A genome-scale metabolic model of 2,3-butanediol production by thermophilic bacteria geobacillus icigianus

Kulyashov, M., Peltek, S. E. & Akberdin, I. R., 1 июл. 2020, в: Microorganisms. 8, 7, стр. 1-13 13 стр., 1002.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Analysis of color and texture characteristics of cereals on digital images

Komyshev, E. G., Genaev, M. A. & Afonnikov, D. A., июл. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 4, стр. 340-347 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Mathematical and Numerical Models of the Central Regulatory Circuit of the Morphogenesis System of Drosophila

Bukharina, T. A., Akinshin, A. A., Golubyatnikov, V. P. & Furman, D. P., 1 мая 2020, в: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 14, 2, стр. 249-255 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

rs2072580T>A Polymorphism in the Overlapping Promoter Regions of the SART3 and ISCU Genes Associated with the Risk of Breast Cancer

Degtyareva, A. O., Leberfarb, E. Y., Efimova, E. G., Brusentsov, I. I., Usova, A. V., Lushnikova, E. L. & Merkulova, T. I., 1 мая 2020, в: Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 169, 1, стр. 81-84 4 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Fold-change-specific enrichment analysis (FSEA): Quantification of transcriptional response magnitude for functional gene groups

Wiebe, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mukhin, A. M., Grosse, I., Lashin, S. A., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V. V., 17 апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 14 стр., 434.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in drosophila melanogaster polytene chromosomes

Khoroshko, V. A., Pokholkova, G. V., Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Antonenko, O. V., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 32 стр., 417.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2020, в: Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Использование гиперспектральной камеры Specim IQ для анализа растений

Alt, V. V., Gurova, T. A., Elkin, O. V., Klimenko, D. N., Maximov, L. V., Pestunov, I. A., Dubrovskaya, O. A., Genaev, M. A., Erst, T. V., Genaev, K. A., Komyshev, E. G., Khlestkin, V. K. & Afonnikov, D. A., 1 мар. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 3, стр. 259-266 8 стр., 6.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Candidate snp markers of atherogenesis significantly shifting the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters show stabilizing natural selection as a sum of neutral drift accelerating atherogenesis and directional natural selection slowing it

Ponomarenko, M., Rasskazov, D., Chadaeva, I., Sharypova, E., Drachkova, I., Oshchepkov, D., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Oshchepkova, E., Nazarenko, M. & Kolchanov, N., 5 февр. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 3, 41 стр., 1045.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Computer Simulation of the Evolution of Microbial Population: Overcoming Local Minima When Reaching a Peak on the Fitness Landscape

Lashin, S. A., Mustafin, Z. S., Klimenko, A. I., Afonnikov, D. A. & Matushkin, Y. G., 1 февр. 2020, в: Russian Journal of Genetics. 56, 2, стр. 242-252 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain

Pavlova, A. S., Ozhegov, G. D., Arapidi, G. P., Butenko, I. O., Fomin, E. S., Alemasov, N. A., Afonnikov, D. A., Yarullina, D. R., Ivanov, V. T., Govorun, V. M. & Kayumov, A. R., 1 февр. 2020, в: Protein Journal. 39, 1, стр. 73-84 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The Effect of Meditation on Comprehension of Statements About One-Self and Others: A Pilot ERP and Behavioral Study

Savostyanov, A., Tamozhnikov, S., Bocharov, A., Saprygin, A., Matushkin, Y., Lashin, S., Kolpakova, G., Sudobin, K. & Knyazev, G., 9 янв. 2020, в: Frontiers in Human Neuroscience. 13, 12 стр., 437.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A mathematical model linking Ca2+-dependent signaling pathway and gene expression regulation in Human Skeletal Muscle

Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., Pintus, S. S., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 1, стр. 20-39 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Potential regulatory SNPs in the ATXN7L3B and KRT15 genes are associated with gender-specific colorectal cancer risk

Leberfarb, E. Y., Degtyareva, A. O., Brusentsov, I. I., Maximov, V. N., Voevoda, M. I., Autenshlus, A. I., Morozov, D. V., Sokolov, A. V. & Merkulova, T. I., янв. 2020, в: Personalized Medicine. 17, 1, стр. 43-54 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Rdbms And Nosql Based Hybrid Technology for Transcriptome Data Structuring and Processing

Mukhin, A. M., Genaev, M. A., Rasskazov, D. A., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 2, стр. 455-470 16 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The mTOR signaling pathway activity and vitamin d availability control the expression of most autism predisposition genes

Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 15 дек. 2019, в: International Journal of Molecular Sciences. 20, 24, 14 стр., 6332.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.)

