1. 2023
  2. Numerous Trigger-like Interactions of Kinases/Protein Phosphatases in Human Skeletal Muscles Can Underlie Transient Processes in Activation of Signaling Pathways during Exercise

    Vertyshev, A. Y., Akberdin, I. R. & Kolpakov, F. A., 7 июл. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 13, 11223.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  3. Comparison of the evolutionary patterns of DNA repeats in ancient and young invertebrate species flocks of Lake Baikal

    Yuxiang, W., Peretolchina, T. E., Romanova, E. V. & Sherbakov, D. Y., июл. 2023, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 27, 4, стр. 349-356 8 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  4. ICAnnoLncRNA: A Snakemake Pipeline for a Long Non-Coding-RNA Search and Annotation in Transcriptomic Sequences

    Pronozin, A. Y. & Afonnikov, D. A., 24 июн. 2023, в: Genes. 14, 7, 1331.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  5. A New Visualization and Analysis Method for a Convolved Representation of Mass Computational Experiments with Biological Models

    Klimenko, A. I., Vorobeva, D. A. & Lashin, S. A., июн. 2023, в: Mathematics. 11, 12, 2783.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  6. Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Salina, E. A., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., июн. 2023, в: Agronomy. 13, 6, 1454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  7. Research Topics of the Bioinformatics of Gene Regulation

    Orlov, Y. L., Anashkina, A. A., Kumeiko, V. V., Chen, M. & Kolchanov, N. A., 15 мая 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 10, 8774.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  8. Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Vasiliev, G. V., Toshchakov, S. V., Shmakov, N. A., Genaev, M. A., Nesterov, M. A., Ibragimova, S. M., Rybakov, D. A., Gavrilenko, T. A., Salina, E. A., Patrushev, M. V., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., 16 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 6, 5713.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  9. Impact of Negative Feedbacks on De Novo Pyrimidines Biosynthesis in Escherichia coli

    Akberdin, I. R., Kozlov, K. N., Kazantsev, F. V., Fadeev, S. I., Likhoshvai, V. A. & Khlebodarova, T. M., 2 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 5, 4806.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  10. Three Cycles of Continuous Propagation of a Severe PSTVd Strain NicTr-3 in Solanum lycopersicum cv. Rutgers Resulted in Its Attenuation and Very Mild Disease Symptoms in Potato

    Kochetov, A. V., Shmakov, N., Afonnikov, D. A., Vasiliev, G. V., Shatskaya, N. V., Egorova, A. A., Mironenko, N. V., Lashina, N. M., Khiutti, A. V. & Afanasenko, O. S., мар. 2023, в: Agronomy. 13, 3, 684.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  11. Differentially Expressed Genes and Molecular Susceptibility to Human Age-Related Diseases

    Shikhevich, S., Chadaeva, I., Khandaev, B., Kozhemyakina, R., Zolotareva, K., Kazachek, A., Oshchepkov, D., Bogomolov, A., Klimova, N. V., Ivanisenko, V. A., Demenkov, P., Mustafin, Z., Markel, A., Savinkova, L., Kolchanov, N. A., Kozlov, V. & Ponomarenko, M., 16 февр. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 4, 3996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  12. Trait-Based Method of Quantitative Assessment of Ecological Functional Groups in the Human Intestinal Microbiome

    Kropochev, A. I., Lashin, S. A., Matushkin, Y. G. & Klimenko, A. I., 11 янв. 2023, в: Biology. 12, 1, 115.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  13. Antitumor efficacy of multi-target in situ vaccinations with CpG oligodeoxynucleotides, anti-OX40, anti-PD1 antibodies, and aptamers

    Proskurina, A. S., Рузанова, В. С., Риттер, Г. С., Ефремов, Я. Р., Mustafin, Z. S., Лашин, С. А., Буракова, Е. А., Фокина, А. А., Zatsepin, T. S., Стеценко, Д. А., Леплина, О. Ю., Останин, А. А., Черных, Е. Р. & Bogachev, S. S., 2023, в: Journal of Biomedical Research. 37, 3, стр. 194-212 19 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  14. Image-based classification of wheat spikes by glume pubescence using convolutional neural networks

    Artemenko, N. V., Genaev, M. A., Epifanov, R. U., Komyshev, E. G., Kruchinina, Y. V., Koval, V. S., Goncharov, N. P. & Afonnikov, D. A., 2023, в: Frontiers in Plant Science. 14, 16 стр., 1336192.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  15. 2022
  16. Algorithm for the Reconstruction of Mathematical Frame Models of Bacterial Transcription Regulation

