1. A bird's-eye overview of molecular mechanisms regulating feed intake in chickens—with mammalian comparisons

    Volyanskaya, A. R., Akberdin, I. R., Kulyashov, M. A., Yevshin, I. S., Romanov, M. N., Shagimardanova, E. I., Gusev, O. A. & Kolpakov, F. A., 1 июн. 2024, в: Animal Nutrition. 17, стр. 61-74

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  2. Abnormal mTOR Activity in Pediatric Autoimmune Neuropsychiatric and MIA-Associated Autism Spectrum Disorders

    Trifonova, E. A., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Kochetov, A. V., 16 янв. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 2, 967.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  3. A Catalog of Human Genes Associated With Pathozoospermia and Functional Characteristics of These Genes

    Ignatieva, E. V., Osadchuk, A. V., Kleshchev, M. A., Bogomolov, A. G. & Osadchuk, L. V., 5 июл. 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, 662770.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  4. Accurate noise-robust classification of Bacillus species from MALDI-TOF MS spectra using a denoising autoencoder

    Uvarova, Y. E., Demenkov, P. S., Kuzmicheva, I. N., Venzel, A. S., Mischenko, E. L., Ivanisenko, T. V., Efimov, V. M., Bannikova, S. V., Vasilieva, A. R., Ivanisenko, V. A. & Peltek, S. E., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  5. Achievements and prospects of applying high-throughput sequencing techniques to potato genetics and breeding

    Bykova, I. V., Shmakov, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 1 янв. 2017, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 21, 1, стр. 96-103 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  6. Achievements and prospects of applying high-throughput sequencing techniques to potato genetics and breeding

    Bykova, I. V., Shmakov, N. A., Afonnikov, D. A., Kochetov, A. V. & Khlestkina, E. K., 1 нояб. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 7, стр. 736-743 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  7. A compendium and functional characterization of mammalian genes involved in adaptation to Arctic or Antarctic environments

    Yudin, N. S., Larkin, D. M. & Ignatieva, E. V., 28 дек. 2017, в: BMC Genetics. 18, Suppl 1, стр. 111 11 стр., 111.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  8. A database of human genes and a gene network involved in response to tick-borne encephalitis virus infection

    Ignatieva, E. V., Igoshin, A. V. & Yudin, N. S., 28 дек. 2017, в: BMC Evolutionary Biology. 17, Suppl 2, стр. 259 14 стр., 259.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  9. A genome-scale metabolic model of 2,3-butanediol production by thermophilic bacteria geobacillus icigianus

    Kulyashov, M., Peltek, S. E. & Akberdin, I. R., 1 июл. 2020, в: Microorganisms. 8, 7, стр. 1-13 13 стр., 1002.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  10. Agent-Based Modeling of Autosomal Recessive Deafness 1A (DFNB1A) Prevalence with Regard to Intensity of Selection Pressure in Isolated Human Population

    Romanov, G. P., Smirnova, A. A., Zamyatin, V. I., Mukhin, A. M., Kazantsev, F. V., Pshennikova, V. G., Teryutin, F. M., Solovyev, A. V., Fedorova, S. A., Posukh, O. L., Lashin, S. A. & Barashkov, N. A., февр. 2022, в: Biology. 11, 2, 257.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  11. Algorithm for the Reconstruction of Mathematical Frame Models of Bacterial Transcription Regulation

    Lakhova, T. N., Kazantsev, F. V., Mukhin, A. M., Kolchanov, N. A., Matushkin, Y. G. & Lashin, S. A., дек. 2022, в: Mathematics. 10, 23, 4480.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  12. AltORFev facilitates the prediction of alternative open reading frames in eukaryotic mRNAs

    Kochetov, A. V., Allmer, J., Klimenko, A. I., Zuraev, B. S., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Hancock, J., 15 мар. 2017, в: Bioinformatics. 33, 6, стр. 923-925 3 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  13. A mathematical model linking Ca2+-dependent signaling pathway and gene expression regulation in Human Skeletal Muscle

    Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., Pintus, S. S., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2020, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 15, 1, стр. 20-39 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  14. A matrix metalloproteinase 9 (MMP9) gene single nucleotide polymorphism is associated with predisposition to tick-borne encephalitis virus-induced severe central nervous system disease

    Barkhash, A. V., Yurchenko, A. A., Yudin, N. S., Ignatieva, E. V., Kozlova, I. V., Borishchuk, I. A., Pozdnyakova, L. L., Voevoda, M. I. & Romaschenko, A. G., 1 мая 2018, в: Ticks and Tick-borne Diseases. 9, 4, стр. 763-767 5 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  15. A modular mathematical model of exercise-induced changes in metabolism, signaling, and gene expression in human skeletal muscle

