1. 2022
  2. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  3. BioUML—towards a universal research platform

    Колпаков, Ф., Акбердин, И. Р., Киселев, И., Колмыков, С. К., Кондрахин, Ю., Куляшов, М. А., Кутумова, Е., Пинтус, С. С., Рябова, А., Шарипов, Р. Н., Евшин, И., Жатченко, С. & Кель, А., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W124-W131 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Multicompartmental Mathematical Model of SARS-CoV-2 Distribution in Human Organs and Their Treatment

    Afonyushkin, V. N., Акбердин, И. Р., Kozlova, Y., Щукин, И. А., Mironova, T., Bobikova, A., Cherepushkina, V., Donchenko, N., Poletaeva, Y. E. & Колпаков, Ф., 1 июн. 2022, в: Mathematics. 10, 11, 1925.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus

    Zubairova, U. S., Kravtsova, A. Y., Romashchenko, A. V., Pushkareva, A. A. & Doroshkov, A. V., 1 июн. 2022, в: Plants. 11, 12, 1533.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Modular Representation of Physiologically Based Pharmacokinetic Models: Nanoparticle Delivery to Solid Tumors in Mice as an Example

    Kutumova, E., Akberdin, I., Kiselev, I., Sharipov, R. & Kolpakov, F., 1 апр. 2022, в: Mathematics. 10, 7, 20 стр., 1176.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses

    Kirichenko, A. D., Poroshina, A. A., Sherbakov, D. Y., Sadovsky, M. G. & Krutovsky, K. V., мар. 2022, в: PLoS ONE. 17, 3, e0264640.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. Isolation and transcriptome analysis of a biotechnologically promising Black Sea protist, Thraustochytrium aureum ssp. Strugatskii

    Konstantinov, D. K., Menzorov, A., Krivenko, O. & Doroshkov, A. V., мар. 2022, в: PeerJ. 10, e12737.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Shishkina, O. D., Adonyeva, N. V., Karpova, E. K., Gruntenko, N. E., Zakharenko, L. P., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., 1 февр. 2022, в: Mathematics. 10, 3, 295.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Salicylic Acid in Root Growth and Development

    Bagautdinova, Z. Z., Omelyanchuk, N., Tyapkin, A. V., Kovrizhnykh, V. V., Lavrekha, V. V. & Zemlyanskaya, E. V., 1 февр. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2228.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  11. Agent-Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population

    Romanov, G. P., Smirnova, A. A., Zamyatin, V. I., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Solovyev, A. V., Fedorova, S. A., Posukh, O. L., Lashin, S. A. & Barashkov, N. A., февр. 2022, в: Biology. 11, 2, 257.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. The functional insight into the geneticsof cardiovascular disease: results from the post-GWAS study

    Bryzgalov, L. O., Korbolina, E. E., Damarov, I. S. & Merkulova, T., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 65-73 9 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. ДНК-метабаркодинг бентосных водорослей и ассоциированных с ними эукариот оз. Байкал в условиях быстрых экологических изменений

    Bukin, Y. S., Kravtsova, L. S., Peretolchina, T. E., Fedotov, A. P., Tupikin, A. E., Kabilov, M. R., Sherbakov, D. Y. & Mincheva, E., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 86-95 10 стр., 10.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders

    Trifonova, E. A., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 янв. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 2, 967.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  15. Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination

    Afonnikov, D. A., Komyshev, E. G., Efimov, V. M., Genaev, M. A., Koval, V. S., Gierke, P. U. & Börner, A., 1 янв. 2022, в: Plants. 11, 1, 35.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. ICBrainDB: An Integrated Database for Finding Associations between Genetic Factors and EEG Markers of Depressive Disorders

    Ivanov, R., Kazantsev, F., Zavarzin, E., Klimenko, A., Milakhina, N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. & Lashin, S., янв. 2022, в: Journal of Personalized Medicine. 12, 1, 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Wheat yield estimation based on analysis of UAV images at low altitude

    Kozhekin, M., Genaev, M., Koval, V., Slobodchikov, A. & Afonnikov, D., 2022, в: BIO Web of Conferences. 47, стр. 05006