Ermakov, A., Bobrovskikh, A., Zubairova, U., Konstantinov, D. & Doroshkov, A., 29 нояб. 2019, в: PeerJ. 7, 11, 28 стр., e7791.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Phylostratigraphic analysis shows the earliest origination of the abiotic stress associated genes in a. Thaliana

Mustafin, Z. S., Zamyatin, V. I., Konstantinov, D. K., Doroshkov, A. V., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 22 нояб. 2019, в: Genes. 10, 12, 27 стр., 963.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Reconstruction and Analysis of Gene Networks of Human Neurotransmitter Systems Reveal Genes with Contentious Manifestation for Anxiety, Depression, and Intellectual Disabilities

Ivanov, R., Zamyatin, V., Klimenko, A., Matushkin, Y., Savostyanov, A. & Lashin, S., 11 сент. 2019, в: Genes. 10, 9, 14 стр., 699.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Candidate SNP Markers of Atherosclerosis That May Significantly Change the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Human Gene Promoters

Ponomarenko, M. P., Rasskazov, D. A., Chadaeva, I. V., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Ponomarenko, P. M., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K. & Kolchanov, N. A., 1 сент. 2019, в: Russian Journal of Genetics. 55, 9, стр. 1137-1151 15 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Shaping Ethylene Response: The Role of EIN3/EIL1 Transcription Factors

Dolgikh, V. A., Pukhovaya, E. M. & Zemlyanskaya, E. V., 26 авг. 2019, в: Frontiers in Plant Science. 10, стр. 1030 9 стр., 1030.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Candidate SNP-markers of rheumatoid arthritis that can significantly alter the affinity of the TATA-binding protein for human gene promoters

Chadaeva, I. V., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K., Ponomarenko, P. M., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Kozlov, V. A., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 1047-1058 12 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Single nucleotide polymorphism rs110861313 in the intergenic region of chromosome 23 is associated with the development of leukosis in the Russian Black Pied cattle

Aitnazarov, R. B., Ignatieva, E. V., Agarkova, T. A., Dvoeglazov, N. G., Osipova, N. A., Khramtsov, V. V. & Yudin, N. S., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 999-1005 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Morphometry of the wheat spike by analyzing 2D images

Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Smirnov, N. V., Kruchinina, Y. V., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 17 июл. 2019, в: Agronomy. 9, 7, 390.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

BioUML: an integrated environment for systems biology and collaborative analysis of biomedical data

Kolpakov, F., Akberdin, I., Kashapov, T., Kiselev, L., Kolmykov, S., Kondrakhin, Y., Kutumova, E., Mandrik, N., Pintus, S., Ryabova, A., Sharipov, R., Yevshin, I. & Kel, A., 1 июл. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, W1, стр. W225-W233 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Insight into genetic and social aspects of modern communities of deaf people in Siberia for forecasting the prevalence of hereditary deafness

Posukh, O. L., Bady-Khoo, M. S., Romanov, G. P., Barashkov, N. A., Smirnova, A. A., Zytsar, M. V., Maslova, E. A., Danilchenko, V. Y., Posukh, O. V. & Lashin, S. A., июл. 2019, в: European journal of human genetics. 27, стр. 1038-1038 1 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › тезисы › Рецензирование

Exome-wide search and functional annotation of genes associated in patients with severe tick-borne encephalitis in a Russian population

Ignatieva, E. V., Yurchenko, A. A., Voevoda, M. I. & Yudin, N. S., 24 мая 2019, в: BMC Medical Genomics. 12, Suppl 3, стр. 61 23 стр., 61.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

New insights from Opisthorchis felineus genome: update on genomics of the epidemiologically important liver flukes

