1. 2023
  2. Numerous Trigger-like Interactions of Kinases/Protein Phosphatases in Human Skeletal Muscles Can Underlie Transient Processes in Activation of Signaling Pathways during Exercise

    Vertyshev, A. Y., Akberdin, I. R. & Kolpakov, F. A., 7 июл. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 11223.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  3. Comparison of the evolutionary patterns of DNA repeats in ancient and young invertebrate species flocks of Lake Baikal

    Yuxiang, W., Peretolchina, T. E., Romanova, E. V. & Sherbakov, D. Y., июл. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 4, стр. 349-356 8 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  4. ICAnnoLncRNA: A Snakemake Pipeline for a Long Non-Coding-RNA Search and Annotation in Transcriptomic Sequences

    Pronozin, A. Y. & Afonnikov, D. A., 24 июн. 2023, в: Genes. 14, 7, 1331.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. A New Visualization and Analysis Method for a Convolved Representation of Mass Computational Experiments with Biological Models

    Klimenko, A. I., Vorobeva, D. A. & Lashin, S. A., июн. 2023, в: Mathematics. 11, 12, 2783.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  6. Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Salina, E. A., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., июн. 2023, в: Agronomy. 13, 6, 1454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. Research Topics of the Bioinformatics of Gene Regulation

    Orlov, Y. L., Anashkina, A. A., Kumeiko, V. V., Chen, M. & Kolchanov, N. A., 15 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 10, 8774.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Vasiliev, G. V., Toshchakov, S. V., Shmakov, N. A., Genaev, M. A., Nesterov, M. A., Ibragimova, S. M., Rybakov, D. A., Gavrilenko, T. A., Salina, E. A., Patrushev, M. V., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., 16 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 6, 5713.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. Impact of Negative Feedbacks on De Novo Pyrimidines Biosynthesis in Escherichia coli

    Akberdin, I. R., Kozlov, K. N., Kazantsev, F. V., Fadeev, S. I., Likhoshvai, V. A. & Khlebodarova, T. M., 2 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 4806.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato

    Kochetov, A. V., Shmakov, N., Afonnikov, D. A., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Egorova, A. A., Mironenko, N. V., Lashina, N. M., Khiutti, A. V. & Afanasenko, O. S., мар. 2023, в: Agronomy. 13, 3, 684.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  11. Differentially Expressed Genes and Molecular Susceptibility to Human Age-Related Diseases

    Shikhevich, S., Chadaeva, I., Khandaev, B., Kozhemyakina, R., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Bogomolov, A., Klimova, N. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Mustafin, Z., Markel, A., Savinkova, L., Kolchanov, N. A., Kozlov, V. & Ponomarenko, M., 16 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 3996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  12. Trait-Based Method of Quantitative Assessment of Ecological Functional Groups in the Human Intestinal Microbiome

    Kropochev, A. I., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G. & Klimenko, A. I., 11 янв. 2023, в: Biology. 12, 1, 115.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  13. Antitumor efficacy of multi-target in situ vaccinations with CpG oligodeoxynucleotides, anti-OX40, anti-PD1 antibodies, and aptamers

    Proskurina, A. S., Рузанова, В. С., Риттер, Г. С., Ефремов, Я. Р., Mustafin, Z. S., Лашин, С. А., Буракова, Е. А., Фокина, А. А., Zatsepin, T. S., Стеценко, Д. А., Леплина, О. Ю., Останин, А. А., Черных, Е. Р. & Bogachev, S. S., 2023, в: Journal of Biomedical Research. 37, 3, стр. 194-212 19 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks

    Artemenko, N. V., Genaev, M. A., Epifanov, R. U., Komyshev, E. G., Kruchinina, Y. V., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 16 стр., 1336192.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  15. 2022
  16. Algorithm for the Reconstruction of Mathematical Frame Models of Bacterial Transcription Regulation

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Mukhin, A. M., Kolchanov, N. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2022, в: Mathematics. 10, 23, 4480.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients

    Ivanisenko, V. A., Gaisler, E. V., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Cheresiz, S. V., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Mishchenko, E. L., Khripko, O. P., Khripko, Y. I., Voevoda, S. M., Karpenko, T. N., Velichko, A. J., Voevoda, M. I., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 12 стр., 19977.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  18. The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 14934.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. Компьютерный анализ особенностей регуляции гиперметилированных маркерных генов гепатокарциномы вирусными белками гепатита С

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 733-742 10 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  20. Контекстные сигналы в митохондриальных микроРНК млекопитающих

    Vishnevsky, O. V., Vorozheykin, P. S. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 819-825 7 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  21. Молекулярные механизмы детерминации клеток сосудистой системы корня Arabidopsis thaliana L

    Sidorenko, A. D., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 721-732 12 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  22. Свойства малого мира научных организаций определяют динамику публикационной активности в области миРНК

    Firsov, A. B. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 826-829 4 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  23. Фосфолипазы A2 человека: функциональный и эволюционный анализ

    Turnaev, I. I., Bocharnikova, M. E. & Afonnikov, D. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 787-797 11 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  24. Genomic analysis reveals cryptic diversity in aphelids and sheds light on the emergence of Fungi

    Mikhailov, K. V., Karpov, S. A., Letcher, P. M., Lee, P. A., Logacheva, M. D., Penin, A. A., Nesterenko, M. A., Pozdnyakov, I. R., Potapenko, E. V., Sherbakov, D. Y., Panchin, Y. V. & Aleoshin, V. V., 7 нояб. 2022, в: Current Biology. 32, 21, стр. 4607-4619.e7 21 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling of Nanoparticle Biodistribution: A Review of Existing Models, Simulation Software, and Data Analysis Tools

    Кутумова, Е. О., Акбердин, И. Р., Киселев, И. Н., Шарипов, Р. Н., Егорова, В. С., Сырочева, А. О., Parodi, A., Замятнин, А. А. & Колпаков, Ф. А., 19 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 22 стр., 12560.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  26. Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes

    Korenskaia, A. E., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 19, 11996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  27. Genetic Regulation of Morphogenesis of Drosophila melanogaster Mechanoreceptors

    Furman, D. P. & Bukharina, T. A., 6 сент. 2022, в: Russian Journal of Developmental Biology. 53, 4, стр. 239-251 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  28. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  29. Web-MCOT Server for Motif Co-Occurrence Search in ChIP-Seq Data

    Levitsky, V. G., Mukhin, A. M., Oshchepkov, D. Y., Zemlyanskaya, E. V. & Lashin, S. A., 11 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8981.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  30. QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing

    Arif, M. A. R., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Koval, V. S., Shmakov, N. A., Börner, A. & Afonnikov, D. A., авг. 2022, в: Plants. 11, 16, 2105.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  31. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  32. BioUML—towards a universal research platform

    Колпаков, Ф., Акбердин, И. Р., Киселев, И., Колмыков, С. К., Кондрахин, Ю., Куляшов, М. А., Кутумова, Е., Пинтус, С. С., Рябова, А., Шарипов, Р. Н., Евшин, И., Жатченко, С. & Кель, А., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W124-W131 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  33. Multicompartmental Mathematical Model of SARS-CoV-2 Distribution in Human Organs and Their Treatment

    Afonyushkin, V. N., Акбердин, И. Р., Kozlova, Y., Щукин, И. А., Mironova, T., Bobikova, A., Cherepushkina, V., Donchenko, N., Poletaeva, Y. E. & Колпаков, Ф., 1 июн. 2022, в: Mathematics. 10, 11, 1925.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  34. Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus

    Zubairova, U. S., Kravtsova, A. Y., Romashchenko, A. V., Pushkareva, A. A. & Doroshkov, A. V., 1 июн. 2022, в: Plants. 11, 12, 1533.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  35. Modular Representation of Physiologically Based Pharmacokinetic Models: Nanoparticle Delivery to Solid Tumors in Mice as an Example

    Kutumova, E., Akberdin, I., Kiselev, I., Sharipov, R. & Kolpakov, F., 1 апр. 2022, в: Mathematics. 10, 7, 20 стр., 1176.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  36. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses

    Kirichenko, A. D., Poroshina, A. A., Sherbakov, D. Y., Sadovsky, M. G. & Krutovsky, K. V., мар. 2022, в: PLoS ONE. 17, 3, e0264640.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  37. Isolation and transcriptome analysis of a biotechnologically promising Black Sea protist, Thraustochytrium aureum ssp. Strugatskii