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  18. 2021
  19. NLR genes related transcript sets in potato cultivars bearing genetic material of wild Mexican solanum species

    Kochetov, A. V., Afonnikov, D. A., Shmakov, N., Vasiliev, G. V., Antonova, O. Y., Shatskaya, N. V., Glagoleva, A. Y., Ibragimova, S. M., Khiutti, A., Afanasenko, O. S. & Gavrilenko, T. A., дек. 2021, в: Agronomy. 11, 12, 2426.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. The mitochondrial genome of a freshwater pelagic amphipod Macrohectopus branickii is among the longest in Metazoa

    Romanova, E. V., Bukin, Y. S., Mikhailov, K. V., Logacheva, M. D., Aleoshin, V. V. & Sherbakov, D. Y., дек. 2021, в: Genes. 12, 12, 2030.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. Mechanisms of stress response in the root stem cell niche

    Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Xu, J. & Mironova, V., 13 окт. 2021, в: Journal of Experimental Botany. 72, 19, стр. 6746-6754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  22. A modular mathematical model of exercise-induced changes in metabolism, signaling, and gene expression in human skeletal muscle

    Akberdin, I. R., Kiselev, I. N., Pintus, S. S., Sharipov, R. N., Vertyshev, A. Y., Vinogradova, O. L., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 19, 10353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. Leave or stay: Simulating motility and fitness of microorganisms in dynamic aquatic ecosystems

    Klimenko, A., Matushkin, Y., Kolchanov, N. & Lashin, S., окт. 2021, в: Biology. 10, 10, 1019.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

    Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  25. Prioritization of biological processes based on the reconstruction and analysis of associative gene networks describing the response of plants to adverse environmental factors

    Demenkov, P. S., Oshchepkova, E. A., Ivanisenko, T. V. & Ivanisenko, V. A., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 580-592 13 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. Комплексный анализ влияния аллельного полиморфизма 5-HTTLPR на поведенческие и нейрофизиологические показатели исполнительного контроля у людей из разных этнических групп в Сибири

    Savostyanov, A. N., Bazovkina, D. V., Lashin, S. A., Tamozhnikov, S. S., Saprygin, A. E., Astakhova, T. N., Kavai-Ool, U. N., Borisova, N. V. & Karpova, A. G., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 593-602 10 стр., 14.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  27. Image-based wheat fungi diseases identification by deep learning

    Genaev, M. A., Skolotneva, E. S., Gultyaeva, E. I., Orlova, E. A., Bechtold, N. P. & Afonnikov, D. A., авг. 2021, в: Plants. 10, 8, 1500.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes

    Ignatieva, E. V., Osadchuk, A. V., Kleshchev, M. A., Bogomolov, A. G. & Osadchuk, L. V., 5 июл. 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, 662770.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. A panel of rsnps demonstrating allelic asymmetry in both chip-seq and rna-seq data and the search for their phenotypic outcomes through analysis of degs

    Korbolina, E. E., Bryzgalov, L. O., Ustrokhanova, D. Z., Postovalov, S. N., Poverin, D. V., Damarov, I. S. & Merkulova, T. I., 2 июл. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 14, 7240.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. Experimental comparison of the in vivo efficacy of two novel anticancer therapies

    Ruzanova, V. S., Proskurina, A. S., Ritter, G. S., Efremov, Y. R., Nikolin, V. P., Popova, N. A., Naprimerov, V. A., Dolgova, E. V., Potter, E. A., Kirikovich, S. S., Levites, E. V., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A., Burakova, E. A., Stetsenko, D. A., Ostanin, A. A., Chernykh, E. R. & Bogachev, S. S., июл. 2021, в: Anticancer research. 41, 7, стр. 3371-3387 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  31. Regulatory SPNs: Altered transcription factor binding sites implicated in complex traits and diseases

    Degtyareva, A. O., Antontseva, E. V. & Merkulova, T. I., 2 июн. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 12, 6454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Genome-wide atlas of promoter expression reveals contribution of transcribed regulatory elements to genetic control of disuse-mediated atrophy of skeletal muscle

    Pintus, S. S., Akberdin, I. R., Yevshin, I., Makhnovskii, P., Tyapkina, O., Nigmetzyanov, I., Nurullin, L., Devyatiyarov, R., Shagimardanova, E., Popov, D., Kolpakov, F. A., Gusev, O. & Gazizova, G. R., июн. 2021, в: Biology. 10, 6, 557.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis

    Bobrovskikh, A., Doroshkov, A., Mazzoleni, S., Cartenì, F., Giannino, F. & Zubairova, U., 21 мая 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, стр. 652974 652974.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  34. Do autism spectrum and autoimmune disorders share predisposition gene signature due to mtor signaling pathway controlling expression?

    Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 мая 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 10, 5248.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress

    Konstantinov, D. K., Zubairova, U. S., Ermakov, A. A. & Doroshkov, A. V., мая 2021, в: PeerJ. 9, стр. e11428 e11428.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

    Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  37. Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы

    Afonnikov, D. A., Sinitsyna, O. I., Golubeva, T. S., Shmakov, N. A. & Kochetov, A. V., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 251-259 9 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Технологии поиска и исследования потенциально осциллирующих ферментативных систем

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 318-330 13 стр., 9.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Геномная изменчивость в регуляторных районах генов, ассоциированная с заболеваниями человека: механизмы влияния на транскрипцию генов и полногеномные информационные ресурсы, обеспечивающие исследование этих механизмов

    Ignatieva, E. V. & Matrosova, E. A., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 18-29 12 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  40. Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2

    Tsukanov, A. V., Levitsky, V. G. & Merkulova, T. I., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 7-17 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. Филостратиграфический анализ генных сетей заболеваний человека

    Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., янв. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 46-56 11 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Hypoxia exerts oxidative stress and changes in expression of antioxidant enzyme genes in gills of Mytilus galloprovincialis (Lamarck, 1819)

    Andreyeva, A. Y., Gostyukhina, O. L., Kladchenko, E. S., Afonnikov, D. A., Rasskazov, D. A., Lantushenko, A. O. & Vodiasova, E. A., 2021, в: Marine Biology Research. 17, 4, стр. 369-379 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains

    Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Klimenko, A. I., Lakhova, T. N., Demenkov, P. S. & Lashin, S. A., 2021, Parallel Computing Technologies - 16th International Conference, PaCT 2021, Proceedings. Malyshkin, V. (ред.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, стр. 445-450 6 стр. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); том 12942 LNCS).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  44. Вироид веретеновидности клубней картофеля

    Kochetov, A. V., Pronozin, A. Y., Shatskaya, N. V., Afonnikov, D. A. & Afanasenko, O. S., 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 269-275 7 стр., 3.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  45. Определение количественного содержания хлорофиллов в листьях по спектрам отражения алгоритмом случайного леса

    Urbanovich, E. A., Afonnikov, D. A. & Nikolaev, S. V., 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 64-70 7 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. 2020
  47. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in drosophila interphase chromosomes

    Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Moshkin, Y. M. & Zhimulev, I. F., 1 дек. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 23, стр. 1-10 10 стр., 9282.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  48. A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: An analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia

    Romanov, G. P., Pshennikova, V. G., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Teryutin, F. M., Cherdonova, A. M., Borisova, T. V., Sazonov, N. N., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L., Fedorova, S. A. & Barashkov, N. A., нояб. 2020, в: PLoS ONE. 15, 11 November, стр. e0242219 e0242219.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  49. Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

    Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  50. The phylogeny of class b flavoprotein monooxygenases and the origin of the yucca protein family

    Turnaev, I. I., Gunbin, K. V., Suslov, V. V., Akberdin, I. R., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 сент. 2020, в: Plants. 9, 9, стр. 1-22 22 стр., 1092.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  51. Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

    Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  52. The Effects of Chronic Stress on Brain Myelination in Humans and in Various Rodent Models

    Antontseva, E., Bondar, N., Reshetnikov, V. & Merkulova, T., 10 авг. 2020, в: Neuroscience. 441, стр. 226-238 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  53. Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview

    Bobrovskikh, A., Zubairova, U., Kolodkin, A. & Doroshkov, A., 16 июл. 2020, в: PeerJ. 8, стр. e9451 27 стр., e9451.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

ID: 3081871