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Mukhin, A. M., Kolchanov, N. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2022, в: Mathematics. 10, 23, 4480.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  17. Plasma metabolomics and gene regulatory networks analysis reveal the role of nonstructural SARS-CoV-2 viral proteins in metabolic dysregulation in COVID-19 patients

    Ivanisenko, V. A., Gaisler, E. V., Basov, N. V., Rogachev, A. D., Cheresiz, S. V., Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Mishchenko, E. L., Khripko, O. P., Khripko, Y. I., Voevoda, S. M., Karpenko, T. N., Velichko, A. J., Voevoda, M. I., Kolchanov, N. A. & Pokrovsky, A. G., дек. 2022, в: Scientific Reports. 12, 1, 12 стр., 19977.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  18. The New Version of the ANDDigest Tool with Improved AI-Based Short Names Recognition

    Ivanisenko, T. V., Demenkov, P. S., Kolchanov, N. A. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 23, 14934.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  19. Компьютерный анализ особенностей регуляции гиперметилированных маркерных генов гепатокарциномы вирусными белками гепатита С

    Antropova, E. A., Khlebodarova, T. M., Demenkov, P. S., Venzel, A. S., Ivanisenko, N. V., Gavrilenko, A. D., Ivanisenko, T. V., Adamovskaya, A. V., Revva, P. M., Lavrik, I. N. & Ivanisenko, V. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 733-742 10 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  20. Контекстные сигналы в митохондриальных микроРНК млекопитающих

    Vishnevsky, O. V., Vorozheykin, P. S. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 819-825 7 стр., 12.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  21. Молекулярные механизмы детерминации клеток сосудистой системы корня Arabidopsis thaliana L

    Sidorenko, A. D., Omelyanchuk, N. A. & Zemlyanskaya, E. V., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 721-732 12 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  22. Свойства малого мира научных организаций определяют динамику публикационной активности в области миРНК

    Firsov, A. B. & Titov, I. I., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 826-829 4 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  23. Фосфолипазы A2 человека: функциональный и эволюционный анализ

    Turnaev, I. I., Bocharnikova, M. E. & Afonnikov, D. A., дек. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 8, стр. 787-797 11 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  24. Genomic analysis reveals cryptic diversity in aphelids and sheds light on the emergence of Fungi

    Mikhailov, K. V., Karpov, S. A., Letcher, P. M., Lee, P. A., Logacheva, M. D., Penin, A. A., Nesterenko, M. A., Pozdnyakov, I. R., Potapenko, E. V., Sherbakov, D. Y., Panchin, Y. V. & Aleoshin, V. V., 7 нояб. 2022, в: Current Biology. 32, 21, стр. 4607-4619.e7 21 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  25. Physiologically Based Pharmacokinetic Modeling of Nanoparticle Biodistribution: A Review of Existing Models, Simulation Software, and Data Analysis Tools

    Кутумова, Е. О., Акбердин, И. Р., Киселев, И. Н., Шарипов, Р. Н., Егорова, В. С., Сырочева, А. О., Parodi, A., Замятнин, А. А. & Колпаков, Ф. А., 19 окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 20, 22 стр., 12560.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  26. Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes

    Korenskaia, A. E., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 19, 11996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  27. Genetic Regulation of Morphogenesis of Drosophila melanogaster Mechanoreceptors

    Furman, D. P. & Bukharina, T. A., 6 сент. 2022, в: Russian Journal of Developmental Biology. 53, 4, стр. 239-251 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  28. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  29. Web-MCOT Server for Motif Co-Occurrence Search in ChIP-Seq Data

    Levitsky, V. G., Mukhin, A. M., Oshchepkov, D. Y., Zemlyanskaya, E. V. & Lashin, S. A., 11 авг. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 16, 8981.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  30. QTL Analysis for Bread Wheat Seed Size, Shape and Color Characteristics Estimated by Digital Image Processing

    Arif, M. A. R., Komyshev, E. G., Genaev, M. A., Koval, V. S., Shmakov, N. A., Börner, A. & Afonnikov, D. A., авг. 2022, в: Plants. 11, 16, 2105.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  31. Motif models proposing independent and interdependent impacts of nucleotides are related to high and low affinity transcription factor binding sites in Arabidopsis