Ershov, N. I., Mordvinov, V. A., Prokhortchouk, E. B., Pakharukova, M. Y., Gunbin, K. V., Ustyantsev, K., Genaev, M. A., Blinov, A. G., Mazur, A., Boulygina, E., Tsygankova, S., Khrameeva, E., Chekanov, N., Fan, G., Xiao, A., Zhang, H., Xu, X., Yang, H., Solovyev, V., Lee, S. M. Y., еще 3Liu, X., Afonnikov, D. A. & Skryabin, K. G., 22 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, 1, стр. 399 22 стр., 399.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genomics research at Bioinformatics of Genome Regulation and Structure\ Systems Biology (BGRS\SB) conferences in Novosibirsk

Orlov, Y. L., Kochetov, A. V., Li, G. & Kolchanov, N. A., 8 мая 2019, в: BMC Genomics. 20, Suppl 3, 5 стр., 322.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Spatial heterogeneity promotes antagonistic evolutionary scenarios in microbial community explained by ecological stratification: a simulation study

Klimenko, A. I., Matushkin, Y. G., Kolchanov, N. A. & Lashin, S. A., 1 мая 2019, в: Ecological Modelling. 399, стр. 66-76 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Genome analysis identifies the mutant genes for common industrial Silverblue and Hedlund white coat colours in American mink

Manakhov, A. D., Andreeva, T. V., Trapezov, O. V., Kolchanov, N. A. & Rogaev, E. I., 14 мар. 2019, в: Scientific Reports. 9, 1, стр. 4581 8 стр., 4581.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

LSM-W ²: Laser scanning microscopy worker for wheat leaf surface morphology

Zubairova, U. S., Verman, P. Y., Oshchepkova, P. A., Elsukova, A. S. & Doroshkov, A. V., 5 мар. 2019, в: BMC Systems Biology. 13, Suppl 1, стр. 22 12 стр., 22.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Evolutionary biology and biodiversity research at BGRS-2018

Orlov, Y. L., Baranova, A. V., Kolchanov, N. A. & Moroz, L. L., 26 февр. 2019, в: BMC Evolutionary Biology. 19, Suppl 1, стр. 43 3 стр., 43.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Natural selection equally supports the human tendencies in subordination and domination: A Genome-wide study with in silico confirmation and in vivo validation in mice

Chadaeva, I., Ponomarenko, P., Rasskazov, D., Sharypova, E., Kashina, E., Kleshchev, M., Ponomarenko, M., Naumenko, V., Savinkova, L., Kolchanov, N., Osadchuk, L. & Osadchuk, A., 20 февр. 2019, в: Frontiers in Genetics. 10, FEB, 16 стр., 73.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

The evolution of gene regulatory networks controlling Arabidopsis thaliana L. trichome development

Doroshkov, A. V., Konstantinov, D. K., Afonnikov, D. A. & Gunbin, K. V., 15 февр. 2019, в: BMC Plant Biology. 19, Suppl 1, 15 стр., 53.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

MIGREW: Database on molecular identification of genes for resistance in wheat

Kazantsev, F. V., Skolotneva, E. S., Kelbin, V. N., Salina, E. A. & Lashin, S. A., 5 февр. 2019, в: BMC Bioinformatics. 20, Suppl 1, 8 стр., 36.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

Kiselev, I. N., Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., D.V., P. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2019, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 14, 2, стр. 373-392 20 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Effect of neonatal dexamethasone treatment on cognitive abilities of adult male mice and gene expression in the hypothalamus

Bondar, N. P., Reshetnikov, V. V., Burdeeva, K. V. & Merkulova, T. I., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 4, стр. 456-464 9 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Image-based analysis of quantitative morphological characteristics of wild potato tubers using the desktop application SeedСounter

Ivanova, K. A., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Egorova, A. A., Koloshina, K. A., Chalaya, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V., Rogozina, E. V. & Gerasimova, S. V., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 5, стр. 519-526 8 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Progress in plant genome sequencing: Research directions

Bragina, M. K., Afonnikov, D. A. & Salina, E. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 38-48 11 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

Deciphering auxin-ethylene crosstalk at a systems level

Zemlyanskaya, E. V., Omelyanchuk, N. A., Ubogoeva, E. V. & Mironova, V. V., 14 дек. 2018, в: International Journal of Molecular Sciences. 19, 12, 15 стр., 4060.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

Regulatory SNPs and their widespread effects on the transcriptome

Merkulov, V. M., Leberfarb, E. Y. & Merkulova, T. I., 1 дек. 2018, в: Journal of Biosciences. 43, 5, стр. 1069-1075 7 стр.

Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование