR journal. 5, 6, стр. 799-812 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Non-agglomerated silicon-organic nanoparticles and their nanocomplexes with oligonucleotides: Synthesis and properties

    Levina, A. S., Repkova, M. N., Shikina, N. V., Ismagilov, Z. R., Yashnik, S. A., Semenov, D. V., Savinovskaya, Y. I., Mazurkova, N. A., Pyshnaya, I. A. & Zarytova, V. F., 21 сент. 2018, в: Beilstein Journal of Nanotechnology. 9, 1, стр. 2516-2525 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Noncatalytic Domains in DNA Glycosylases

    Torgasheva, N. A., Diatlova, E. A., Grin, I. R., Endutkin, A. V., Mechetin, G. V., Vokhtantsev, I. P., Yudkina, A. V. & Zharkov, D. O., 1 июл. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 13, 7286.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  40. Not only the active site: importance of remote interactions in the recognition of oxidative DNA lesions

    Zharkov, D., июл. 2018, в: FEBS Open Bio. 8, стр. 139-140 2 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  41. Nuclear delivery of oligonucleotides via nanocomposites based on TiO2 nanoparticles and polylysine

    Chelobanov, B. P., Repkova, M. N., Baiborodin, S. I., Ryabchikova, E. I. & Stetsenko, D. A., 9 нояб. 2017, в: Molekuliarnaia biologiia. 51, 5, стр. 797-808 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Nuclear delivery of oligonucleotides via nanocomposites based on TiO2 nanoparticles and polylysine

    Chelobanov, B. P., Repkova, M. N., Baiborodin, S. I., Ryabchikova, E. I. & Stetsenko, D. A., 1 сент. 2017, в: Molecular Biology. 51, 5, стр. 695-704 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. Nucleotide modifications decrease innate immune response induced by synthetic analogs of snRNAs and snoRNAs

    Stepanov, G., Zhuravlev, E., Shender, V., Nushtaeva, A., Balakhonova, E., Mozhaeva, E., Kasakin, M., Koval, V., Lomzov, A., Pavlyukov, M., Malyants, I., Zhorov, M., Kabilova, T., Chernolovskaya, E., Govorun, V., Kuligina, E., Semenov, D. & Richter, V., 2 нояб. 2018, в: Genes. 9, 11, 18 стр., 531.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  44. Observations on Protecting Groups in the Synthesis of Mono- and Triphosphates of Amino Alcohols

    Sherstyuk, Y. V., Chalova, P. V., Silnikov, V. N. & Abramova, T. V., 4 мар. 2019, в: Organic Preparations and Procedures International. 51, 2, стр. 182-191 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  45. Oxidative damage to epigenetically methylated sites affects DNA stability, dynamics and enzymatic demethylation

    Gruber, D. R., Toner, J. J., Miears, H. L., Shernyukov, A. V., Kiryutin, A. S., Lomzov, A. A., Endutkin, A. V., Grin, I. R., Petrova, D. V., Kupryushkin, M. S., Yurkovskaya, A. V., Johnson, E. C., Okon, M., Bagryanskaya, E. G., Zharkov, D. O. & Smirnov, S. L., 16 нояб. 2018, в: Nucleic Acids Research. 46, 20, стр. 10827-10839 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. Pan-cancer antagonistic inhibition pattern of ATM-driven G2/M checkpoint pathway vs other DNA repair pathways

    Zolotovskaia, M. A., Modestov, A. A., Suntsova, M. V., Rachkova, A. A., Koroleva, E. V., Poddubskaya, E. V., Sekacheva, M. I., Tkachev, V. S., Garazha, A. V., Glusker, A. A., Seryakov, A. P., Vladimirova, U. S., Rumiantsev, P. O., Moisseev, A. A., Zharkov, D. O., Kuzmin, D. V., Zhao, X., Prassolov, V. S., Shegay, P. V., Li, X., еще 5Steinbichler, T. B., Kim, E., Sorokin, M. I., Wang, Y. & Buzdin, A. A., мар. 2023, в: DNA Repair. 123, 18 стр., 103448.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  47. Photoactivatable CRISPR/Cas9 System

    Akhmetova, E. A., Golyshev, V. M., Vokhtantcev, I. P., Meschaninova, M. I., Venyaminova, A. G. & Novopashina, D. S., мар. 2021, в: Russian Journal of Bioorganic Chemistry. 47, 2, стр. 496-504 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  48. Photoactivatable nanocrispr/cas9 system based on crrna reversibly immobilized on carbon nanoparticles

    Semikolenova, O., Sakovina, L., Akhmetova, E., Kim, D., Vokhtantsev, I., Golyshev, V., Vorobyeva, M., Novopashin, S. & Novopashina, D., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 20, 10919.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  49. Photocleavable guide RNAs for controllable genome editing with CRISPR/Cas9 system

    Novopashina, D., Khabardina, E., Vokhtantsev, I., Kim, D., Venyaminova, A. & Zharkov, D., июл. 2019, в: FEBS Open Bio. 9, стр. 400-400 1 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхтезисыРецензирование

  50. Photoinduced inhibition of DNA repair enzymes and the possible mechanism of photochemical transformations of the ruthenium nitrosyl complex [RuNO(β-Pic)2(NO2)2OH

    Mikhailov, A. A., Khantakova, D. V., Nichiporenko, V. A., Glebov, E. M., Grivin, V. P., Plyusnin, V. F., Yanshole, V. V., Petrova, D. V., Kostin, G. A. & Grin, I. R., 11 дек. 2019, в: Metallomics : integrated biometal science. 11, 12, стр. 1999-2009 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

ID: 3086315