    Tsukanov, A. V., Mironova, V. V. & Levitsky, V. G., 28 июл. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 938545.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  32. BioUML—towards a universal research platform

    Колпаков, Ф., Акбердин, И. Р., Киселев, И., Колмыков, С. К., Кондрахин, Ю., Куляшов, М. А., Кутумова, Е., Пинтус, С. С., Рябова, А., Шарипов, Р. Н., Евшин, И., Жатченко, С. & Кель, А., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W124-W131 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  33. Multicompartmental Mathematical Model of SARS-CoV-2 Distribution in Human Organs and Their Treatment

    Afonyushkin, V. N., Акбердин, И. Р., Kozlova, Y., Щукин, И. А., Mironova, T., Bobikova, A., Cherepushkina, V., Donchenko, N., Poletaeva, Y. E. & Колпаков, Ф., 1 июн. 2022, в: Mathematics. 10, 11, 1925.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  34. Particle-Based Imaging Tools Revealing Water Flows in Maize Nodal Vascular Plexus

    Zubairova, U. S., Kravtsova, A. Y., Romashchenko, A. V., Pushkareva, A. A. & Doroshkov, A. V., 1 июн. 2022, в: Plants. 11, 12, 1533.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  35. Modular Representation of Physiologically Based Pharmacokinetic Models: Nanoparticle Delivery to Solid Tumors in Mice as an Example

    Kutumova, E., Akberdin, I., Kiselev, I., Sharipov, R. & Kolpakov, F., 1 апр. 2022, в: Mathematics. 10, 7, 20 стр., 1176.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  36. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses

    Kirichenko, A. D., Poroshina, A. A., Sherbakov, D. Y., Sadovsky, M. G. & Krutovsky, K. V., мар. 2022, в: PLoS ONE. 17, 3, e0264640.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  37. Isolation and transcriptome analysis of a biotechnologically promising Black Sea protist, Thraustochytrium aureum ssp. Strugatskii

    Konstantinov, D. K., Menzorov, A., Krivenko, O. & Doroshkov, A. V., мар. 2022, в: PeerJ. 10, e12737.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  38. Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Shishkina, O. D., Adonyeva, N. V., Karpova, E. K., Gruntenko, N. E., Zakharenko, L. P., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., 1 февр. 2022, в: Mathematics. 10, 3, 295.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  39. Salicylic Acid in Root Growth and Development

    Bagautdinova, Z. Z., Omelyanchuk, N., Tyapkin, A. V., Kovrizhnykh, V. V., Lavrekha, V. V. & Zemlyanskaya, E. V., 1 февр. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 4, 2228.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  40. Agent-Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population

    Romanov, G. P., Smirnova, A. A., Zamyatin, V. I., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Solovyev, A. V., Fedorova, S. A., Posukh, O. L., Lashin, S. A. & Barashkov, N. A., февр. 2022, в: Biology. 11, 2, 257.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  41. The functional insight into the geneticsof cardiovascular disease: results from the post-GWAS study

    Bryzgalov, L. O., Korbolina, E. E., Damarov, I. S. & Merkulova, T., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 65-73 9 стр., 8.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  42. ДНК-метабаркодинг бентосных водорослей и ассоциированных с ними эукариот оз. Байкал в условиях быстрых экологических изменений

    Bukin, Y. S., Kravtsova, L. S., Peretolchina, T. E., Fedotov, A. P., Tupikin, A. E., Kabilov, M. R., Sherbakov, D. Y. & Mincheva, E., февр. 2022, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 26, 1, стр. 86-95 10 стр., 10.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  43. Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders

    Trifonova, E. A., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 янв. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 2, 967.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  44. Relationship between the characteristics of bread wheat grains, storage time and germination

    Afonnikov, D. A., Komyshev, E. G., Efimov, V. M., Genaev, M. A., Koval, V. S., Gierke, P. U. & Börner, A., 1 янв. 2022, в: Plants. 11, 1, 35.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  45. ICBrainDB: An Integrated Database for Finding Associations between Genetic Factors and EEG Markers of Depressive Disorders

    Ivanov, R., Kazantsev, F., Zavarzin, E., Klimenko, A., Milakhina, N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. & Lashin, S., янв. 2022, в: Journal of Personalized Medicine. 12, 1, 53.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  46. Wheat yield estimation based on analysis of UAV images at low altitude