    Akberdin, I. R., Kiselev, I. N., Pintus, S. S., Sharipov, R. N., Vertyshev, A. Y., Vinogradova, O. L., Popov, D. V. & Kolpakov, F. A., 1 окт. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 19, 10353.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  16. A modular visual model of energy metabolism in human skeletal muscle

    Kiselev, I. N., Akberdin, I. R., Vertyshev, A. Y., D.V., P. & Kolpakov, F. A., 1 янв. 2019, в: Mathematical Biology and Bioinformatics. 14, 2, стр. 373-392 20 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  17. Analysis of color and texture characteristics of cereals on digital images

    Komyshev, E. G., Genaev, M. A. & Afonnikov, D. A., июл. 2020, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 24, 4, стр. 340-347 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  18. Analysis of Genome Structure and Its Variations in Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Vasiliev, G. V., Toshchakov, S. V., Shmakov, N. A., Genaev, M. A., Nesterov, M. A., Ibragimova, S. M., Rybakov, D. A., Gavrilenko, T. A., Salina, E. A., Patrushev, M. V., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., 16 мар. 2023, в: International Journal of Molecular Sciences. 24, 6, 5713.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  19. Analysis of the neurogenesis: Prepattern gene network controlling first stage of bristle pattern development in Drosophila melanogaster

    Furman, D. P. & Bukharina, T. A., 1 июл. 2017, в: Russian Journal of Genetics: Applied Research. 7, 5, стр. 550-557 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  20. A new approach to estimating the prevalence of hereditary hearing loss: An analysis of the distribution of sign language users based on census data in Russia

    Romanov, G. P., Pshennikova, V. G., Lashin, S. A., Solovyev, A. V., Teryutin, F. M., Cherdonova, A. M., Borisova, T. V., Sazonov, N. N., Khusnutdinova, E. K., Posukh, O. L., Fedorova, S. A. & Barashkov, N. A., нояб. 2020, в: PLoS ONE. 15, 11 November, стр. e0242219 e0242219.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  21. A New Visualization and Analysis Method for a Convolved Representation of Mass Computational Experiments with Biological Models

    Klimenko, A. I., Vorobeva, D. A. & Lashin, S. A., июн. 2023, в: Mathematics. 11, 12, 2783.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  22. An experimental study of the effect of rare polymorphisms of human HBB, HBD and F9 promoter TATA boxes on the kinetics of interaction with the TATA-binding protein

    Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Kashina, E. V., Rasskazov, D. A., Ponomarenko, M. P., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Savinkova, L. K., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 1, стр. 145-152 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  23. An integrated information system on bioresource collections of the FASO of Russia

    Lashin, S. A., Afonnikov, D. A., Genaev, M. A., Kazantsev, F. V., Komyshev, E. G., Oschepkova, E. A., Petrov, A. V., Rasskazov, D. A., Smirnova, A. A. & Kolchanov, N. A., 1 янв. 2018, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 22, 3, стр. 386-393 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  24. Antitumor efficacy of multi-target in situ vaccinations with CpG oligodeoxynucleotides, anti-OX40, anti-PD1 antibodies, and aptamers

    Proskurina, A. S., Рузанова, В. С., Риттер, Г. С., Ефремов, Я. Р., Mustafin, Z. S., Лашин, С. А., Буракова, Е. А., Фокина, А. А., Zatsepin, T. S., Стеценко, Д. А., Леплина, О. Ю., Останин, А. А., Черных, Е. Р. & Bogachev, S. S., 2023, в: Journal of Biomedical Research. 37, 3, стр. 194-212 19 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  25. A panel of rsnps demonstrating allelic asymmetry in both chip-seq and rna-seq data and the search for their phenotypic outcomes through analysis of degs

    Korbolina, E. E., Bryzgalov, L. O., Ustrokhanova, D. Z., Postovalov, S. N., Poverin, D. V., Damarov, I. S. & Merkulova, T. I., 2 июл. 2021, в: International Journal of Molecular Sciences. 22, 14, 7240.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  26. Application of neural networks to image recognition of wheat rust diseases

    Genaev, M., Ekaterina, S. & Afonnikov, D., июл. 2020, Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 40-42 3 стр. 9214703. (Proceedings - 2020 Cognitive Sciences, Genomics and Bioinformatics, CSGB 2020).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  27. Architecture of DNA elements mediating ARF transcription factor binding and auxin-responsive gene expression in Arabidopsis

    Freire-Rios, A., Tanaka, K., Crespo, I., Van der Wijk, E., Sizentsova, Y., Levitsky, V., Lindhoud, S., Fontana, M., Hohlbein, J., Roeland Boer, D., Mironova, V. & Weijers, D., 29 сент. 2020, в: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 117, 39, стр. 24557-24566 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  28. Architecture of Promoters of House-Keeping Genes in Polytene Chromosome Interbands of Drosophila melanogaster