    Konstantinov, D. K., Menzorov, A., Krivenko, O. & Doroshkov, A. V., мар. 2022, в: PeerJ. 10, e12737.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  38. Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Shishkina, O. D., Adonyeva, N. V., Karpova, E. K., Gruntenko, N. E., Zakharenko, L. P., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., 1 февр. 2022, в: Mathematics. 10, 3, 295.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  39. Salicylic Acid in Root Growth and Development

    Bagautdinova, Z. Z., Omelyanchuk, N., Tyapkin, A. V., Kovrizhnykh, V. V., Lavrekha, V. V. & Zemlyanskaya, E. V., 1 февр. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2228.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  40. Agent-Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population

    Romanov, G. P., Smirnova, A. A., Zamyatin, V. I., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Solovyev, A. V., Fedorova, S. A., Posukh, O. L., Lashin, S. A. & Barashkov, N. A., февр. 2022, в: Biology. 11, 2, 257.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  41. The functional insight into the geneticsof cardiovascular disease: results from the post-GWAS study

    Bryzgalov, L. O., Korbolina, E. E., Damarov, I. S. & Merkulova, T., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 65-73 9 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  42. ДНК-метабаркодинг бентосных водорослей и ассоциированных с ними эукариот оз. Байкал в условиях быстрых экологических изменений

    Bukin, Y. S., Kravtsova, L. S., Peretolchina, T. E., Fedotov, A. P., Tupikin, A. E., Kabilov, M. R., Sherbakov, D. Y. & Mincheva, E., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 86-95 10 стр., 10.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders

    Trifonova, E. A., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 янв. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 2, 967.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  44. Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination

    Afonnikov, D. A., Komyshev, E. G., Efimov, V. M., Genaev, M. A., Koval, V. S., Gierke, P. U. & Börner, A., 1 янв. 2022, в: Plants. 11, 1, 35.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  45. ICBrainDB: An Integrated Database for Finding Associations between Genetic Factors and EEG Markers of Depressive Disorders

    Ivanov, R., Kazantsev, F., Zavarzin, E., Klimenko, A., Milakhina, N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. & Lashin, S., янв. 2022, в: Journal of Personalized Medicine. 12, 1, 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  46. Wheat yield estimation based on analysis of UAV images at low altitude

    Kozhekin, M., Genaev, M., Koval, V., Slobodchikov, A. & Afonnikov, D., 2022, в: BIO Web of Conferences. 47, стр. 05006

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  47. 2021
  48. NLR genes related transcript sets in potato cultivars bearing genetic material of wild Mexican solanum species

    Kochetov, A. V., Afonnikov, D. A., Shmakov, N., Vasiliev, G. V., Antonova, O. Y., Shatskaya, N. V., Glagoleva, A. Y., Ibragimova, S. M., Khiutti, A., Afanasenko, O. S. & Gavrilenko, T. A., дек. 2021, в: Agronomy. 11, 12, 2426.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. The mitochondrial genome of a freshwater pelagic amphipod Macrohectopus branickii is among the longest in Metazoa

    Romanova, E. V., Bukin, Y. S., Mikhailov, K. V., Logacheva, M. D., Aleoshin, V. V. & Sherbakov, D. Y., дек. 2021, в: Genes. 12, 12, 2030.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. Mechanisms of stress response in the root stem cell niche

    Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Xu, J. & Mironova, V., 13 окт. 2021, в: Journal of Experimental Botany. 72, 19, стр. 6746-6754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  51. A modular mathematical model of exercise-induced changes in metabolism, signaling, and gene expression in human skeletal muscle

    Akberdin, I. R., Kiselev, I. N., Pintus, S. S., Sharipov, R. N., Vertyshev, A. Y., Vinogradova, O. L., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 19, 10353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  52. Leave or stay: Simulating motility and fitness of microorganisms in dynamic aquatic ecosystems

    Klimenko, A., Matushkin, Y., Kolchanov, N. & Lashin, S., окт. 2021, в: Biology. 10, 10, 1019.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  53. Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

    Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

ID: 3081871