    Kozhekin, M., Genaev, M., Koval, V., Slobodchikov, A. & Afonnikov, D., 2022, в: BIO Web of Conferences. 47, стр. 05006

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  47. 2021
  48. NLR genes related transcript sets in potato cultivars bearing genetic material of wild Mexican solanum species

    Kochetov, A. V., Afonnikov, D. A., Shmakov, N., Vasiliev, G. V., Antonova, O. Y., Shatskaya, N. V., Glagoleva, A. Y., Ibragimova, S. M., Khiutti, A., Afanasenko, O. S. & Gavrilenko, T. A., дек. 2021, в: Agronomy. 11, 12, 2426.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  49. The mitochondrial genome of a freshwater pelagic amphipod Macrohectopus branickii is among the longest in Metazoa

    Romanova, E. V., Bukin, Y. S., Mikhailov, K. V., Logacheva, M. D., Aleoshin, V. V. & Sherbakov, D. Y., дек. 2021, в: Genes. 12, 12, 2030.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  50. Mechanisms of stress response in the root stem cell niche

    Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V., Xu, J. & Mironova, V., 13 окт. 2021, в: Journal of Experimental Botany. 72, 19, стр. 6746-6754 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  51. A modular mathematical model of exercise-induced changes in metabolism, signaling, and gene expression in human skeletal muscle

    Akberdin, I. R., Kiselev, I. N., Pintus, S. S., Sharipov, R. N., Vertyshev, A. Y., Vinogradova, O. L., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 19, 10353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  52. Leave or stay: Simulating motility and fitness of microorganisms in dynamic aquatic ecosystems

    Klimenko, A., Matushkin, Y., Kolchanov, N. & Lashin, S., окт. 2021, в: Biology. 10, 10, 1019.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  53. Transcriptional regulation in plants: Using omics data to crack the cis-regulatory code

    Zemlyanskaya, E. V., Dolgikh, V. A., Levitsky, V. G. & Mironova, V., окт. 2021, в: Current Opinion in Plant Biology. 63, стр. 102058 102058.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  54. Prioritization of biological processes based on the reconstruction and analysis of associative gene networks describing the response of plants to adverse environmental factors

    Demenkov, P. S., Oshchepkova, E. A., Ivanisenko, T. V. & Ivanisenko, V. A., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 580-592 13 стр., 13.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  55. Комплексный анализ влияния аллельного полиморфизма 5-HTTLPR на поведенческие и нейрофизиологические показатели исполнительного контроля у людей из разных этнических групп в Сибири

    Savostyanov, A. N., Bazovkina, D. V., Lashin, S. A., Tamozhnikov, S. S., Saprygin, A. E., Astakhova, T. N., Kavai-Ool, U. N., Borisova, N. V. & Karpova, A. G., сент. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 5, стр. 593-602 10 стр., 14.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  56. Image-based wheat fungi diseases identification by deep learning

    Genaev, M. A., Skolotneva, E. S., Gultyaeva, E. I., Orlova, E. A., Bechtold, N. P. & Afonnikov, D. A., авг. 2021, в: Plants. 10, 8, 1500.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  57. A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes

    Ignatieva, E. V., Osadchuk, A. V., Kleshchev, M. A., Bogomolov, A. G. & Osadchuk, L. V., 5 июл. 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, 662770.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  58. A panel of rsnps demonstrating allelic asymmetry in both chip-seq and rna-seq data and the search for their phenotypic outcomes through analysis of degs

    Korbolina, E. E., Bryzgalov, L. O., Ustrokhanova, D. Z., Postovalov, S. N., Poverin, D. V., Damarov, I. S. & Merkulova, T. I., 2 июл. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 14, 7240.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  59. Experimental comparison of the in vivo efficacy of two novel anticancer therapies

    Ruzanova, V. S., Proskurina, A. S., Ritter, G. S., Efremov, Y. R., Nikolin, V. P., Popova, N. A., Naprimerov, V. A., Dolgova, E. V., Potter, E. A., Kirikovich, S. S., Levites, E. V., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A., Burakova, E. A., Stetsenko, D. A., Ostanin, A. A., Chernykh, E. R. & Bogachev, S. S., июл. 2021, в: Anticancer research. 41, 7, стр. 3371-3387 17 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  60. Regulatory SPNs: Altered transcription factor binding sites implicated in complex traits and diseases: Altered Transcription Factor Binding Sites Implicated in Complex Traits and Diseases

    Degtyareva, A. O., Antontseva, E. V. & Merkulova, T. I., 16 июн. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 12, 6454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  61. Genome-wide atlas of promoter expression reveals contribution of transcribed regulatory elements to genetic control of disuse-mediated atrophy of skeletal muscle

    Pintus, S. S., Akberdin, I. R., Yevshin, I., Makhnovskii, P., Tyapkina, O., Nigmetzyanov, I., Nurullin, L., Devyatiyarov, R., Shagimardanova, E., Popov, D., Kolpakov, F. A., Gusev, O. & Gazizova, G. R., июн. 2021, в: Biology. 10, 6, 557.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  62. A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis

    Bobrovskikh, A., Doroshkov, A., Mazzoleni, S., Cartenì, F., Giannino, F. & Zubairova, U., 21 мая 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, стр. 652974 652974.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  63. Do autism spectrum and autoimmune disorders share predisposition gene signature due to mtor signaling pathway controlling expression?

    Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 мая 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 10, 5248.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  64. Comparative transcriptome profiling of a resistant vs susceptible bread wheat (Triticum aestivum L.) cultivar in response to water deficit and cold stress

    Konstantinov, D. K., Zubairova, U. S., Ermakov, A. A. & Doroshkov, A. V., мая 2021, в: PeerJ. 9, стр. e11428 e11428.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  65. Вироид веретеновидности клубней картофеля

    Kochetov, A. V., Pronozin, A. Y., Shatskaya, N. V., Afonnikov, D. A. & Afanasenko, O. S., мая 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 269-275 7 стр., 3.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  66. Tissue-specific transcriptome profiling of the Arabidopsis inflorescence stem reveals local cellular signatures

    Shi, D., Jouannet, V., Agustí, J., Kaul, V., Levitsky, V., Sanchez, P., Mironova, V. V. & Greb, T., 17 апр. 2021, в: The Plant cell. 33, 2, стр. 200-223 24 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  67. Рибосомное профилирование как инструмент исследования трансляции у растений: основные итоги, проблемы и перспективы

    Afonnikov, D. A., Sinitsyna, O. I., Golubeva, T. S., Shmakov, N. A. & Kochetov, A. V., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 251-259 9 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  68. Технологии поиска и исследования потенциально осциллирующих ферментативных систем

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., мар. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 3, стр. 318-330 13 стр., 9.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  69. Геномная изменчивость в регуляторных районах генов, ассоциированная с заболеваниями человека: механизмы влияния на транскрипцию генов и полногеномные информационные ресурсы, обеспечивающие исследование этих механизмов

    Ignatieva, E. V. & Matrosova, E. A., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 18-29 12 стр., 2.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  70. Метод поиска структурной гетерогенности сайтов связывания транскрипционных факторов с использованием альтернативных de novo моделей на примере FOXA2

    Tsukanov, A. V., Levitsky, V. G. & Merkulova, T. I., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 7-17 11 стр., 1.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  71. Определение количественного содержания хлорофиллов в листьях по спектрам отражения алгоритмом случайного леса

    Urbanovich, E. A., Afonnikov, D. A. & Nikolaev, S. V., февр. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 64-70 7 стр., 7.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  72. Филостратиграфический анализ генных сетей заболеваний человека

    Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Matushkin, Y. G., янв. 2021, в: Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii. 25, 1, стр. 46-56 11 стр., 5.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  73. Hypoxia exerts oxidative stress and changes in expression of antioxidant enzyme genes in gills of Mytilus galloprovincialis (Lamarck, 1819)

    Andreyeva, A. Y., Gostyukhina, O. L., Kladchenko, E. S., Afonnikov, D. A., Rasskazov, D. A., Lantushenko, A. O. & Vodiasova, E. A., 2021, в: Marine Biology Research. 17, 4, стр. 369-379 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  74. The Web Platform for Storing Biotechnologically Significant Properties of Bacterial Strains

    Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Klimenko, A. I., Lakhova, T. N., Demenkov, P. S. & Lashin, S. A., 2021, Parallel Computing Technologies - 16th International Conference, PaCT 2021, Proceedings. Malyshkin, V. (ред.). Springer, стр. 445-450 6 стр. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); том 12942 LNCS).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  75. 2020
  76. Nucleosome positioning around transcription start site correlates with gene expression only for active chromatin state in drosophila interphase chromosomes

    Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Moshkin, Y. M. & Zhimulev, I. F., 1 дек. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 23, стр. 1-10 10 стр., 9282.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  77. A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: An analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia

    Romanov, G. P., Pshennikova, V. G., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Teryutin, F. M., Cherdonova, A. M., Borisova, T. V., Sazonov, N. N., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L., Fedorova, S. A. & Barashkov, N. A., нояб. 2020, в: PLoS ONE. 15, 11 November, стр. e0242219 e0242219.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  78. Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

    Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  79. The phylogeny of class b flavoprotein monooxygenases and the origin of the yucca protein family

    Turnaev, I. I., Gunbin, K. V., Suslov, V. V., Akberdin, I. R., Kolchanov, N. A. & Afonnikov, D. A., 1 сент. 2020, в: Plants. 9, 9, стр. 1-22 22 стр., 1092.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  80. Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

    Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  81. The Effects of Chronic Stress on Brain Myelination in Humans and in Various Rodent Models

    Antontseva, E., Bondar, N., Reshetnikov, V. & Merkulova, T., 10 авг. 2020, в: Neuroscience. 441, стр. 226-238 13 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  82. Subcellular compartmentalization of the plant antioxidant system: an integrated overview

    Bobrovskikh, A., Zubairova, U., Kolodkin, A. & Doroshkov, A., 16 июл. 2020, в: PeerJ. 8, стр. e9451 27 стр., e9451.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  83. A genome-scale metabolic model of 2,3-butanediol production by thermophilic bacteria geobacillus icigianus

    Kulyashov, M., Peltek, S. E. & Akberdin, I. R., 1 июл. 2020, в: Microorganisms. 8, 7, стр. 1-13 13 стр., 1002.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  84. Analysis of color and texture characteristics of cereals on digital images

    Komyshev, E. G., Genaev, M. A. & Afonnikov, D. A., июл. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 4, стр. 340-347 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › обзорная статья › Рецензирование

  85. Application of neural networks to image recognition of wheat rust diseases

    Genaev, M., Ekaterina, S. & Afonnikov, D., июл. 2020, Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 40-42 3 стр. 9214703. (Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  86. GPU Based Composite Elements Discovery in Large DNADatasets

    Vishnevsky, O., Bocharnikov, A. & Kolchanov, N., июл. 2020, Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 135-138 4 стр. 9214777. (Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференций › статья в сборнике материалов конференции › научная › Рецензирование

  87. Mathematical and Numerical Models of the Central Regulatory Circuit of the Morphogenesis System of Drosophila

    Bukharina, T. A., Akinshin, A. A., Golubyatnikov, V. P. & Furman, D. P., 1 мая 2020, в: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 14, 2, стр. 249-255 7 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  88. rs2072580T>A Polymorphism in the Overlapping Promoter Regions of the SART3 and ISCU Genes Associated with the Risk of Breast Cancer

    Degtyareva, A. O., Leberfarb, E. Y., Efimova, E. G., Brusentsov, I. I., Usova, A. V., Lushnikova, E. L. & Merkulova, T. I., 1 мая 2020, в: Bulletin of Experimental Biology and Medicine. 169, 1, стр. 81-84 4 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  89. Specification and regulation of vascular tissue identity in the Arabidopsis embryo

    Smit, M. E., Llavata-Peris, C. I., Roosjen, M., van Beijnum, H., Novikova, D., Levitsky, V., Sevilem, I., Roszak, P., Slane, D., Jürgens, G., Mironova, V., Brady, S. M. & Weijers, D., 20 апр. 2020, в: Development (Cambridge). 147, 8, 15 стр., dev186130.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  90. Fold-change-specific enrichment analysis (FSEA): Quantification of transcriptional response magnitude for functional gene groups

    Wiebe, D. S., Omelyanchuk, N. A., Mukhin, A. M., Grosse, I., Lashin, S. A., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V. V., 17 апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 14 стр., 434.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  91. Genes containing long introns occupy series of bands and interbands in drosophila melanogaster polytene chromosomes

    Khoroshko, V. A., Pokholkova, G. V., Levitsky, V. G., Zykova, T. Y., Antonenko, O. V., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., апр. 2020, в: Genes. 11, 4, 32 стр., 417.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  92. Faint gray bands in Drosophila melanogaster polytene chromosomes are formed by coding sequences of housekeeping genes