    Zykova, T. Y., Levitsky, V. G. & Zhimulev, I. F., 1 мар. 2019, в: Doklady Biochemistry and Biophysics. 485, 1, стр. 95-100 6 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  29. Argo_CUDA: Exhaustive GPU based approach for motif discovery in large DNA datasets

    Vishnevsky, O. V., Bocharnikov, A. V. & Kolchanov, N. A., 1 февр. 2018, в: Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 16, 1, 23 стр., 1740012.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  30. A Sight on Single-Cell Transcriptomics in Plants Through the Prism of Cell-Based Computational Modeling Approaches: Benefits and Challenges for Data Analysis

    Bobrovskikh, A., Doroshkov, A., Mazzoleni, S., Cartenì, F., Giannino, F. & Zubairova, U., 21 мая 2021, в: Frontiers in Genetics. 12, стр. 652974 652974.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхобзорная статьяРецензирование

  31. A single ChIP-seq dataset is sufficient for comprehensive analysis of motifs co-occurrence with MCOT package

    Levitsky, V., Zemlyanskaya, E., Oshchepkov, D., Podkolodnaya, O., Ignatieva, E., Grosse, I., Mironova, V. & Merkulova, T., 2 дек. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, 21, стр. e139 14 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  32. Assembly and Analysis of Plastomes for 15 Potato Cultivars Grown in Russia

    Karetnikov, D. I., Salina, E. A., Kochetov, A. V. & Afonnikov, D. A., июн. 2023, в: Agronomy. 13, 6, 1454.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  33. Asymmetric conservation within pairs of co-occurred motifs mediates weak direct binding of transcription factors in chip-seq data

    Levitsky, V., Oshchepkov, D., Zemlyanskaya, E. & Merkulova, T., 21 авг. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 17, стр. 1-22 22 стр., 6023.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  34. A system approach to the modeling of fungal infections of the wheat leaf

    Nikolaev, S. V., Zubairova, U. S., Skolotneva, E. S., Orlova, E. A. & Afonnikov, D. A., 1 янв. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 1, стр. 100-109 10 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  35. Auxin regulates functional gene groups in a fold-change-specific manner in Arabidopsis thaliana roots

    Omelyanchuk, N. A., Wiebe, D. S., Novikova, D. D., Levitsky, V. G., Klimova, N., Gorelova, V., Weinholdt, C., Vasiliev, G. V., Zemlyanskaya, E. V., Kolchanov, N. A., Kochetov, A. V., Grosse, I. & Mironova, V. V., 30 мая 2017, в: Scientific Reports. 7, 1, стр. 2489 11 стр., 2489.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  36. Behavior and Depression Gene Networks Reconstruction and Analysis

    Ivanov, R. A., Zamyatin, V. I., Klimenko, A. I., Astakhova, T. N., Matushkin, Y. G., Savostyanov, A. N. & Lashin, S. A., окт. 2019, SIBIRCON 2019 - International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences, Proceedings. Institute of Electrical and Electronics Engineers Inc., стр. 361-365 5 стр. 8958072. (SIBIRCON 2019 - International Multi-Conference on Engineering, Computer and Information Sciences, Proceedings).

    Результаты исследований: Публикации в книгах, отчётах, сборниках, трудах конференцийстатья в сборнике материалов конференциинаучнаяРецензирование

  37. BGRS: bioinformatics of genome regulation and data integration

    Orlov, Y. L., Chen, M., Kolchanov, N. A. & Hofestädt, R., 1 сент. 2023, в: Journal of integrative bioinformatics. 20, 3, 20230032.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  38. Bioinformatic Analysis Reveals the Role of Translation Elongation Efficiency Optimisation in the Evolution of Ralstonia Genus

    Korenskaia, A. Y., Matushkin, Y. G., Mustafin, Z. S., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2023, в: Biology. 12, 10, 1338.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  39. Bioinformatic Assessment of Factors Affecting the Correlation between Protein Abundance and Elongation Efficiency in Prokaryotes

    Korenskaia, A. E., Matushkin, Y. G., Lashin, S. A. & Klimenko, A. I., окт. 2022, в: International Journal of Molecular Sciences. 23, 19, 11996.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  40. BioUML: an integrated environment for systems biology and collaborative analysis of biomedical data

    Kolpakov, F., Akberdin, I., Kashapov, T., Kiselev, L., Kolmykov, S., Kondrakhin, Y., Kutumova, E., Mandrik, N., Pintus, S., Ryabova, A., Sharipov, R., Yevshin, I. & Kel, A., 1 июл. 2019, в: Nucleic Acids Research. 47, W1, стр. W225-W233 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  41. BioUML—towards a universal research platform

    Колпаков, Ф., Акбердин, И. Р., Киселев, И., Колмыков, С. К., Кондрахин, Ю., Куляшов, М. А., Кутумова, Е., Пинтус, С. С., Рябова, А., Шарипов, Р. Н., Евшин, И., Жатченко, С. & Кель, А., 5 июл. 2022, в: Nucleic Acids Research. 50, W1, стр. W124-W131 8 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  42. Candidate snp markers of atherogenesis significantly shifting the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters show stabilizing natural selection as a sum of neutral drift accelerating atherogenesis and directional natural selection slowing it

    Ponomarenko, M., Rasskazov, D., Chadaeva, I., Sharypova, E., Drachkova, I., Oshchepkov, D., Ponomarenko, P., Savinkova, L., Oshchepkova, E., Nazarenko, M. & Kolchanov, N., 5 февр. 2020, в: International Journal of Molecular Sciences. 21, 3, 41 стр., 1045.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  43. Candidate SNP Markers of Atherosclerosis That May Significantly Change the Affinity of the TATA-Binding Protein for the Human Gene Promoters

    Ponomarenko, M. P., Rasskazov, D. A., Chadaeva, I. V., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Ponomarenko, P. M., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K. & Kolchanov, N. A., 1 сент. 2019, в: Russian Journal of Genetics. 55, 9, стр. 1137-1151 15 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  44. Candidate SNP markers of familial and sporadic Alzheimer's diseases are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters

    Ponomarenko, P., Chadaeva, I., Rasskazov, D. A., Sharypova, E., Kashina, E. V., Drachkova, I., Zhechev, D., Ponomarenko, M. P., Savinkova, L. K. & Kolchanov, N., 20 июл. 2017, в: Frontiers in Aging Neuroscience. 9, JUL, стр. 231 24 стр., 231.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  45. Candidate SNP markers of reproductive potential are predicted by a significant change in the affinity of TATA-binding protein for human gene promoters

    Chadaeva, I. V., Ponomarenko, P. M., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Kashina, E. V., Zhechev, D. A., Drachkova, I. A., Arkova, O. V., Savinkova, L. K., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A., Osadchuk, L. V. & Osadchuk, A. V., 9 февр. 2018, в: BMC Genomics. 19, Suppl 3, стр. 0 23 стр., 0.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  46. Candidate SNP-markers of rheumatoid arthritis that can significantly alter the affinity of the TATA-binding protein for human gene promoters

    Chadaeva, I. V., Rasskazov, D. A., Sharypova, E. B., Drachkova, I. A., Oshchepkova, E. A., Savinkova, L. K., Ponomarenko, P. M., Ponomarenko, M. P., Kolchanov, N. A. & Kozlov, V. A., 1 авг. 2019, в: Вавиловский журнал генетики и селекции. 23, 8, стр. 1047-1058 12 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  47. Central Regulatory Circuit of the Drosophila Mechanoreceptor Morphogenesis System: Effects of Mutations

    Furman, D. P., Bukharina, T. A. & Golubyatnikov, V. P., сент. 2023, в: Journal of Applied and Industrial Mathematics. 17, 3, стр. 535-543 9 стр.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  48. CisCross: A gene list enrichment analysis to predict upstream regulators in Arabidopsis thaliana

    Lavrekha, V. V., Levitsky, V. G., Tsukanov, A. V., Bogomolov, A. G., Grigorovich, D. A., Omelyanchuk, N., Ubogoeva, E. V., Zemlyanskaya, E. V. & Mironova, V., 18 авг. 2022, в: Frontiers in Plant Science. 13, 942710.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  49. Classification of Fruit Flies by Gender in Images Using Smartphones and the YOLOv4-Tiny Neural Network

    Genaev, M. A., Komyshev, E. G., Shishkina, O. D., Adonyeva, N. V., Karpova, E. K., Gruntenko, N. E., Zakharenko, L. P., Koval, V. S. & Afonnikov, D. A., 1 февр. 2022, в: Mathematics. 10, 3, 295.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

  50. Comparative analysis of alignment-free genome clustering and whole genome alignment-based phylogenomic relationship of coronaviruses

    Kirichenko, A. D., Poroshina, A. A., Sherbakov, D. Y., Sadovsky, M. G. & Krutovsky, K. V., мар. 2022, в: PLoS ONE. 17, 3, e0264640.

    Результаты исследований: Научные публикации в периодических изданияхстатьяРецензирование

Назад 1 2 3 4 5 Далее

ID: 3081871