    Demakova, O. V., Demakov, S. A., Boldyreva, L. V., Zykova, T. Y., Levitsky, V. G., Semeshin, V. F., Pokholkova, G. V., Sidorenko, D. S., Goncharov, F. P., Belyaeva, E. S. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2020, в: Chromosoma. 129, 1, стр. 25-44 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  93. Использование гиперспектральной камеры Specim IQ для анализа растений

    Alt, V. V., Gurova, T. A., Elkin, O. V., Klimenko, D. N., Maximov, L. V., Pestunov, I. A., Dubrovskaya, O. A., Genaev, M. A., Erst, T. V., Genaev, K. A., Komyshev, E. G., Khlestkin, V. K. & Afonnikov, D. A., 1 мар. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 3, стр. 259-266 8 стр., 6.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  94. Candidate snp markers of atherogenesis significantly shifting the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters show stabilizing natural selection as a sum of neutral drift accelerating atherogenesis and directional natural selection slowing it

    Ponomarenko, M., Rasskazov, D., Chadaeva, I., Sharypova, E., Drachkova, I., Oshchepkov, D., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Oshchepkova, E., Nazarenko, M. & Kolchanov, N., 5 февр. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 3, 41 стр., 1045.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  95. Computer Simulation of the Evolution of Microbial Population: Overcoming Local Minima When Reaching a Peak on the Fitness Landscape

    Lashin, S. A., Mustafin, Z. S., Klimenko, A. I., Afonnikov, D. A. & Matushkin, Y. G., 1 февр. 2020, в: Russian Journal of Genetics. 56, 2, стр. 242-252 11 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  96. Identification of Antimicrobial Peptides from Novel Lactobacillus fermentum Strain

    Pavlova, A. S., Ozhegov, G. D., Arapidi, G. P., Butenko, I. O., Fomin, E. S., Alemasov, N. A., Afonnikov, D. A., Yarullina, D. R., Ivanov, V. T., Govorun, V. M. & Kayumov, A. R., 1 февр. 2020, в: Protein Journal. 39, 1, стр. 73-84 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  97. The Effect of Meditation on Comprehension of Statements About One-Self and Others: A Pilot ERP and Behavioral Study

    Savostyanov, A., Tamozhnikov, S., Bocharov, A., Saprygin, A., Matushkin, Y., Lashin, S., Kolpakova, G., Sudobin, K. & Knyazev, G., 9 янв. 2020, в: Frontiers in Human Neuroscience. 13, 12 стр., 437.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  98. A mathematical model linking Ca2+-dependent signaling pathway and gene expression regulation in Human Skeletal Muscle

    Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., Pintus, S. S., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 1, стр. 20-39 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  99. Potential regulatory SNPs in the ATXN7L3B and KRT15 genes are associated with gender-specific colorectal cancer risk

    Leberfarb, E. Y., Degtyareva, A. O., Brusentsov, I. I., Maximov, V. N., Voevoda, M. I., Autenshlus, A. I., Morozov, D. V., Sokolov, A. V. & Merkulova, T. I., янв. 2020, в: Personalized Medicine. 17, 1, стр. 43-54 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  100. Rdbms And Nosql Based Hybrid Technology for Transcriptome Data Structuring and Processing

    Mukhin, A. M., Genaev, M. A., Rasskazov, D. A., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 2, стр. 455-470 16 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  101. 2019
  102. The mTOR signaling pathway activity and vitamin d availability control the expression of most autism predisposition genes

    Trifonova, E. A., Klimenko, A. I., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 15 дек. 2019, в: International Journal of Molecular Sciences. 20, 24, 14 стр., 6332.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  103. A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

    Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  104. Stress-induced changes in the expression of antioxidant system genes for rice (Oryza sativa L.) and bread wheat (Triticum aestivum L.)

    Ermakov, A., Bobrovskikh, A., Zubairova, U., Konstantinov, D. & Doroshkov, A., 29 нояб. 2019, в: PeerJ. 7, 11, стр. e7791 28 стр., e7791.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

  105. Phylostratigraphic analysis shows the earliest origination of the abiotic stress associated genes in a. Thaliana

    Mustafin, Z. S., Zamyatin, V. I., Konstantinov, D. K., Doroshkov, A. V., Lashin, S. A. & Afonnikov, D. A., 22 нояб. 2019, в: Genes. 10, 12, 27 стр., 963.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданиях › статья › Рецензирование

ID: 3081871